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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
본 프로토콜은 Arduino 및 관련 하드웨어를 사용하여 설치류 동물 모델을위한 오픈 소스 5 선택 직렬 반응 시간 작업 도구 상자와 자동화 된 행동 훈련을위한 선택적 스크립트를 포함한 다목적 Matlab 도구 상자의 개발을 설명합니다. 스크립트는 사용자 정의 할 수 있으며 다양한 시험 및 테스트 설계의 구현을 용이하게합니다.
5-choice 연속 반응 시간 작업 (5-CSRTT)은 설치류의 점성 공간적 관심과 충동성을 연구하는 데 자주 사용되는 행동 테스트입니다. 이 작업은 동물들이 광원이 장착 된 다섯 개의 작은 조리개 수평 배열에주의를 기울여야하며, 제한된 시간 내에 하나의 조명 된 대상 조리개를 코를 찌르고 챔버의 반대쪽 벽에있는 음식 잡지에서 음식 보상을 받아야합니다. 이 과제는 반응 정확도 및 반응 시간과 같은 행동 통제 조치를 고려하고 선택적인주의와 충동을 추론 할 수있게합니다. 작업 난이도는 일반적으로 자극 지속 시간 및 작업 설계를 수정하여 제어 할 수 있습니다. 상업적으로 이용 가능한 장치는 일반적으로 작업 매개 변수를 지정하는 실험 챔버 및 특정 소프트웨어로 구성되지만 고정 된 하드 및 소프트웨어로 인해 일반적인 실험 설계 및 특정 작업 요구 사항 및 관련 데이터 출력의 변경에 많은 제한을 제기합니다. 이 문서에서는 사용하기 쉬운 단일 보드 마이크로 컨트롤러 및 표준 전기 기술 구성 요소, 오픈 액세스 Arduino 스크립트 및 하드웨어 제어 및 동작 작업 사양을 위한 Matlab-toolbox를 기반으로 하는 완전히 사용자 지정 가능한 대안에 대해 설명합니다. 도구 상자에는 선택적 계단 절차가 포함되어 있어 자동화된 행동 교육을 수행할 수 있습니다. 맞춤형 챔버에 설치할 수 있는 완벽한 하드웨어 설정과 자유롭게 적응할 수 있는 소프트웨어는 표준화되지 않은 작업과 챔버 설계를 장려합니다. 시스템 설계와 하드웨어 제어 및 실험 설정을 위한 오픈 소스 코드에 대해 설명합니다.
5-CSRTT는 행동적 테스트로, 설치류에서 시각적 주의력 과정과 충동성 1,2,3,4,5,6을 연구하기 위해 종종 사용되는데, 예를 들어 주의력에서 콜린성 시스템의 역할과 충동적인 행동에 대한 노르에피네프린 재흡수 억제제의 영향을 결정하는 것과 같은7 . 표준 장치는 반응 정확도, 반응 시간, 충동 및 강박 행동, 운동 능력 및 동기 부여 1,2,3,4,5와 같은 다양한 제어 조치를 관찰 할 수있게합니다. LED가 장착 된 5 개의 조리개, 조리개를 반대하는 챔버 벽의 음식 잡지 및 집 조명 2,5로 구성된 수평 배열로 구성됩니다. 일반적인 작업에서는 집 조명이 켜지고 세션의 시작은 무료 펠릿이 배달되는 음식 잡지의 조명으로 표시됩니다. 시험 과정은 동물이 펠릿1을 회수하기 위해 잡지를 코를 찌를 때 시작됩니다. 그 후, 음식 잡지 조명이 꺼지고 시험 간 간격 (ITI)이 시작되며, 그 동안 동물은 조리개쪽으로 관심을 기울여야합니다. ITI가 경과하면, 조리개 1,2,5 중 하나에 자극 조명이 표시됩니다. 자극은 자극 지속기간(StD)으로 알려진 특정 길이에 대해 주어진다. 동물은 자극이 제시되는 동안 또는 StD가 끝난 후 제한된 시간 창 동안 자극에 반응 할 수 있습니다 (LH)로 알려져 있습니다. 이에 대응하기 위해 동물은 목표 조리개를 코로 찌르고, 올바르게 수행되면 음식 잡지 1,2,5에 보상이 발표됩니다. 그렇지 않으면 잘못된 응답뿐만 아니라 자극 프레젠테이션 전의 응답(예상 또는 조기) 또는 응답 실패(누락)로 인해 시간 초과(TO)가 발생하며, 이 동안 집 조명이 특정 기간 동안 꺼지는 동안 1,2,5가 꺼집니다(그림 1). 일반적으로 차별적 자극 정확도는 주의력 기능을 측정하는 반면, 조기 및 인내 반응(자극 발표 후 조리개에서 반복되는 반응)은 충동 행동과 강박성의 척도로 각각 1,4,5,6으로 간주됩니다.

