Metoda ta została zastosowana w badaniach opisanych w pracy Boland et al. Nature 461, 91-96 (2009).1
1. Przygotowanie lentiwirusa
Niniejszy protokół wykorzystuje indukowalne doksycykliną lentiwirusowe wektory transmisyjne kodujące Oct4, Sox2, Klf4 oraz c-Myc pod kontrolą elementu odpowiedzi tetO. Transgeny są aktywowane przez odwrotny białkowy aktywator transkrypcji tetracykliny, rtTAM2.216, który indukuje ekspresję czynników reprogramowania w obecności doksycykliny. System ten umożliwia ściśle kontrolowaną, wysoką ekspresję czynników reprogramowania. Zastosowane tutaj wektory lentiwirusowe są samoinaktywujące, w związku z czym nie mogą replikować się po integracji z genomem. Należy jednak zachować ostrożność podczas pracy z lentiwirusami; prace te powinny być prowadzone w laboratoriach zgodnych ze standardami BSL2 (USA) i S2 (Europa).
- Rozmrozić komórki HEK293T i przeprowadzić co najmniej jeden pasaż przed transfekcją. Komórki należy hodować w gęstości poniżej konfluencji w medium HEK w temperaturze 37 °C, 5% CO2 w warunkach zwiększonej wilgotności. Rutynowo pasażować komórki co 2 dni, stosując stosunek podziału 1:6-1:10.
- Zasiać ~8 x 106 komórek HEK293T/T150 w 25 ml medium HEK. Użyć jednej flaski T150 dla każdej preparacji lentiwirusa.
- Następnego dnia przeprowadzić transfekcję komórek HEK293T metodą wytrącania fosforanem wapnia. (Uwaga: w naszych doświadczeniach wytrącanie fosforanem wapnia rutynowo daje 80-90% wydajności transfekcji; można jednak stosować również kationowe odczynniki do transfekcji lipidowej, takie jak Lipofectamine 2,000). Przygotować dwie probówki stożkowe o pojemności 15 ml dla każdego wirusa do przygotowania. Oznaczyć probówki jako „A” i „B”. Probówka A: po 10 μg każdego z: lentiwirusowego wektora wahadłowego kodującego czynniki reprogramowania (lub rtTAM2.2), wektorów pakujących oraz plazmidu kodującego wirusowe białko otoczki, VSVg. Do probówki A dodać 186 μl 2 M CaCl2 i dopełnić objętość do 1,5 ml sterylną wodą H2O. Probówka B: 1,5 ml 2x HBS (podgrzane do temperatury pokojowej).
- Pipetować mieszaninę w probówce A, aż powstanie jednorodny roztwór. Dodawać roztwór A do roztworu B kropla po kropli i pozostawić w temperaturze pokojowej na 2-3 min.
- Odssać medium wzrostowe z komórek HEK293T i zastąpić je 22 ml podgrzanego medium HEK bez penicyliny i streptomycyny.
- Przenieść za pomocą pipety połączone roztwory AB (osad fosforanu wapnia) bezpośrednio do komórek HEK293T i równomiernie rozprowadzić poprzez delikatne kołysanie.
- 24 h po transfekcji komórek HEK-293T lentiwirusem usunąć medium wzrostowe i zastąpić je 25 ml świeżego, podgrzanego medium HEK. Przenieść transfekowane komórki HEK z powrotem do inkubatora.
- 48 h po transfekcji komórek HEK-293T lentiwirusem zebrać media wzrostowe zawierające cząstki lentiwirusowe z transfekowanych komórek HEK. Usunąć zanieczyszczenia cząsteczkowe z zebranego roztworu wirusowego poprzez wirowanie przy 3,000 x g przez 5 min w temperaturze 4 °C.
