1. Izolacja i hodowla neuronów z zwojówczennych górnych (SCG) z embrionów szczura
W celu zapewnienia przydatnego kontekstu dla zrozumienia niniejszego protokołu oraz dla wyczerpującego omówienia wcześniejszej literatury ustanawiającej metody hodowli neuronów SCG, w tym podstaw hodowli SCG in vitro, podłoży do powlekania płytek oraz składników pożywek bezsurowiczych, czytelnika odsyła się do referencji2-4.
- Wykorzystanie szczurów jako źródła neuronów SCG przeprowadzono zgodnie z wytycznymi NIH w ramach aktywnego protokołu zatwierdzonego przez Komitet ds. Opieki i Korzystania ze Zwierząt Laboratoryjnych (IACUC).
- Przed rozpoczęciem dysekcji należy przygotować 96-dołkowe naczynia hodowlane pokryte kolagenem i lamininą. Używając pipety wielokanałowej, należy napełnić wszystkie 96 dołków roztworem zawierającym 0,66 mg / ml kolagenu z ogona szczura. Natychmiast usunąć kolagen, który można odzyskać i wykorzystać do 8 dysekcji. Po usunięciu kolagenu bardzo ważne jest pozostawienie dołków do wyschnięcia w komorze z laminarnym przepływem powietrza. Czas schnięcia zależy od liczby dołków w naczyniu. Na przykład wyschnięcie dołków w naczyniu 96-dołkowym zajmuje zazwyczaj około 5-10 min, ale może trwać do 30 - 40 min w przypadku użycia większego naczynia 24-dołkowego. Niewłaściwe wysuszenie dołków prowadzi do słabej adhezji SCG. Następnie należy powtórzyć procedurę, używając roztworu 2 μg / ml lamininy. Inkubować roztwór lamininy przez co najmniej 2 hr w temperaturze 37 °C w humidyfikowanym inkubatorze CO2 aż do momentu wysiewania neuronów (krok 1.14).
- Zakupione komercyjnie ciężarne samice szczurów poddaje się eutanazji za pomocą CO2. Po spryskaniu ciała 70% etanolem wykonuje się nacięcie w kształcie litery U wokół brzucha. Po odchyleniu skóry wykonuje się drugie nacięcie w kształcie litery U przez ścianę mięśniową brzucha. Macica staje się widoczna po uniesieniu warstwy mięśni brzucha. Należy usunąć macicę i umieścić ją w naczyniu o średnicy 15 cm. Ostrożnie otworzyć macicę za pomocą tępych nożyczek, aby uniknąć uszkodzenia płodów. Każdy płód musi zostać uwolniony z pęcherzyka zarodkowego, pępowina przecięta, a płód oczyszczony 70% etanolem i chusteczkami Kimwipes.
- Pracując pod dysekcyjną komorą laminarną, uśmiercić nienarodzone płody szczura w 21. dniu embrionalnym (E21) poprzez oddzielenie głowy od tułowia. Nożyczki należy skierować w podstawę szyi, tuż nad barkami. Aby odsłonić zwoje, należy przypiąć głowę (stroną szyi do góry) za pomocą igieł 23 G w trzech miejscach: i) rdzeń kręgowy; ii) przednia skóra odciągnięta nad nosem i przypięta; iii) przełyk / tchawica muszą być odciągnięte i przypięte z dala od podstawy szyi.
- Zlokalizować dwa SCG* znajdujące się po obu stronach rozwidlenia tętnicy szyjnej wspólnej (dwa SCG na jeden embrion). SCG znajduje się bezpośrednio pod rozgałęzieniem. Oddzielić SCG od tętnic, rozsuwając rozwidlenie. Umieścić zwoje w 12 ml pożywki L15 (uzupełnionej o 0,4% D(+)-glukozy) w 15 ml probówce stożkowej na lodzie.
