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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
DetectSyn은 치료 또는 질병 상태에 걸친 상대적 시냅스 (시냅스 전 및 시냅스 후 참여) 수의 변화를 측정하는 편향되지 않은 신속한 형광 분석법입니다. 이 기술은 배양된 뉴런 및 고정 조직 모두에서 사용될 수 있는 근접 라이게이션 기술을 이용한다.
시냅스는 뉴런 사이의 통신 부위입니다. 신경 회로 강도는 시냅스 밀도와 관련이 있으며, 시냅스의 분해는 주요 우울 장애 (MDD) 및 알츠하이머 병과 같은 질병 상태의 특징입니다. 시냅스 수를 조사하기 위한 전통적인 기술에는 형광 마커(예를 들어, 녹색 형광 단백질(GFP))의 유전적 발현, 뉴런을 채우는 염료(예를 들어, 카르보시아닌 염료, DiI), 및 척추 마커의 면역형광 검출(예를 들어, 시냅스 후 밀도 95(PSD95))이 포함된다. 이러한 프록시 기술에 대한 주요 경고는 시냅스 후 변경 사항 만 식별한다는 것입니다. 그러나 시냅스는 시냅스 전 말단과 시냅스 후 척추 사이의 연결입니다. 시냅스 형성/제거를 측정하기 위한 황금 표준은 시간이 많이 소요되는 전자 현미경 또는 어레이 단층 촬영 기술이 필요합니다. 이러한 기술에는 전문 교육과 값 비싼 장비가 필요합니다. 또한, 제한된 수의 뉴런 만 평가할 수 있으며 전체 뇌 영역의 변화를 나타내는 데 사용됩니다. DetectSyn은 질병 상태 또는 약물 활동으로 인한 시냅스 형성 또는 제거의 변화를 식별하는 신속한 형광 기술입니다. DetectSyn은 신속한 근접 결찰 분석을 사용하여 병치된 시냅스 전후 단백질과 표준 형광 현미경을 검출하며, 이는 대부분의 실험실에서 쉽게 사용할 수 있는 기술입니다. 결과 누자의 형광 검출은 실험의 신속하고 편향되지 않은 분석을 가능하게합니다. DetectSyn은 제한된 수의 형광 뉴런보다 더 큰 영역을 분석 할 수 있기 때문에 전자 현미경보다 더 대표적인 결과를 제공합니다. 또한, DetectSyn은 시험관 내에서 배양된 뉴런 및 고정 조직 조각에 대해 작동합니다. 마지막으로, 이 기술로부터 수집된 데이터를 분석하는 방법이 제공된다. 전반적으로 DetectSyn은 치료 또는 질병 상태에 걸쳐 시냅스 밀도의 상대적 변화를 감지하는 절차를 제공하며 기존 기술보다 더 쉽게 접근 할 수 있습니다.
시냅스는 뉴런 1 사이의 통신의 기본 단위입니다. 동일한 영역 내의 뉴런 사이의 많은 시냅스는 행동2를 매개하는 회로를 발생시킵니다. 시냅스는 다른 뉴런의 시냅스 후 수용체에 정보를 전달하는 신경 전달 물질 또는 신경 펩티드를 방출하는 하나의 뉴런에서 시냅스 전 말단으로 구성됩니다. 시냅스 전 신호의 합산은 시냅스 후 뉴런이 행동 잠재력을 발사하고 메시지를 다른 뉴런으로 전파할지 여부를 결정합니다.
시냅스의 분해 인 Synaptopathology는 알츠하이머 병 및 주요 우울 장애와 같은 신경 부피 감소로 인한 질병 및 장애에서 발생하며 더 이상 3,4,5를 최적으로 수행하지 않는 회로를 초래합니다. 시냅스 밀도를 복원하는 것은 이러한 장애에 대한 잠재적 인 치료법의 효능의 기초가 될 가능성이 큽니다. 예를 들어, 시냅스의 증가가 빠른 항우울제6의 행동 효능의 기초가 된다는 것이 최근에 입증되었다. 가능한 시냅스 병리학 치료를 신속하게 스크리닝하기 위해 연구자들은 시냅스 수의 변화를 신속하게 식별하는 기술이 필요합니다.