- Skoncentrować wirusa poprzez ultrawirowanie przez poduszkę 20% sacharozy (2 ml sacharozy/25 ml supernatantu wirusowego) przez 2 h przy 112,000 x g w temperaturze 4 °C. Resuspender pellet wirusowy w 0,4 ml medium MEF w temperaturze 4 °C przez 15-30 min przy delikatnym kołysaniu. Przechowywać cząstki wirusowe w jednorazowych alikwotach (t.j. 50 μl) w temperaturze -80 °C.
2. Przygotowanie mysich fibroblastów embrionalnych (MEF) do reprogramowania
Uwaga: Przedstawiony tutaj protokół dotyczy otrzymywania iPSC z embrionalnych fibroblastów mysich w wieku E 13.5 do zastosowania w testach TEC. Choć inne grupy wygenerowały myszy all-iPSC z komórek dawców dorosłych, nie testowaliśmy tej metody na innych typach komórek i nie możemy mieć pewności, że typ komórek dawcy nie jest czynnikiem wpływającym na wynik.
- Przygotować zapłodnienia myszy w czasie. W 13,5 dniu embrionalnym (E13.5) uśmiercić ciążną samicę i wypreparować embriony z rogów macicy. Umieścić i przechowywać embriony w 1x PBS (schłodzonym do 4 °C) na lodzie.
- Usunąć tkanki pozazarodkowe (i.e. chorion, amnion i łożysko). Odciąć głowę embrionu oraz ogon (opcjonalnie – jeśli jest wymagany do genotypowania) i kończyny. Wyjąć organy wewnętrzne, używając pęsety lub szpatułki w kształcie łyżki, a pozostałą część tułowia rozdrobnić ostrzem skalpela lub ostrymi nożyczkami.
- Przemyć rozdrobniony tułów w 5 ml schłodzonego 1x PBS. Wirować przy 200 x g przez 5 min.
- Odssać naddatek. Resuspender osad w 5 ml 0,25% Trypsyny-EDTA i inkubować w 37 °C przy intensywnym wytrząsaniu przez 20-30 min.
- Dodać 5 ml pożywki MEF (podgrzanej do 37 °C), wymieszać i wirować przy 200 x g przez 5 min.
- Odssać naddatek i resuspender osad w podgrzanej pożywce MEF.
- Wysiać dysocjowane MEF do 2-3 studni płytki 6-dołkowej uprzednio pokrytej 0,1% żelatyną. Jest to uznawane za pasaż 1.
- Pasażować MEF w rozcieńczeniu 1:4-1:5 co 48 hr. MEF w pasażu 3 są gotowe do transdukcji lentiwirusowej.
3. Wytwarzanie linii iPSC
- Dzień przed transdukcją lentiwirusową: wysiać ~3 x 105 pierwotnych MEF do jednego dołka płytki 6-dołkowej uprzednio pokrytej 0,1% żelatyną.
- Dzień 1: pierwotne MEF powinny osiągnąć 80-90% konfluencji przed transdukcją lentiwirusową. Dodać cząstki lentiwirusowe bezpośrednio do pożywki MEF i inkubować z MEF przez noc w temperaturze 37 °C, przy 5% CO2 w warunkach zwiększonej wilgotności.
- Następnego dnia (dzień 2) odessać pożywkę i dwukrotnie przemyć 3 ml 1x PBS w celu usunięcia cząstek wirusowych.
- Dodać do komórek 0,5 ml podgrzanego do temperatury roboczej 0,25% Trypsyny-EDTA i inkubować w 37 °C przez 3-5 min, wykonując sporadycznie ruchy kołyszące.
- Triturować do uzyskania zawiesiny pojedynczych komórek. Sprawdzić komórki pod mikroskopem świetlnym, aby upewnić się, że uzyskano zawiesinę pojedynczych komórek.
- Przenieść MEF do probówki stożkowej 15 ml zawierającej 5 ml pożywki MEF. Odwirować przy 200 x g przez 5 min. Odessać supernatat i delikatnie resuspendować komórki w pożywce MEF.