그림 1: 전형적인 5-CSRTT의 가능한 시험 서열. 심방 간 간격 이후, 자극 표시등이 특정 기간 동안 켜진 다음 제한된 보류 간격 동안 꺼집니다. 쥐는 올바르게 대답하고 보상을받을 수 있거나 잘못 대답하고이 시간 동안 시간 초과를 얻을 수 있습니다. 쥐가 제 시간에 대답하지 않으면 누락으로 인해 시간 초과가 발생합니다. 마찬가지로, 광 자극을 나타내기 전에 반응하면 조기 응답으로 인해 시간 초과가 발생합니다. 또 다른 평가판은 보상 수집 또는 시간 초과 기간이 끝난 후에 시작됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
5-CSRTT는 유연성 때문에 널리 사용됩니다 : 시험 설계의 매개 변수를 변경하여 다양한 하위 범주의주의를 조사 할 수 있습니다. 예를 들어, 동물이 다섯 개의 상이한 개구들(visuospatial attention)에 걸쳐 그의 주의를 분할하도록 되어 있는 반면, 무관한 자극(예를 들어, 청각 자극)의 사용은 선택적이거나 지속적인 주의력(1,2,5,6)의 시험을 가능하게 한다. 이를 위해, 실험 설정은 스피커를 포함함으로써 확장 될 수 있으며, 이는 자극 1,2,5,6을 산만하게하거나 심지어 강화시키는 데 사용될 수 있습니다. 더욱이, 주의력 부하는, 자극 프리젠테이션을 변경하거나 ITI 지속기간(10)을 랜덤화함으로써 직접적으로 변조될 수 있다. 5-CSRTT는 설치류3,7뿐만 아니라 최근 인간이 아닌 영장류 1,7,8과 물고기 7,9를 테스트하기 위해 적용되어 그 타당성을 더욱 보여줍니다. 완전히 사용자 정의 할 수있는 5-CSRTT 도구 상자를 사용하면 표준 설치류 패러다임을 다른 동물 모델에 쉽게 적용 할 수 있습니다. 또한 5-CSRTT 도구 상자의 사용자 정의 유연성은 비표준 작업 설계를 사용한 연구를 장려합니다.
여기에 제시된 완전히 사용자 정의 가능한 5-CSRTT 도구 상자에는 통합 개발 환경에서 프로그래밍된 하드웨어 제어를 위한 Arduino 스크립트가 포함되어 있습니다. 또한 실험 제어를 위한 Matlab 도구 상자(버전 R2019b 이하)로 구성됩니다. 다음 프로토콜은 널리 사용되는 표준 패러다임으로 5-CSRTT 도구 상자를 구성하는 방법을 설명하고 비표준 패러다임에 대한 선택적 구성을 보여 줍니다.
이 프로토콜의 실험 절차는 실험 동물 복지에 대한 EU 지침 2010/63의 권고에 따라 독일 연방 정부가 발행 한 동물 복지법에 따라 수행되었으며 지방 당국의 승인을 받았습니다. 이 연구는 행동 훈련 만 필요로했기 때문에 동물을 안락사시키지 않았으며 연구가 수행 된 후 모두 축산장에 보관되었습니다. 이 연구는 열 마리의 수컷 리스터 후드 쥐 (행동 훈련 시작시 생후 4 개월)를 사용하여 수행되었습니다.