*SCG jest półprzezroczysty i bezbarwny w porównaniu z nieprzezroczystą, żółtawą tkanką tłuszczową otaczającą rozwidlenie. Przed pobraniem zwojów należy starać się usunąć jak najwięcej pozostałej tkanki tłuszczowej oraz naczyń krwionośnych.*
- Powtarzać kroki 1.4 i 1.5 do czasu pozyskania wszystkich SCG z embrionów.
- Ostrożnie wirować zwoje przez 1 min przy 600 rpm, a następnie odessać nadmiar pożywki.
- Resuspender zwoje w 1 ml pożywki L15 zawierającej trypsynę (0,25%, bez EDTA) i kolagenazę (1 mg/ml). Inkubować przez 30 min w temperaturze 37 °C, mieszając co 10 min.
- Dodać 10 ml pożywki C (1x MEM, 0,4% D(+)-glukozy, 2 mM L-glutaminy, 10% FBS), aby dezaktywować trypsynę, i wirować przez 1 min przy 600 rpm.
- Usunąć jak największą ilość pożywki z trypsyną/kolagenazą* i przemyć zwoje 10 ml pożywki C. Wirować przez 1 min przy 600 rpm. Powtórzyć ten krok raz.
*Pozostałości kolagenazy będą zakłócać działanie podłoża kolagenowego niezbędnego do przyкрепienia komórek do płytki hodowlanej.
- Usunąć medium płuczące i resuspender zwoje w 1 ml C-media, a następnie przeprowadzić triturację za pomocą igły 21 G przymocowanej do strzykawki 5 ml, aby rozbić duże skupiska komórek*. Kontynuować triturację igłą 23 G aż do momentu rozbicia widocznych skupisk.
*Należy uważać, aby nie przesadzić z tryturacją, ponieważ może to uszkodzić komórki. Jeśli obróbka trypsyną i kolagenazą przebiegła pomyślnie, wystarczające powinno być maksymalnie piętnaście cykli zasysania i wypychania igłą 21 G oraz trzy cykle igłą 23 G.
- Przefiltruj rozdzielone neurony przez nylonowy filtr 70 μm [BD Biosciences cell strainer] do probówki stożkowej o pojemności 50 ml, aby usunąć wszelkie pozostałe skupki komórek.
- Pobierz 10 μl alikwot przefiltrowanej zawiesiny komórkowej i wymieszaj z błękitem trypanowym w celu określenia liczby żywych komórek. Policz liczbę komórek, które aktywnie wykluczają barwnik, używając komory hemocytometrycznej.
- Usuń roztwór lamininy z płytek 96-dołkowych oczekujących w inkubatorze w temperaturze 37 °C (patrz KROK 1.2). Nie wysuszaj płytki; można jej użyć niezwłocznie do wysiewu komórek po usunięciu lamininy. Rozdziel* 5 000-6 000 łącznie żywych komórek (50 - 100 μl na dołek) do płytki hodowlanej 96-dołkowej uprzednio pokrytej kolagenem i lamininą. Dodaj 50 ng / ml czynnika wzrostu nerwów (NGF) do pożywki C-media.
*Kluczowe jest stosowanie prawidłowej, sterylnej techniki hodowli tkanek, ponieważ z pożywki wzrostowej pominięto antybiotyki. Ponadto może występować znaczna zmienność kolagenu pochodzącego od różnych dostawców. Uzyskiwaliśmy spójne wyniki w różnych partiach, stosując kolagen z ogona szczura firmy Millipore.
- W dniu DIV (day in vitro) 1 zastąpić pożywkę C użytą do wysiewu komórek 50 μl NBM (0,4% D(+)-glucose, 2 mM L-glutamine, suplement B-27 zawierający 50 ng/ml NGF, 5 μM aphidicolin oraz 20 μM 5-fluorouracil [5-fluoro-2'-deoxyuridine]). Inkubować kultury przez 5 dni*. Na tym etapie można przeprowadzić trypsynizację i policzyć komórki pozostałe w kilku studzienkach, aby określić liczbę neuronów, które przeżyły działanie czynnika antymitotycznego. Typowo w płytce 96-dołkowej pozostaje około 1 000 neuronów na studzienkę.