- Równomiernie podzielić zawiesinę komórkową pomiędzy dwa dołki płytki 6-dołkowej uprzednio pokrytej 0,1% żelatyną.
- Kołysać płytką w przód i w tył, na boki, a następnie raz w ruchu okrężnym, aby uzyskać równomierny rozkład komórek w dołku. Inkubować przez noc w 37 °C, przy 5% CO2 w warunkach zwiększonej wilgotności.
- Dzień 3: powtórzyć kroki 4-9, z wyjątkiem tego, że komórki z jednego dołka należy równomiernie podzielić na 3 dołki płytki 6-dołkowej uprzednio pokrytej 0,1% żelatyną. Pozwoli to uzyskać 6 dołków z transdukowanymi pierwotnymi fibroblastami.
- Dzień 4: dodać doksycyklinę (dox) w stężeniu 10 μg/ml do 5 z 6 dołków. Jeden dołek powinien pozostać nieleczony jako kontrola.
- Dodać VPA w stężeniu 1,9 mM do 3 z 5 dołków traktowanych dox. VPA obniża tempo proliferacji MEF. Gęste kultury MEF tolerują przedłużoną ekspozycję na VPA, podczas gdy kultury subkonfluencyjne wykazują tendencję do starzenia się w ciągu 2-5 dni. Dlatego MEF powinny być w 100% konfluencyjne w momencie dodawania VPA. Uwaga: w naszych eksperymentach z reprogramowaniem stosujemy VPA, ponieważ jest on znanym modyfikatorem epigenetycznym i wykazano, że zwiększa wydajność generowania iPSC17, choć efekty i mechanizmy działania VPA w odniesieniu do generowania w pełni pluripotencjalnych linii iPSC nie są znane.
- Dzień 5: odessać pożywkę, przemyć i poddać komórki trypsynizacji jak wcześniej. Przesiać komórki traktowane dox/VPA do naczynia hodowlanego o powierzchni 15 cm2 uprzednio pokrytego 0,1% żelatyną, a komórki z pozostałych wariantów do naczyń o powierzchni 10 cm2 pokrytych żelatyną, w pożywce dla komórek ES uzupełnionej o świeżą dox i VPA.
- Uzupełniać pożywkę codziennie, stosując pożywkę ESC z dodatkiem świeżej dox i VPA. Kolonie przypominające ESC powinny zacząć pojawiać się po ok. 7 dniach w traktowaniu dox/VPA oraz po ok. 10 dniach w traktowaniu samą dox. W przypadku braku traktowania dox nie powinny pojawić się żadne kolonie.
- Gdy kolonie będą miały jasną, refrakcyjną, wyraźnie zarysowaną granicę i będą zawierać 30-50 komórek, ręcznie wyizolować kolonie za pomocą końcówki do nakładania żelu i przenieść do płytki 96-dołkowej z dnem w kształcie litery U zawierającej 20 μl 0,25% trypsyny-EDTA. Poddać trypsynizacji do pojedynczych komórek i przenieść na warstwę feederową do płytki 96-dołkowej z płaskim dnem w 150 μl pożywki ESC zawierającej dox/VPA lub samą dox.
- Kontynuować klonalną ekspansję wyizolowanych linii iPSC na warstwach feederowych w pożywce ESC. Usunąć dox i VPA w 19. dniu po ich dodaniu (23. dzień po transdukcji). Odrzucić linie iPSC, które nie utrzymują zdolności do samoodnawiania lub tempa proliferacji zbliżonego do kontrolnych ESC.
