1. Przygotowanie roztworów i pożywek
- Roztwór do powlekania żelatyną: 0,1% (w/v) żelatyny w ddH2O, autoklawowany i przechowywany w temperaturze 4°C.
- Roztwory do powlekania Matrigel. Roztwór zapasowy: powolne rozmrażanie Matrigelu (10 ml) w 4°C przez noc, dodanie 10 ml lodowatego DMEM lub DMEM/F12, dokładne wymieszanie i rozdzielenie na aliquoty po 1 ml/probówkę pod sterylnym dygestorium do hodowli tkankowych, przechowywanie w -20°C. Roztwór roboczy: powolne rozmrażanie aliquoty 1 ml Matrigelu w 4°C przez 1-2 godziny, przeniesienie do 14 ml schłodzonego DMEM lub DMEM/F12 i dokładne wymieszanie pod sterylnym dygestorium do hodowli tkankowych bezpośrednio przed powlekaniem.
- Roztwór do powlekania ludzką lamininą: rozcieńczenie 1 ml roztworu ludzkiej lamininy (0,5 mg/ml w buforze Tris-NaCl, przechowywać w -80°C, powoli rozmrażać w 4°C przez 1-2 godziny) lodowatym DMEM lub DMEM/F12 do 12,5 ml roztworu roboczego (40 μg/ml) pod sterylnym dygestorium do hodowli tkankowych bezpośrednio przed powlekaniem.
- Roztwory zapasowe czynników wzrostu (50-10X): rozpuszczenie czynnika wzrostu w stężeniu 10 μg/ml w sterylnym buforze (0,5% BSA, 1,0 mM DTT, 10% glicerolu, 1XPBS) i przechowywanie w aliquotach 50-10 μl/probówkę w -80°C.
- Roztwór roboczy kwasu all-trans-retinowego (10X): 10 mM w DMSO, przechowywać w aliquotach w -80°C.
- Pożywka do HESC: DMEM/F12 lub KO-DMEM (80%), zamiennik surowicy KO (20%), L-alanylo-L-glutamina lub L-glutamina (2 mM), nieessentialne aminokwasy MEM (MNAA, 1X) oraz β-merkaptoetanol (10 μM), przefiltrowana i przechowywana w 4°C, uzupełniona o 20 ng/ml bFGF przed użyciem. Alternatywnie, zastąpienie „zamiennika surowicy knock out (KO)” określonymi składnikami: DMEM/F12 lub KO-DMEM (10%), L-alanylo-L-glutamina lub L-glutamina (2 mM), MNAA (1X), essentialne aminokwasy MEM (MEAA, 1X) oraz β-merkaptoetanol (100 μM), przefiltrowana i przechowywana w 4°C, uzupełniona przed użyciem o bFGF (20 ng/ml), ludzką insulinę (20 μg/ml), kwas askorbinowy (50 μg/ml), ludzką aktywinę A (50 ng/ml), ludzką albuminę/Albumax (10 mg/ml) oraz ludzką transferrynę (8 μg/ml).
- Pożywka do NSC: DMEM/F12 (10%), suplement N-2 (1X), heparyna (8 μg/ml).
2. Powlekanie płytek
- Pokrycie płytek żelatyną: dodać 2,5 ml/dołek roztworu żelatyny do płytek 6-dołkowych i inkubować przez noc w inkubatorze z nawilżaniem w temperaturze 37°C.
- Pokrycie płytek lamininą: schłodzić płytki pokryte żelatyną i usunąć żelatynę, następnie dodać 2,5 ml/dołek roztworu roboczego Matrigel lub ludzkiej lamininy do schłodzonych wcześniej żelatynizowanych płytek 6-dołkowych i inkubować w temperaturze 4°C przez noc.
3. Pasażowanie i wysiewanie niezróżnicowanych hESC w warunkach zdefiniowanych
- Pozostaw kolonie hESC do czasu osiągnięcia wieku 5-7 dni, a następnie przenieś płytkę z hodowlą hESC pod mikroskop dissectingowy (wcześniej podgrzej stolik mikroskopowy do 37°C) wewnątrz sterylnego dygestorium.