*Problemy z kontaminacją grzybiczą lub bakteryjną są zazwyczaj widoczne w ciągu pierwszych 24 h hodowli. Przed wymianą pożywki należy dokładnie sprawdzić każdą studzienkę pod kątem wzrostu drobnoustrojów. Jeśli problem dotyczy tylko ograniczonej liczby studni, można je potraktować rozcieńczonym roztworem wybielacza, wypłukać PBS i wysuszyć, aby kontynuować eksperyment. Zalecamy powtórzenie każdego eksperymentu, w którym wystąpiła kontaminacja mikrobiologiczna, nawet w niewielkiej liczbie studni. W przypadku stwierdzenia rozległej kontaminacji mikrobiologicznej w płytce 96-dołkowej należy przerwać eksperyment.
2. Zakażanie kultur SCG wirusem HSV-1 Us11-EGFP i ustanawianie latencji
W celu zapoznania się z przydatnymi informacjami na temat technik wirusologicznych, w tym podstawowej propagacji wirusów, określania miana wirusa oraz wielokrotności infekcji (MOI), czytelnik może odnieść się do publikacji5. W kwestii biologii herpeswirusów zaleca się zapoznanie z publikacją6. Na koniec, odnośnie poprzednich przykładów, innych protokołów oraz dodatkowych informacji dotyczących litycznej infekcji neuronów SCG przez alfa-herpeswirusy, a także w celu porównania z adaptacjami naszego protokołu do badania latencji i reaktywacji, czytelnik może odnieść się do publikacji7-10.
- W 6. dobie in vitro (DIV 6) dodaj acyklowir (ACV) do obecnej pożywki w każdej studzience, tak aby stężenie końcowe wynosiło 100 μM*. Na przykład, jeśli każda studzienka zawiera 50 μl, dodaj 25 μl roztworu zapasowego ACV o stężeniu 300 μM. Zazwyczaj ACV dodaje się w noc poprzedzającą infekcję, ale można go również podać na 6–8 h przed infekcją.
*Jest wyjątkowo ważne, aby w każdym momencie ograniczać niepotrzebną manipulację fizyczną neuronem. Samą wymianę pożywki lub zakażanie zapasami wirusa należy przeprowadzać bardzo delikatnie i powoli. W przeciwnym razie powstały stres mechaniczny może negatywnie wpłynąć na żywotność neuronów.
- W 7. dniu in vitro (DIV 7) zainfekuj hodowle SCG wirusem HSV-1 Us11-EGFP (opisanym w ref11) przy wielokrotności infekcji (MOI) w zakresie 1–2 (patrz poniższy ważny komentarz dotyczący wyznaczania optymalnego MOI)*. Dodaj rozcieńczonego wirusa bezpośrednio do istniejącej pożywki w dołku. Uwzględnij kontrolę mock-infected oraz dodatnią kontrolę infekcji litycznej w pożywce bez ACV. Pozostaw próbki do toku infekcji przez 2-3 hr w temperaturze 37 °C.
