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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
여기서는 모션 큐와 같은 대체 시각적 기능이 물고기의 방향 결정에 미치는 영향을 정량화하는 행동 분석법을 보여 주는 프로토콜을 제시합니다. 대표적인 데이터는 골든 샤이너(노테미고누스 crysoleucas)가가상 물고기의 움직임을 따르는 속도와 정확성에 표시됩니다.
집단 동물 행동은 개별적인 운동동기 및 개별적인 적피트를 위해 중요한 사회적인 상호 작용에서 생깁니다. 물고기는 오랫동안 집단 운동, 특히 생태 학적 맥락에서 환경 및 사회적 정보를 통합 할 수있는 능력에 대한 조사를 영감을 주었습니다. 이 데모는 컴퓨터 시각화 및 디지털 이미지 분석을 사용하여 시각적 자극에, 이 경우, 골든 샤이너(Notemigonus crysoleucas)의행동 반응을 정량화하는 데 사용되는 기술을 보여줍니다. 컴퓨터 시각화의 최근 발전은 시각적 기능을 제어하고 미세하게 조작하여 사회적 상호 작용의 메커니즘을 격리할 수 있는 실험실에서 경험적 테스트를 가능하게 합니다. 이 방법의 목적은 독방이든 그룹이든 개인의 방향 결정에 영향을 미칠 수있는 시각적 기능을 분리하는 것입니다. 이 프로토콜은 프로젝터 및 애니메이션의 물리적 Y-미로 도메인, 기록 장비, 설정 및 교정, 실험 단계 및 데이터 분석에 대한 세부 사항을 제공합니다. 이러한 기술은 컴퓨터 애니메이션이 생물학적으로 의미 있는 반응을 유도할 수 있음을 보여줍니다. 또한 이 기술은 광범위한 실험 응용 분야에 대한 대체 가설, 도메인 및 종을 테스트하기 위해 쉽게 적응할 수 있습니다. 가상 자극의 사용은 필요한 살아있는 동물의 수를 감소시키고 대체 할 수 있게 하고, 결과적으로 실험실 오버헤드를 감소시킵니다.
이 데모는 가상 컨특이성의 이동 속도(초당 2개의 바디 길이)의 작은 상대적 차이가 가상 에서 제공하는 방향 신호를 따르는 속도와 정확도를 향상시킨다는 가설을 테스트합니다. 실루엣. 결과에 따르면 배경 노이즈(이미지 일관성 67%)가 있는 경우에도 시각적 신호속도의 증가에 따라 방향 결정이 크게 영향을 받는 것으로 나타났습니다. 모션 큐가 없는 경우 피사체는 무작위로 방향을 선택했습니다. 결정 속도와 큐 속도 사이의 관계는 가변적이었고 큐 속도의 증가는 방향 정확도에 미미하게 불균형한 영향을 미쳤습니다.
동물은 서식지를 지속적으로 감지하고 해석하여 다른 사람들과 상호 작용하고 시끄러운 주변 환경을 탐색 할 때 정보에 입각한 결정을 내보합니다. 개인은 자신의 행동에 사회적 정보를 통합하여 자신의 상황 인식과 의사 결정을 향상시킬 수 있습니다. 그러나 소셜 정보는 특정 메시지를 전달하기 위해 진화한 직접 신호(예: 흔들기)를 통해 신뢰할 수 없는 의도하지 않은 단서(즉, 포식자를 피하기 위한 갑작스런 기동)를 통한 추론에서 비롯됩니다. 꿀벌춤) 1. 개인이 사회적 단서또는 감각 정보의 가치를 신속하게 평가하는 방법을 식별하는 것은 특히 개인이 그룹으로 여행하는 경우 구도자에게 어려운 작업이 될 수 있습니다. 비전은 사회적 상호 작용을지배하는 데 중요한 역할을 한다 2,3,4 및 연구는 각 개인의 시야에 따라 물고기 학교에서 발생할 수있는 상호 작용 네트워크를 유추한 5, 6. 그러나 어류 학교는 동적 시스템이므로 그룹 구성원 간의 상호 작용으로 인해 발생하는 고유의 공선및 혼란스러운 요인으로 인해 특정 기능 또는 이웃 행동에 대한 개별 응답을 격리하기가 어렵습니다. 이 프로토콜의 목적은 대체 시각적 기능이 혼자 또는 그룹 내에서 여행하는 개인의 방향 결정에 어떻게 영향을 미칠 수 있는지 를 격리하여 현재 작업을 보완하는 것입니다.