현재의 방법론은 시간이 많이 걸리고 비용이 많이 들거나 (전자 현미경, 배열 단층 촬영), 시냅스 전 결합 (척추 분석, 면역 형광 / 공국소화)을 통합하지 않고 시냅스 후 변화 만 검사합니다. DiI와 같은 염료 또는 GFP와 같은 형광 단백질은 뉴런을 시각화하고 시냅스 후 척추를 특성화하는 데 도움이됩니다. 그러나 척추 분석은 연구자가 정의한 비율을 사용하여 형태학을 결정하며, 이는 재현성을 감소시킬 수 있습니다7. 또한, 상이한 척추 클래스가 기능적 시냅스와 어떻게 관련되는지는 여전히 밝혀지고 있다8. 척추 형성은 일시적일 수 있고 시냅스 후 가소성을 반영할 수 있지만, 이러한 척추는 시냅스 전 뉴런(9)을 갖는 시냅스로 안정화되기 전에 제거될 수 있다.
공국소화는 시냅스 전 및 시냅스 후 단백질에 대한 면역염색을 할 수 있기 때문에 척추 분석보다 시냅스에 대한 더 나은 프록시를 제공합니다. 그러나, 시냅스 단백질은 단백질이 병치되어 있고 일관되게 겹치지 않을 수 있기 때문에 낮은 공동국소화 값을 산출할 수 있다. 따라서, 단백질이 완전히 중첩되지 않기 때문에, 공동국재화 기술은 이러한 누락된 정보로 인한 시냅스 형성의 변화를 정확하게 측정하지 못할 수 있다. 마지막으로, 전자 현미경 (EM)과 어레이 단층 촬영 모두 시냅스의 고해상도 이미지를 제공하지만 시간이 많이 걸립니다. EM은 또한 전문 장비를 필요로하며, 연구원은 주어진 실험을 위해 소량의 조직으로 제한됩니다. 배열 단층 촬영은 초박형 절편에서 많은 단백질을 선별 할 수있는 기능을 우아하게 제공하고 EM10과 결합 할 수 있지만,이 기술은 너무 노동 집약적이며 시냅스 형성의 변화를 신속하게 스캔해야하는 실험 범위를 벗어날 수 있습니다.
DetectSyn은 Duolink 근접 결찰 분석의 특정 응용 프로그램입니다. PLA 분석은 단백질-단백질 상호작용의 일반적인 검출을 허용한다. DetectSyn 브릿지는 서로 40 nm 내에서 태그가 지정된 시냅스 전 및 시냅스 후 단백질에 의해 방출되는 형광 신호를 증폭하여 시냅스 후 측정을 브릿지합니다. 시냅스 단백질이 시냅스 구개열 내에서와 같이 40nm 이내에있는 경우, DNA 프로브를 포함하는 보조 항체는 원형 DNA로 혼성화됩니다. 이 혼성화된 원형 DNA는 형광 프로브를 발현하고, 이 프로브는 표준 형광 현미경 기술로 증폭 및 검출된다( 그림 1 참조). 결정적으로, EM 및 어레이 단층 촬영과는 달리,이 기술은 전문 장비를 필요로하지 않으며 표준 면역 조직 화학과 거의 동일한 시간이 걸립니다. 따라서이 기술의 접근성은 연구 집약적 인 기관 외부의 조사관이 시냅토 병리학 연구에 참여할 수있게합니다. 또한,이 기술은 단일 실험 내에서 여러 뇌 영역에서 시냅스 밀도의 변화를 조사 할 수 있으며, 질병 또는 치료로 인한 시냅스 변화의보다 전체적인 표현을 제공합니다.