*MOI oblicza się na podstawie miana wirusa wyznaczonego poprzez test plackowy w komórkach Vero12 oraz liczby wysianych żywych komórek na dołek w kroku 1.14. Obliczenie to jest przydatne jedynie w sensie operacyjnym, ponieważ całkowita liczba wysianych komórek obejmuje neurony wraz z zanieczyszczającymi je glejem i fibroblastami. Ponieważ te zanieczyszczające dzielące się komórki są usuwane poprzez traktowanie środkami antymitotycznymi, efektywne MOI dla przeżyjących neuronów jest w rzeczywistości wyższe. Z początkowej liczby 5,000 - 6,000 żywych komórek, po zastosowaniu środków antymitotycznych pozostaje około 1,000 neuronów (co oceniono poprzez trypsynizację i bezpośrednie liczenie komórek). Optymalne MOI do stosowania podczas infekowania kultur neuronalnych może nieco różnić się w zależności od preparatu zapasu wirusa. Przy każdym nowym preparacie wirusa zalecamy przetestowanie ograniczonego zakresu różnych wartości MOI od 1 do 2. Celem jest zidentyfikowanie takiej wartości, która wywiera najmniejszy wpływ na żywotność neuronów i skutkuje największą liczbą zdarzeń indukowanej reaktywacji (zdefiniowanych w sekcji 3). Wirus Us11-EGFP jest szczególnie pomocny w szybkiej optymalizacji warunków, ale można również stosować inne metody odczytu, takie jak test plackowy lub ilościowy PCR. Pomocne może być zastosowanie wirusa oczyszczonego za pomocą poduszki sacharozowej w celu usunięcia zanieczyszczeń obniżających żywotność komórek, choć nie jest to niezbędne i nie jest wykonywane rutynowo.
- Ostrożnie zastąp podłoże do infekcji świeżym NBM zawierającym 50 ng / ml NGF oraz 100 μM ACV*.
*Niezwykle ważne jest, aby zachować maksymalną ostrożność podczas wymiany pożywki infekcyjnej. Należy skierować końcówkę pipety na ściankę dołka, a nie na jego dno, i pozwolić pożywce powoli spłynąć na komórki. Nawet szybkie wypchnięcie pożywki z pipety może wygenerować siłę wystarczającą do odczepienia aksonów od podłoża, co zazwyczaj powoduje odwarstwienie komórek w formie płata. Jeśli odczepi się tylko ograniczona liczba neuronów (20-30%), konsekwencje są minimalne, pod warunkiem, że komórki wyglądają na zdrowe. Odczepione neurony prawdopodobnie z czasem przywrą ponownie; jednak aksony nie będą już prawidłowo wyciągnięte i wyrosną nowe aksony. Choć nie jest to rozwiązanie optymalne, eksperyment może być kontynuowany, jeśli problem dotyczy tylko ograniczonej liczby dołków. W przypadku rozległego odczepienia neuronów (70-80%), nie zalecamy włączania dotkniętych dołków do eksperymentu. Jeśli w większości dołków odczepiło się 70-80% neuronów, zalecamy przerwanie eksperymentu.Mimo że neurony mogą ponownie przywrzeć, zazwyczaj tworzą one duże skupiska. Utrudnia to prawidłową ocenę poszczególnych reaktywowanych neuronów. Zalecamy powtórzenie każdego eksperymentu, w którym zaobserwowano dołki z odczepionymi neuronami, aby upewnić się, że wskaźniki reaktywacji nie zostały pod wpływem różnic w adhezji neuronów do dołków.
Dodatkowo kluczowe jest to, aby zawsze obchodzić się z kulturami jak najdelikatniej. Stres mechaniczny wynikający z niepotrzebnych, gwałtownych ruchów (w tym wielokrotnego otwierania i zamykania drzwi komory inkubatora) lub siłowego aplikowania pożywki może upośledzić zdolność kultur do utrzymywania latencji HSV-1, co może prowadzić do niedopuszczalnie wysokiego poziomu spontanicznej reaktywacji w danym eksperymencie.
- Utrzymywać hodowle przez 6 dni, podczas których wirus przejdzie w stan latencji. W tym okresie należy użyć mikroskopu fluorescencyjnego do monitorowania stanu zdrowia neuronów oraz ekspresji Us11-EGFP jako wskaźnika replikacji litycznej. Us11-EGFP powinien być wykrywalny WYŁĄCZNIE w studzienkach kontrolnych bez zastosowania ACV, co wskazuje na przebieg prawidłowej infekcji pierwotnej i produktywną replikację lityczną. Neurony mogą wykazywać efekty cytopatyczne nawet przy braku produktywnego wzrostu wirusa. Zainfekowane hodowle powinny być ściśle monitorowane i porównywane z neuronami poddanymi infekcji pozorowanej.
