$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Ludzkie naturalne autoprzeciwciała IgM są atrakcyjnymi kandydatami do immunoterapii i wykazały potencjał terapeutyczny w leczeniu różnych chorób, w tym nowotworów i zaburzeń OUN 1-7. Korzystne jest to, że przeciwciała te nie wywołają odpowiedzi immunologicznej, w której wytwarzanie przeciwciał neutralizujących znacznie zmniejsza skuteczną dawkę terapeutyczną i skuteczność. Co ważne, wszystkie przeciwciała o potencjale terapeutycznym są izotypu IgM i należą do repertuaru NAb 3-5,8,9,37,40,42-45. Główną przeszkodą w potencjalnym klinicznym zastosowaniu przeciwciał IgM jest identyfikacja ich antygenów, które w wielu przypadkach są nieokreślone. Standardowe techniki stosowane w przypadku przeciwciał IgG często nie mają zastosowania do identyfikacji antygenu IgM.
Protokół ten opisuje identyfikację PSA-NCAM jako antygenu regeneracyjnego ludzkiego przeciwciała IgM HIgM12, skutecznego w zwierzęcych modelach SM i ALS 15-18. Zastosowana metodologia ma zasadnicze zastosowanie do wszystkich przeciwciał ludzkich ze specyficznymi łańcuchami lekkimi Vκ VκI, VκIII i VκIV oraz przeciwciał mysich z łańcuchami lekkimi VκI, niezależnie od izotypu przeciwciała.
Najważniejszym krokiem w tym protokole jest zastosowanie przeciwciał IgM w zastosowaniach chromatografii powinowactwa. Mówiąc dokładniej, skuteczne przeciwciała są niezbędne do działania jako czynniki ściągające w immunoprecypitacji w celu wyizolowania lub wzbogacenia antygenu ze złożonych lizatów kultur tkankowych lub komórkowych. Wzbogacone frakcje antygenu można porównać z immunoprecypitacjami z przeciwciał kontrolnych izotypu, a następnie przeanalizować pod kątem różnic za pomocą spektrometrii mas. Jednym z podstawowych wymagań lub ograniczeń tego etapu jest obecność prawidłowego przeciwciała Vκ łańcucha lekkiego i gospodarza (człowieka, myszy), aby umożliwić wiązanie przeciwciała z białkiem L-agarozy. Zastosowanie białka wiążącego mannan związanego z agarozą (zwanego również lektyną wiążącą mannozę) zamiast białka L agarozy jest potencjalną alternatywą dla immunoprecypitatu IgM bez specyficznych łańcuchów lekkich Vκ. Jednak, jak stwierdzili Arnold i wsp. 35, przeciwciała IgM związane z antygenem nie wiążą się z białkiem wiążącym mannan, ponieważ docelowy glikan wydaje się być niedostępny, gdy IgM zwiąże się ze swoim antygenem. Na podstawie tych ustaleń białko wiążące mannan nie może być stosowane jako matryca wiążąca do immunoprecypitacji cząsteczek IgM obciążonych antygenem 35. Innymi potencjalnymi alternatywami może być zastosowanie wtórnych przeciwciał anty-IgM IgG związanych z agarozą 46,47 lub zastosowanie aktywowanych powierzchniowo kulek magnetycznych 48. Przeciwciała IgG skierowane przeciwko IgM mogą być chemicznie sieciowane z agarozą A lub agarozą G w celu zmniejszenia zakresu eluowanego przeciwciała wraz z badanym antygenem. Właściwe porównanie różnych wariantów immunoprecypitacji IgM w odniesieniu do pomyślnie zidentyfikowanych antygenów jest trudne, ponieważ większość immunoprecypitacji przeprowadzono w celu wyizolowania lub zubożenia IgM bez dalszego zainteresowania ich antygenami. Ponadto immunoprecypitacje z wykorzystaniem IgMs stosowano głównie w celu potwierdzenia już znanego lub oczekiwanego pojedynczego antygenu z ekspozycją przeciwciał na oczyszczone antygeny 49. Wadą IgG sprzężonych z agarozą skierowanych przeciwko ludzkim IgM jest bardzo niska wydajność (10 - 15%) immunoprecypitowanych cząsteczek IgM surowicy w porównaniu z materiałem wyjściowym 50. W przeciwieństwie do tego, aktywowane powierzchniowo kulki magnetyczne z powodzeniem zastosowano do przeciwciał o różnych izotypach, w tym IgM, w celu immunoprecypitacji włókienek związanych z trzęsawką 48. Metoda ta nie jest ograniczona do specyficznych łańcuchów kappa (Vκ) lub lambda (λ) ani do konkretnego gospodarza i może znacznie poszerzyć spektrum przeciwciał IgM stosowanych w immunoprecypitacji.
