Name: 단핵 RNA 염기서열분석 및 ATAC-염기서열분석, 벌크 대사체학을 결합하기 위한 냉동 비인간 영장류 태아 섬의 준비 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2024-11-08T12:40:00.000+00:00
Duration: 3 min 39 s
Description: 학습하세요 냉동 비인간 영장류 태자 췌장 섬에서 핵 분리 및 RNA-seq, ATAC-seq, 대사체학을 동시 수행하는 방법. 이 프로토콜은 대사와 유전자 발현의 다층적 상호작용을 포괄적으로 분석합니다.

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<meta charset="utf8"></head><body>RNA에서 대사 산물까지: 비인간 영장류 태아 섬의 다중 오믹 프로파일링

<ol><li>Christensen, A. A., Gannon, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+beta+cell+in+type+2+diabetes%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Diab+Rep%22%5BJournal%5D)">The beta cell in type 2 diabetes.</a> Curr Diab Rep. 19 (9), 81(2019).</li>
<li>Elsakr, J. M., Gannon, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Developmental+programming+of+the+pancreatic+islet+by%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Developmental programming of the pancreatic islet by.</a> Trends Dev Biol. 10, 79-95 (2017).</li>
<li>Salzberg, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Risk+factors+and+lifestyle+interventions%5BTitle%5D)+AND+%22Prim+Care%22%5BJournal%5D)">Risk factors and lifestyle interventions.</a> Prim Care. 49 (2), 201-212 (2022).</li>
<li>Pound, L. D., Kievit, P., Grove, K. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+non-human+primate+as+a+model+for+type+2+diabetes%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Endocrinol+Diabetes+Obes%22%5BJournal%5D)">The non-human primate as a model for type 2 diabetes.</a> Curr Opin Endocrinol Diabetes Obes. 21 (2), 89-94 (2014).</li>
<li>Kang, R. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-nucleus+RNA+sequencing+of+human+pancreatic+islets+identifies+novel+gene+sets+and+distinguishes+%CE%B2-cell+subpopulations+with+dynamic+transcriptome+profiles%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Med%22%5BJournal%5D)">Single-nucleus RNA sequencing of human pancreatic islets identifies novel gene sets and distinguishes β-cell subpopulations with dynamic transcriptome profiles.</a> Genome Med. 15 (1), 30(2023).</li>
<li>Basile, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+single-nucleus+RNA-sequencing+to+interrogate+transcriptomic+profiles+of+archived+human+pancreatic+islets%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Med%22%5BJournal%5D)">Using single-nucleus RNA-sequencing to interrogate transcriptomic profiles of archived human pancreatic islets.</a> Genome Med. 13 (1), 128(2021).</li>
<li>Cabé, C. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-quality+brain+and+bone+marrow+nuclei+preparation+for+single+nuclei+multiome+assays%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">High-quality brain and bone marrow nuclei preparation for single nuclei multiome assays.</a> J Vis Exp. (202), e65715(2023).</li>
<li>Nuclei from embryonic mouse brain for single cell multiome ATAC + gex sequencing. , Available from: 
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<li>Elsakr, J. M., Deeter, C., Ricciardi, V., Gannon, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+non-human+primate+pancreatic+islet+oxygen+consumption%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Analysis of non-human primate pancreatic islet oxygen consumption.</a> J Vis Exp. (154), e60696(2019).</li>
<li>Chromium next gem single cell multiome ATAC + gene expression reagent kits user guide. , Available from: 
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<li>Maruyama, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Extraction+of+aqueous+metabolites+from+cultured+adherent+cells+for+metabolomic+analysis+by+capillary+electrophoresis-mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Extraction of aqueous metabolites from cultured adherent cells for metabolomic analysis by capillary electrophoresis-mass spectrometry.</a> J Vis Exp. (148), e59551(2019).</li>