동물로부터 세포 및 조직을 분리하는 것은 실험실 동물의 관리 및 사용을위한 국립 보건원 가이드에 따라 이루어졌으며 웨이크 포레스트 기관 동물 관리 및 사용위원회의 승인을 받았습니다.
참고: 이 프로토콜은 특정 실험 패러다임 및 요구 사항에 따라 이미 처리되고 고정된 샘플에 사용됩니다. 시연 목적을 위해, 신속한 항우울제 처리로 인한 시냅스 형성이 시냅스 검출 기술6을 강조하기 위해 사용된다. 이전에 커버슬립 상에서 배양되고, 처리되고, 4% 파라포름알데히드(PFA)에 고정되고, 1x 포스페이트 완충 식염수(PBS)에 저장된 뉴런은 시험관내 절차를 강조하기 위해 사용될 것이다. 이전에 처리된 마우스로부터 해마 조직(25 μm 두께)을 슬라이스하고, 얼음처럼 차가운 PBS 및 4% PFA로 경심 관류시킨 다음, 동결보호제에 저장하여 슬라이스 절차를 강조하는데 사용될 것이다. 뉴런을 배양하거나 설치류를 심폐 관류하는 방법에 대한 자세한 내용은 11,12를 참조하십시오. 이 절차의 그래픽 표현은 그림 1을 참조하십시오.

그림 1: DetectSyn 분석의 그래픽 표현. 세포막을 투과시킨 후, Synapsin1 및 PSD95에 대한 1차 항체는 이들 시냅스 단백질에 결합한다. 올리고뉴클레오티드 태그를 갖는 보조는 이어서 일차 항체에 결합한다. Synapsin1 및 PSD95가 시냅스에서와 같이 40nm 내에 있으면 올리고뉴클레오티드가 상호 작용하고 형광 태그가 증폭됩니다. 이 형광 신호는 표준 현미경을 통해 이미징되고 분석 될 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
1. 샘플 헹굼
2. 샘플을 차단하고 투과시킵니다.
3. 일차 항체에서 샘플을 인큐베이션한다.
4. 샘플을 세척한 다음, 이차 항체에서 배양한다.
5. 결찰
6. 증폭
7. 장착
8. 공초점 현미경으로 디지털 이미지 얻기
9. 분석
Heaney et al.6에서 수정 된 데이터는 증가 된 시냅스 형성이 예상되는 실험을 입증하기 위해 제시됩니다 (메커니즘에 대한 자세한 정보와 심층적 인 논의는 6 참조). 이전에, 신속한 항우울제가 효과적인 대사성 수용체인 GABAB(감마아미노부티르산 서브타입 B)의 활성화를 필요로 한다는 것이 입증되었다(13). 또한, 이전의 데이터는 신속한 항우울제가 시냅스 후 마커14를 증가시킨다는 것을 나타냈다; 따라서 DetectSyn은 신속한 항우울제가 시냅스 수를 증가시켜 효과적이라는 가설을 테스트하는 데 사용되었습니다.
배양된 뉴런에서, 네 가지 조건이 시험된다. 먼저, 도 2A의 상단 패널에서, 배양된 뉴런은 실험 대조군과 동일한 조건하에서 비히클로 처리되었다. 그러나, PSD95 일차 항체는 DetectSyn 분석법에 대한 기술적 대조군을 제공하기 위해 생략된다 (각 성분이 신호에 어떻게 기여하는지에 대해서는 도 1 참조). 다음으로, 제어판에서 뉴런은 다시 비히클로 치료되지만 PSD95 및 Synapsin1 프라이머리를 모두 받습니다. 다음으로, 배양된 뉴런은 신속항우울제 Ro-25-6981(Ro) 또는 Ro 플러스 GABAB 작용제인 바클로펜(Bac)만을 처리한다. 앞서 도13에 입증된 바와 같이, 신속한 항우울제 Ro-25-6981 및 GABAB 작용제 바클로펜 둘 모두는 Ro-25-6981의 시험관내 효능을 위해 요구된다. 따라서, 시냅스 형성의 증가는 백색 천자의 증가에 의해 입증된다 (도 2A). 바클로펜이 없으면 시험관 내에서 시냅스 형성의 증가가 보이지 않습니다.