Przed przystąpieniem do TEC pomocne może być scharakteryzowanie linii iPSC w odniesieniu do ESC. Nasze linie scharakteryzowaliśmy poprzez 1) ekspresję endogennych markerów pluripotencji (SSEA-1, Oct4, Sox2, Nanog) za pomocą immunocytochemii, 2) analizę kariotypu poprzez liczenie chromosomów oraz 3) formowanie ciałek zarodkowych. Można również przeprowadzić specyficzny dla lentiwirusów test RT-qPCR, aby potwierdzić, że prowiralne transgeny nie są ekspresjonowane w iPSC. Zidentyfikowaliśmy jednak w pełni pluripotencjalne iPSC, opierając się wyłącznie na morfologii, immunobarwieniu i kariotypowaniu. W naszych eksperymentach wybór linii iPSC na podstawie morfologii i cech wzrostu przypominających ESC skutkował tym, że większość linii wykazywała ekspresję markerów pluripotencji, podczas gdy zazwyczaj identyfikowaliśmy kilka linii z potencjalnie nieprawidłowymi kariotypami.
4. Przygotowanie iPSC do wstrzyknięcia do blastocysty
Wykazano, że numer pasażu linii PSC wpływa na jej pluripotencję18, choć może to zależeć od konkretnej linii19. Do wytworzenia dorosłych myszy all-iPSC wykorzystaliśmy iPSC z pasaży 8-14.
- Rozmrozić iPSC i wysiać na warstwie feederów w pożywce ESC. Przesiać komórki przynajmniej raz na feederach przed użyciem do iniekcji.
- Jedna studnia płytki 6-dołkowej zawierająca 70-80% konfluencji iPSC zapewni liczbę komórek do iniekcji z nawiązką. Odessać pożywkę wzrostową i przemyć komórki ~3 ml 1x PBS (bez Ca2+/Mg2+).
- Dodać do komórek 0,5 ml uprzednio ogrzanej 0,05% trypsyny-EDTA i inkubować w 37 °C przez 10 min, sporadycznie kołysząc płytką.
- Triturować w celu uzyskania zawiesiny pojedynczych komórek. Obserwować komórki pod mikroskopem świetlnym, aby upewnić się, że uzyskano zawiesinę pojedynczych komórek. iPSC muszą znajdować się w zawiesinie pojedynczych komórek, ponieważ kolonie/agregaty komórkowe zapchają pipetę do iniekcji.
- Po uzyskaniu zawiesiny pojedynczych komórek dodać do studni 1,0 ml pożywki ESC i umieścić płytkę z powrotem w inkubatorze w 37 °C. Inkubować przez ~15 min lub do momentu, aż większość feederów zacznie przylegać.
- Ostrożnie usunąć pożywkę zawierającą iPSC, dbając o to, aby nie oderwać słabo przylegających feederów.
- Przenieść iPSC do probówki stożkowej o pojemności 15 ml zawierającej 5 ml pożywki ESC. Centryfugować przy 200 x g przez 5 min. Odessać supernatant i usunąć resztę pożywki ESC za pomocą mikropipety. Opukać probówkę, aby oderwać osad, i delikatnie resuspender komórki w 0,2-0,5 ml schłodzonej pożywki FHM. Przechowywać komórki na lodzie do momentu i w trakcie iniekcji do tetraploidalnych blastocyst.
5. Generowanie blastocyst tetraploidalnych
Procedury wykonane w tej sekcji zostały szczegółowo opisane w innych opracowaniach5,6,20. Poniżej przedstawiamy naszą technikę, zoptymalizowaną pod kątem manipulatora elektrochemicznego BTX Electro Cell Manipulator ECM 2001.
- Przygotuj myszy będące dawcami embrionów poprzez stymulację samic w wieku 23–28 dni (C57BL/6J-Tyrc-2J /BALB/cByJ F1) za pomocą PMS i HCG. Podaj 5 IU PMS o godzinie 14:00, a 5 IU HCG po 47 h. Po wstrzyknięciu HCG skojarz samice z samcami rozpłodniczymi C57BL/6J-Tyrc-2J /BALB/cByJ F1. Następnego dnia sprawdź obecność czopów pochwowych.
