Summary
Dit protocol is gericht op kwantitatieve analyse van complexiteit van de neuronale dendritische arborization (NDAC) in Drosophila, die kan worden gebruikt voor studies van dendritische morfogenese.
Abstract
Dendrites de vertakte projecties van een neuron worden en dendritische morfologie weerspiegelt synaptic organisatie tijdens de ontwikkeling van het zenuwstelsel. Drosophila larvale neuronale dendritische arborization (da) is een ideaal model voor het bestuderen van de morfogenese van neurale dendrites en genfunctie in de ontwikkeling van het zenuwstelsel. Er zijn vier klassen van da neuronen. Klasse IV is het meest complex met een vertakkende patroon dat betrekking heeft op bijna het hele gebied van de larvale lichaam muur. Wij hebben eerder het effect van het monddood maken van de ortholog van de Drosophila van SOX5 op klasse IV neuronale dendritische arborization complexiteit (NDAC) met behulp van vier parameters gekenmerkt: de lengte van dendrites, de oppervlakte van de dendriet dekking, de totaal aantal van takken, en de vertakkende structuur. Dit protocol stelt de workflow van NDAC kwantitatieve analyse, bestaande uit de larvale dissectie, confocal microscopie en afbeelding analysemethodes ImageJ softwarematig. Verder inzicht in da neuronale ontwikkeling en de onderliggende mechanismen zal verbetering van het inzicht van neuronale functie en aanwijzingen over de fundamentele oorzaken van neurologische en neurologische aandoeningen.
Introduction
Dendrites, die de vertakte projecties van een neuron, betrekking hebben op het veld dat van het neuron zintuiglijke en synaptische ingangen van andere neuronen1,2 omvat. Dendrites zijn een belangrijk onderdeel van synapse formation en spelen een cruciale rol in de integratie van synaptic ingangen, evenals de elektrochemische stimulatie in een neuron teeltmateriaal. Dendritische arborization (da) is een proces waarmee vormen de neuronen nieuwe dendritische bomen en takken maken nieuwe synapsen. De ontwikkeling en de morfologie van de da, zoals tak dichtheid en groepering patronen, resultaat van scriptingregel biologische processen en zijn sterk gecorreleerd aan neuronale functie. Het doel van dit protocol is bedoeld als een methode voor kwantitatieve analyse van neuronale dendritric arborization complexiteit in Drosophila.
De complexiteit van dendrites bepaalt de synaptische typen, connectiviteit en ingangen van partner neuronen. Vertakkende patronen en een bevolkingsdichtheid van dendrites betrokken zijn bij de verwerking van de signalen die naar de dendritische veld3,4 convergeren. Dendrites hebben de flexibiliteit om aanpassing in ontwikkeling. Bijvoorbeeld heeft synaptic signaling een effect op dendriet organisatie in de somatosensorische neuron tijdens de ontwikkelings fase en het volwassen zenuwstelsel5. De oprichting van neuronal connectiviteit is afhankelijk van de voedselproductie en de rijping van dendrites. Misvorming van dendrites wordt geassocieerd met verminderde neuronale functie. Studies hebben aangetoond dat de abnormaliteit van da neuron morfogenese aan de etiologie van meerdere neurodegeneratieve ziekten bijdragen kan, met inbegrip van de ziekte van Alzheimer (AD), de ziekte van Parkinson (PD), de ziekte van Huntington (HD), en Lou Gehrig's disease / Amyotrophic lateral sclerosis (ALS)6,7,8. Synaptic wijzigingen weergegeven in het beginstadium van AD, in overleg met de achteruitgang en de bijzondere waardevermindering van neuron functie7,8. Echter, de specifieke kenmerken van hoe dendriet pathologie bijdraagt aan pathogenese in deze neurodegeneratieve ziekten blijft ongrijpbaar.