3. Reaktywacja i ocena
- W 14. dniu in vitro (DIV 14) ostrożnie zastąp pożywkę zawierającą ACV świeżą pożywką pozbawioną ACV. Jeśli jest to właściwe, wprowadź w tym czasie zmienne farmakologiczne (lub biologiczne). Należy pamiętać o przestrzeganiu środków ostrożności określonych w punkcie 2.3.
- W okresie od 5 do 6 dni monitoruj żywe kultury za pomocą mikroskopu fluorescencyjnego, aby wykryć neurony przechodzące reaktywację. Alternatywnie pobierz próbki do innych rodzajów analiz (białek, kwasów nukleinowych, testu plackowego itp.).
- Oblicz częstotliwość reaktywacji, licząc liczbę studzienek zawierających neurony dodatnie pod kątem EGFP, i wyraź tę wartość jako proporcję całkowitej liczby studzienek z próbkami. Należy zauważyć, że ekspresja EGFP w pojedynczej studzience nie pozwala odróżnić pierwotnego zdarzenia reaktywacji od późniejszej infekcji wynikającej z rozprzestrzeniania się wirusa. Ponieważ rozprzestrzenianie zakaźne jest ograniczone do jednej studzienki z kulturą, obecność jednego lub więcej neuronów EGFP-dodatnich w studzience jest w tych warunkach operacyjnie definiowana jako jedno zdarzenie reaktywacji.
*W kulturze mogą wystąpić wielokrotne zdarzenia reaktywacji, jak opisano w1. Aby odróżnić pierwotne zdarzenie reaktywacji od rozprzestrzeniania się wirusa wynikającego z reaktywacji, można dodać inhibitor enkapsydacji WAY-150138. Poprzez blokowanie enkapsydacji nie powstaje zakaźny wirus, a rozprzestrzenianie się wynikające z reaktywacji staje się niemożliwe. W związku z tym sygnał EGFP wykryty w obecności WAY-150138 odzwierciedla liczbę niezależnych zdarzeń reaktywacji w obrębie pojedynczej studni hodowlanej1,13-15. Należy pamiętać, że WAY-150138 jest skuteczny wyłącznie przeciwko szczepowi HSV-1 Patton i nie jest dostępny w sprzedaży. Jako alternatywę dla WAY-150138 można rozważyć następujące opcje: i) wykorzystanie wirusa mutantowego o upośledzonej zdolności do rozprzestrzeniania się na sąsiednie komórki; ii) zastosowanie wirusa reporterowego, w którym EGFP jest ekspresyjny z promotora IE przy ciągłej obecności ACV; iii) traktowanie PAA lub ACV w celu zapobiegania ekspresji późnych genów (i produkcji zakaźnego wirusa), a następnie przeprowadzenie immunofluorescencji z użyciem przeciwciał skierowanych przeciwko produktowi genu IE.
4. Alternatywne metody oceny reaktywacji z wykorzystaniem testu
Wyniki z pojedynczego, indywidualnego eksperymentu powinny być uzyskiwane z jednej partii preparatu SCG. Eksperymenty powtórzone można przeprowadzać z niezależnymi preparatami SCG, pod warunkiem, że każde powtórzenie zostało wykonane przy użyciu pojedynczej partii SCG.
- Ocena transkrypcji litycznej HSV-1. Należy zebrać RNA w wybranych punktach czasowych po usunięciu ACV, w obecności lub przy braku różnych eksperymentalnych induktorów reaktywacji. W przypadku stosowania płytek hodowlanych 96-dołkowych zaleca się łączenie co najmniej 20 dołków dla każdej próbki (około 105 komórek na próbkę RNA). Alternatywnie, SCG można wysiać w większych dołkach (np. w płytce 24-dołkowej użyć 4-5 x104 komórek/dołek). Choć możliwe jest wykrycie RNA z mniej niż 20 dołków, małe objętości prowadzą do nieuzasadnionej zmienności między próbkami.