- Wybierz kolonie hESC do pasażowania. Pod względem morfologicznym kolonie te powinny zawierać > 75% niezróżnicowanych hESC (małe, zwarte komórki), zazwyczaj lekko mętne (nie białe skupiska komórek, nie przezroczyste komórki zróżnicowane) z wyraźną krawędzią widoczną pod mikroskopem dissectingowym. Ostrożnie obrysuj wybrane kolonie i usuń otaczającą je warstwę zróżnicowanych fibroblastów oraz wszystkie zróżnicowane części kolonii (jeśli występują), używając krawędzi sterylnego końcówki pipety P2 lub wyciągniętej kapilary szklanej. (Należy pamiętać, że pluripotencjalne hESC znajdują się w stadium przejściowym i ulegają spontanicznej różnicowaniu nawet w optymalnych warunkach; choć jest to preferowane, trudno stwierdzić pod mikroskopem dissectingowym, czy komórki te są w 100% niezróżnicowane; zazwyczaj za punkt dopuszczający pasażowanie uznaje się >75% niezróżnicowanych komórek. Komórki zróżnicowane zazwyczaj nie przytwierdzą się do podłoża i nie będą dalej rosnąć, zostając wyeliminowane w procesie pasażowania).
- Usuń starą pożywkę zawierającą pływające, oderwane komórki zróżnicowane poprzez aspirację. Przepłucz raz pożywką hESC (bez bFGF). Dodaj 3 ml/studzienkę świeżej pożywki hESC zawierającej 20 ng/ml bFGF.
- Podziel niezróżnicowane kolonie hESC na małe fragmenty i oddziel je za pomocą sterylnej końcówki pipety lub wyciągniętej kapilary szklanej.
- Zebierz pożywkę zawierającą oderwane fragmenty kolonii do probówki stożkowej o pojemności 50 ml. Przepłucz płytkę raz za pomocą 1 ml/studzienkę pożywki hESC zawierającej 20 ng/ml bFGF i dodaj do wspólnej puli.
- Odsuń aspirat z roztworu Matrigelu lub ludzkiej lamininy z nowo powlekanych płytek. Rozdziel po 4 ml/studzienkę pożywki hESC z fragmentami kolonii do płytki 6-dołkowej. Ostrożnie przenieś płytkę do inkubatora, nie potrząsając nią, i pozostaw fragmenty kolonii do przytwierdzenia przez noc, niepokojąc ich, w wilgotnym inkubatorze przy 37°C w atmosferze 5% CO2.
4. Indukcja neuronalna hESC w zdefiniowanym systemie hodowli z zastosowaniem kwasu retinowego
- W 3. dniu po wysiewaniu usunąć większość starej pożywki z każdej studni płytki, pozostawiając ilość wystarczającą do zanurzenia kolonii hESC (nigdy nie dopuszczać do wyschnięcia hESC). Zastąpić ją 4 ml/studnię świeżym medium dla hESC zawierającym 20 ng/ml bFGF oraz 10 μM kwasu retinowego.
- Wymieniać starą pożywkę na świeże medium dla hESC zawierające 20 ng/ml bFGF i 10 μM kwasu retinowego co drugi dzień i pozwolić koloniom hESC indukowanym w kierunku neuronalnym rosnąć do 7. lub 8. dnia. Wszystkie komórki w obrębie kolonii ulegną zmianom morfologicznym, przekształcając się w duże zróżnicowane komórki, które będą nadal mnożyć się. Kolonie zwiększą swój rozmiar, pokrywając płytkę do 7. lub 8. dnia, a w niektórych obszarach kolonii komórki zaczną się piętrzyć.