De ontwikkeling van dendrites wordt gereguleerd door de genen die coderen voor een complex netwerk van regelgevende instanties, zoals de familie van de Wnt van eiwitten9,10, transcriptiefactoren en liganden op cel oppervlakte receptoren11,12 . Drosophila da neuronen bestaan uit vier klassen (klasse I, II, III, IV), van welke klasse IV da neuronen hebben de meest complexe vertakkende patronen en hebben gewerkt als een krachtige experimenteel systeem voor beter begrip morfogenese13, 14. Tijdens de vroege morfogenese, overexpressie en/of RNAi zwijgen van genen in klasse IV da neuronen leiden tot veranderingen in de vertakkende patronen en dendriet snoeien13. Het is belangrijk een praktische methode voor de kwantitatieve analyse van de neuronale dendritische arborization te ontwikkelen.
Wij hebben eerder aangetoond dat zwijgen van de Drosophila ortholog van SOX5, Sox102F, tot kortere dendrites van da neuronen en verminderde complexiteit in klasse IV da neuronen15 leidde. Hier presenteren we de procedure voor kwantitatieve analyse voor de complexiteit van de neuronale dendritische arborization (NDAC) in Drosophila. Dit protocol, aangepast uit de vorige beschreven methodologie, biedt een korte methode om de ontwikkeling van de sensorische neuronen da assay. Het illustreert de robuuste afbeelding labeling en de da neuron in de derde instar larvale lichaam muur16,17,18,19. Het is een waardevolle protocol voor onderzoekers die willen onderzoeken van de NDAC en ontwikkelingsstoornissen verschillen in vivo.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
1. experimentele voorbereiding
- Voorbereiding van de volgende reagentia: Dulbecco van fosfaatgebufferde zoutoplossing (PBS); Triton-X-100; 0,2% PBST (PBS + 0,2% Triton X-100); 32% paraformaldehyde (PFA), verdund tot 4% wordt afgesloten vóór gebruik; silicone-elastomeer base en genezen agent; antifade montage medium (bvverlengen goud); en vingernagel Pools.
- Voorbereiding van de volgende apparatuur: dissectie Microscoop, twee scherpe pincet en een paar van schaar voor microdissection, een aantal pinnen voor microdissection, een petrischaal voor het maken van de dissectie schotel, Microscoop dia's en coverslips, een confocal microscoop, en een computer met Fiji ImageJ software geïnstalleerd.
2. de larven collectie
- UAS-Sox102F-RNAi vliegen met UAS-GFP, ppk-GAL4 of W1118 wild type vliegen, respectievelijk metgezel. Cultuur vliegt in standaardomstandigheden bij 25 ° C.
- In ~ 5-6 dagen, verzamelen de derde instar-larven van UAS-Sox102F-RNAi / ppk-GAL4, UAS-GFP of UAS-GFP en ppk-GAL4 / + control zorgvuldig met een Tang voor dissectie.
3. dissectie van de larven
Opmerking: Alle procedures in deze sectie worden geëxploiteerd onder een microscoop met microdissection. De vergroting is aan de onderzoekers. Probeer aan te passen aan de optimale zicht-weergave. ~ 4-6 X vergroting wordt aanbevolen.
- Plaats een larve op een dissectie gerecht gemaakt van silicone-elastomeer basis en een weefselkweek petrischaal.
- PIN de larve mond haak zodat de dorsale zijde onder ogen te zien, en vervolgens pin de staart van de larve. Plaats de dorsale zijde in het midden zo veel mogelijk om de middellijn, die de open-up marker zullen bloot te stellen.
- 200 µL van PBS aan de larve te behouden lichaam vocht toevoegen.
- Maak een knippen met een schaar langs de dorsale middellijn tussen de twee tracheas, van caudal naar rostraal. Maken een kleine snede op elk van de vier hoeken van het lichaam van de larve.
- Plaats een PIN-code op elk van de vier hoeken van het lichaam zodat het lichaam plat ligt.
- De larve lichaam muur vast in 4% PFA gedurende 25 minuten bij kamertemperatuur.
