Heterogeniczność populacji komórek macierzystych nie jest jeszcze w pełni zrozumiała i pozostaje główną przeszkodą w rozwoju klinicznie skutecznych zastosowań terapeutycznych opartych na komórkach macierzystych. Jednym z najczęstszych sposobów scharakteryzowania heterogenicznej populacji komórek macierzystych jest zastosowanie metody sortowania komórek, takiej jak sortowanie komórek aktywowane fluorescencją (FACS), w celu oddzielenia komórek na podstawie ich profili ekspresji markerów powierzchniowych. W miarę jak metody sortowania stają się coraz bardziej złożone, możliwe staje się zidentyfikowanie bardziej wyraźnych funkcjonalnych subpopulacji komórek. Technologie mikroprzepływowe są coraz częściej wykorzystywane do analizy ekspresji genów na poziomie pojedynczej komórki. Multipleksowana ilościowa reakcja łańcuchowa polimerazy (qPCR) w układzie mikroprzepływowym pozwala na skuteczną i niezawodną analizę transkrypcji pojedynczej komórki w wysokiej rozdzielczości. 1-5
W poprzednim badaniu wykorzystującym profilowanie transkrypcyjne pojedynczej komórki 48 genów, zaobserwowano znaczną heterogeniczność transkrypcji wśród ASC. 6 Jednak dystrybucja genów MSX2, BMP-5, BMP-7, ALP, OCN, RUNX2 wykazywała silny związek z klastrem komórek o wysoce osteogennych profilach transkrypcyjnych. Aby wyizolować komórki zgodnie z tym osteogennym profilem ekspresji genów, wzorce ekspresji antygenu powierzchniowego skorelowano z wzorcami transkrypcji, a następnie odkryto, że ekspresja markera powierzchniowego endoglinu (CD105) ściśle koreluje ze zwiększonym potencjałem różnicowania osteogennego ASC. Niezależnie od ekspresji CD105, ekspresja receptora powierzchniowego Thy-1 (CD90), białka błonowego połączonego z glikozylofosfatydyloinozytolem, jak wcześniej wykazano przez Chen i wsp., że jest związane z komórkami osteoprogenitorowymi, była również skorelowana z ekspresją genów osteogennych. 6,7 Odkrycia te dają możliwość prospektywnego wyizolowania subpopulacji w ramach większej heterogenicznej puli ASC o zwiększonej zdolności osteogennej do zastosowań w inżynierii tkanki kostnej opartej na komórkach.