2012년 10월 19일
우리는 β-갈 락토의 활성화 표현으로 올무로 인한 막 퓨전 이벤트를 단정 지을 세포 융합 분석을 개발했습니다.
이 프로시저의 전반적인 목표는 beta galacto의 활성화된 발현을 통해 snare 매개 세포 융합 사건을 정량화하는 것입니다. 이는 먼저 cost seven 세포 표면에 v 및 t snare 단백질을 이소성으로 발현시킴으로써 수행됩니다. 프로시저의 다음 단계는 V snare 단백질을 발현하는 세포와 T snare 단백질을 발현하는 세포를 결합하는 것입니다.
이는 snare 매개 세포 융합과 beta galacto의 활성화된 발현을 유도합니다. 최종적으로, 세포 융합으로 인해 유도된 beta galacto 활성을 분광광도계를 사용하여 측정합니다. 이 기술의 주요 장점 또는 현미경 기반 SAL 영역 분석과 같은 기존 방법의 장점은 여러 snare 조합을 분석할 수 있다는 점입니다.
정량적으로, 이 방법은 snare 매개 막 융합의 메커니즘과 조절을 이해하는 데 적용될 수 있을 뿐만 아니라, 처리량 연구(throughput studies)에도 적용될 수 있습니다. 시연은 저희 연구실의 박사후 연구원인 Doc Na Hassan과 기술원인 David Humphrey가 담당하며, transfection 로딩 전날에 진행될 예정입니다.
12mm 유리 커버슬립이 포함된 24웰 플레이트를 준비하고, 실험에서 고유한 플라스미드를 발현하는 세포 조합별로 두 개의 웰을 준비합니다. 4.5 g/L glucose와 10% FBS가 첨가된 DMEM에서 배양한 COST7 세포 30,000개를 transfection을 위해 커버슬립에 분주합니다. V 세포가 포함된 각 웰에 0.25 µg의 TTA 플라스미드와 한 세트의 발현 플라스미드를 첨가합니다.
이 경우 관심 대상인 flipped 단백질(flipped vamps)을 T 세포에 형질전환시키기 위해, TRE lacks Z를 인코딩하는 플라스미드 0.25 µg과 flipped 단백질을 인코딩하는 상보적 플라스미드 세트를 추가합니다. 여기서는 snap 25, syntaxin 1 및 syntaxin 4를 사용합니다. 이제 제조사의 지침에 따라 lipofectamine으로 cost 7을 형질전환하고, 세포를 24시간 동안 배양합니다. 형질전환 24시간 후, 보충된 paraformaldehyde로 세포를 10분 동안 고정합니다. 고정 후, PBS++로 세포를 3회 세척한 다음, 보충된 FBS로 세포를 30분 동안 블로킹합니다.
블로킹 후, anti mic 단클론 항체 Nine E 10과 함께 세포를 30분 동안 배양합니다. PBS++로 4회 세척한 후, 1:500으로 희석한 fitzy 접합 2차 항체와 함께 세포를 1시간 동안 배양합니다. PBS++로 4회 더 세척한 후, 라벨링된 세포를 시판되는 안티페이드 시약(anti fade reagent)으로 마운트합니다.
이제 세포를 공초점 현미경 관찰에 사용할 준비가 되었습니다. transfection 전날, 분석할 각 플라스미드 조합에 대해 100 mm 조직 배양 접시당 120만 개의 Cos-7 세포를, 6-well 플레이트의 각 well당 20만 개의 Cos-7 세포를 분주하십시오. 배양액을 준비하고 세포를 24시간 동안 배양하십시오. 다음 날 transfection을 위해 플라스미드를 첨가하십시오. Cos-7 세포의 경우, 각 100 mm 배양 접시의 세포에 관심 있는 Flip 단백질을 발현하는 플라스미드와 5 µg의 pTet-Off를 transfection 하십시오.
100 mm 배양 접시에서 대조군 세포를 V 세포와 동일한 상대 농도의 공벡터(empty vector) 및 P te off로 공동 형질전환합니다. V 세포와 대조군 세포에 모든 플라스미드를 첨가한 후, vamp의 N-당화(N-glycosylation)를 방지하기 위해 해당 웰에 tcom mycin을 첨가합니다. 6웰 플레이트의 각 웰에서 관심 단백질을 발현하는 상보적 플라스미드가 포함된 1 µg의 PBIG로 T 세포를 공동 형질전환합니다.
이제 제조사의 지침에 따라 lip을 사용하여 cost seven 세포를 형질전환합니다. 그다음 세포를 24시간 동안 배양하고, 형질전환 24시간 후에 효소 없는 세포 해리 버퍼(enzyme free cell dissociation buffer)를 사용하여 배양 접시에서 V 세포를 분리합니다. 먼저 20 milliliters의 PBS로 세포를 한 번 세척하는 것으로 시작하십시오.