- Wassen in PBST voor 5 min. Repeat tweemaal meer.
- Verwijder de pennen uit het weefsel. Breng het weefsel op een glasplaatje, dek af met antifade montage medium, en monteren met een cover slip. Lucht drogen voor 1 h en verzegel de randen met vingernagel Pools.
4. beeldvorming verwerking
Opmerking: De beelden werden genomen met behulp van een systeem van omgekeerde confocal microscoop. De gebruiker kan het fotograferen van het monster met behulp van een 20 X doelstelling (aanbevolen).
- Z-serie opnamen. Open het dialoogvenster 'Capture Z-serie' in de confocal microscoop software. Het bereik voor het vastleggen van de beelden van de serie Z te bepalen.
- Klik op de knop "Boven en beneden". De boven- en onderkant positie en input van de waarden te bepalen "onderaan:" en "Top:" vakken. De "stap" in het dialoogvenster 'Capture Z-serie' instellen als 0,5 µm. Klik vervolgens op de "Run nu" knop om te verwerven van de Z-serie beelden.
- De verkregen afbeeldingen opslaan als *.tiff of *.nd2 bestanden.
- De dia's opslaan in een donkere houder bij 4 ° C na imaging.
5. dendriet evaluatie
Opmerking: GFP eiwit was co-overexpressie in UAS-GFP en ppk-GAL4 vliegt in de neuronen van de da voor GFP fluorescentie imaging analyse. De lengte, de vertakking en de structuur van da neuronen in de derde instar-larven werden gekwantificeerd. Analyseparameters omvatten lengte van dendrites (µm), de oppervlakte (µm2), de totale aantal takken en vertakkende structuur (%). Figuur 1 toont de analyse gebruikte parameters in detail.
-
Lengte van Dendrites
Opmerking: De lengte van dendrites is de som van alle dendrites label in tracer plugin.- Installeren en uitvoeren van Fiji ImageJ (https://fiji.sc/)20 software. Vervolgens splitsen beelden in afzonderlijke kanalen, als er meerdere kanalen van beelden.
Opmerking: De afbeelding in dit protocol heeft slechts één kanaal van GFP. - Uitvoeren "afbeelding | Stapels | Z project"om een Z-projectie; een nieuw venster verschijnt met de naam 'Z-projectie.' Klik op "max intensiteit" voor projectie type en organiseren nummers tussen segment start en stop segment afhankelijk van op individuele voorkeuren. Klik op 'OK'. Er verschijnt een Z-projectie-afbeelding met de presentatie van de projectie dendriet duidelijk.
- Sporen van de neurites.
- Selecteer "Plugins | Segmentatie | Eenvoudige Neurites Tracer"in het venster om te traceren van de dendrites. Zoek het neuron soma, en klik op een punt op een dendriet vanaf de cel lichaam, en een ander punt aan het uiteinde van deze dendriet.
Opmerking: Het programma verbindt de twee punten met een blauwe lijn. - Druk op "Y" in de plug-in venster als het pad duidelijk is; het pad dendriet is herleid tot de eindpunten van het geselecteerde pad in de zichtbare beelden. Klik op "volledige pad" op hetzelfde plugin venster; het segment is voltooid (Figuur 2).
Opmerking: Sommige dendrites eindigde verder van de uitgangspunten, waarin het traject werd verdeeld in kleinere segmenten. De segmenten werden gecombineerd om een volledige pad voor de tracer.
- Selecteer "Plugins | Segmentatie | Eenvoudige Neurites Tracer"in het venster om te traceren van de dendrites. Zoek het neuron soma, en klik op een punt op een dendriet vanaf de cel lichaam, en een ander punt aan het uiteinde van deze dendriet.
- Nadat een pad is voltooid, ga terug naar een nieuw punt waar de takken zijn. Het nieuwe pad kan worden gebouwd op; het vak "Alle paden" venster zal tonen de waarden van de lengte van alle paden (Figuur 3). De tracering-bestand opslaan en doorgaan met de onvoltooide sporen zoals afgebeeld in Figuur 2.