현재 프로토콜의 장점은 조작 실험과 컴퓨터 시각화 기술을 결합하여 개인이 자연에서 경험할 수 있는 기본 시각적 기능을 분리하는 것입니다. 구체적으로, Y-미로(그림 1)는 이진 응답으로 방향 선택을 축소하고 가상 이웃의 수영 동작을 모방하도록 설계된 컴퓨터 애니메이션 이미지를 도입하는 데 사용된다. 이러한 이미지는 미로 아래에서 하나 이상의 피사체 아래에서 수영하는 conspecifics의 실루엣을 모방하기 위해 투영됩니다. 이러한 실루엣의 시각적 특성, 예: 형태, 속도, 일관성, 및 수영 동작은 대체 가설을 테스트하기 위해 쉽게 맞춤화되어7.
이 논문은 모델 사회 어종의 개인, 골든 샤이너(Notemigonus crysoleucas)가가상 이웃의 상대적 속도에 어떻게 반응하는지 고립시킴으로써이 접근법의 유용성을 보여줍니다. 여기서 프로토콜 포커스는 가상 이웃의 방향 영향이 속도에 따라 변화하는지 여부와 그렇다면 관찰된 관계의 형태를 정량화하는 것입니다. 특히, 방향 신호는 실루엣의 고정 된 비율이 리더 역할을하고 한 팔 또는 다른 쪽으로 탄도적으로 이동함으로써 생성됩니다. 나머지 실루엣은 지시선/산만 비율을 조정하여 조정할 수 있는 배경 노이즈를 제공하기 위해 임의로 이동하여 산만하게 작동합니다. 지시자와 산만도의 비율은 방향 단서의 일관성을 캡처하고 그에 따라 조정할 수 있습니다. 산만 한 실루엣은 결정 영역 ("DA", 그림 1A)에국한 된 실루엣이 경계에서 반사하도록 합니다. 그러나 리더 실루엣은 DA 영역을 떠나 지정된 팔을 입력한 후 실루엣이 팔 길이의 1/3을 통과하면 서서히 사라지도록 허용됩니다. 리더가 DA를 떠날 때, 새로운 리더 실루엣은 자신의 자리를 차지하고 리더 / 산만 비율이 실험 전반에 걸쳐 DA에서 일정하게 유지되도록 자신의 정확한 경로를 되돌리.
가상 물고기의 사용은 시각적 인 감각 정보의 제어를 허용, 피사체의 방향 반응을 모니터링하면서, 이는 그룹으로 사회 탐색, 운동, 또는 의사 결정의 새로운 기능을 공개 할 수있다. 여기서 사용되는 접근 방식은 컴퓨터 애니메이션을 조작하여 다양한 복잡성의 행동 패턴을 생성하여 치명적인 스트레스 또는 사회적 상호 작용에 대한 포식의 영향과 같은 광범위한 질문에 적용할 수 있습니다.
모든 실험 프로토콜은 환경 연구소의 기관 동물 관리 및 사용위원회에 의해 승인되었다, 미국 육군 엔지니어 및 연구 개발 센터, 빅스 버그, MS, 미국 (IACUC # 2013-3284-01).
1. 감각 미로 디자인
2. 녹음 장비
3. 조명, 프로젝터 및 카메라 설정 보정
4. 시각적 프로젝션 프로그램 보정 : 배경
시각적 자극 프로그램을 사용하여 가우시안 그라데이션() 만들기5. 시각 투영 프로그램 보정 : 시각적 자극
참고: 시각적 자극을 렌더링하고 애니메이션하는 작업은 플랫폼 자습서와 함께 아래 단계를 가이드로 사용하여 처리할 수도 있습니다. 현재 프로그램의 논리의 도식은(그림3)에 제공되며 추가 세부 사항은 Lemasson 외(2018)7에서확인할 수 있습니다. 다음 단계는 현재 실험에서 수행된 교정 단계의 예를 제공합니다.
6. 동물 준비
7. 실험 절차
8. 데이터 분석
가설 및 설계
이 실험 시스템의 유용성을 입증하기 위해 우리는 골든 샤이너가 시각적 신호를 따르는 정확도가 그 단서의 속도로 향상될 것이라는 가설을 테스트했습니다. 야생형 골든 샤이너는사용하였다(N=16, 체길이, BL, 및 습식 중량, WW, 63.4±3.5 mm 및 1.8±0.3 g, 정중하게). 시각적 자극(리더/산만비율)의 일관성은 0.67로 고정되었으며, 모션 큐(즉, 리더)가 산만함으로 이동하는 속도를 조작했습니다. 지향성 신호를 제공하는 리더 실루엣의 속도 수준은 0-10 BL/s(2배 증가)에 이르는데, 이는 일반적으로 물고기12에서지속적, 장기간 또는 버스트 수영 모드를 반영하는 것으로 간주되는 속도 범위에 걸쳐 있다. 제어 수준에서 0, 리더 실루엣은 임의로 방향이 지정된 산만한 사람들 사이에서 대상 팔을 향하게 되었지만 실루엣은 움직이지 않았습니다. 대상 팔은 프로그램에 의해 각 평가판에 대해 무작위로 선택되었습니다. 거리 단위는 피사체의 평균 표준 길이로 정의된 바디 길이이며 시간은 초단위입니다. 현재 대표적인 분석은 1차 반응 변수(의사 결정 속도 및 정확도)를 측정하는 데 중점을 두고 있지만, 실험 설계를 통해 조사자가 피사체의 움직임을 추적하고 분석하여 추가 정보를 추출할 수 있습니다. 운동학.