- Uśmierć samice z obecnym czopem i pobierz jajowody. Pozyskaj embriony w stadium 1 komórki, umieszczając jajowody w medium FHM z hialuronidazą i delikatnie rozrywając ampuły. Pozostaw masy cumulus w roztworze FHM/hialuronidaza na 5–7 min.
- Zbierz embriony w stadium 1 komórki za pomocą pipety ustnej i przemyj je przez krople medium FHM przed przeniesieniem do hodowli w KSOM-AA. Inkubuj w temperaturze 37 °C, 5% CO2 pod warstwą oleju mineralnego przez noc, a w dniu elektrofuzji wybierz embriony w stadium 2 komórek; pozostałe embriony należy odrzucić.
- Umieść mikroslajd BTX w szalce Petriego o średnicy 10 cm. Wlej odpowiednią ilość medium do elektrofuzji w temperaturze pokojowej, aby zanurzyć slajd w roztworze, ale nie tak dużo, by całkowicie zanurzyć bieguny elektrod.
- Włącz urządzenia ECM 2001 oraz BTX Enhancer 400. Podłącz kable ECM do elektrod mikroslajdu i przymocuj kable do boku szalki Petriego, aby zapobiec niezamierzonemu przesunięciu slajdu.
- Wykonaj jeden impuls ręczny, aby uzyskać odczyt na urządzeniu BTX enhancer i zanotuj napięcie przykładanych prądów AC/DC. Prąd AC będzie kontrolował prędkość, z jaką embriony ustawią się między elektrodami, prąd DC spowoduje fuzję blastomerów, a czas impulsu określi długość impulsu DC. Dobrym punktem wyjścia są parametry: AC 3V, DC 100V i czas 0,05 msec. Optymalne napięcie DC mieści się w zakresie 90–150 V.
- Za pomocą pipety ustnej pobierz około 30–40 dwukomórkowych embrionów z hodowli KSOM-AA i przemyj je przez kilka kropli medium do elektrofuzji. Nabierz świeże medium do elektrofuzji z szalki z mikroslajdem do pipety ustnej i pobierz z niej przemyte embriony. Umieść je w 1 mm szczelinie między elektrodami na mikroslajdzie. Upewnij się, że są one ustawione na środku szczeliny i nie stykają się ze sobą.
- Przykładaj prąd AC, naciskając przycisk impulsu ręcznego. Embriony będą obracać się w polu AC, aż płaszczyzna kontaktu blastomerów stanie się równoległa do elektrod. Jeśli embriony nie ustawią się w ciągu kilku sekund, zwiększ ustawienie AC.
- Po ustawieniu się embrionów ponownie naciśnij przycisk impulsu ręcznego, aby przyłożyć impuls DC.
- Używając pipety z medium do elektrofuzji, zbierz embriony z mikroslajdu. Przemyj embriony przez kilka kropli KSOM-AA i umieść je w hodowli KSOM-AA w temperaturze 37 °C, 5% CO2. Fuzja blastomerów powinna zakończyć się w czasie krótszym niż 30 min w hodowli.
- Powtórz kroki 7–11 dla pozostałych dwukomórkowych embrionów. Po kolejnych grupach fuzji monitoruj i wybieraj embriony z zlanymi blastomerami. Pomyślnie zfuzowane embriony będą sprawiać wrażenie, że znajdują się w stadium 1 komórki. Odrzuć embriony lizowane oraz dwukomórkowe po 30 min w hodowli. Jeśli stopień fuzji jest niższy niż 80%, zwiększ napięcie i/lub czas w przyrostach 5V i 0,01 msec. Jeśli poziom lizy przekracza 20%, odpowiednio zmniejsz napięcie DC i/lub czas. Optymalne ustawienia w naszych eksperymentach wynosiły: AC 4V, DC 146V i 0,07 msec. Ustawienia te konsekwentnie pozwalały uzyskać stopień fuzji na poziomie 90% lub wyższym przy niewielkiej lub zerowej lyzie.
