Aby zapewnić równomierne rozmieszczenie bakterii w kulkach agarowych, ważne jest, aby równomiernie zawiesić stopioną mieszaninę agaru i bakterii przed dodaniem jej do fazy olejowej. Stosunek objętości oleju do bakterii agarowych ma kluczowe znaczenie w kontrolowaniu wielkości kulek. Wyższy stosunek oleju do agaru prowadzi do tworzenia mniejszych kulek agaru. Podczas mieszania zawiesiny agarowo-bakteryjnej z fazą olejową kontrola temperatury ma kluczowe znaczenie. Mieszanina oleju i agaru musi być wystarczająco ciepła, aby umożliwić emulgację i tworzenie kropel, ale wystarczająco chłodna, aby nie zaszkodzić bakteriom. Ciągłe mieszanie podczas schładzania mieszaniny do temperatury pokojowej lub niższej umożliwia tworzenie się i zestalanie kropelek agaru.
Właściwa kalibracja płytki mieszającej, rozmiar mieszadła oraz kształt i rozmiar kolby są ważnymi wyznacznikami jednolitego wiru. Mieszadło umieszczone w środku kolby tworzy symetryczny wir, zapewniając równomierne mieszanie. Mieszadło poza środkiem może prowadzić do niestabilnego wiru, co skutkuje koralikami o nieregularnych kształtach i wprowadzaniem pęcherzyków powietrza do kulek. Zalecane jest monitorowanie w czasie rzeczywistym i regulacja położenia mieszadła. Objętość kolby musi być proporcjonalna do objętości mieszaniny oleju i agaru. Kolba o pojemności 500 ml jest idealna do wirowania mieszaniny oleju i agaru o pojemności 90 ml, wytwarzając widoczny wir. W przypadku stosowania większych kolb ważne jest, aby dostosować objętość mieszaniny olejowo-agarowej, wielkość mieszadła i prędkość wirowania, aby osiągnąć równowagę między skutecznym mieszaniem a stabilnym wirem. Utrzymanie stałej prędkości wirowania podczas procesu i podczas przygotowywania kulek ma kluczowe znaczenie dla powtarzalności między partiami.
Proces przygotowania kulek agarowych, w szczególności prędkość wirowania i stosunek oleju do agaru, są dostosowane do16,22, z niewielkimi modyfikacjami. Siły ścinające w wirującym wirze z natury wytwarzają koraliki o różnych rozmiarach. Aby zminimalizować tę zmienność wielkości, etap zbierania kulek został zmodyfikowany poprzez wprowadzenie kilku etapów mycia, wykorzystując gradient zmniejszającej się prędkości i czasu wirowania, aby zapewnić usunięcie kulek o małych rozmiarach (i wolnych bakterii). Zastosowano filtr z mikrosiatką, aby wzbogacić kulki o pożądanym rozmiarze, skutecznie odfiltrowując większe kulki i te, które mogły powstać w wyniku przypadkowej koalescencji. Aby uniknąć strat kulek lub bakterii, gdy zawiesina kulek przechodzi przez strzykawkę i podłączoną rurkę do inokulacji dotchawiczej myszy, ważne jest, aby użyć szklanej strzykawki, metalowych igieł do karmienia 24 G i rurki połączonej z metalem.
Głównym ograniczeniem metody jest złożoność techniczna przygotowania kulek i inokulacji dotchawiczej w celu uzyskania powtarzalnego obciążenia kulkami i implantacji płuc. Wymagana jest dbałość o szczegóły i umiejętność rozwiązywania problemów. Ponadto model nie został w pełni zwalidowany poprzez testowanie skuteczności standardowych antybiotyków i najczęstszych kombinacji antybiotyków podawanych pacjentom z MAB.
Obecnie żaden mysi model przewlekłego zakażenia Mab nie został zwalidowany w takim stopniu, aby skuteczność pojedynczych leków i kombinacji leków u pacjentów można racjonalnie przewidzieć za pomocą modelu9. Mysi system C57BL/6 z zatopionymi kulkami agarowymi został wykorzystany do przetestowania skuteczności leczenia przeciwbakteryjnego 15,19,23. Najbliższą alternatywą dla systemu mysiego C57BL/6 osadzonego w kulkach agarowych jest mysi model C3HeB/FeJ, który opiera się na immunosupresji deksametazonu w celu uzyskania trwałej przewlekłej infekcji24,25. Zaletą opisanego tutaj protokołu jest to, że (i) można użyć w pełni immunokompetentnych i najbardziej przystępnych cenowo myszy C57BL/6, (ii) można uzyskać produktywną i przewlekłą infekcję za pomocą dobrze scharakteryzowanego szczepu typu ATCC 19977 oraz (iii) nie ma chemicznie indukowanej potrzeby immunosupresji, co pozwala obejść potrzebę codziennych zastrzyków deksametazonu, unikając w ten sposób potencjalnych interakcji lek-lek i wpływu na immunopatologię płuc.
Biorąc pod uwagę brak zwalidowanych mysich modeli przewlekłego zakażenia Mab do oceny nowych kandydatów na leki i schematów leczenia 8,9, opisana tutaj technika ma potencjał, aby posunąć tę dziedzinę do przodu, poprawić wartość predykcyjną przedklinicznych danych dotyczących skuteczności, pomóc w ustaleniu priorytetów schematów leczenia o największym potencjale w celu zapewnienia trwałego wyleczenia i ogólnie przyspieszyć odkrywanie i opracowywanie leków na chorobę płuc Mab. Metoda może być stosowana do innych patogenów płuc i ma ugruntowaną historię w przypadku P. aeruginosa lub Haemophilus influenza. Głównym celem opisanego tutaj protokołu jest dostarczenie wystarczających szczegółów i zaleceń, aby zapewnić łatwość wdrożenia i doskonałą odtwarzalność między laboratoriami.