5. Kontynuacja różnicowania neuronalnego w hodowli zawiesinowej
- Przenieś płytkę z hodowlą hESC pod sterylną komorę laminarnej do mikroskopu sekcyjnego (wcześniej podgrzej stolik sekcyjny do 37°C). Ostrożnie obrysuj kolonie i usuń warstwę fibroblastów otaczającą kolonię (zróżnicowane komórki, które wywędrowały z kolonii) za pomocą krawędzi sterylnej końcówki pipety P2 lub wyciągniętej kapilary szklanej.
- Usuń starą pożywkę zawierającą pływające, oderwane komórki fibroblastów poprzez aspirację. Przepłucz raz pożywką hESC (bez bFGF). Dodaj 3 ml/studzienkę świeżej pożywki hESC (bez bFGF).
- Podziel indukowane do linii neuronalnej kolonie hESC na małe fragmenty i oderwij je za pomocą sterylnej końcówki pipety lub wyciągniętej kapilary szklanej.
- Złącz pożywkę zawierającą oderwane fragmenty kolonii w probówce stożkowej o pojemności 50 ml. Przepłucz płytkę raz za pomocą 1 ml/studzienkę pożywki hESC (bez bFGF) i połącz z resztą materiału.
- Przenieś aliquoty po 4 ml/studzienkę bezzsrytkowej pożywki hESC zawierającej fragmenty kolonii na płytkę 6-dołkową o ultra-niskiej adhezji (ultralow attachment) i inkubuj w wilgotnym inkubatorze w temperaturze 37°C przez 4-5 dni, aby umożliwić formowanie się pływających skupisk komórkowych (neuroblastów).
6. Dojrzewanie fenotypu neuronalnego w hodowli adhezyjnej
- Połączyć pożywki zawierające pływające neuroblasty w probówce stożkowej o pojemności 50 ml. Wirować przy 1400 rpm przez 5 min. Odessać jak największą ilość starej pożywki i dodać taką samą objętość świeżej pożywki NSC zawierającej VEGF (20 ng/ml), NT-3 (10 ng/ml) oraz BDNF (10 ng/ml).
- Wymieszać pływające neuroblasty poprzez wielokrotne pipetowanie i rozdzielić do płytek 6-dołkowych w ilości 4 ml/dołek. Neuroblasty można również wysiać w polimeryzowanej trójwymiarowej macierzy lamininy/kolagenu (Matrigel) lub ludzkiej lamininy w bezserwatkowej pożywce NSC zawierającej VEGF (20 ng/ml), NT-3 (10 ng/ml) oraz BDNF (10 ng/ml). Przenieść płytki do inkubatora z nawilżaniem w temperaturze 37°C, aby umożliwić neuroblastom przytwierdzenie się przez noc.
- Wymieniać pożywkę NSC zawierającą VEGF (20 ng/ml), NT-3 (10 ng/ml) oraz BDNF (10 ng/ml) co drugi dzień. Rozległe sieci komórek neuronalnych z wypustkami oraz komórek pigmentowanych zaczną pojawiać się w ciągu 2 tygodni ciągłej hodowli, a ich liczba będzie z czasem rosła; hodowla może być utrzymywana przez ponad 3 miesiące.