- Wykrywanie białek litycznych HSV-1. Należy zebrać lizaty w wybranym czasie po indukcji reaktywacji. Do każdego z 10 dołków w płytce 96-dołkowej należy dodać 7,5 μl buforu do lizy, a następnie przeprowadzić analizę za pomocą SDS-PAGE i immunoblottingu. Alternatywnie, białka wirusowe można wykryć metodą pośredniej immunofluorescencji. Pierwotny wysiew musi zostać wykonany na podłożu umożliwiającym obrazowanie, takim jak sterylna szklana lamella, która została uprzednio pokryta poli-D-lizyną (0,2 mg/ml, Sigma) przed aplikacją kolagenu i lamininy (patrz 1.10).
- Wykrywanie cząsteczek zakaźnych. Należy zebrać supernatant hodowli po reaktywacji. Należy wykonać test plackowy na monowarstwach komórek Vero, wykorzystując rozcieńczenia seryjne supernatantu. Dodatkowo testy plackowe można przeprowadzić z użyciem lizatów kultur poddanych zamrażaniu i rozmrażaniu, aby uwzględnić cząsteczki związane z komórkami w celu oznaczenia miana.
5. Reprezentatywne wyniki
Rysunek 2A przedstawia przykład, w którym 1 μM trichostatyny A (TSA), znanego induktora reaktywacji16-18, zastosowano do kultur SCG z latentną infekcją szczepu reporterowego HSV1 EGFP-Us11 typu dzikiego. Przy zastosowaniu TSA reaktywacja osiąga 50% wartości maksymalnej w ciągu 2 dni, a do 5 dnia stabilizuje się na poziomie około 60% studni. Poziom bazowej reaktywacji („spontanicznej”) w tym eksperymencie wynosi około 10% i zazwyczaj mieści się w zakresie 10-20% w tym systemie in vitro. Maksymalne poziomy reaktywacji różnią się w zależności od zastosowanego induktora reaktywacji. Wiele induktorów reaktywacji można stosować przez cały czas trwania eksperymentu, ponieważ nie zakłócają one produkcyjnej replikacji wirusa, jednak musi to zostać określone empirycznie. Inne induktory, w tym każdy odczynnik wpływający na żywotność neuronów lub utrudniający zakończenie produkcyjnego cyklu życiowego wirusa, mogą wymagać krótkotrwałej aplikacji impulsowej w celu wywołania reaktywacji.
Chociaż akumulacja EGFP-Us11 w każdej studni eksperymentu przedstawionego na Rysunku 2A wskazuje na reaktywację z latentności, nie pozwala ona rozstrzygnąć, czy sygnał Us11-EGFP w pojedynczych neuronach pochodzi z niezależnego zdarzenia reaktywacji, czy z rozprzestrzeniania się reaktywowanego wirusa w hodowli. Aby ocenić liczbę neuronów przechodzących niezależne zdarzenia reaktywacji w każdej studni, hodowle poddano wstępnej obróbce związkiem WAY-150138, który specyficznie blokuje rozprzestrzenianie się wirusa poprzez zapobieganie enkapsydacji wirusowego genomu DNA13-15. Zainfekowane hodowle neuronów współczulnych potraktowano związkiem WAY-150138, a reaktywację indukowano za pomocą TSA. Znaczną liczbę neuronów wykazujących pozytywny wynik dla EGFP wykryto wyłącznie w studniach traktowanych TSA w porównaniu z hodowlami kontrolnymi traktowanymi DMSO, co dowodzi, że w pojedynczej hodowli zachodzi szereg niezależnych zdarzeń reaktywacji (Rysunek 2B).