<li>Ooga, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metabolomic+anatomy+of+an+animal+model+revealing+homeostatic+imbalances+in+dyslipidaemia%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biosyst%22%5BJournal%5D)">Metabolomic anatomy of an animal model revealing homeostatic imbalances in dyslipidaemia.</a> Mol Biosyst. 7 (4), 1217-1223 (2011).</li>
<li>Ohashi, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Depiction+of+metabolome+changes+in+histidine-starved+Escherichia+coli+by+CE-TOFMS%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biosyst%22%5BJournal%5D)">Depiction of metabolome changes in histidine-starved Escherichia coli by CE-TOFMS.</a> Mol Biosyst. 4 (2), 135-147 (2008).</li>
<li>Chiou, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+chromatin+accessibility+identifies+pancreatic+islet+cell+type%E2%80%93+and+state-specific+regulatory+programs+of+diabetes+risk%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genetics%22%5BJournal%5D)">Single-cell chromatin accessibility identifies pancreatic islet cell type– and state-specific regulatory programs of diabetes risk.</a> Nat Genetics. 53 (4), 455-466 (2021).</li>
<li>Pang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metaboanalyst+6.0%3A+Towards+a+unified+platform+for+metabolomics+data+processing%2C+analysis+and+interpretation%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Metaboanalyst 6.0: Towards a unified platform for metabolomics data processing, analysis and interpretation.</a> Nucleic Acids Res. , 253(2024).</li>
<li>Willency, J. A., Lin, Y., Pirro, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeted+metabolomics+in+human+and+animal+biofluids+and+tissues+using+liquid+chromatography+coupled+with+tandem+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Targeted metabolomics in human and animal biofluids and tissues using liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry.</a> STAR Protoc. 5 (1), 102884(2024).</li>
<li>Behnke, J. -S., Urner, L. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Emergence+of+mass+spectrometry+detergents+for+membrane+proteomics%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Bioanal+Chem%22%5BJournal%5D)">Emergence of mass spectrometry detergents for membrane proteomics.</a> Anal Bioanal Chem. 415 (18), 3897-3909 (2023).</li>
<li>Ouimet, C. M., D'amico, C. I., Kennedy, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+capillary+electrophoresis+and+the+implications+for+drug+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Expert+Opin+Drug+Discov%22%5BJournal%5D)">Advances in capillary electrophoresis and the implications for drug discovery.</a> Expert Opin Drug Discov. 12 (2), 213-224 (2017).</li>
<li>Alexandrov, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatial+metabolomics+and+imaging+mass+spectrometry+in+the+age+of+artificial+intelligence%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Biomed+Data+Sci%22%5BJournal%5D)">Spatial metabolomics and imaging mass spectrometry in the age of artificial intelligence.</a> Annu Rev Biomed Data Sci. 3, 61-87 (2020).</li>