그 다음, 효소 제거 해리 버퍼 5 mL를 추가합니다. 상온에서 10분간 배양한 후, 플레이트를 가볍게 쳐서 세포를 탈락시키고 현미경으로 세포가 잘 분리되었는지 확인합니다. 세포의 절반 미만이 탈락했다면, 5분 더 기다린 후 플레이트를 다시 쳐줍니다.
세포의 절반 이상이 떨어져 나올 때까지 분리 버퍼에서 배양을 계속합니다. 그 다음, 혈구 계수기로 V 세포의 수를 측정합니다. 이어서 보충된 heis 버퍼 DMEM에서 V 세포를 mL당 약 480,000 cells의 농도로 재현탁합니다.
이제 T 세포가 들어있는 각 웰에 재현탁된 V 세포 1 mL를 추가하고 플레이트를 다시 인큐베이터에 넣습니다. 세포를 6, 12 또는 24시간 동안 공동 배양한 후, PBS로 세척하고 용해 버퍼를 추가합니다. 다음으로, 웰에서 세포를 긁어내어 원심분리를 위해 튜브로 옮깁니다.
원심분리 후, 상층액을 새 튜브로 옮기고 제조사의 지침에 따라 시판되는 분석 키트를 사용하여 beta galacto의 발현량을 측정하십시오. 해당 프로토콜 동안, 결과 점수를 매기기 위해 1 M sodium carbonate를 첨가하여 90분 후 cholera metric 반응을 반드시 중단시키십시오. 분광광도계를 사용하여 420 nm에서 흡광도를 측정하십시오. CO seven 세포에 flipped snare 플라스미드를 형질전환했을 때, flipped snare 단백질이 세포 표면에서 발현되었습니다.
세포 표면의 snare 단백질 발현 수준을 측정하기 위해 유세포 분석법을 사용하였습니다. 막 융합 능력을 비교하기 위해서는 vamps가 동일한 수준으로 발현되어야 했습니다. 따라서 형질전환에 사용된 각 flipped snare 플라스미드의 농도를 적정하여 형질전환에 최적화하였습니다.
이러한 조건 하에서, 세포 표면에 vamps 1, 3, 4, 5, 7, 8 및 syntaxin 1과 4가 각각 동일한 수준으로 발현되었으며, 시냅스 엑소사이토시스를 매개하는 뉴런 SNARE들을 이용하여 분석법의 타당성을 테스트하였습니다. 실제로 vamp 2를 발현하는 V 세포와 SYNTAXIN 1 및 snap 25를 발현하는 T 세포를 결합했을 때, 강력한 beta galacto 발현이 검출되었습니다. 하지만 vamp 2 또는 SNAP 25 중 어느 하나라도 발현되지 않았을 때는 기저 수준의 beta galacto sase 활성만이 검출되었으며, 이는 세포 융합과 beta galacto sase의 발현이 v 및 t SNARE 간의 상호작용에 의존함을 나타냅니다. 전반적으로 SYNTAXIN 1, snap 25, vamp 1, vamp 3 및 vamp 8이 비슷하며 가장 높은 융합 활성을 보였습니다.
이와 대조적으로, 기저 beta GAL 활성은 해당 단백질 조합이 vamp five와 SYNTAXIN one의 사례와 같은 막 융합을 유도하지 않음을 시사합니다. Snap 25. 효소적 융합 분석을 수행할 때, SNARE 단백질의 N-당화(N-glycosylation)를 방지하기 위해 tunicamycin을 첨가하고, SNARE 단백질 간의 이황화 결합 형성을 방지하기 위해 DTT를 첨가해야 함을 유념하는 것이 중요합니다.
이 영상을 시청하고 나면 세포 융합 분석법을 수행하는 방법에 대해 충분히 이해하게 될 것입니다.
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본 연구에서는 β-galactosidase의 활성화된 발현을 통해 SNARE 매개 막 융합 사건을 정량화하도록 설계된 세포 융합 분석법을 제시합니다. 이 방법은 여러 SNARE 조합의 분석을 가능하게 하여, 기존 기술보다 상당한 이점을 제공합니다.
이 효소적 세포 융합 분석법은 SNARE 매개 막 융합의 정량적 분석을 가능하게 하여, 소포 수송 경로의 타겟 검증을 지원합니다. 미세한 융합 이벤트를 분광 광도법 판독값으로 변환함으로써, 이 방법은 융합 관련 타겟의 기전적 위험 제거를 위한 확장 가능하고 재현 가능한 데이터를 제공합니다. 또한, 다양한 조합에 걸쳐 v-SNARE와 t-SNARE 간의 상호작용을 체계적으로 비교할 수 있게 함으로써 초기 발견 단계에서의 예측 신뢰도를 높여줍니다.
본 분석법은 타겟 검증부터 리드 물질 발굴에 이르는 발견 연속체에 통합되어, 소포 수송 조절제의 우선순위 결정에 필요한 정량적 융합 데이터를 제공합니다.