Przedstawiona metoda pozwala na obserwację gojenia się ran i regeneracji tkanek u żywych larw danio pręgowanego za pomocą obrazowania poklatkowego in vivo na stereomikroskopie jasnego pola, przy użyciu stosunkowo prostego układu. Ta procedura wymaga pewnych ważnych aspektów, które przetestowaliśmy, które zoptymalizują wynik: 1) Niskie stężenia agarozy (~0,5%) zminimalizują przeszkody wzrostu stale rosnących larw danio pręgowanego, 2) Usunięcie agarozy wokół płetwy jest ważne, aby nie zaciemniać procesu gojenia, 3) Uwięzienie agarozy w plastikowej siatce utrzymuje agarozę i zwierzę w stabilnej pozycji przez cały zabieg, oraz 4) Odpowiednie środowisko o kontrolowanej temperaturze, które jest niezbędne dla żywotności larw. Dostosowaliśmy podgrzewaną komorę inkubacyjną 23,24, która wykorzystuje folię bąbelkową przyklejoną do kartonu oraz przewodową grzałkę kopułkową do kontrolowania temperatury i prawidłowej cyrkulacji powietrza przy minimalnych wahaniach podczas procedury obrazowania. Ta prosta i ekonomiczna komora może być przygotowana tak, aby pasowała do każdego mikroskopu. Podobna podgrzewana komora inkubacyjna została również wykorzystana do obrazowania rozwoju myszy i piskląt 24,29.
Sugerujemy, aby larwy przed amputacją były montowane w celu uzyskania obrazu sprzed amputacji, demontowane w celu amputacji i ponownie montowane w celu obrazowania poklatkowego. Chociaż możliwe jest wykonanie tych kroków w jednym kroku w końcowej komorze obrazowania, z naszego doświadczenia wynika, że amputacja płetwy ogonowej na szklanym szkiełku nakrywkowym nie jest optymalna, ponieważ rozrywa tkankę i nie powoduje czystego cięcia. Metoda amputacji oparta na agarozie przy użyciu igły strzykawkowej została pierwotnie opisana przez Kawakamiego i współpracowników (2004) 16 i jest również, z naszego doświadczenia, idealna do wykonywania amputacji. Tak więc dość skomplikowana seria kroków, którą przedstawiliśmy, jest dobrze uzasadniona i zapewnia optymalny efekt regeneracji.
Wykazaliśmy, że larwy danio pręgowanego przy 2 dpf można obrazować do 1,5 dnia w roztworze agarozy i trikainy. Zastosowaliśmy zoptymalizowany pod kątem pH roztwór Trikainy (pH7) przygotowany z soli oceanicznej instant, który nie wpływa na zdrowie próbki w prezentowanym okresie obrazowania. Wcześniej jednak wykazaliśmy również, że użycie trikainy w pożywce Danieau pozwala na obrazowanie poklatkowe larw danio pręgowanego o wartości 2,5 dpf pod mikroskopem konfokalnym przez co najmniej 2 dni 30. W ten sposób optymalne warunki buforowe mogą wydłużyć zdrowie larw i czas trwania obrazowania. Alternatywnie, niższe stężenia trikainy mogą być użyte do znieczulenia lub 2-fenoksyetanol, który, jak stwierdziliśmy, jest dobrze tolerowany w stadiach larwalnych i dorosłych w temperaturze 28 °C przez co najmniej 60 godzin.
Aby uniknąć wad w regeneracji płetwy, usunęliśmy agarozę z płetwy ogonowej przed obrazowaniem. Z naszych danych wynika, że w ciągu 1,5 dnia płetwa zregenerowała się do około 60%. To tempo regeneracji jest zgodne z poprzednim badaniem, w którym zdefiniowano 3 dni jako średni czas regeneracji płetwy ogonowej u larw danio pręgowanego do 6 dpf 16. Alternatywne metody dla agarozy mogą być jednak wykorzystane do zamontowania ryb w celu obrazowania. Na przykład cienkie skrzepy plazmowe 31 lub probówki z fluorowanym etylenem propylenem (FEP) pokryte metylocelulozą i wypełnione bardzo niskimi stężeniami agarozy (0,1%) zostały zalecone do mikroskopii na jasnych arkuszach 32 i mogą być odpowiednie dla przedstawionej przez nas metody. Nie zalecamy jednak metylocelulozy i 0,1% agarozy, ponieważ wymagają one zamontowania próbki na dnie komory ze względu na brak krzepnięcia tych mediów. Z naszego doświadczenia wynika, że bardzo wysokie stężenia metylocelulozy będą ponadto generować kieszenie powietrzne, które mogą zakłócać procedurę obrazowania. Jeśli te media są preferowane przy użyciu dolnej komory, ważne jest, aby zapewniona była odpowiednia odległość robocza między soczewką obiektywu a preparatem. Należy zauważyć, że metyloceluloza jako podłoże montażowe jest zalecana tylko przez okres do 1 dnia, ponieważ może wpływać na zdrowie larw 32.