<li>Ewald, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Web-based+multi-omics+integration+using+the+analyst+software+suite%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Web-based multi-omics integration using the analyst software suite.</a> Nat Protoc. 19, 1467-1497 (2024).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>33 G 쥐 뇌 캐뉼라 주입기</td><td>Protech International</td><td>8IC315IS5SPC</td><td>덕트 캐뉼레이션 및 췌장 팽창</td></tr><tr><td>페니실린 / 스트렙토 마이신</td><td>Fisher</td><td>15-140-122</td><td>RT 미디어</td></tr><tr><td>FBS</td><td>Millipore / Sigma</td><td>F4135-500ML</td><td>RT 미디어</td></tr><tr><td>RPMI 1640</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>11-875-135</td><td>RT 미디어</td></tr><tr><td>콜라겐 분해 효소 P</td><td>Sigma Aldrich</td><td>11213865001</td><td>췌장 소화용</td></tr><tr><td>Bovine Dnase I</td><td>Sigma Aldrich</td><td>11284932001</td><td>RT 매체 및 분리용</td></tr><tr><td>Dextrose</td><td>Fisher</td><td>D16-1</td><td>최종 농도는 2.8mM</td></tr><tr><td>염화칼슘</td><td>Fisher</td><td>C4901-500G</td><td>최종 농도는 0.5mM</td></tr><tr><td>HEPES</td><td>Gibco</td><td>15630-080</td><td>Final입니다. 농도는 10mM</td></tr><tr><td>소 혈청 알부민(BSA) 분획 5</td><td>Research Products International</td><td>A30075100</td><td>최종 농도는 0.5mg/mL</td></tr>입니다. <tr><td>Dulbecco의 Modified Eagle Medium</td><td>Gibco</td><td>11966025</td><td>손으로 섬을 선별하는 경우</td></tr><tr><td>20x 핵 완충액</td><td>10X 게놈</td><td>2000153/2000207</td><td></td></tr><tr><td>디지토닌(5%)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>BN2006</td><td>디지토닌은 65°C로 예열해야 할 수도 있습니다. 백색 침전물을 용해시키는</td></tr><tr><td>C MACS SmartStrainers (30 &micro; M)</td><td>Miltenyi Biotec</td><td>130-098-458</td><td></td></tr><tr><td>MACS BSA 스톡 솔루션 (10%)</td><td>Miltenyi Biotec</td><td>130-091-376</td><td></td></tr><tr><td>IGEPAL CA-630</td><td>Sigma Aldrich</td><td>i8896</td> MilliQ water Trizma Hydrochloride Solution, pH 7.5 Sigma Aldrich T2319-1L <td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Sodium Chloride Solution, 5 M</td><td>Sigma Aldrich</td><td>S6546-1L</td><td></td>을 사용하여 10% 스톡을 준비합니다.</tr><tr><td>염화마그네슘 용액, 1m</td><td>Sigma Aldrich</td><td>M1028-100mL</td><td></td></tr><tr><td>시그마 보호기 Rnase 억제제</td><td>Sigma Aldrich</td><td>3335402001</td><td></td></tr><tr><td>DTT</td><td>Research Products International</td><td>D11000-5.0</td><td></td></tr><tr><td>RNASE-Free 일회용 펠렛 유봉</td><td>Fisher Scientific</td><td>12-141-368</td><td></td></tr><tr><td>트윈 20</td><td>Fisher 생물 시약</td><td>BP337-500</td><td>MilliQ water</td></tr><tr><td>Nuclease-Free Water</td><td>Promega</td><td>PR-P1193</td><td></td></tr><tr><td>DNA LoBind Tubes(5 mL)</td>를 사용하여 20% 스톡 준비, <td>Eppendorf</td><td>30108310</td><td></td></tr><tr><td>Cryovials(1.5 mL),</td> <td>VWR</td><td>20170-225</td><td></td></tr><tr><td>Posi-Click Tubes(0.6 mL),</td> <td>Denville</td><td>C-2177</td><td></td></tr><tr><td>Trypan Blue(0.4%)</td><td>, Thermo Fisher Scientific</td><td>T-10282</td><td></td></tr><tr><td>이중 챔버 세포 계수 슬라이드</td><td>Bio-Rad</td><td>1450011</td><td></td></tr><tr><td>MiiliQ 초순수 시스템</td><td>Millipore/Sigma</td><td>7003/05/10/15</td><td></td></tr><tr><td>5 kDa 컷오프 필터</td><td>HMT Metabolome Technologies</td><td></td><td></td></tr><tr><td>내부 표준</td><td>HMT Metabolome Technologies</td><td></td><td></td></tr><tr><td>P10, P20, P200 및 P1000 피펫</td><td>Eppendorf</td><td>2231000602</td><td></td></tr><tr><td>피펫 팁, 10 &micro; L</td><td>VWR</td><td>76322-528</td><td></td></tr><tr><td>피펫 팁, 1000 &마이크로; L</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>21-236-2A</td><td></td></tr><tr><td>피펫 팁, 20 &마이크로; L</td><td>Genesee Scientific</td><td>23-404</td><td></td></tr><tr><td>피펫 팁, 200 &마이크로; L</td><td>USA Scientific</td><td>1120-8810</td><td></td></tr><tr><td>위상차 현미경</td><td>Olympus</td><td>BX41-PH-B</td><td></td></tr><tr><td>Countess II 자동 세포 계수기</td><td>Thermo Fisher Scientific AMQAX1000</td><td></td><td></td></tr><tr><td>DPBS (1x)&nbsp;</td><td>Gibco</td><td>14190-144</td><td></td></tr><tr><td>Allegra X-30R 원심분리기</td><td>Beckman-Coulter</td><td>B06315</td><td></td></tr><tr><td>RNase-ZAP</td><td>시그마 Aldrich</td><td>R2020</td><td></td></tr></tbody></table>