우리의 물고기 과목은 프로토콜의 섹션 6 다음 보관했다. 각 피험체는 하루에 1단계의 치료에 노출되었다. 우리는 피험자 치료 수준 (큐 속도) 일 및 피험자가 매일 테스트 된 순서 내에서 모두 무작위화했습니다. 선형 및 일반화 선형 혼합 효과 모델(각각 LMM 및 GLMM)은 피사체가 시각적 자극을 따르는 속도와 정확도에 대한 리더 실루엣 속도의 효과를 테스트하는 데 사용되었습니다. 주체 ID는 두 모델 모두에서 임의의 효과로 포함되었다.
데이터 및 결과
어떤 모션 큐의 부재에서 골든 샤이너는 예상대로 행동하고 무작위로 자신의 방향을 선택 (자극 속도 = 0, 이노미얼 테스트, n왼쪽= 33, n오른쪽= 40, = 0.45, P = 0.483). 대부분의 과목은 도메인 내에서 스트레스 행동의 흔적을 보여주지 않고 할당 된 시간 (5 분) 이내에 결정적인 결정을 내렸지만, 22 %의 피험자는 보류 영역을 떠나거나 결정 영역에 들어가는 것을 꺼리는 것으로 나타났습니다. 이러한 우유부단한 물고기의 데이터는 분석에 포함되지 않았습니다. 나머지 78%의 피험자는 그 자극의 속도가 증가함에 따라 방향 자극을 따르는 정확도에서 현저한 개선을 보였다(GLMM, z = 1.937, P = 0.053). 그림 5A는 자극 속도 레벨의 각 증가에 대한 방향 정확도가 1.2배 증가하는 이 관계의 특성을 보여줍니다. 이 관계는 단지 겸손하게 불균형하고, 그 자체로, 큐 속도의 변화에 대한 임계 응답의 암시하지 않습니다. 자극 속도의 증가는 또한 결정 속도의 현저한 증가로 이어졌다(LMM, F1,56= 4.774, P = 0.033). 그러나 그림 5B에서 알 수 있듯이 결정 속도의 추세는 자극 속도 수준에서 일관되지 않고 매우 가변적이었습니다. 이러한 결정 속도 데이터에서 명백한 것은 자극이 움직이지 않았을 때보다 자극이 움직일 때보다 5-20배 더 오래 걸리는 피험자(자극에 대한 결정 속도 4.6±2.3 s 및 81.4±74.7s)가 더 오래 걸렸다는 것입니다. 각각 0과 8의 속도, ± 표준 편차, SD). 실제로, 제어 레벨없이 우리는 자극 속도의 함수로 결정 속도에 큰 변화를 발견하지 않았다.