Kolejnym ważnym krokiem w protokole jest zdolność przeciwciała do działania jako przeciwciało wykrywające (przeciwciało pierwszorzędowe) w Western blot lub innych platformach przesiewowych. Skuteczne przeciwciała muszą być ukierunkowane na swój antygen z wystarczająco wysokim powinowactwem, aby umożliwić wiązanie antygenu w obecności niejonowych lub ewentualnie jonowych detergentów. Przeciwciała o wysokim powinowactwie są powszechne wśród przeciwciał IgG dojrzałych w powinowactwie, ale rzadziej wśród przeciwciał izotypu IgM, co jest jednym z powodów, dla których istnieje stosunkowo niewiele dostępnych na rynku przeciwciał IgM jako środków wykrywających w warunkach biochemicznych. Wysokie powinowactwo wiązania przeciwciał jest wymagane do immunoprecypitacji antygenów molekularnych i do Western blot. Obniżenie stężenia detergentów lub całkowity brak detergentów w IP i do lizy umożliwia celowanie w antygen przez przeciwciała o niskim powinowactwie za pośrednictwem jego domeny Fab. W przeciwieństwie do tego, zdolność przeciwciała do celowania w białko L agaroza poprzez jego część Fc nie jest znacząco zmieniona wśród kontroli izotypów w zakresie różnych stężeń detergentów. Jednak niskie stężenie detergentu w buforze do lizy i buforze IP zapobiega rozerwaniu błony komórkowej i izolacji określonych cząsteczek. Podobnie, niskie stężenie detergentu w do płukania Western blot (np. PBS-T) umożliwia wiązanie antygenu przeciwciał o niskim powinowactwie, ale jednocześnie zwiększa niespecyficzne wiązanie i dlatego nie jest opcją.
Obecność rdzenia białka antygenowego jest kolejnym wymogiem dla tej metody. Białka z modyfikacjami potranslacyjnymi (np. glikoproteiny, lipoproteiny) i niemodyfikowane białka, ale nie same lipidy lub węglowodany, są wykrywalne w Western Bloc. Nie jest możliwe immunoprecypitacja lipidów (np. sfingolipidów) z lizatów tkankowych lub komórkowych w obecności lub bez detergentów. Właściwości fizykochemiczne detergentów i lipidów są zbyt podobne, aby umożliwić selektywne interakcje lipid-przeciwciało, podczas gdy jednocześnie detergenty są niezbędne do rozerwania błon, aby umożliwić selektywną izolację określonych cząsteczek. Zgodnie z naszą najlepszą wiedzą, immunoprecypitacje składające się wyłącznie z węglowodanów, przy braku rdzenia białkowego, nie były wcześniej zgłaszane. Staje się to szczególnie istotne, ponieważ przeciwciała IgM często są skierowane przeciwko węglowodanom i glikolipidom, które niekoniecznie są związane z jednostką białkową. Inne techniki chromatograficzne są wymagane do separacji i immunologicznej identyfikacji lipidów i węglowodanów w przypadku braku rdzenia białkowego. Na przykład chromatografia cienkowarstwowa (TLC) lipidów komórkowych z późniejszym wykrywaniem przeciwciał na płytce TLC (immuno-TLC) może być zaimplementowana 51,52.