7. Reprezentatywne wyniki:
Kwas retinowy (RA) jest wystarczający, aby indukować przejście hESC utrzymywanych w zdefiniowanym systemie hodowlanym ze stanu pluripotencji wyłącznie w stronę fenotypu neuroektodermalnego (Ryc. 2A). Po wystawieniu niezróżnicowanych hESC na działanie RA, wszystkie komórki w kolonii przejdą zmiany morfologiczne w duże komórki zróżnicowane, które przestaną wyrażać markery związane z pluripotencją, takie jak Oct-4, i zaczną wyrażać różne markery związane z neuroektodermą, m.in. HNK1, AP2 i TrkC (Ryc. 2B). Te duże zróżnicowane komórki będą nadal się namnażać, a kolonie będą zwiększać swoje rozmiary, spontanicznie przechodząc do ekspresji wczesnego markera neuronalnego β-III-tubuliny (Ryc. 2B). Bardziej dojrzały marker neuronalny Map-2 zacznie pojawiać się w obszarach kolonii, w których komórki uległy zagęszczeniu (Ryc. 2B). Równocześnie z pojawieniem się komórek neuroektodermalnych i różnicowaniem neuronalnym, czynnik transkrypcyjny specyficzny dla neuronów Nurr1, zaangażowany w różnicowanie neuronów dopaminergicznych i aktywację genu hydroksylazy tyrozynowej (TH)16, przemieści się do jądra komórkowego (Ryc. 2B). Po odłączeniu hESC traktowane RA utworzą pływające skupiska komórkowe (neuroblasty) w hodowli zawiesinowej, aby kontynuować proces różnicowania neuronalnego. Po usunięciu bFGF i umożliwieniu neuroblastom przyczepienia się do płytki do hodowli tkanek lub po ich wysianiu w polimeryzowanej trójwymiarowej macierzy lamininy/kolagenu w zdefiniowanym medium beznadserkowym, zaczną pojawiać się komórki z wypustkami neurytowymi oraz komórki pigmentowe wykazujące ekspresję β-III-tubuliny i Map-2; nastąpi przy tym gwałtowny wzrost wydajności w porównaniu do spontanicznego różnicowania wieloliniowego hESC bez traktowania w tym samym okresie czasu, a proces ten mógł być utrzymywany przez ponad 3 miesiące (Ryc. 2C).

Rysunek 1 Schemat dobrze kontrolowanej, efektywnej indukcji ludzkich pluripotencjalnych komórek macierzystych wyłącznie w kierunku konkretnej, istotnej klinicznie linii komórkowej poprzez proste zastosowanie małych cząsteczek.

Rycina 2 Kwas retinowy indukuje specyfikację linii neuronalnej i progresję neuronalną bezpośrednio z pluripotencji w określonych warunkach. (A) Schemat przedstawiający oś czasu protokołu ukierunkowanej dyferencjacji hESC w neurony. (B) Po wystawieniu nieróżnicowanych hESC na działanie kwasu retinowego (RA) w określonym systemie hodowlanym, wewnątrz kolonii zaczęły pojawiać się duże, zróżnicowane komórki Oct-4 (czerwone) ujemne, w porównaniu z hESC poddanymi kontrolnej obróbce (DMSO). Zróżnicowane komórki Oct-4-ujemne indukowane przez RA zaczęły wykaziwać ekspresję HNK-1 (czerwony), AP2 (czerwony), TrkC (zielony), a następnie β-III-tubuliny (czerwony), co jest zgodne z wczesną różnicowaniem w kierunku neuroektodermy. Komórki te nadal dojrzewały, ostatecznie wykazując ekspresję markera neuronalnego Map-2 (zielony), zazwyczaj w obszarach, w których zaczęły się one spiętrzać. Równocześnie z pojawieniem się komórek neuroektodermalnych i różnicowaniem neuronalnym, czynnik transkrypcyjny specyficzny dla neuronów Nurr1 (zielony), zaangażowany w różnicowanie neuronów dopaminergicznych i aktywację genu hydroksylazy tyrozynowej (TH), przemieścił się do jądra. Wszystkie komórki są widoczne dzięki barwieniu ich jąder DAPI (niebieski). (C) Traktowanie kwasem retinowym (RA) indukuje różnicowanie w kierunku linii neuronalnej z wysoką wydajnością, co potwierdzają rozległe sieci komórek z wypustkami neurytowymi wykazujących ekspresję β-III-tubuliny (czerwony) i Map-2 (zielony, pokazany w macierzy trójwymiarowej). Strzałki wskazują komórki pigmentowane, typowe dla komórek OUN. Wszystkie komórki są widoczne dzięki barwieniu jąder DAPI (niebieski) na wstawkach. Paski skali: 0,1 mm.