1. 축산업, 축산 및 취급
2. 하드웨어 및 제어 소프트웨어 준비
3. 실험 제어 소프트웨어의 제조
4. 5-CSRTT 도구 상자에 사용되는 매개변수 구성
5. 행동 실험

도 2: 현재 연구에 사용된 5-CSRTT 장치. 이 장치는 5-CSRTT 도구 상자가 장착된 노트북에서 실행되며, 마이크로 컨트롤러 및 모든 관련 장비를 제어하기 위한 스크립트와 5-CSRTT 실험을 제어하기 위한 여러 스크립트를 제공합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
완전히 사용자 정의 할 수있는 툴 박스는 사용하기 쉽고 단일 보드 마이크로 컨트롤러 및 표준 전기 기술 구성 요소를 기반으로합니다. 그림 3은 단순화된 회로 및 배선도를 보여줍니다. 전체 조리개는 빛 자극으로 5 개의 LED와 코 찌름을 감지하는 5 개의 적외선 센서로 구성됩니다. 집 조명은 여덟 개의 LED가있는 하나의 스트립으로 구성되며 식품 잡지는 마이크로 스위치가있는 플랩 도어, 모터 구동 펠릿 디스펜서 및 조명을위한 여덟 개의 LED가있는 스트립이있는 조리개로 만들어집니다. 이 회로는 또한 청각 피드백을 위한 수동 부저 스피커 및 볼륨 조정을 위한 디지털 전위차계와 같은 선택적 구성 요소에 대한 연결을 예시합니다. 이 도구 상자 개발에 사용된 장비 목록은 재료 표를 참조하십시오.

그림 3: 마이크로 컨트롤러 하드웨어의 간소화된 회로. 쉽고 빠르게 사용자 정의 할 수 있도록 마이크로 컨트롤러 장비는 브레드 보드를 통해 연결됩니다. 왼쪽 위에서 왼쪽 아래로, 시계 방향: 마이크로 컨트롤러 보드가 모터 실드와 DC 모터(펠릿 디스펜서 모터를 나타냄)에 연결됩니다. 오른쪽에는 집과 음식 잡지 조명을위한 LED 스트립이 있으며, 중간에는 자극 광을위한 다섯 개의 흰색 LED와 조리개에 사용되는 다섯 개의 적외선 센서 쌍이 모두 있습니다. 마이크로 컨트롤러 보드 아래에는 간단한 마이크로 스위치 (식품 잡지 플랩 도어에 사용 된 스위치를 나타냄)가 있습니다. 마지막으로, 패시브 부저 스피커와 디지털 포텐쇼미터가 중간에 묘사됩니다. 이 이미지는 오픈 소스 소프트웨어 Fritzing을 사용하여 만들어졌습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4: 실험 제어 스크립트의 모든 구성 요소의 연결 및 함수와 "코드" 함수의 단순화된 다이어그램. (A) "User" 스크립트는 매개 변수를 "Code" 함수로 보내고, 이 함수는 "Staircase" 함수에 직접 연결되므로 실험이 진행되는 동안 "Code" 함수에 사용되는 모든 매개 변수를 업데이트할 수 있습니다. 그런 다음 "Code" 함수는 세션이 끝날 때 결과를 "DataProc" 함수로 보냅니다. (B) 실험 세션을 시작하기 전에 "코드" 함수는 먼저 습관화 프로토콜을 시작해야 하는지 여부를 확인합니다. 그렇지 않은 경우 "User" 스크립트에서 선택한 정의를 기반으로 매개 변수를 설정합니다. 각 평가판이 시작되기 전에 함수는 키보드의 ESC 키를 눌렀는지 여부를 확인합니다. 그렇지 않은 경우 새 평가판으로 계속됩니다. 그렇지 않으면 실험 세션을 중지하고 수집된 데이터를 DataProc 함수로 전달합니다. 각 평가판 시작 전에 이 중요한 검사를 통해 선택한 시간 제한에 도달하기 전에 프로그램을 중지할 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