- De dendriet lengtegegevens exporteren door te klikken, "bestand | Exporteren als *.cvs"in het 'Plugin'-venster. Vervolgens een samenvatting van alle lengtes van het pad, en de gegevens exporteren naar een data-analyse/spreadsheet-software. (Figuur 3).
- Installeren en uitvoeren van Fiji ImageJ (https://fiji.sc/)20 software. Vervolgens splitsen beelden in afzonderlijke kanalen, als er meerdere kanalen van beelden.
-
Oppervlakte van de da neuronen
- Selecteer de Freehand tekengereedschap in het venster 'Fiji ImageJ'. Het pad traceren, en sluit vervolgens de eindpunten. Het 'Analyseren'-menu, selecteer "Set metingen | Gebied." Klik op "maatregel" uit het menu 'Analyseren'. Het resultaat wordt weergegeven in een nieuwe doos met de waarde voor het gebied geselecteerd (Figuur 4). Kopieer het naar de software van de analyse van de gegevens.
-
Totaal aantal van takken en vertakking structuur van de da neuronen
- Berekenen van het totale aantal takken door het openen van de "Analyse" en vervolgens "maken | Analyze Skeletonized paden"in het venster plugin van tracering (Figuur 5).
Opmerking: De structuur van de arbor is de som van de niveaus van takken. Het pad is gedefinieerd tussen de cel lichaam en de dendriet tips en één pad kan bevatten meerdere branches, zoals de primaire arbors zijn de dendrites van de cel lichaam van neuron. De secundaire arbors zijn takken van de primaire en zo verder met het tertiair, quaternaire en quinary arbors. De structuur van dendriet vertakking wordt gescheiden afhankelijk van de niveaus van takken. Bijvoorbeeld, is de primaire % het aantal vestigingen verdeeld door totale aantal vertakking, enzovoort.
- Berekenen van het totale aantal takken door het openen van de "Analyse" en vervolgens "maken | Analyze Skeletonized paden"in het venster plugin van tracering (Figuur 5).
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
De dendrites van da neuronen waren gelabeld door co-overexpressing GFP (UAS-GFP; ppk-GAL4) in de da neurale soma en dendritische arbors voor GFP fluorescentie imaging analyse. De morfologie van da neuron dendrites was beeld door een omgekeerde confocal microscoop (Figuur 2).
De dendrites van da neuronen werden opgespoord met behulp van Fiji ImageJ software. Het bestand werd gebruikt voor het schatten van de dendriet lengte (Figuur 3). Zwijgen van Sox102F in da neuronen (N = 21) (UAS-Sox102F-RNAi/ppk-GAL4; UAS-GFP) leidde tot een aanzienlijke vermindering van het aantal dendrites en een kortere lengte met een eenvoudiger structuur ten opzichte van besturingselementen (N = 20) (UAS-GFP; ppk-GAL4 / +) in het derde instar larve (Figuur 6). Specifiek, vliegen waarin Sox102F werd tot zwijgen gebracht tentoongesteld een afname van de gemiddelde dendriet lengte 127 µm vergeleken met 249 µm in besturingselementen (p = 0,02), en had een oppervlakte van kleinere gemiddelde arbor 552,476 µm2 vergeleken met 847,571 µm,2 in besturingselementen (p = 0,04). Bovendien zwijgen van Sox102F resulteerde in een kleiner aantal takken en een eenvoudiger vertakkende structuur van arbors met totale takken van 17 (17.3 ± 6.7), in vergelijking met 28 (28.4 ± 9,5) in besturingselementen (p = 0,04). Student t-tests werden uitgevoerd om te vergelijken van de verschillen tussen de groepen en het significantieniveau 0,05 was instelt.