Inne przeciwciała anty-PSA zostały opisane w poprzednich badaniach i wynikach porównanych z HIgM12, a także z dostępnym na rynku anty-PSA IgM (klon 2-2B). Najczęściej stosowanym przeciwciałem w dziedzinie PSA jest przeciwciało IgG (klon 735) dostępne jako mysie przeciwciało monoklonalne lub poliklonalne królika 53. To przeciwciało anty-PSA IgG wykrywa PSA na SynCAM i NCAM na różnych typach komórek OUN, w tym komórkach mikrogleju 41. W przeciwieństwie do przeciwciała anty-PSA IgG, ludzkie przeciwciała IgM HIgM12, HIgM42 i mysie przeciwciała anty-PSA IgM (klon 2-2B) nie są w stanie celować w PSA na SynCAM (ale na NCAM) w różnych stadiach embrionalnych i wczesnych stadiach postnatalnych u myszy, podczas gdy niepolisjalilowany SynCAM jest łatwo wykrywalny 15. Zastosowane przeciwciała IgM również nie są w stanie wykryć PSA na komórkach mikrogleju (ryc. 3 + 4). Możliwym wyjaśnieniem różnic obserwowanych między izotypami przeciwciał może być niski poziom PSA-SynCAM w porównaniu z poziomami PSA-NCAM w połączeniu z potencjalnie niższym powinowactwem wiązania przeciwciał IgM w porównaniu z przeciwciałami anty-PSA IgG. Aby przetestować tę hipotezę, przeprowadziliśmy immunoprecypitacje u zwierząt NCAM KO w stadium embrionalnym E17 z obecnymi ogromnymi ilościami SynCAM i użyliśmy HIgM12 jako "środka ściągającego"15. W E17 WT rodzeństwo z miotu kontroluje HIgM12 immunoprecypitowane PSA-NCAM w stopniu, który wykazywał podobną intensywność "ściągniętego" PSA-NCAM w porównaniu z łańcuchem ciężkim IgMs, wykrytym za pomocą densytometrii w kolejnym Western blot przy użyciu eluowanych antygenów. Wynik ten sugerował co najmniej wystarczające powinowactwo HIgM12 do docelowego PSA. W przeciwieństwie do kontroli z miotu WT, HIgM12 nie wykrył PSA przyłączonego do SynCAM u zwierząt NCAM KO. Identyczne wyniki uzyskano w immunoprecypitacjach z użyciem ludzkiego anty-PSA IgM HIgM42. HIgM12 i HIgM42, a także mysi anty-PSA IgM (klon 2-2B) nie były w stanie celować w PSA na SynCAM w Western blot od zwierząt WT i NCAM KO w embrionalnych i postnatalnych stadiach rozwoju. Biorąc pod uwagę niewielką ilość HIgM12 wymaganą (0,1 μg/ml) do specyficznego wykrycia PSA przyłączonego do NCAM w Western blot przy użyciu niewielkich ilości tkanki OUN (0,1 μg tkanki OUN na studzienkę) 15 , wydaje się mało prawdopodobne, aby samo niskie powinowactwo było odpowiedzialne za całkowity brak wykrywania PSA-SynCAM przez HIgM12 w trzech różnych metodach.
Wnioskujemy, że istnieją znaczące różnice między przeciwciałami anty-PSA IgM a często publikowanym przeciwciałem anty-PSA IgG (klon 735). Nie jest jasne, dlaczego dostępne na rynku przeciwciała anty-PSA IgM nie były w przeszłości częściej stosowane w celu potwierdzenia wyników uzyskanych z przeciwciałem anty-PSA IgG 735. Jest to szczególnie interesujące, ponieważ HIgM12 ma już udowodnioną skuteczność w różnych modelach choroby. Podczas gdy inne przeciwciała anty-PSA IgM mogą mieć podobne efekty terapeutyczne, pozostaje niejasne, czy przeciwciało anty-PSA IgG (klon 735) ma podobny wynik terapeutyczny w modelach stwardnienia rozsianego i ALS.
Krótko mówiąc, opisane tutaj metody zostały wykorzystane przede wszystkim do identyfikacji antygenu regeneracyjnego ludzkiego przeciwciała HIgM12 w celu wsparcia potencjalnych badań klinicznych dotyczących stwardnienia rozsianego i prawdopodobnie innych chorób neurodegeneracyjnych. Identyfikacja antygenów dla przeciwciał o aktywności biologicznej jest niezbędnym krokiem do zrozumienia ich mechanizmu działania. Staje się to szczególnie istotne w kontekście licznych przeciwciał monoklonalnych, które są obecnie testowane pod kątem bezpieczeństwa i skuteczności w badaniach na ludziach. Chociaż liczba przebadanych klinicznie przeciwciał IgM do tej pory jest niewielka, ostatnie postępy w technologii hybrydoma wraz z rosnącą liczbą badań podkreślających potencjał terapeutyczny tej klasy przeciwciał 1-10,37,40,42-45 wymagają opracowania nowych lub zmodyfikowanych metod mających zastosowanie do identyfikacji niebiałkowych antygenów IgM.