$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Chociaż nie pokazano tego w filmie, szczury najpierw otrzymały przedawkowanie 300 mg/kg pentobarbitalu, co spowodowało znieczulenie w czasie krótszym niż 3 minuty, a następnie zostały zabite przez ścięcie. Ich mózgi zostały następnie szybko, ale ostrożnie usunięte z czaszki i schłodzone w lodowatej soli fizjologicznej przez 5 minut. Ważne jest, aby pozwolić mózgowi ostygnąć przez ten czas przed preparacją MAV, tak aby MAV mógł zostać oddzielony od powierzchni kory mózgowej (górna część warstwy I). Mózg umieszczono następnie na dnie szklanej szalki Petriego spoczywającej na lodzie, który był pełen (1 cm głębokości) lodowatej normalnej soli fizjologicznej lub 0,1 M soli fizjologicznej buforowanej fosforanem sodu pH = 7,4. Cała sekcja odbywa się z mózgiem w większości zanurzonym w soli fizjologicznej.
1. Usunięcie szyszynki
- Ułóż mózg grzbietową stroną do góry (względem dna szalki Petriego). Szyszynka znajduje się w najbardziej ogonowym obszarze brzusznym między dwiema półkulami, tuż rostralnie do móżdżku (zachyłka szyszynki) i znajduje się tuż poniżej lub na powierzchni opon mózgowych nad szyszką. Najpierw usuń szyszynkę za pomocą dwóch małych kleszczyków z wygiętą końcówką. Ma różowy kolor jak kora mózgowa, ale często jest otoczony resztkami krwi i naczyń krwionośnych pozostałościami po usunięciu mózgu.
2. Usunięcie MAV
- Odwróć mózg "do góry nogami" i oddziel tętnicę kręgową, mniejsze tętnice i opony mózgowe pokrywające most od opon mózgowych i naczyń krwionośnych przodomózgowia. Następnie rozpoczyna się usuwanie MAV przodomózgowia.
Ważne jest, aby rozpocząć proces rozwarstwiania brzusznie. Duże główne tętnice koła Willisa, tętnice środkowe mózgu (MCA) i tętnice przednie są najsilniejsze i służą jako "rusztowanie", za pomocą którego mniejsze tętnice powierzchowne i tętniczki błony błony włosowej mogą być następnie usunięte z kory mózgowej wraz z pozostałą częścią opon mózgowych. Zobacz recenzję Scremin7, aby uzyskać więcej wizualnych reprezentacji i szczegółów dotyczących unaczynienia powierzchni mózgu.
- Zaczynając od dowolnej półkuli, użyj małych kleszczyków z wygiętą końcówką, aby przeciąć tylną tętnicę łączącą tuż za połączeniem tętnicy szyjnej wewnętrznej. W ten sposób oddziela się bardziej przednie i tylne drzewa tętnicze przodomózgowia. Powtórz ten sam proces dla przeciwległej półkuli.
- Chwytając kleszczem MCA i tętnicę przednią, delikatnie pociągnij w kierunku przednio-grzbietowym, tak aby MAV pokrywający brzuszną korę przednią (gruszkowaty, węchowy) został uniesiony nad i wokół przewodu węchowego. Powoduje to usunięcie dużej części MAV pokrywającej korę przednią (obręcz i oczodoł).
- Obróć mózg pod kątem od 45 do 90° do szalki Petriego. Boczne, bardziej przednie obszary MAV otaczające boczne obszary kory (ziarnista wyspowa, wtórna kora somatosensoryczna i kora słuchowa) można uwolnić od kory, chwytając MCA i powiązane tętnice i delikatnie ciągnąc grzbietowo wzdłuż kory. W razie potrzeby końce kleszczy mogą być użyte do podniesienia i uwolnienia głównych tętnic z kory podczas sekcji.
- Teraz usuń bardziej tylne boczne obszary MAV. (Należy pamiętać, że podczas tego procesu zbioru najlepiej jest przełączać się z jednej półkuli na drugą, aby upewnić się, że MAV pozostaje zimny i nawodniony. Ponadto, jeśli napotkasz opór w uwolnieniu MAV z kory mózgowej na jednej półkuli, tymczasowo przełącz się na półkulę przeciwległą, a następnie wróć do pierwotnej półkuli później.)