Figuur 1 : Schema van de analyseparameters dendriet van Drosophila da neuron. Deelvenster (A) is de oorspronkelijke afbeelding van een da neuron. (B) dendriet lengte was het gemiddelde van alle dendriet lengtes in alle gemeten da neuronen. (C) de oppervlakte van da neuron dendriet werd handmatig gedefinieerd door de ImageJ freehand tool. (D) dit schema ziet u hoe te tellen het totale aantal takken en vertakkende structuur van een neuron da analyseren. 1: primaire arbor. 2: secundaire arbor. 3: tertiaire arbor. 4: quaternaire arbor. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
Figuur 2 : Representatief tracering van de dendrites van een neuron da. Een neuron da was beeld met een confocal fluorescentie Microscoop systeem. (A) de eerste tracering is gemaakt met een beginpunt van de cel lichaam en het eindpunt van een dendriet met behulp van het hulpprogramma plugin/segmentatie. De blauwe lijn (witte pijl) staat voor het pad gedefinieerd. Na klikken op "Yes" (rode pijl), verandert de lijn kleur van blauw naar rood. (B) te klikken op "Finish Path" paars (C)weergegeven. (A-C) Toont het proces van tracering van een enkele dendriet; (D) de volledige overgetrokken afbeelding. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
Figuur 3 : Meting van de overgetrokken paden. De afbeelding aan de linkerkant toont hoe meet je de trace paden na het lopen de "analyse | Meten van paden." Pad lengte waarden exporteren naar een spreadsheet-bestand, en het berekenen van de som van de lengte. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
Figuur 4 : Een voorbeeld van het definiëren van de oppervlakte van dendriet handmatig. Een gedefinieerde beeld werd verkregen met behulp van de freehand tool in het venstermenu voor ImageJ dat (aangegeven door de rode pijl). Stel de metingen door gebied te selecteren. Voer de functie "Maatregel" om te verkrijgen van de ruimte die zijn genoemd in het rode vak. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
Figuur 5 : Een voorbeeld van analyse van vertakking. Run "Analysis_Render | Analyze Skeletonized paden"in het venster van de plugin"Segmentatie". De gesmolten paden en hun aantal werden verkregen door het selecteren van "alle paden maken | Verkrijgen van samenvatting." Het pad is gedefinieerd tussen de cel lichaam en de dendriet tips, en één pad kan bevatten meerdere branches; bijvoorbeeld, waren de primaire arbors de dendrites van het neuron cel lichaam; de secundaire arbors waren takken van de primaire en zo verder met het tertiair, quaternaire en quinary arbors. De structuur van dendriet vertakking werd gescheiden afhankelijk van de niveaus van takken. Bijvoorbeeld, was primaire % het aantal bijkantoren verdeeld door totale aantal vertakking, enzovoort. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
Figuur 6 : Representatieve resultaten monddood maken van Sox102F in da neuronen. Dendriet lengte tot zwijgen brengen van Sox102F in da neuronen (UAS-Sox102F-RNAi/UAS-GFP; ppk-GAL4) heeft geleid tot aanzienlijk verlaagd en kortere vertakking met eenvoudiger structuur in de derde instar larve vergeleken met besturingselementen. De verschillen tussen Sox102F-RNAi vliegen (UAS-Sox102F-RNAi/UAS-GFP; ppk-GAL4, N = 21) en controle (UAS-GFP; ppk-GAL4 / +, N = 20) vliegen waren op (A) dendriet lengte (B) arbor oppervlakte (C) totaal aantal bijkantoren, en (D, E ) vertakkende structuur van de da neuronen. Student T-test was universiteitstheater voor statistische analyse. * geeft aan dat de statistische significantie (p < 0,05). De foutbalken zijn gemiddelde ± standaardafwijking. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Dendrites die de epidermis innervate zijn de input gebieden van neuronen en hun morphologies bepalen hoe de informatie is ontvangen en verwerkt door individuele neuronen. Ontwikkeling dendriet morfologie weerspiegelt gene modulatie van dendriet organisatie. De Drosophila larvale da neuron van het perifere zenuwstelsel is een belangrijk model voor het bestuderen van dendriet ontwikkeling omdat: 1) de functionele gelijkenis met zoogdieren11,12; 2) vier klasse onderscheid op basis van dendriet structuur11,12; en 3) de genetische factoren die morfogenese regelen. In dit protocol presenteren wij de workflow van larven voorbereiding tot beeldanalyse van Drosophila da neuronen. De vier belangrijke parameters voor het analyseren van dendrites in da neuronen in detail, die de lengte van dendrites, de oppervlakte en het totale aantal takken de vertakkende structuur worden beschreven. De kritische stap was om zoveel weefsels van de larve lichaam muur mogelijk om volledig bloot de neuronen da voor beeldbewerking en analyses. Er zou sommige korte takken afgesneden vanwege het beperkte aantal Z-projectie beelden. Als deze methode de relatieve meting van dendrites lengte ten opzichte van de besturingselementen is, moet een groot aantal afbeeldingen voor elke groep van da neuronen worden gehouden om de gebieden van de dekking van Z-projectie beelden.