생체내에서, 기저 GABA 수준은 신속한 항우울제(13)가 작동하기에 충분하므로, 신속한 항우울제 Ro-25-6981만이 마우스에 복강내 주사를 통해 투여된다(도 2B). 도 2B의 왼쪽 패널은 DetectSyn 분석에 대한 또 다른 기술적 대조군을 나타낸다. 식염수-처리된 마우스로부터의 해마 조직은 PSD95 및 Synapsin1에 대한 원발성 둘 다로 프로브되었지만, 이차 중 하나는 생략되었다. 식염수 처리된 마우스에 비해 신속한 항우울제 Ro-25-6981을 사용한 처리로 인한 시냅스 형성의 증가는 도 2B의 중간 및 오른쪽 패널에서 입증된다.
시험관내 및 생체외에서의 기술적 제어를 위한 대표적인 이미지가 도시된다. 도 2A에서, 시냅스 쌍에 대한 원색 중 하나는 생략되고(즉, PSD95), 도 2B에서, 이차 중 하나는 생략된다. 일부 누점은 기술 제어 이미지에 나타나지만, 다른 패널의 큰 누점과 비교하여 그림 2A의 상단 패널에서 흰색 얼룩에 의해 입증 된 것처럼 일반적으로 동일한 크기는 아닙니다. 또한, 이들 펑타는 도 2B의 기술 제어의 소마 내에 나타나는 일부 펑타에 의해 입증된 바와 같이 정량화된 펑타와 동일한 위치에 있지 않다. 전형적으로, 비특이적 펑타는 핵 내에서 발생하며, 아마도 DNA의 존재로 인해 발생합니다.
도 2A의 대표적인 결과를 분석하기 위해, 수상 돌기(MAP2 염색에 의해 시각화되고 여기에서 회색 윤곽선으로 표시됨)를 자유형 드로잉 도구를 사용하여 관심 영역(ROIs)을 생성하였다. 먼저, MAP2 ROI의 면적은 자동화된 측정 결과 탭 아래의 NIS Elements 기능, ROI 데이터를 사용하여 구하였다. 다음으로, NIS 엘리먼트에서 임계화 함수를 사용하여 누점을 검출하였다. 이 함수는 정의된 강도 임계값 내에 속하는 개체의 이진 마스크를 만듭니다. 그런 다음 MAP2 ROI 내의 이진 개체 수를 자동 측정 결과 탭 아래의 NIS 요소 함수인 ROI의 이진을 사용하여 감지했습니다. 도 2A의 오른쪽에 있는 그래프에 제시된 데이터는 ROI의 영역으로 나눈 누점의 정규화된 값들이다.
도 2B의 대표적인 결과를 분석하기 위해, CA1의 지층 반경을 자유형 드로잉 도구를 사용하여 ROI를 생성하여 추적하였다. 먼저, ROI의 영역은 위의 단락에서 설명한 바와 같이 ROI 데이터 기능을 사용하여 구하였다. 다음으로, 누점은 이진 메뉴 아래에 있는 스팟 감지 - 밝은 스팟 기능을 사용하여 검출되었습니다. 다음으로, 직경 및 명암비는 모든 처리로부터 다수의 슬라이스의 육안 검사에 기초하여 선택되었다. 이러한 값이 결정되면 분석된 모든 이미지에 균일하게 적용되었습니다. 스폿 감지 함수는 정의된 지름 및 대비 매개변수 세트 내에서 오브젝트의 이진 마스크를 생성합니다. 그런 다음 MAP2 ROI 내의 이진 개체 수를 자동 측정 결과 탭 아래의 NIS 요소 함수인 ROI의 이진을 사용하여 감지했습니다. 도 2B의 오른쪽에 있는 그래프에 제시된 데이터는 누점의 정규화된 값을 ROI의 영역으로 나눈 값들이다.