- Aby usunąć większość grzbietowych obszarów MAV otaczających pierwotną korę somatosensoryczną i ruchową, odwróć mózg grzbietową stroną do góry (w stosunku do dna szalki Petriego). Aby w końcu uwolnić MAV z mózgu, użyj końców kleszczy wzdłuż zatoki strzałkowej.
Ta część zebranego MAV może być tymczasowo przechowywana w lodowatym roztworze soli do czasu przeprowadzenia testów i analizy lub zamrożona w celu późniejszego przetworzenia. Często MAV obejmujący najbardziej tylne/ogonowe obszary kory (śródwęchowe, wzrokowe i większość ogonowych kory słuchowej) pozostaje przyczepiony do kory. Jego usunięcie jest pokazane w dalszej części filmu, gdy MAV między korą zaśledzioną a leżącymi nad nią wzgórkami są preparowane.
3. Usunięcie splotu naczyniówkowego
- Ustaw mózg grzbietową stroną do góry i przytrzymaj w miejscu większymi kleszczami Wepchnij mniejsze kleszcze w dół przez linię środkową między półkulami, a następnie użyj końców do przebicia kory i ciała modzelowatego (≈-3,3 mm od bregmy) do górnej części linii środkowej hipokampa.
- Użyj kleszczy, aby odciągnąć korę z modzelem od grzbietowego hipokampa i przegrody, odsłaniając większość komory bocznej. Splot naczyniówkowy można zlokalizować i zidentyfikować za pomocą falistej czerwonej linii wyznaczającej główną tętnicę biegnącą na jego długości. Użyj dwóch końców kleszczy, aby podważyć boczne ściany trzeciej komory i powiększyć ją na najbardziej ogonowym końcu (≈-4,3 mm od bregmy8).
- Za pomocą małych kleszczy wyciągnij ten koniec splotu naczyniówkowego z powrotem. Następnie przejdź do bardzo przedniego obszaru między przegrodą a jądrem ogoniastym/skorupą (najbardziej rostralna rozciągłość, ≈+1,6 mm od Bregmy) i za pomocą kleszczy powiększ ten odcinek komory i uwolnij splot naczyniówkowy. Wykonaj tę samą procedurę na przeciwległej półkuli, aby uzyskać drugi pozostały splot naczyniówkowy.
Również w tym przypadku tkanka ta może być tymczasowo przechowywana w lodowatej soli fizjologicznej do czasu przeprowadzenia testów i analiz lub zamrożona do późniejszego przetworzenia.
4. Usunięcie pozostałego MAV w 3komorze pokrywającej wzgórze i wzgórki, jak również w bardziej ogonowych obszarach kory mózgowej, w tym w korze retrosplenialnej, słuchowej i wzrokowej
- Usuń cały hipokamp z obu półkul, odsłaniając MAV nad wzgórzem i colliculi. Usunięcie tej części MAV jest znacznie mniej trudne niż usunięcie MAV przez korę mózgową.
- Wyciągnij tę część MAV wolno, chwytając większy układ krwionośny leżący nad przednią częścią wzgórza i delikatnie ciągnąc doogonowo. To unaczynienie jest połączone z siecią nadkolkularną i dostarcza krew do grzbietowego hipokampa i sieci grzbietowego wzgórza. Odciągnij go doogonowo i stopniowo uwalniaj sieć nadokrzemkową, aż do osiągnięcia ostatnich części naczynia krwionośnego koła tętniczego ogona.
W tym momencie należy zachować większą ostrożność, aby usunąć wszelkie pozostałe tylne brzuszne MAV na powierzchni ziarnistej kory zaśledzionowej, pierwotnej słuchowej i wzrokowej. Podobnie jak w przypadku innej części MAV obejmującej bardziej przednie części kory, tkanka ta może być tymczasowo przechowywana w lodowatym roztworze soli fizjologicznej do czasu badania i analizy lub zamrożona do późniejszego przetworzenia. Wszelkie pozostałe tylne brzuszne MAV pobrane za pomocą tego drugiego odcinka MAV powinny zostać usunięte i dodane do pierwszego wypreparowanego odcinka MAV pokrywającego korę, jeśli mają być analizowane oddzielnie.