Drosophila klasse IV da neuronen zijn de focus van het onderzoek betreffende dendriet arbor morfologie15,21,22,23. Morfogenese van dendritische arbor ontwikkeling zou kunnen worden verstoord door verlies of winst van de genfunctie, waaruit blijkt dat de da neuron ontwikkeling gevoelig voor genetische veranderingen24 is. Voor genetische studies is het belangrijk om te analyseren van de morfologie nauwkeurig om te begrijpen van de invloed ervan op da neuronen. Klasse IV da neuronen zijn complex, maar nog steeds toegankelijk voor kwalitatief hoogwaardige beeldvorming omdat ze zich net onder de semi-transparante body muur en tak, bijna geheel in twee dimensionale ruimte. De dynamische GFP-fluorescentie label da neuronen (ppk-GAL4; UAS-GFP) bieden een gemakkelijk gevisualiseerde model om te onderzoeken van neuronale ontwikkeling. De richting van de verandering van de morfologie varieert, arbors kunnen worden overbranched of kan worden vereenvoudigd. Hier, we gecategoriseerd deze morfologische veranderingen door stand parameters, b.v. de dendriet lengte, de oppervlakte en het totale aantal takken de vertakkende structuur van da neuronen. De resultaten weerspiegelen de reactie in de Sox102F expressie regulering van de neuronale ontwikkeling, zoals in deze studie.
Ons protocol is gebruikt voor het weergeven van de morfologische veranderingen van klasse IV da neuronen in vliegen in die de Drosophila ortholog van SOX5, Sox102F, werd het zwijgen opgelegd, met vermelding van een belangrijke functionele rol van SOX5 dendriet ontwikkeling en voedselproductie. De Wnt-eiwitten vormen een familie van secreted glycoproteïnen die zijn betrokken bij de regulering van dendriet morphogeneis. Wnt2 en Wnt7b da en neuronale complexiteit9,10te bevorderen. Deze activering wordt in de canonieke WNT gevolgd door activatie van GSK3β, een serine-threonine kinase, die op zijn beurt β-catenine gemedieerde transcriptie10,25 activeert. We hebben eerder geconstateerd dat zwijgen van SOX5 in menselijke SH-SY5Y neuroblastoom cellen in een aanzienlijke onderdrukking van Wnt signalering activiteit resulteerde en geregeld de expressie van een aantal Wnt genen met inbegrip van een overexpressie van GSK3β 15. Verhoogde expressie van GSK3β is geassocieerd met de hallmark-kenmerken van AD, waaronder geheugenverlies, β-amyloid plagen en abnormale hyperphosphorylation van tau26. Zwijgen van SOX5 verhoogd GSK3β expressie, die zou kunnen op een functioneel verband tussen SOX5 en GSK3β wijzen.
