$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Weź kulturę bakterii Pseudomonas aeruginosa w bulionie.
Umieść kulturę na agarze izolacyjnym i inkubuj, aby pobudzić wzrost bakterii i produkcję alginianu, egzopolisacharydu złożonego z kwasów uronowych.
Dodaj izotoniczną sól fizjologiczną do trawnika bakteryjnego i zeskrob, aby zebrać komórki bakteryjne wraz z alginianem.
Przenieś zawiesinę do probówki, zwiruj, aby rozproszyć zawartość, i umieść ją na lodzie, aby zapobiec degradacji enzymatycznej.
Zmierz gęstość optyczną lub OD, aby określić gęstość bakterii.
Dodaj zawiesinę bakteryjną do roztworu kwasowo-boranowego i wymieszaj, aby zhydrolizować alginian do monomerów kwasu uronowego.
Dodaj karbazol, odczynnik chromogenny i inkubuj. W kwaśnych warunkach odczynnik reaguje z kwasami uromonowymi, tworząc kolorowe kompleksy.
Zmierzyć absorbancję, aby określić ilościowo poziomy kwasu uronowego, które odzwierciedlają stężenie alginianów.
Korzystając z krzywej standardowej, określ stężenie alginianów, a następnie podziel je przez zmierzoną gęstość komórek bakteryjnych, aby obliczyć produkcję alginianów na jednostkę biomasy.
Aby rozpocząć test karbazolu z kwasem uronowym zidentyfikuj pojedynczą kolonię z czystej kultury pożądanego szczepu, który ma być testowany, i wybierz kolonię za pomocą sterylnej wykałaczki.
Umieść wykałaczkę w probówce do hodowli zawierającej pięć mililitrów PIB. Hoduj w inkubatorze z wytrząsarką w temperaturze 37 stopni Celsjusza przez 24 godziny. Po inkubacji dodaj porcję bulionu PIB na wstępnie podgrzaną płytkę PIA.
Za pomocą sterylnego rozsiewacza komórek rozprowadź bulion na talerzu i rosj w temperaturze 37 stopni Celsjusza przez 24 godziny. Za pomocą kontrolera pipet i sterylnej pipety o pojemności 50 mililitrów dodaj 0,85% chlorku sodu do dorosłego trawnika i zbierz próbkę, zeskrobując płytkę za pomocą rozsiewacza komórek. Odessać próbkę za pomocą świeżej pipety o pojemności 50 mililitrów i przenieść do probówki zbiorczej o pojemności 50 mililitrów.
Wirować próbkę na wysokim poziomie, aby wymieszać i umieścić próbki na lodzie. Aby zmierzyć OD 600 próbek, najpierw wyślepić spektrofotometr za pomocą jednego mililitra 0,85% chlorku sodu. Następnie dodaj jeden mililitr próbki do nowej jednorazowej kuwety i odczytaj OD. Powtórz ten krok dwukrotnie, aby uzyskać trzykrotne odczyty dla każdej próbki.
Teraz dodaj trzy mililitry roztworu boranu kwasu siarkowego do probówek hodowlanych i pozostaw na lodzie. Powoli dodawać 350 mikrolitrów pobranej próbki do mieszaniny kwasów w probówkach. Po krótkim wirowaniu na niskim poziomie dodać 100 mikrolitrów 0,1% roztworu karbazolu i etanolu do mieszaniny próbek kwasów.
Zakryj probówkę i wiruj na medium przez pięć sekund. Następnie umieść w suchej kąpieli w temperaturze 55 stopni Celsjusza na 30 minut. Po inkubacji krótko zwirować probówki na wysokich obrotach i pozostawić do ostygnięcia na pięć minut.
Użyj probówki z 0.85% chlorkiem sodu jako ślepej próby do spektrofotometru. Następnie dodaj jeden mililitr mieszaniny do czystej kuwety i odczytaj OD próbek przy 530 nanometrach na spektrofotometrze. Przygotować krzywą wzorcową, mierząc OD 530 seryjnych rozcieńczeń znanych stężeń kwasu d-mannuronowego.
Powtórz dwa razy i wyodrębnij równanie liniowe z tych odczytów. Obliczyć stężenie alginianu w każdej próbce, stosując krzywą wzorcową i podzielić stężenie alginianu z równania liniowego przez OD 600, aby otrzymać całkowitą ilość alginianu na OD 600.