단핵 rna 염기서열분석 및 atac-염기서열분석, 벌크 대사체학을 결합하기 위한 냉동 비인간 영장류 태아 섬의 준비

Preparation of Frozen Non-Human Primate Fetal Islets for Combined Single Nuclei RNA-Sequencing and ATAC-Sequencing, and Bulk Metabolomics

시퀀싱 출력의 품질은 핵 입력의 품질에 크게 좌우됩니다. 핵 블레빙 및 외부 핵막의 손상은 분석에서 주변 RNA 및 DNA 오염을 초래하여 데이터에 노이즈를 유발합니다. 순수한 핵 추출물은 세포질 성분으로 캡슐화된 핵(그림 2A) 또는 핵 파열(그림 2B)로 입증되는 과소화의 증거를 최소화합니다. 이상적인 핵 입력은 손상되지 않은 핵을 포함할 것입니다(그림 2C).
단핵 RNA 및 ATAC 염기서열분석 데이터의 분석에 대한 자세한 내용은 다른 곳에도 광범위하게 제공되어 있다 5,14. 태아 NHP 핵 제제의 대표적인 세포 집단군집은 그림 3A의 UMAP를 통해 설명되어 있습니다. 대사체학 데이터는 앞서 설명한 바와 같이 오픈 소스 소프트웨어를 사용하여 쉽게 분석됩니다15. 생성된 스펙트럼을 시각화할 수 있으며, WSD 공급 댐의 태아 섬에 있는 농축된 대사 산물을 CD 공급 댐의 대사 산물과 비교할 수 있습니다(그림 3B-F).
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66849/66849fig01.jpg"> 그림 1: 핵 및 세포질 분획 분리를 위한 프로토콜 개요. 태아 췌장 섬은 분석 당일까지 -80 °C에서 보관하고 보관했습니다. 핵을 분리하여 단일 핵 RNA 및 ATAC 시퀀싱에 활용했습니다. 핵 분리의 첫 번째 세척 후 세포질 분획은 모세관 전기영동-질량 분석법을 위해 유지되었습니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66849/66849fig01large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66849/66849fig02.jpg"> 그림 2: 단일 핵 다중오믹스 분석에 대한 적절한 핵 입력의 시연. (A) 세포질에 의해 캡슐화된 핵, (B) 손상된 핵이 있는 파열 핵, (C) 둥근 형태를 가진 온전한 핵의 예. 스케일 바: 10 μm. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66849/66849fig02large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66849/66849fig03.jpg"> 그림 3: 단일핵 다중체학(single nucleus multiomics)과 벌크 대사체학(bulk metabolomics)이 결합된 대표 데이터. (ᅡ) 유전자 발현을 기반으로 한 고립된 태아 NHP 섬 내 세포 아형의 UMAP 클러스터링. 댐에 WSD(mWSD) 또는 CD(mCD)를 공급했을 때 분리된 태아 NHP 섬의 세포질 분획에서 해당작용 대사산물, (B) 디하이드록시아세톤 포스페이트 및 (C) 글리세롤-3-포스페이트의 정량적 추정. 산모의 식단은 또한 (D) 구연산 회로(2-옥소글루타레이트), (E) 아미노산 대사(크레아틴) 및 (F) 태아 섬의 세포 산화 환원 상태(글루타티온)를 변화시킴으로써 신진대사를 차별적으로 조절할 수 있습니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66849/66849fig03large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
표 1: 핵 분리를 위한 완충액 제형. 핵, 용해, 용해 희석 및 세척 완충액의 자세한 구성 요소가 표시됩니다. 필요한 경우 완충액을 준비하기 전에 시약을 스톡 농도로 희석하십시오. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66849/66849_Table%201.xlsx" target="_blank">이 표를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>

단핵 RNA 염기서열분석 및 ATAC-염기서열분석, 벌크 대사체학을 결합하기 위한 냉동 비인간 영장류 태아 섬의 준비

One challenge in studies using tissue collected from multiple cohorts is avoiding batch effects when preparing for large-scale multi-omic experiments, ...

preparation-frozen-non-human-primate-fetal-islets-for-combined-single

Research

연구

JoVE Journal

Developmental Biology

발생생물학

여기, 선물이 빠르게 다운스트림 대규모 병렬 RNA 시퀀싱 신선 또는 냉동 조직에서 높은-품질 핵을 분리 하는 프로토콜. 우리는 세제-기계 및 소형 기계 조직 장애 및 셀 세포 옵션을 둘 다 핵의 격리에 대 한 사용할 수 있습니다를 포함 합니다.

대규모 병렬 단일 핵 RNA 시퀀싱에 대 한 성인 척수 핵의 절연

여기서, 우리는 액적 기반 의 미세 유체 단일 세포 RNA 염기서열 분석 기술을 사용하여 단면 췌도로부터 단일 세포의 고품질, 대규모 전사체 데이터를 생성하는 프로토콜을 제시한다.