De klasse IV da neuronen hebben de meeste zeer complexe dendrites van alle sensoriële neuronen. In dit protocol hebben we een methode voor het analyseren van de complexiteit van arbor en takken te abstraheren van de eigenschappen van de klasse IV da neuronen in Drosophila gebaseerd op conventioneel beschikbare plugins en software ontwikkeld. Beelden die zijn genomen uit een confocal microscoop werden geanalyseerd en de segmentatie van de plugin van een eenvoudige neurite tracer verstrekt een ideaal hulpmiddel voor het traceren van de dendriet takken27,28. Bovendien, deze kwantificering methode geschikt is voor de gedetailleerde analyse van dendriet complexiteit door de presentatie van de ratio's van verschillende niveaus van vertakking van het soma op de meer afgelegen dendriet. Bovendien, deze methode kan worden gebruikt voor het analyseren van andere klassen van da neuronen. Bijvoorbeeld, klasse I da neuronen uitbreiden van secundaire dendrites aan de ene kant van de muur van het lichaam; klasse II heeft vertakking takken symmetrisch; en klasse III da neuronen hebben meer complexiteit van vertakking en pieken. Kortom, hebben wij een protocol voor imaging en analyse van klasse IV da neuronen verstrekt voor neuronale dendriet analyses in Drosophila.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
De auteurs hebben niets te onthullen.
Acknowledgments
We bedank William A. Eimer voor imaging technische bijstand. Dit werk werd gesteund door de Cure Alzheimer Fonds [R.E.T], het National Institute of Health [R01AG014713 en R01MH60009 voor de R.E.T; R03AR063271 en R15EB019704 naar A.L.], en de National Science Foundation [NSF1455613 naar A.L.].
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Phosphate buffered saline(PBS) | Gibco Life Sciences | 10010-023 | |
| TritonX-100 | Fisher Scientific | 9002-93-1 | |
| Paraformaldehyde(PFA) | Electron Microscopy Sciences | 15714-S | |
| Sylgard 184 silicone elastomer base and curing agent | Dow Corning Corportation | 3097366-0516;3097358-1004 | |
| ProLong Gold Antifade Mountant | Thermo Fisher Scientific | P36931 | |
| Fingernail polish | CVS | 72180 | |
| Stereo microscope | Nikon | SMZ800 | |
| Confocal microscope | Nikon | Eclipse Ti-E | |
| Petri dish | Falcon | 353001 | |
| Forceps | Dumont | 11255-20 | |
| Scissors | Roboz Surgical Instrument Co | RS-5611 | |
| Insect Pins | Roboz Surgical Instrument Co | RS-6082-25 | |
| Microscope slides and cover slips | Fisher Scientific | 15-188-52 |
References
- Wassle, H., Boycott, B. B.
- MacNeil, M. A., Masland, R. H. Extreme diversity among amacrine cells: implications for function. Neuron. 20 (5), 971-982 (1998).
- Losonczy, A., Makara, J. K., Magee, J. C. Compartmentalized dendritic plasticity and input feature storage in neurons. Nature. 452 (7186), 436-441 (2008).
- Spruston, N. Pyramidal neurons: dendritic structure and synaptic integration. Nat Rev Neurosci. 9 (3), 206-221 (2008).
- Jaworski, J., et al. Dynamic microtubules regulate dendritic spine morphology and synaptic plasticity. Neuron. 61 (1), 85-100 (2009).
- Kweon, J. H., Kim, S., Lee, S. B. The cellular basis of dendrite pathology in neurodegenerative diseases. BMB Rep. 50 (1), 5-11 (2016).
- Baloyannis, S. J.
- Masliah, E., Terry, R. D., Alford, M., DeTeresa, R., Hansen, L. A. Cortical and subcortical patterns of synaptophysinlike immunoreactivity in Alzheimer's disease. Am J Pathol. 138 (1), 235-246 (1991).
- Wayman, G. A., et al. Activity-dependent dendritic arborization mediated by CaM-kinase I activation and enhanced CREB-dependent transcription of Wnt-2. Neuron. 50 (6), 897-909 (2006).