상이한 실험 제어 스크립트 사이의 상호작용은 도 4A에서 볼 수 있다. "User" 스크립트에는 실험을 정의하는 모든 매개 변수가 포함됩니다. 거기에서, 실험의 타이밍, 조명 자극의 수 및 밝기, ITI 지속 시간 등을 결정하는 변수들이 자유롭게 선택될 수 있다. Code 함수(보충 파일 5)에는 단일 시험과 모든 가능한 결과에 대한 자세한 설명이 포함되어 있으며, 이는 그림 4B와 같이 실험 전반에 걸쳐 반복됩니다. 또한, 그것은 장치에 동물의 습관화를위한 프로토콜로 구성됩니다. Code 함수는 또한 정기적으로 동물의 성능을 확인합니다. 또한 계단 기능은 선택 사항입니다. 피험자의 수행은 이전에 설정된 기준과 비교되며, 동물의 성능이 이러한 기준을 충족하면 원하는 매개 변수가 자동으로 업데이트됩니다. 계단 기능은 또한 전날의 세션에서 획득 한 결과를 고려할 수 있습니다. 실험이 실행되는 동안 평가판이 끝날 때 성능 검사는 정확도, 누락 및 완료된 시험의 총 정답 수를 계산하고 계단 함수에 지정된 대로 레벨 업데이트에 대해 원하는 기준과 결과를 비교합니다. 마지막으로 DataProc 함수는 수집된 모든 데이터를 처리하고 빠른 분석을 위해 간단한 그래프를 생성합니다. 세션이 끝나면 도구 상자는 모든 데이터를 *.mat 파일에 자동으로 저장하고 실험의 필수 정보가 포함된 추가 *.xlsx 파일을 생성합니다.

그림 5: 5-CSRTT 도구 상자의 다양한 자극 구성의 예. 다이어그램은 선택된 구성에 의존하여 표적 자극의 가능한 조합을 예시한다. "모든"구성과 "단일"구성 모두 표준 패러다임 (습관화 및 행동 실험)에 사용됩니다. "이웃" 및 "이동된" 구성은 비표준 자극 구성을 보여주며, 다른 수의 조명 자극을 사용할 수 있게 하며, 이는 또한 목표 자극과 다른 대조를 가질 수 있다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
프로토콜 단계 4.2.7.7에서는 선택적 기능인 대상 조리개 그룹화 변경을 언급합니다. 표준 5-CSRTT 패러다임은 하나의 단일 표적 자극을 이용한다. 여기에서는 제시된 도구 상자가 표준 패러다임을 수정할 수있는 방법을 보여줍니다. 그림 5는 선택한 구성과 관련된 총 5개의 조리개 중 몇 가지 가능한 그룹 조합을 보여 줍니다. "모든" 구성은 사용 가능한 모든 조리개를 점등하여 각 조리개가 이제 대상 조리개가 되도록 하여 초기 훈련 단계에서 도움이 될 수 있습니다. 이웃 구성은 (자유롭게 선택된) 수의 대상 조리개가 서로 인접하도록 합니다. 이웃이 대상 조리개와 동일하지 않고 더 낮은(또는 더 높은) 대비로 조명되도록 설정을 지정할 수 있습니다. 조명 대비가 다른 조리개를 사용하면 고대비 또는 저대비 조리개에서 코 찌르기에 대해 다르게 등급이 매겨진 보상을 사용하는 것과 같은 새로운 패러다임을 테스트 할 수 있습니다. 그림 5는 동일한 조명을 가진 세 개의 대상 조리개가 있는 예를 보여 줍니다. 단일 구성은 일반적으로 단일 타겟만 조명되는 표준 5-CSRTT에서 사용됩니다. 마지막으로 이동된 구성은 인접 구성을 확장합니다. 대상 조리개가 각각 첫 번째 또는 마지막 위치에 있는 경우 이웃 자극을 마지막 또는 첫 번째 조리개 쪽으로 이동합니다. 이웃 구성에서와 같이, 이웃들의 조명 강도는 타겟 개구와 동일하거나 상이한 자유롭게 선택될 수 있다. 또한, 전체 조명 자극의 수는 자유롭게 선택할 수 있습니다. 그런 다음 도구 상자는 가능한 모든 자극을 자동으로 계산합니다. 그러나 이 구성의 경우 매개 변수 "Config.LED.NumHighLED"를 "1"로 설정해야 합니다.