단세포 RNA 시퀀싱 및 인간 췌장 섬 분석

본 간행물은 성숙한 지방세포로부터 핵의 분리, 형광 활성화 선별에 의한 정제, 및 단세포 수준 전사학에 대한 프로토콜을 설명합니다.

단세포 게놈 응용을 위한 지방 조직 핵의 격리

종양 내 이질성은 진모를 포함한 종양의 내재된 특징입니다. 우리는 단일 핵 RNA 및 ATAC 염기서열 분석 연구를 위한 신선한 동결 신경교종 조직에서 단 하나 핵을 격리하기 위하여 완충과 그라데이션 원심분리의 조합을 이용하는 간단하고 효율적인 프로토콜을 개발했습니다.

단일 핵 RNA-seq 및 ATAC-seq를 위한 신선한 냉동 뇌 종양에서 핵 절연

여기에서, 저자들은 망막에서 전사체 및 크로마틴 접근성 프로파일을 특성화하는데 있어서 표현형 및 후속 쌍을 이룬 scRNA-seq 및 scATAC-seq 에 대한 MULTI-seq 의 유용성을 보여준다.

scRNA-Seq 및 scATAC-Seq 를 이용한 망막 유전자 발현 및 크로마틴 접근성의 다중화 분석

우리는 하류 분자 분석에 사용하기 위해 인간 성상 세포 집단을 신선하게 냉동 된 조직으로부터 풍부하게하고 분리하는 방법을 개발했습니다.

형광 활성화 핵 분류를 사용하여 신선 냉동 피질로부터 성인 인간 성상세포 집단의 분리

여기에서는 단일 핵 RNA-seq, ATAC-seq 및 관절 다중오믹스(RNA-seq 및 ATAC-seq)에 대해 급속 냉동되고 보관된 간 조직에서 핵을 분리하기 위한 프로토콜을 제시합니다.

단일 세포 다중오믹스를 위한 급속 동결 간 조직으로부터 핵 분리

우리는 핵 형광 표지가 있는 형질전환 리포터 마우스에서 분리된 지방 조직으로 핵 분류를 사용하는 지방 세포에 특히 고처리량 시퀀싱(ATAC-seq)을 사용하여 전치사 효소 접근 가능한 염색질 분석을 위한 프로토콜을 제시합니다.

Fluorescence-Activated Nucleus Sorting을 사용한 지방 조직을 사용한 지방 세포 특이적 ATAC-Seq

여기에서 우리는 세포핵 준비를 설명하는 프로토콜을 제시합니다. 심장 조직을 단일 세포로 미세 해부 및 효소 해리한 후, 전구 세포를 동결한 다음, 순수 생존 세포를 분리하여 단일 핵 RNA 시퀀싱 및 고처리량 시퀀싱 분석을 통한 전이효소 접근 가능한 염색질에 대한 단일 핵 분석에 사용했습니다.

단일 세포 분해능에서 후성유전체 및 유전자 발현 프로파일링을 위한 마우스 심장 전구 세포에서 핵 분리

이 연구는 다운스트림 단일 핵 RNA 염기서열 분석을 위해 냉동 포유류 조직에서 고품질 핵을 분리하는 간단하고 빠르며 부분적으로 자동화된 프로토콜을 설명합니다.

단일 핵 염기서열분석을 위해 냉동 포유류 조직에서 단일 핵을 분리하기 위한 간단하고 빠르며 부분적으로 자동화된 프로토콜

근육 간 지방 조직(IMAT)의 생물학은 인체 조직의 접근성이 제한되어 있기 때문에 대부분 탐구되지 않았습니다. 여기에서는 이 고유한 지방 저장소의 세포 구성을 식별하기 위해 단일 핵 RNA 염기서열 분석을 위한 냉동 인간 IMAT의 핵 분리 및 라이브러리 준비에 대한 자세한 프로토콜을 제시합니다.

인간 근육 간 지방 조직에서 핵 분리 및 다운스트림 단일 핵 RNA 염기서열분석

학습하세요 냉동 비인간 영장류 태자 췌장 섬에서 핵 분리 및 RNA-seq, ATAC-seq, 대사체학을 동시 수행하는 방법. 이 프로토콜은 대사와 유전자 발현의 다층적 상호작용을 포괄적으로 분석합니다.

단핵 RNA 염기서열분석 및 ATAC-염기서열분석, 벌크 대사체학을 결합하기 위한 냉동 비인간 영장류 태아 섬의 준비

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