- Rosso, S. B., Sussman, D., Wynshaw-Boris, A., Salinas, P. C. Wnt signaling through Dishevelled, Rac and JNK regulates dendritic development. Nat Neurosci. 8 (1), 34-42 (2005).
- Grueber, W. B., Jan, L. Y., Jan, Y. N. Different levels of the homeodomain protein cut regulate distinct dendrite branching patterns of Drosophila multidendritic neurons. Cell. 112 (6), 805-818 (2003).
- Sugimura, K., Satoh, D., Estes, P., Crews, S., Uemura, T. Development of morphological diversity of dendrites in Drosophila by the BTB-zinc finger protein abrupt. Neuron. 43 (6), 809-822 (2004).
- Jan, Y. N., Jan, L. Y. Branching out: mechanisms of dendritic arborization. Nat Rev Neurosci. 11 (5), 316-328 (2010).
- Sears, J. C., Broihier, H. T. FoxO regulates microtubule dynamics and polarity to promote dendrite branching in Drosophila sensory neurons. Dev Biol. 418 (1), 40-54 (2016).
- Li, A., et al. Silencing of the Drosophila ortholog of SOX5 leads to abnormal neuronal development and behavioral impairment. Hum Mol Genet. 26 (8), 1472-1482 (2017).
- Misra, M., et al. A Genome-Wide Screen for Dendritically Localized RNAs Identifies Genes Required for Dendrite Morphogenesis. G3 (Bethesda). 6 (8), 2397-2405 (2016).
- Emoto, K., et al. Control of dendritic branching and tiling by the Tricornered-kinase/Furry signaling pathway in Drosophila sensory neurons. Cell. 119 (2), 245-256 (2004).
- Olesnicky, E. C., et al. Extensive use of RNA-binding proteins in Drosophila sensory neuron dendrite morphogenesis. G3 (Bethesda). 4 (2), 297-306 (2014).
- Parrish, J. Z., Xu, P., Kim, C. C., Jan, L. Y., Jan, Y. N. The microRNA bantam functions in epithelial cells to regulate scaling growth of dendrite arbors in drosophila sensory neurons. Neuron. 63 (6), 788-802 (2009).
- Schindelin, J., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat Methods. 9 (7), 676-682 (2012).
- Corty, M. M., Matthews, B. J., Grueber, W. B. Molecules and mechanisms of dendrite development in Drosophila. Development. 136 (7), 1049-1061 (2009).
- Jinushi-Nakao, S., et al. Knot/Collier and cut control different aspects of dendrite cytoskeleton and synergize to define final arbor shape. Neuron. 56 (6), 963-978 (2007).
- Crozatier, M., Vincent, A. Control of multidendritic neuron differentiation in Drosophila: the role of Collier. Dev Biol. 315 (1), 232-242 (2008).
- Copf, T. Importance of gene dosage in controlling dendritic arbor formation during development. Eur J Neurosci. 42 (6), 2234-2249 (2015).
- Rosso, S. B., Inestrosa, N. C. WNT signaling in neuronal maturation and synaptogenesis. Front Cell Neurosci. 7, 103 (2013).
- Engel, T., Hernandez, F., Avila, J., Lucas, J. J. Full reversal of Alzheimer's disease-like phenotype in a mouse model with conditional overexpression of glycogen synthase kinase-3. J Neurosci. 26 (19), 5083-5090 (2006).
- Longair, M. H., Baker, D. A., Armstrong, J. D. Simple Neurite Tracer: open source software for reconstruction, visualization and analysis of neuronal processes. Bioinformatics. 27 (17), 2453-2454 (2011).
- Pool, M., Thiemann, J., Bar-Or, A., Fournier, A. E. NeuriteTracer: a novel ImageJ plugin for automated quantification of neurite outgrowth. J Neurosci Methods. 168 (1), 134-139 (2008).