그림 2: DetectSyn 분석을 사용한 시냅스 검출. 백색 천자는 (A) 시험관내 배양된 1차 해마 뉴런 및 (B) 생체외 CA1 지층 반경에서 DetectSyn PSD95-Synapsin1 근접 결찰 분석(황색 화살촉)으로 검출된 시냅스를 나타낸다. (A)에서, 회색 윤곽선은 MAP2 염색을 나타낸다. (A)에서, PLA 대조군으로 표지된 상부 패널은 대조군과 같은 비히클만으로 처리된 샘플을 나타낸다. 그러나, PSD95 일차는 반응에 포함되지 않았다. 마지막 두 패널에서, 뉴런을 90분 동안 신속한 항우울제 Ro-25-6981 (Ro, 10 μM) 또는 Ro 플러스 GABAB 작용제 바클로펜 (Bac, 50 μM)으로 처리하였다. 증가된 누점 수(노란색 화살촉으로 확인됨)는 시험관 내에서, 신속한 항우울제 Ro-25-6981이 GABAB 작용제와 함께 투여될 때만 시냅스 형성이 증가한다는 것을 나타낸다. (B)에서, 녹색은 MAP2로 염색된 수상돌기를 나타내고, 파란색은 DAPI로 염색된 핵을 나타낸다. 병합 된 이미지에서 노란색 사각형으로 윤곽이 그려진 단일 덴드리트는 누점이 덴드라이트로 현지화된다는 것을 보여주기 위해 대표적인 이미지 아래에 격리됩니다. 동물을 Ro-25-6981 (10 mg/kg)로 처리하였고, 치료 45분 후에 조직을 수집하였다. 누점의 증가된 수(노란색 화살촉으로 확인됨)는 생체내에서 기저 GABA 신호전달 및 신속한 항우울제 Ro-25-6981에 따라 시냅스의 수가 증가한다는 것을 나타낸다. 대표적인 결과의 정량화는 막대 그래프로 표시되며 MAP2 영역으로 나눈 DetectSyn puncta의 평균 수를 나타냅니다. 결과는 실험 대조군으로 정규화된다. 이미지는 니콘 A1plus 공초점 현미경을 사용하여 수득하였다. 스케일 바 = (A) 10 μm; (B, 상단) 50 μm; (B, 바닥) 5 μm. 막대는 평균의 평균 +/- 표준 오차를 나타냅니다. 단방향 ANOVA에 의해 분석된 결과: *p < 0.05, **p < 0.01, *** p < 0.001, **** p < 0.0001 사후 분석에 의해. 이 그림은 Heaney et al.6에서 수정되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 이해 상충을보고하지 않습니다.
DetectSyn은 치료 또는 질병 상태에 걸친 상대적 시냅스 (시냅스 전 및 시냅스 후 참여) 수의 변화를 측정하는 편향되지 않은 신속한 형광 분석법입니다. 이 기술은 배양된 뉴런 및 고정 조직 모두에서 사용될 수 있는 근접 라이게이션 기술을 이용한다.
이 연구는 국립 보건원 NINDS R01 NS105005 (KRG) 및 NS105005-03S1 (KRG), 국방부 USAMRMC W81XWH-14-1-0061 (KRG), NIAAA R01AA016852, NIAAA T32AA007565 (CFH), FRAXA 연구 (CFH) 및 알츠하이머 협회 AARG-NTF-21-852843 (KRG), AARF-19-614794-RAPID (KRG)의 보조금을 지원했습니다.