5. Reprezentatywne wyniki
Gdy sekcja zostanie przeprowadzona poprawnie, powstałe tkanki MAV powinny znajdować się w dwóch nienaruszonych jednostkach o łącznej wadze około 35 do 45 mg. Początkowo wypreparowany MAV otaczający większość kory powinien ważyć około 25 mg, a MAV obejmujący wzgórze, wzgórki i korę potyliczną powinien ważyć około 15 mg. Powinien mieć lekko różowawy kolor od resztkowej krwi w naczyniach krwionośnych. Pobrany obustronny splot naczyniówkowy powinien znajdować się w dwóch nienaruszonych próbkach tkankowych, z których każda waży od 1 do 2 mg. Chociaż nadmiar wody można usunąć z MAV przed przechowywaniem lub przetwarzaniem za pomocą bibuły, takiej jak ta używana do czyszczenia soczewek, aby uniknąć utraty tkanki, nie jest dobrym pomysłem usuwanie nadmiaru wody z wypreparowanego splotu naczyniówkowego. Rysunek 1 został wygenerowany w celu porównania profili ekspresji w trzech regionach (prążkowie, kora ciemieniowa i MAV) w warunkach kontrolnych przy użyciu 60-merowych macierzy oligonukleotydowych Agilent-014879 Whole Rat Genome 4x44K (G4131F, Agilent Technologies, Palo Alto, CA; Akcesja NCBI GEO # GPL7294; GSE23093 i GSE29733, które znajdują się w repozytorium NCBI GEO). Dwa wykresy na rysunku obrazowo pokazują wyrażenie w 1) prążkowiu w porównaniu z korą ciemieniową i 2) MAV w porównaniu z korą ciemieniową. Oczywiste jest, że prążkowie i kora ciemieniowa są znacznie ściślej ze sobą związane niż MAV. Dane porównujące splot naczyniówkowy z MAV zostaną przedstawione w przyszłej publikacji. Jest jednak prawdopodobne, że profile ekspresji w MAV i splocie naczyniówkowym są bliżej związane ze sobą niż z prążkowiem i korą ciemieniową. Rycina 2 przedstawia różnicową odpowiedź ekspresji genów na hipertermię (EIH) w porównaniu z AMPH w MAV w porównaniu z grupą kontrolną i sobą nawzajem.
Ekspresja genów ponad 11 000 genów z oficjalnymi symbolami genów NCBI w MAV zwierząt kontrolnych została porównana z tymi zarejestrowanymi w prążkowiu i korze ciemieniowej. Ponad 2000 z tych genów miało 2,5-krotnie lub więcej różniącą się ekspresję w MAV w porównaniu z dwiema tkankami bogatymi w neurony, a 550 genów miało 10-krotnie większą różnicę w ekspresji. Nieco ponad 40% (253) z nich to geny o zmniejszonej ekspresji 10-krotnie lub więcej w MAV i były związane z funkcją neuronów. Stwierdzono 343 geny z ponad 10-krotną lub większą ekspresją w MAV w porównaniu z korą ciemieniową i prążkowiem. Ta lista genów została wykorzystana jako punkt wyjścia do określenia genów o bardzo wysokim wzbogaceniu w MAV. Tabela 1 zawiera listę genów o ponad 15-krotnej ekspresji MAV w porównaniu z korą ciemieniową i prążkowiem oraz kategoryzuje je pod względem funkcji. Wiele z tych genów było związanych z układem naczyniowym i/lub układem odpornościowym. Tego typu geny powinny być wzbogacone około 5 do 10 razy ze względu na zwiększone unaczynienie i krew w nim obecną. Jednak nawet w przypadku genów o znanych ogólnych funkcjach naczyniowych wzrost powyżej 15-krotności wskazuje na wzbogacenie w MAV. Istniała również liczba genów z bardzo dużymi zmianami fałdowania, które były; 1) białka macierzy zewnątrzkomórkowej (niespecyficznie związane z naczynieniem), 2) transportery substancji rozpuszczonych oraz 3) metabolizm lipidów i kwasów retinowych. Znaleziono również niewiele genów wzrostu i różnicowania lub czynników transkrypcyjnych.

