높은 해상도 생체 3T 자기 공명 영상을 이용하여 인간의 해마 서브 필드에 대한 수동 분할 프로토콜

이 프로토콜의 전반적인 목표는 자기 공명 이미지의 하위 필드로 인간 해마를 분할하기 위한 신뢰할 수 있고 해부학적으로 정확한 방법을 제공하는 것입니다. 여기서, 해마 하위 필드는 CA 1, CA 2, CA 3, CA 4, 치상회(dentate gyrus), S-R-S-L-S-M 및 icm의 5개 레이블로 나뉩니다. 이 방법은 건강한 상태와 질병 상태에서 해마 하부 필드 구조가 어떻게 변화하는지와 같은 신경 이미징 분야의 주요 질문에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다.

이 기술의 주요 장점은 3개의 T 스캐너에서 수집된 고해상도 이미지에 맞게 조정되고 해마의 전체 전방 후방 길이에 대한 하위 필드 정의를 포함한다는 것입니다. 여기 터미널에 다음 명령 장면을 입력하여 시작합니다. T one 가중치 영상에서 소프트웨어 인터페이스를 열려면 코로나 보기를 확대하고 해마를 확대한 다음 탐색 창에서 분할을 선택한 다음 XY 반경을 선택합니다.

XY 브러시 크기를 0.1로 설정합니다. 해마의 가장 앞쪽 관상 절편으로 스크롤하여 절편 a, 전방 mott 절편을 찾습니다. 주변 측두엽 백질과 만나는 해마 회백질의 가장 바깥쪽 경계를 그리고 alves의 고강도 백질을 사용하여 상위 경계를 돕습니다.

탐색 창의 세분화 메뉴에서 label fill 키를 사용하여 테두리 내부의 레이블을 채웁니다. 슬라이스 B의 경우 해마 머리가 이겼습니다. 측두엽과 alves의 백질을 가이드로 사용하여 해마 머리의 경계를 계속 그립니다.

다음으로 슬라이스 C의 경우, 해마 머리는 dations가 있는 두 개입니다. alius의 백질을 사용하여 해마의 dations를 그립니다. 그런 다음 축 보기를 사용하여 측면 해마의 앞쪽 가장자리에서 수평선을 그리고 이 선 아래의 모든 것을 해마의 일부로 지정합니다.

이제 해마 머리 3인 슬라이스 D의 경우 측두엽의 백질에서 해마의 아래쪽 경계를 그리고 측면 심실의 아래쪽 뿔에서 측면 경계를 그립니다. alius fibr의 백질에서 상경계(superior border)를 그리고 주변 수조(ambient cison)의 저강도(hypo intensity) 영역에서 내측 경계(medial border)를 그립니다. slice, E의 경우 inferior, lateral, superior 및 medial borders를 그립니다.

이전과 같이, 해마가 약간 얇아지고 내측 피질의 회백질로 확장되는 내측 경계의 아래쪽 부분을 그려 추론 내측 경계를 정의합니다. 이 슬라이스에서는 해마 분할에 onus를 포함합니다. 그런 다음 F.As 전에 슬라이스에 해마체를 지정하고, 잔류 해마 열구의 저강도 대뇌 척수액을 분할에 포함하지 마십시오.

이제 슬라이스 G 세그먼트의 경우 해마 꼬리가 꼬리를 분할하기 시작합니다. fornix의 순항이 처음 보일 때. 더 많은 앞쪽 조각을 위해 수포회(vesicular gyrus)의 모양을 해마 꼬리로 외삽하여 수포회(vesicular gyrus

수포회(vesicular gyrus)를 더 이상 구별할 수 없을 때, 보이는 모든 회백질을 해마 꼬리로 처리한다. 그런 다음 슬라이스 H의 경우 해마 꼬리 두 분절, 주변의 고강도 백질에서 후방 해마 꼬리의 저강도 회백질. 마지막으로, 또는 슬라이스 눈, 가장 뒤쪽의 슬라이스 세그먼트, 측두엽의 주변 백질에서 해마 회백질의 작은 남은 영역.

T 2 가중치 이미지에서 해마의 가장 앞쪽 관상 절편으로 스크롤하는 것으로 시작합니다. 페인트 라벨 설정을 선택하고 터미널에 1에서 255 사이의 숫자를 입력하여 페인트 브러시의 색상을 변경합니다. 가장 앞쪽에 있는 슬라이스 A의 경우, 가장 긴 가시 축을 따라 보이는 해마 회백질을 두 개의 동일한 섹션으로 나누는 선을 그립니다.

두 가지 다른 색상을 사용하여 이 두 부분 중 상위 부분을 ca 1로, 하위 부분을 슬라이스 B의 술루, 해마 머리 1로 표시합니다. 해마 형성의 중간에 있는 낮은 강도의 영역을 표시하십시오. SR SLSM으로, 하측 csum ca one border를 inferior hippocampus의 구부러진 부분에 정의합니다.