| 10x PBS | Fisher Scientific | BP39920 | PBS는 집에서 제작했습니다. |
| 24웰 플레이트 | Fisher Scientific | FB012929 | 조직 슬라이스의 경우 사전 멸균된 플레이트가 필요하지 않을 수 있습니다. |
| 50mL 원뿔형 튜브 | Fisher Scientific | 14-432-22 | |
| 알루미늄 호일 | Fisher Scientific | 15-078-290 | |
| 닭 항 MAP2 항체 | Abcam | ab5392 | |
| 투명 매니큐어 | Fisher Scientific | NC1849418 | 기타 투명 매니큐어도 작동합니다. |
| 콜드 블록 | 피셔 사이언티픽 | 13131012 | |
| 컴퓨터 워크 스테이션 | HP | ||
| 컨 포칼 또는 형광 현미경 | 니콘 | A1R HD25 | |
| 당나귀 안티 치킨 FITC | 피셔 사이언티픽 | SA1-72000 | |
| 듀오 링크 당나귀 안티 마우스 플러스 | 시그마 | DUO92001 | |
| 듀오 링크 당나귀 안티 래빗 마이너스 | Sigma | DUO92005 | |
| Duolink 현장 검출 시약 원적외선 | Sigma | DUO92013 | 에는결찰 스톡, 증폭 스톡, 리가아제 및 중합효소가 포함되어 있습니다. |
| Sigma | DUO82040 | Duolink 현장 세척 버퍼가 | 있는 Duolink In Situ |
| 장착 매체, 형광 | 시그마 | DUO82049 | 에는세척 버퍼 A와 세척 버퍼 B가 포함되어 있습니다. 세척 버퍼 B를 diH20에서 1%로 희석하여 1% 세척 버퍼 B를 만듭니다. |
| 끝이 가는 붓 | Fisher Scientific | NC9691026 | 세이블 헤어, 크기 00 또는 000은 공예품 상점에서도 찾을 수 있습니다 |
| Fisherbrand Cover Glasses: | Rectangles Fisher Scientific | 12545MP | 커버 유리는 이미 유리 커버 슬립에 있는 배양 뉴런에는 필요하지 않습니다. |
| Fisherbrand Superfrost Plus 현미경 슬라이드 | Fisher Scientific | 1255015 | 이미 유리 커버슬립에 있는 배양된 뉴런의 경우 Superfrost 슬라이드가 필요하지 않을 수 있습니다. |
| 냉동고, -20° C | VWR | 76449-108 | |
| 유리 커버 슬립 | Fisher Scientific | 125480 | |
| 글리신 | Fisher Scientific | BP381-1 | |
| 이미지 처리 소프트웨어 | (예: NIS 요소, ImageJ | ||
| 인큐베이터 | Fisher Scientific | 15-015-2633 | |
| 대형 페트리 접시, 100mm | Fisher Scientific | FB0875712 | |
| 분자 등급 물 | Fisher Scientific | BP24701 | |
| Mouse anti-Synapsin1 항체 | Synaptic Systems | 106-011 | |
| Normal donkey serum | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 | |
| Orbital shaker | Fisher Scientific | 02-106-1013 | |
| Parafilm | Fisher Scientific | 13-374-10 | |
| 피펫 팁 | Fisher Scientific | 02-707-025 | |
| 피펫 | Fisher Scientific | 14-388-100 | 작업량 범위는 3 & 마이크로입니다. L에서 500 & 마이크로; L |
| 플라스틱 파스퇴르 피펫 | Fisher Scientific | 02-708-006 | |
| 정밀 핀셋/포셉스 | Fisher Scientific | 12-000-122 | |
| Rabbit anti-PSD95 항체 | Abcam | ab18258 | 다른 항체 쌍도 최적화와 함께 작동할 수 있습니다. |
| 냉장고 | VWR | 76470-402 | |
| 소형 페트리 접시, 60mm | Fisher Scientific | FB0875713A | |
| 타이머 | Fisher Scientific | 14-649-17 | |
| 트윈 20 | Fisher Scientific | BP337-100 |