프로토콜에 이어서, 5-CSRTT에 대한 래트 (N=10)의 훈련은 표 1에 제시된 훈련 단계에 따라 수행되었다.
표 1: 5-CSRTT 훈련 일정 및 다음 단계로 이동하기 위한 기준. (A) 시험 간 간격은 모든 훈련 레벨에서 5초로 일정하게 유지되었다. (B) 모든 훈련 수준에 대한 자극 기간. (C) 제한된 홀드 (LH) 시간 창, 자극 꺼짐과 코 찌르기 반응 사이에 허용되는 최대 시간. (D) 각 교육 수준을 통과하는 데 필요한 총 정답 수. (E) 정확도 백분율은 로
계산된다. (F) 누락 오류의 백분율은 로
정의됩니다. 이 기준에는 조기 응답이 포함되지 않습니다. 이 테이블을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
래트의 성능을 표 1에 주어진 각 훈련 수준을 완료하는데 필요한 훈련 일수(세션)의 수와 비교하였다. 모든 동물들은 각각 60초의 StD와 LH로 훈련 레벨 1에서 시작했다. 그러나, 일부 래트(N=5)는 이전에 보고된 추가적인 자극 옵션 중 일부를 테스트하기 위해 향상된 습관화 훈련을 받았으며, 이는 개별 동물이 훈련 레벨 1에 머물렀던 세션 수의 차이를 설명한다. 레벨의 완료는 총 30 개 이상의 정확한 응답에 도달하여 표시되었습니다. StD와 LH는 다음 레벨에서 감소한 반면, 다음 교육 레벨로 발전하기 위한 기준은 더욱 엄격해졌고, 과제 1,6의 주의 요구가 증가하였다.
표 2는 한 세션 동안 한 예의 쥐의 자동으로 생성된 *.xlsx 스프레드시트를 보여준다. 쥐는 훈련 수준 5에 지정된 구성으로 시작했습니다. 네 번의 시험 후, 쥐는 현재 세션에서 수행 된 시험과 이전 세션에서 달성 된 정확성을 고려하여 레벨 6으로 나아갔습니다. 다음 교육 수준으로 진행하기 위해 현재 세션에서 최소 몇 번의 시험을 수행해야 하는지는 "Config.Experiment.MinNumTrials" 변수에 명시되어 있습니다. 같은 세션에서 쥐는 레벨 6에서 66 건의 시험을 완료하고 80 %의 정확도와 > 20 %의 누락의 요구 사항을 달성 한 후 훈련 레벨 7< 진행했습니다. 전체적으로, 래트는 표 1에 제공된 바와 같은 훈련 수준의 구성을 사용하여 26일 동안 훈련되었다. 훈련 레벨당 소비된 세션의 수는 도 6A에 제공된다. 검은 선은 모든 피험자의 평균을 보여 주며 각 색의 선은 한 마리의 쥐의 데이터를 표시합니다. 모든 래트는 14-22 세션 내에 여덟 번째 수준에 도달했다 (그림 6B). 도 6C 는 5-CSRTT 장치에서의 훈련 수준 및 모든 훈련 일수에 걸친 피험자의 평균 성과를 나타낸다. 파선 검정 선은 정확도 백분율을 나타내고 직선 검정 선은 누락 백분율을 나타냅니다. 정확도는 정답 수와 총 응답 수 사이의 비율로 계산되었습니다. 누락은 누락 횟수와 총 시행 횟수 사이의 비율 (즉, 올바른 응답, 잘못된 응답 및 누락의 합)으로 계산되었습니다. 회색 선은 각 레벨의 모든 시험에서 평균 총 정정 응답 수를 나타냅니다. 도 6D는 여덟 번째 및 최종 훈련 레벨에서 각 피험자에 의해 달성된 최종 정확도를 디스플레이한다.