그림 1. Y-미로 도메인. A. 의사 결정 시험을 위한 Y-미로 장치의 이미지. 주석은 유지 영역(HA, 녹색), 결정 영역(DA, 파란색), 왼쪽 결정 암(LDA) 및 오른쪽 결정 암(RDA)을 나타냅니다. B. Y-미로의 이미지와 오버 헤드 조정 트랙 조명 및 GigE 카메라 배치 (4 개의 오버 헤드 라이트 스트립 중 하나만 볼 수 있음). C. 시험 중 또는 그 사이의 움직임을 제거하기 위해 슬라이딩 캐리지에 의해 잠긴 프로젝터 배치를 포함한 Y-미로(측면 보기)의 이미지. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2. 배경 및 자극 보정. A. 균일한 배경색과 픽셀 강도의 Transect(녹색 선)을 가진 조명된 Y-미로의 이미지는 유지 영역과 결정 영역 사이의 DA(평균 픽셀 강도 112±1278)이다. 프로젝터의 전구(핫스팟)에서 생성된 광그라데이션을 명확하게 볼 수 있습니다. B. DA와 투영의 정렬을 보여주는 이미지입니다. C. 필터링 된 배경과 교정 (크기, 속도)을 위해 DA의 중앙에 투영 된 고독한 실루엣이있는 미로 이미지. (C)에 카운터 그라데이션 배경을 추가하면 어두운 배경(평균 픽셀 강도 143.1±5.5) 및 공간 가변성(변형 계수 11.4(A.)에서 0.03(C.)으로 떨어집니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3. 실험에 사용된 시각화 프로그램에서 작업의 일반적인 흐름에 대한 회로도입니다. 추가 절차 정보는 7을참조하십시오. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4. 실제 물고기 실루엣과 가상 물고기 실루엣 모두 실험 시험. A. 이미지 a (라이브) 골든 샤이너 가 유지 영역을 떠나 (녹색 원). B. 가상 물고기 실루엣 중 결정 영역 (녹색 원)에서 (라이브) 골든 샤이너의 이미지. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5. 모션 큐의 상대 속도 변화에 대한 방향 응답의 정확도 및 속도입니다. A. 골든 샤이너가 자극 속도(BL/s)에 대해 그려진 '리더' 실루엣을 따랐던 물고기 결정 정확도그래프. B. 자극 속도 (BL / s)에 대해 플롯 물고기 결정 속도의 그래프. 데이터는 ± 표준 오차를 의미하며, SE. 15개의 가상 실루엣 그룹은 67% 일관성 수준(15개의 실루엣 중 10개가 리더역할을 하고 나머지 5개의 실루엣은 산만함으로 작용함)으로 의사 결정 영역에 걸쳐 무작위로 분포되어 있으며, 0-10 BL/s. 산만 속도는 실루엣이 움직이지 않는 컨트롤을 제외한 모든 속도 에서 1 BL/s로 고정된 상태로 유지되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
모든 저자는 실험 설계, 분석 및 논문 작성에 기여했습니다. A.C.U. 및 C.M.W. 설정 및 수집 데이터. 저자는 공개 할 것이 없다.
여기서는 모션 큐와 같은 대체 시각적 기능이 물고기의 방향 결정에 미치는 영향을 정량화하는 행동 분석법을 보여 주는 프로토콜을 제시합니다. 대표적인 데이터는 골든 샤이너(노테미고누스 crysoleucas)가가상 물고기의 움직임을 따르는 속도와 정확성에 표시됩니다.
우리는 설치 지원을 위해 브라이튼 힉슨 감사합니다. 이 프로그램은 기본 연구 프로그램, 환경 품질 및 설치 (EQI) 지원되었다; 엘리자베스 퍼거슨 박사, 기술 이사), 미 육군 엔지니어 연구 개발 센터.
| 흑백 IP 카메라 | Noldus, Leesburg, VA, USA | https://www.noldus.com/ | |
| 압출 알루미늄 | 80/20 Inc., Columbia City, IN, USA | 3030-S | https://www.8020.net 3.00" X 3.00" 부드러운 T-슬롯 프로파일, Vpak이 있는 8개의 개방형 T-슬롯 |
| Finfish 스타터, 1.5mm 압출 펠릿 | Zeigler Bros. Inc., Gardners, PA, USA | http://www.zeiglerfeed.com/ | |
| Golden shiners | Saul Minnow Farm, AR, USA | http://saulminnow.com/ | |
| ImageJ (v 1.52h) 프리웨어 | National Institute for Health (NIH), 미국 | https://imagej.nih.gov/ij/ | |
| LED 트랙 조명 | Lithonia Lightening, Conyers, GA, USA | BR20MW-M4 | https://lithonia.acuitybrands.com/residential-track |
| Oracle 651 white cut vinyl | 651Vinyl, Louisville, KY, USA | 651-010M-12:5피트 | http://www.651vinyl.com. 다양 한 크기를 주문할 수 있습니다. |
| PowerLite 570 오버헤드 프로젝터 | Epson, Long Beach, CA, USA | V11H605020 | https://epson.com/For-Work/Projectors/Classroom/PowerLite-570-XGA-3LCD-Projector/p/V11H605020 |
| Processing (v 3) 프리웨어 | Processing Foundation | https://processing.org/ | |
| R (3.5.1) 프리웨어 | The R Project for Statistical Computing | https://www.r-project.org/ | |
| Ultra-white 360 극장 스크린 | 대안 스크린 솔루션, 클린턴, 미시건, 미국 | 1950 | https://www.gooscreen.com. 특수 절단 크기 |
| Z-Hab 시스템 | Pentair Aquatic Ecosystems, Apopka, FL, USA | https://pentairaes.com/ 를 요청해야 합니다 | . 세부 사항 및 크기는 전화로 문의하십시오. |