- Kontynuuj hodowlę zfuzowanych embrionów w mikrokroplach KSOM-AA pod warstwą oleju mineralnego w temperaturze 37 °C, 5% CO2. Można oczekiwać, że 85–95% zfuzowanych embrionów utworzy tetraploidalne (4n) blastocysty po 48 h inkubacji.
6. Mikroiniekcja iPSC do blastocyst tetraploidalnych
Do wstrzykiwania do blastocyst wykorzystujemy odwrócony mikroskop Nikon TE-2000U wyposażony w optykę DIC oraz mikromanipulatory Narishige. Do każdej tetraploidalnej blastocysty wstrzykuje się 10-12 iPSC zgodnie ze standardowym protokołem wstrzykiwania ESC do blastocyst myszy, który został zaprezentowany w poprzedniej publikacji JoVE5,20,21
- Nanieś kroplę 20 μl FHM na środek wklęsłego szkiełka podstawowego i przykryj ją 150 μl oleju mineralnego.
- Zanurz pipetę przytrzymującą oraz igłę do mikroiniekcji w kropli FHM. Odczekaj 2-3 min, aż obie igły częściowo wypełnią się FHM.
- Przepłucz 20-30 tetraploidalnych blastocyst przez kolejne krople FHM i przenieś je do kropli FHM na szkiełku mikroskopowym.
- Zaciągnij ustami mieszaninę iPSC do kropli. Jeśli komórki są zbyt skoncentrowane lub zagregowane, konieczne może być wcześniejsze rozcieńczenie mieszaniny komórek w kropli FHM.
- Pobierz 100-200 komórek za pomocą igły iniekcyjnej.
- Utrzymaj blastocystę tak, aby masa komórkowa znajdowała się na pozycji godziny 9. Wstrzyknij komórki do blastocele, przebijając strefę błyskotkę i trofoblast na pozycji godziny 3. Wstrzyknij 16-18 komórek do każdej blastocysty.
- Przenieś blastocysty uzupełnione o iPSC z powrotem do hodowli w KSOM-AA.
7. Transfer uzupełnionych tetraploidalnych blastocyst do rogów macicy myszy biorczych
Uzupełnione tetraploidalne blastocysty są chirurgicznie przeniesione do rogów macicy samic myszy biorcy zgodnie z wytycznymi instytutu badawczego, stosując standardową technikę20, którą krótko podsumujemy. Wybierz samice myszy CD-1 w fazie proestrus i przygotuj je do kojenia z samcami poddanymi wazektomii. Następnego ranka sprawdź obecność czopów pochwowych. Samice są gotowe do transferu embrionów do macicy dwa dni po wykryciu czopa (2.5 dpc).
Na jeden dzień przed kopulacją samic biorców z wazektomizowanymi samcami, przygotuj dodatkowe samice CD-1 z niewazektomizowanymi samcami, które posłużą jako matki zastępcze dla myszy all-iPSC pozyskanych metodą cięcia cesarskiego.
8. Cięcie cesarskie i adaptacja młodych szczurów pochodzących z iPSC
Transfer embrionów TC zazwyczaj skutkuje licznymi resorpcjami po implantacji, nawet jeśli linia iPSC lub ESC wykazuje wysoki potencjał rozwojowy. W konsekwencji można spodziewać się nie więcej niż 4 żyjących szczeniąt (zazwyczaj 1-2) na jedną biorczynię. Tak małe mioty są zazwyczaj zaniedbywane przez matki. Aby zwiększyć poziom opieki neonatologicznej i przeżywalność, wykonujemy cięcia cesarskie oraz fostering zgodnie ze standardowymi protokołami20. W celu przeprowadzenia cięcia cesarskiego należy uśpić myszy biorczyń 16 dni po transferze embrionów w godzinach 19:00-20:00 (biorczynia 18,5 dpc) i wyciąć szczenięta z rogów macicy. Żyjące szczenięta należy przekazać pod opiekę matkom CD-1, które urodziły mioty tego samego dnia.