해마의 가장 긴 축을 계속 따라가면서 해마 머리인 슬라이스 C의 상부 내측 끝에 ca 1 sulu 경계를 그립니다. 둘은 유혹과 함께. ca one 레이블의 곡선을 따르는 어두운 S-R-S-L-S-M 대역, S-R-S-L-S-M 내부의 고강도 회백질에 CA four dg로 레이블을 지정합니다.

그런 다음 bend와 inferior hippocampus를 사용하여 sicm ca one border를 정의합니다. CA 1과 CA 2 사이의 경계, CA 3을 S-R-S-L-S-M의 가장 상측 모서리에서 상측 방향으로 확장되는 45도 각도 선으로 정의합니다. ca 2 ca 3 을 superior edge를 따라 dations 사이의 골까지 중간으로 확장하고 나머지 superior edge를 slice D, hippocampal head three에 대해 ca 1로 표시합니다.

방금 설명한 대로 S-R-S-L-S-M CA 4, DG 및 ICM에 레이블을 지정합니다. 슬라이스 C의 경우, CA 2, CA 3을 상위 가장자리를 따라 중간으로 확장하고, 상위 가장자리의 나머지 절반을 CA 1로 레이블합니다. 초 내측 해마 머리를 수직으로 반으로 나눕니다.

내측 절반을 S-R-S-L-S-M으로 표시합니다. 그런 다음 수평으로 측면 절반을 반으로 나눕니다. 다시 말하지만, 아래쪽 부분은 CA 2, CA 3으로 표시하고, 위쪽 부분은 슬라이스 E에 대해 CA 4 DG, 해마 머리 4는 앵거스로 레이블을 지정합니다.

saeculum ca one border를 CA four dg의 가장 내측 가장자리에서 아래쪽 방향으로 연장되는 수직선으로 정의합니다. CA 1, CA 2, CA 3s, RSL, SM 및 ca four DG 테두리를 계속 정의합니다. 이전과 마찬가지로 해마의 머리가 해마체로 전환될 때 해마의 부담을 온스 라벨에 표시하고, 중앙의 낮은 강도 영역을 SRSL sm으로 표시합니다.

슬라이스 E를 계속 진행하면서 UCAS 레이블의 하측 초내측 축을 따라 S-R-S-L-S-M 섹션의 위쪽 가장자리에 선을 그립니다. 이 선 위의 모든 회백질은 CA 2, CA 3으로 표시되며, 이 선 아래의 레이블이 지정되지 않은 회백질은 CA 4 D.Next, 또는 slice F, 해마체로 표시됩니다. sulu S-R-S-L-S-M ca 4, DG ca 2, CA 3에 대한 테두리를 슬라이스 G, 해마 꼬리 1의 슬라이스 E에 대해 언급했듯이 계속 적용합니다.

ICM ca one 경계는 45도 각도 선이되며, 슬라이스 H.The 해마 꼬리 2에 대한 CA 4 DG의 내측 가장자리에서 인프라 내측 방향으로 확장되며, 저강도 내부 층을 S-R-S-L-S-M으로, 외부 고강도 층을 CA 1로 표시합니다. 수포회(vesicular gyrus)가 더 이상 해마 형성과 구별되지 않게 되면, 중간에 남아 있는 회백질은 CA 4 dg로 표시한다. 마지막으로, 절편의 경우 가장 뒤쪽의 절편은 전체 구조를 CA 1로 남겨둡니다.

어두운 S-R-S-L-S-M이 해마 형성에서 더 이상 보이지 않게 되면 이 프로토콜은 자기 공명 영상을 사용하여 인간 해마를 분할합니다. 여기에서 전체 해마는 T one 가중치 이미지를 사용하여 9개의 관상 절편으로 나뉩니다. 그런 다음 여기에서 T 2개의 가중치 이미지를 사용하여 5개의 해마 하위 필드를 분할하며, CA 1, CA 2, CA 3, CA 4, denate gyrus, S-R-S-L-S-M 및 ICM을 이 해마 머리 슬라이스 내에서 볼 수 있습니다.

이 기술을 숙달하면 제대로 수행되면 각 과목에 대해 40시간 안에 완료할 수 있습니다. 가능한 한 이미지의 강도 패턴을 따르고 이 절차를 따라 피사체 사이의 경계와 일관성을 유지하는 것을 기억하는 것이 중요합니다. 다른 자동화된 세분화 기법을 수행하여 건강한 노화를 겪고 있거나 알츠하이머병을 앓고 있는 사람들과 같은 취약 집단에서 해마의 부피와 모양에 대한 질문에 답할 수 있습니다.

이 비디오를 시청한 후에는 이 프로토콜을 안정적으로 복제하고 피험자의 상세한 해마 하부 해부학적 구조에 대한 통찰력을 얻을 수 있어야 합니다.