평균적으로 쥐는 레벨 1을 완료하기 위해 5.9 (±1.03 SEM) 세션을 보냈고, 레벨 2에서 6까지 완료하기 위해 1.5 (±0.17)와 3.5 (±0.5) 세션 사이, 최종 레벨 8에 도달하기 전에 레벨 7을 완료하기 위해 1.7 (±0.16) 세션을 보냈습니다. 도 6A로부터 명백한 바와 같이, 피험자 간의 분산은 초기 수준(레벨 1에서 SD = 3.25, 레벨 2에서 1.58)에서 가장 유의하였고, 이후 레벨에서 감소하였다(레벨 6 및 7에서 각각 0.47 및 0.48). 수준 4에서, 자극 지속 시간이 더 감소되었을 때, 소비된 세션의 평균 수(2.6 ± 0.52)와 래트 사이의 차이(1.64)가 증가하였고, 두 마리의 쥐가 수준을 결론짓기 위해 5일과 6일이 걸렸다.

그림 6: 5-CSRTT 도구를 사용한 행동 실험의 결과 . (A) 각 훈련 수준에서 수행된 세션 수입니다. 검은 선은 각 레벨에 대한 모든 피험자의 평균 세션 수 (평균 ± SEM)를 묘사하고 컬러 라인은 개별 피험자의 데이터를 나타냅니다. (B) 과목 당 최종 수준에 도달하는 데 필요한 절대 세션 수. (C) 훈련 전반에 걸친 평균 성과 측정 (SEM± 평균). 검은 점선은 훈련 수준당 모든 세션에서 주어진 모든 응답에 대한 모든 피험자의 정확도를 나타내고, 검은 선은 해당 누락 비율을 보여줍니다. 회색 선은 각 훈련 수준에서 모든 과목의 평균 절대 정답 수를 나타냅니다. (D) 여덟 번째 및 최종 교육 수준 동안 과목 당 정확도. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
표 2: 하나의 훈련 세션 동안 한 예시적인 래트로부터 데이터를 수집하였다. A 열은 B 열에 표시된 것처럼 현재 교육 수준과 관련된 세션의 평가판 수를 표시합니다. C 열에는 ITI 기간이 표시되고 D 열에는 평가판 시작 시간이 표시됩니다. 열 E 내지 I는 개구개 1 내지 5에서 LED 자극에 대한 밝기 레벨을 각각 나타낸다. 밝기 수준이 0이면 자극이 꺼져 있음을 의미하고, 밝기 수준이 0.2이면 최대 강도의 20%로 자극이 켜졌음을 의미합니다. 열 J 및 K는 자극이 각각 켜지고 꺼진 정확한 시간을 보여준다. L 열은 시험 결과를 표시합니다 : 0은 "누락", 1은 "올바른 응답", 3은 "잘못된 응답"(비 표적 조리개로 코 찌르기)을 의미하고 4는 "조기"를 의미합니다. M 열은 시험 중에 어떤 구멍이 코를 찔렀는지 보여 주며, N 열은 코 찌르기의 정확한 시간을 묘사합니다. 컬럼 O, P 및 Q는 펠릿 디스펜서 모터가 켜진 시간, 해당 모터 번호 및 래트가 펠릿 디스펜서를 열어 보상을 얻은 시간을 각각 보여줍니다. R 열에는 평가판 종료 시간이 표시됩니다. S, T, U, V 및 W 열에는 ITI 동안 조기 응답, 시간 제한, 패널 푸시의 총 수, 인내 답변의 총 수 및 세션의 총 런타임(분)이 각각 표시됩니다. 이 테이블을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 파일 1 : IDE 소프트웨어의 하드웨어 제어를위한 스크립트 (아두 이노 코드). 여기에는 도구 상자의 하드웨어 및 전기 기술 구성 요소를 제어하는 모든 명령이 포함됩니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 파일 2 : 실험 제어 소프트웨어의 "사용자"기능에 대한 스크립트. 여기에는 실험을 정의하는 모든 매개 변수가 포함됩니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 파일 3 : 실험 제어 소프트웨어에서 "계단"기능에 대한 스크립트. 이렇게 하면 피사체의 성능이 모니터링되고 이전에 설정된 기준과 비교됩니다. 동물의 성능이 이러한 기준을 충족하는 경우 원하는 매개 변수가 자동으로 업데이트됩니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 파일 4: 실험 제어 소프트웨어에서 "DataProc" 기능에 대한 스크립트입니다. 이렇게 하면 수집된 모든 데이터를 처리하고 빠른 분석을 위해 간단한 그래프를 생성합니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
보충 파일 5 : "코드"함수에 대한 스크립트. 여기에는 단일 시험과 모든 가능한 결과에 대한 자세한 설명이 포함되며 실험 전체에서 반복됩니다. 이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
저자들은 경쟁적인 재정적 이익이 없다고 선언합니다.