Rysunek 1. Porównanie ekspresji genów w MAV z korą ciemieniową i prążkowiem. Wykres wulkaniczny porównujący poziomy ekspresji genów kory ciemieniowej i prążkowia (wykres górny) oraz kory ciemieniowej i MAV (wykres dolny). Czerwone symbole oznaczają geny, które znacząco różnią się między regionami na poziomie p <0,05 i mają 1,5-krotną lub większą różnicę ekspresji między regionami. Czarne symbole reprezentują geny, które nie różnią się znacząco między regionami (p >0,05) i różnią się ekspresją mniej niż 1,5-krotnie. Różowe symbole oznaczają geny o mniej niż 1,5-krotnej różnicy w ekspresji, ale statystycznie istotnie różniące się przy p<0,05. Żółte symbole identyfikują geny, które mają 1,5-krotną lub większą ekspresję, ale zmiana ta nie jest statystycznie istotna przy p<0,05.
Skróty
AMPH amfetamina
EIH Hipertermia indukowana przez środowisko
Opony mózgowe MAV i związane z nimi naczynia krwionośne mózgu
Normy normotermiczne

Rysunek 2. Wpływ hipertermii i amfetaminy na ekspresję genów w MAV. Wykresy wulkaniczne porównujące poziomy ekspresji genów w MAV po soli fizjologicznej, EIH lub AMPH w 3-godzinnym punkcie czasowym. Czerwone symbole oznaczają geny, które uważa się za znacząco różne, podczas gdy czarne kropki/kółka reprezentują geny, które nie różnią się znacząco między regionami. Zastosowano dodatkową analizę statystyczną w celu sprawdzenia, które różnice w ekspresji między grupą kontrolną a leczeniem były w rzeczywistości statystycznie istotne.
Ekspresja MAV Ekspresja mózgu
Symbole genów NCBI
Specyficzność tkankowa lub zgłoszona funkcja (funkcje)
> 50-krotnie
Anxa2a, Col8a1, Des, Esm1, Glycam1, Kla, Lect1, Lepr, Lum, Myh11, Ogn, Tagln, Thbs2, Tnnt2
Unaczynienie i serce
> 50-krotnie
Ccl19, Cd74a, Defb1, Lrrc21, MGL1, Mrc1, Msln, Pla2G5, Prg4, RT1-BB, RT1-DA
Układ odpornościowy
> 50-krotnie
Adh1, Aebp1, Aldh1a2, Gstm2
Przetwarzanie kwasu retinowego i lipidów
> 50-krotnie
cdh1, col3a1, col1a2, colec12, cpxm2, cpz, dcn, emp3, gpc3, nupr1, omd, pcolce slamf9, tmem27, tspan8
Macierz zewnątrzkomórkowa i połączenia komórka-komórka
> 50-krotnie
aqp1, asgr1, kcnj13, slc5a5, slc6a13, slc6a20, slc22a6, sned1, ttr
Homeostaza jonów i substancji rozpuszczonych
> 50-krotnie
alx3, cdkn1c, foxc2, igfbp2, ifitm1, ifitm2, nkx6-1, osr1, prrx2, sfrp1, tbx15. upk1b, wis2, wnt6
Regulacje dotyczące rozwoju i transkrypcji
> 50-krotnie
gpha2, mfap5, mpzl2 plac8, scgb1c1, sostdc1, steap1
Nieznane i różne
Od 30 do 50-krotnie
anxa1a , angpt2, c6a, gjb2, ptgis, thbd, timep1
Unaczynienie i serce
Od 30 do 50-krotnie