Zamontowanie próbki w pokrywie może spowodować powolny dryf grawitacyjny w dół. Dlatego zaleca się obrazowanie wielu sekcji w każdym punkcie czasowym, które mogą być rzutowane na jedną płaszczyznę lub tylko obrazy znajdujące się w płaszczyźnie ogniskowej mogą być wyodrębnione w celu złożenia końcowego filmu. Obrazowanie próbki w dolnej komorze może być alternatywną metodologią pozwalającą uniknąć potencjalnego dryfu w dół. Skrzepy plazmowe mogą być przydatne w celu uniknięcia dryfu, ponieważ plazma przykleja się do zewnętrznej warstwy otaczającej (EVL, peryderma) 31 , a zatem może stabilizować próbkę. To jednak musi zostać przetestowane, a także to, jak długo larwy danio pręgowanego mogą być utrzymywane w skrzepach osocza bez ingerencji w zdrowie larw lub regenerację płetw.
Nasz film został zmontowany przy użyciu pojedynczych sekcji (26 μm) zarejestrowanego stosu z, który obejmował pełną grubość żeberka (~10 μm) i który uwzględniał potencjalny dryf z-żeberka podczas procedury obrazowania. Aby zachować informacje 3D, możliwe jest również rzutowanie stosów z na pojedyncze obrazy. Ponieważ może to spowodować rozmycie obrazu, może być pożądana dekonwolucja w jasnym polu. Do tego celu można wykorzystać oprogramowanie, takie jak Deconvolve lub Autoquant X3. Alternatywnie, algorytmy matematyczne (opisane w Tadrous33) mogą być zastosowane do uzyskania funkcji rozrzutu punktowego o wysokim stosunku sygnału do szumu (SNR). Uzyskanie wysokiego stosunku sygnału do szumu (SNR) stanowi jedną z głównych przeszkód w dekonwolucji jasnego pola. Chociaż metoda ta wymaga wysokiego kontrastu i cienkiej grubości próbki, byłaby odpowiednia do obrazowania płetwy ogonowej ze względu na jej zmniejszoną szerokość.
Niewątpliwą zaletą prezentowanej metody obrazowania jest to, że można ją szybko dostosować do każdego mikroskopu stereoskopowego wyposażonego w kamerę CCD i oprogramowanie poklatkowe oraz stanowi tanią alternatywę dla droższych systemów obrazowania konfokalnego. Chociaż metoda ta nie wykorzystuje fluorescencji do wykrywania komórek, można ją rozszerzyć o takie zastosowania, wykorzystując zautomatyzowany system sterowania migawką i oprogramowanie do dekonwolucji po obrazowaniu 34. Umożliwiłoby to użytkownikom dalszą obserwację procesów gojenia i regeneracji ran z rozdzielczością jednokomórkową lub subkomórkową w dłuższych okresach czasu.
Przejrzystość optyczna i łatwość, z jaką można obchodzić się z embrionalnymi i larwalnymi danio pręgowanymi, a także możliwość dostosowania tej metody do dowolnego mikroskopu stereoskopowego sprawiają, że nadaje się ona do nauczania podstawowej biologii kręgowców w klasie. Metoda ta może zapewnić uczniom lepsze zrozumienie podstawowych procesów biologicznych leżących u podstaw naprawy i regeneracji tkanek. Inne procesy biologiczne, które zostały uchwycone za pomocą podobnej metody, to rozwój embrionalny danio pręgowanego 23,34 i funkcja serca (niepublikowana). Metoda ta daje również możliwość monitorowania gojenia się i regeneracji ran u larw, które zostały poddane manipulacji genetycznej i farmakologicznej.