본 프로토콜은 Arduino 및 관련 하드웨어를 사용하여 설치류 동물 모델을위한 오픈 소스 5 선택 직렬 반응 시간 작업 도구 상자와 자동화 된 행동 훈련을위한 선택적 스크립트를 포함한 다목적 Matlab 도구 상자의 개발을 설명합니다. 스크립트는 사용자 정의 할 수 있으며 다양한 시험 및 테스트 설계의 구현을 용이하게합니다.
이 작업은 DFG WE 5469/3-1에서 지원합니다.
| 실험실에서 이미 사용 가능한 | 1200 옴 저항기 | ||
| 8-비트 10 kΩ 디지털 포텐시미터 | Microchip | MCP42010-I/P | Conrad.de 에서: 1083205 |
| ARD MEGA2560 키트 Arduino - Mega 2560 R3 Lernset | JOY-IT | ARD-Set01 | Reichelt.de 에서: ARD MEGA2560 KIT |
| ARD SHD MOTOR 아두이노 실드 - 모터 | Adafruit | 1438 | Reichelt.de 에서: ARD SHD 모터 |
| ARDUINO 스택 가능한 헤더 키트 - R3 | Sparkfun Electronics | PRT-11417 | Antratek.de 에서: PRT-11417 |
| Chow | Altromin | 1324 N | Altromin chow 제품 |
| Euro-Gehä | Hammond Electronics | 1591EBK | 사용 Conrad.de: 520691 |
| Food pellets | Bio-Serv | F0021 | Bio-serv.com: Dustless Precision Pellets Rodent |
| Fritzing | Interaction Design Lab Potsdam | Fritzing Software 다운로드 | |
| 통합 개발 환경 | Arduino | Arduino IDE 다운로드 (무료 사용 가능) | |
| IR 브레이크 빔 센서 - 3mm LED | Adafruit | 2167 | Mouser.de 에서: 485-2167 |
| 노트북 또는 컴퓨터 | |||
| LED 흰색 라운드 5mm 2000mcd 20mA | TruComponents | 1573731 | Conrad.de 에서: 1573731 |
| 마이크로 스위치 | Hartmann | MBB1 01 A 01 C 09 A | Conrad.com 에서: 707243 |
| NeoPixel Stick - 8 WS2812 5050 RGB LED | Adafruit | 1426 | Reichelt.de 에서: DEBO LED NP8 2 |
| 패시브 부저 스피커 | Conrad Components | 93038c213a | Conrad.de 에서: 1511468 |
| 펠릿 릴리스 디스크 | 실험실에서 이미 사용 가능합니다. 아래에 묘사된 유사한 제품. 이러한 제품 중 일부는 다른(그리고 더 강한) 모터와 적외선 센서를 사용한다는 점을 명심하십시오. 마이크로 스위치(행 7)의 사용 Arduino Motor Shield(3행)는 이러한 새로운 사양에 맞게 조정해야 합니다. 제공된 재료 및 소프트웨어로 작업하려면 디스크를 3D 프린팅하는 것이 좋습니다. Carbatec 범용 베이스 플레이트 Open Science Framework Open Feeder Open Ephys 3d 모델 식품 펠릿 디스펜서 Campden Instruments 45mg 펠릿 디스펜서 | ||
| 프로그래밍 플랫폼 | Mathworks | R2019b 이하 | |
| Psychtoolbox Software | V3 | Psychtoolbox-3 다운로드 | |
| DC 브러시 모터가 있는 스퍼 GEAR-MOTOR | 마이크로모터 | B138F.12.208 | Micromotos 시리즈 B138F 기술 데이터 |