Casp12, Ccl2, Ccr1, Cd14, Cxcl10, Ifitm3, Klra5, Lgals1, Lgals3, Ms4a4a, Ms4a7, Plscr1, Spp1, Xcl1
Układ odpornościowy
Od 30 do 50-krotnie
Col6a3, cpxm1, efemp1, fmod, mgp, nid2
Macierz zewnątrzkomórkowa i połączenia komórka-komórka
Od 30 do 50-krotnie
cp, cubn, gcgr, s100a6, scn7a, sct, slc4a5, slc16a11, slco1a5
Homeostaza jonów i substancji rozpuszczonych
Od 30 do 50-krotnie
Cfd, Ch25H, Krab2, Rarres2
Przetwarzanie kwasu retinowego i lipidów
Od 30 do 50-krotnie
bmp6, csp12, dab2, folr1, igf2, msx1, tbx18, twist1, wnt5b
Regulacje dotyczące rozwoju i transkrypcji
Od 30 do 50-krotnie
cela3b, cln6, c1qtnf7, copz2, dhrs7c, gng11, prss23, srpx, vim
Nieznane i różne
Od 15 do 30-krotnie
adm, angpt1, angptl2, bgn, cklfa, cnn1,cox8h, ctsk, f13a1, gja5, klf4, lox, lyz, myl9, procr, pros1, RT1-ba, serpinb10, serping1, serpinf1, tgm2, tnmd, trim63, txnipa, vamp5, vtn
Unaczynienie i serce
Od 15 do 30-krotnie
Adaa, bst2, ccl6, cd40, cd68, ctsc, dap, faim3, fkbp9, fxyd5, fmo1, glipr1, ier3, ifi47, igsf6, msc, nfatc4, RT1-db1, serpinb1a, tir4, tubb6
Układ odpornościowy
Od 15 do 30-krotnie
Adamtsl4, Col1a1, crb3, dpt, egfl3, fbn1, fbln1, fbln5, fn1, itgb4, lama2, lgals3bp, loxl1, mfap4, mmp14, mmp23, ppic, serpinh1, timep3
Macierz zewnątrzkomórkowa i połączenia komórka-komórka
Od 15 do 30-krotnie
cybrd1, selenbp1, slc2a4, slc9a2, slc13a3, slc16a4, slc22a8, slc22a18
Homeostaza jonów i substancji rozpuszczonych
Od 15 do 30-krotnie
Agpat2, Bdh2, Cyp26b1, Lpar3, Ltb4dh, Olr1, Pon3, Rbp1, Rbp4
Przetwarzanie kwasu retinowego i lipidów
Od 15 do 30-krotnie
atf3, dkk4, eya2, ifitm7, ltbp1, mustn1, nr2f2, ptrf, sphk1, tgfbi, tcea3 tcfap2b, wnt2b, wnt5a, zic1
Regulacje dotyczące rozwoju i transkrypcji
Od 15 do 30-krotnie
Adamts12, Adamtsl3, C1R, Crispld2, Crygn, Cyp1b1, Dse, Enpep, Enpp2, Epn3, Flna, Fmo3, Gnmt, Gprc5c, Hspb1, Klc3, krt18, krt19, mdk, mesp1, ms4a6a, ms4a6b, ms4a11, net1, pdlim2, phactr2, plp2, pp1r3b, pqlc3, rin3, spag11, sult1a1, tmem106a, wfikkn2
Nieznane i różne
*Geny uwzględnione w tabeli muszą być zarówno ponad 15-krotnie powyżej ekspresji w prążkowiu i korze ciemieniowej, jak i 5-krotnie powyżej poziomów tła. Do grupowania wykorzystano niższy z dwóch współczynników (MAV/prążkowie lub MAV/kora ciemieniowa) dla każdego genu.
aGeny znajdują się w komórkach śródbłonka, ale prawdopodobnie odgrywają również główną rolę w pośredniczeniu w odpowiedziach immunologicznych.
Tabela 1. Geny o 15-krotnej* lub większej zwiększonej ekspresji MAV w porównaniu z prążkowiem i korą ciemieniową.