W naszym teście reporter Us11-EGFP jest ekspresowany z endogennego promotora Us1111. Ponieważ Us11 jest „prawdziwie późnym” genem litycznym wirusa (typ γ2), do silnej ekspresji wymagana jest replikacja viralnego DNA. Zostało to przedstawione na Rysunku 3, gdzie akumulacja EGFP-Us11 jest upośledzona przez fosfonowocetową kwas (PAA), inhibitor polimerazy DNA wirusa, w kulturach indukowanych do reaktywacji inhibitorem kinazy PI3 LY294002.

Rycina 1. Schemat ilustrujący typowy protokół eksperymentalny z wykorzystaniem systemu hodowli neuronów in vitro do badania latencji i reaktywacji HSV-1. 1) Po wycięciu zwojów szyjnych górnych (SCG) od szczurów w 21. dniu embrionalnym (E21), zdysocjowane neurony wysiewa się do płytek 96-dołkowych i traktuje środkami antymitotycznymi w celu usunięcia komórek nieneuronalnych. 2) Po 6 dniach in vitro (DIV) kultury infekuje się rekombinowanym HSV-1 zawierającym EGFP połączone z kodowanym przez wirusa późnym genem Us11 (EGFP-HSV-1) w obecności acyklowiru (ACV), leku przeciwwirusowego, który blokuje replikację lityczną. 3) W 14. dniu (DIV 14) acyklowir jest usuwany, a ekspresja EGFP nie jest wykrywana. Kultury mogą być w ten sposób stabilnie utrzymywane przez miesiąc lub dłużej, bądź można dodać zmienną testową, aby ocenić jej zdolność do wywołania reaktywacji z latencji. Zmienna ta może mieć postać małocząsteczkowego inhibitora chemicznego, przeciwciała przeciwko rozpuszczalnej neurotrofinie lub białku powierzchniowemu komórki, albo lentiwirusa wykazującego ekspresję specyficznego dla genu shRNA lub białka ekspresowanego ektopowo. Reaktywację monitoruje się następnie poprzez ocenę liczby studzienek pozytywnych pod kątem EGFP w czasie rzeczywistym.

Rycina 2. TSA reaktywuje HSV-1 w kulturach SCG. Kultury SCG zostały zainfekowane latentnie zgodnie z opisem w Rycini 1. W 14. dniu in vitro (DIV 14) ACV usunięto i zastąpiono medium zawierającym 1 μM trichostatyny A (TSA). (A) Kultury wizualizowano i oceniano za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej każdego dnia po podaniu leku przez okres 5 dni. Przedstawiono procent studni ulegających reaktywacji w trakcie eksperymentu w porównaniu do kultur kontrolnych traktowanych DMSO. Procent reaktywacji obliczono na podstawie liczby studni pozytywnych pod kątem EGFP z 20 studni na 96-dołkowej płytce hodowlanej. Słupki błędu wskazują standardowy błąd średniej. (B) Latentnie zainfekowane kultury traktowano TSA oraz inhibitorem enkapsydacji wirusowego DNA, WAY-150138 (20 μg/ml). Liczbę neuronów EGFP+ porównano 48 h po podaniu leków z kontrolą traktowaną DMSO i WAY-150138. Każdy punkt danych reprezentuje stosunek neuronów EGFP+ do 1 000 neuronów w studni hodowlanej. Słupek przedstawia średni procent neuronów EGFP+ w studni.

Rysunek 3. Detekcja EGFP zależy od replikacji viralnego DNA. Hodowle SCG zostały zainfekowane latentnie, a następnie poddane działaniu 10 μM LY29004, znanego induktora reaktywacji 1. Reaktywację wywołaną przez LY (kolor niebieski) porównano z reaktywacją po zastosowaniu inhibitora syntezy viralnego DNA, kwasu fosfonooctowego (PAA) (300μg/ml, kolor czerwony) oraz obu związków jednocześnie (kolor zielony).