Descrevemos um protocolo detalhado para a geração de organoides cerebrais pluripotentes induzidos por células-tronco induzidos pelo homem e seu uso na modelagem de doenças mitocondriais.
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Artigo de método
Descrevemos um protocolo detalhado para a geração de organoides cerebrais pluripotentes induzidos por células-tronco induzidos pelo homem e seu uso na modelagem de doenças mitocondriais.
As doenças mitocondriais representam a maior classe de erros inatos do metabolismo e são atualmente incuráveis. Essas doenças causam defeitos neurodesenvolvimentistas cujos mecanismos subjacentes permanecem a ser elucidados. Um grande obstáculo é a falta de modelos eficazes recapitulando o comprometimento neuronal de início precoce visto nos pacientes. Os avanços na tecnologia de células-tronco pluripotentes induzidas (iPSCs) permitem a geração de organoides cerebrais tridimensionais (3D) que podem ser usados para investigar o impacto das doenças no desenvolvimento e organização do sistema nervoso. Pesquisadores, incluindo esses autores, introduziram recentemente organoides cerebrais humanos para modelar distúrbios mitocondriais. Este artigo relata um protocolo detalhado para a geração robusta de organoides cerebrais derivados do iPSC humanos e seu uso em perfis bioenergénicos mitocondrial e análises de imagens. Esses experimentos permitirão o uso de organoides cerebrais para investigar disfunções metabólicas e de desenvolvimento e podem fornecer informações cruciais para dissecar a patologia neuronal de doenças mitocondriais.
As doenças mitocondriais representam a maior classe de erros inatos do metabolismo1. São causadas por mutações genéticas que interrompem diferentes processos mitocondriais, incluindo fosforilação oxidativa (OXPHOS)2, montagem da cadeia respiratória, dinâmica mitocondrial e transcrição ou replicação do DNA mitocondrial3. Tecidos com necessidades energéticas são particularmente afetados pela disfunção mitocondrial4. Assim, pacientes com doenças mitocondriais normalmente desenvolvem manifestações neurológicas precoces.
Atualmente, não há tratamentos disponíveis para crianças afetadas com doenças mitocondriais5. Um grande obstáculo para o desenvolvimento de medicamentos de doenças mitocondriais é a falta de modelos eficazes recapitulando o curso da doença humana6. Vários dos modelos animais atualmente estudados não apresentam os defeitos neurológicos presentes nos pacientes7. Assim, os mecanismos subjacentes à patologia neuronal das doenças mitocondriais ainda não são totalmente compreendidos.
Estudos recentes geraram iPSCs de pacientes afetados por doenças mitocondriais e usaram essas células para obter células neuronais específicas do paciente. Por exemplo, defeitos genéticos associados à doença mitocondrial, síndrome de Leigh, foram encontrados para causar aberrações em bioenergética celular8,9, síntese proteica10 e homeostase de cálcio9,11. Esses relatórios forneceram importantes pistas mecanicistas sobre o comprometimento neuronal que ocorre em doenças mitocondriais, abrindo caminho para a descoberta de medicamentos para essas doenças incuráveis12.
Culturas bidimensionais (2D), no entanto, não permitem a investigação da complexidade arquitetônica e da organização regional dos órgãos 3D13. Para isso, o uso de organoides cerebrais 3D derivados de iPSCs 14 específicos do paciente pode permitir que os pesquisadores obtenham informações importantes adicionais e, assim, ajudem a dissecar como as doenças mitocondriais impactam o desenvolvimento e a função do sistema nervoso15. Estudos que empregam organoides cerebrais derivados do IPSC para investigar doenças mitocondriais estão começando a descobrir os componentes neurodesenvolvimentista das doenças mitocondriais.
Organoides medulares portadores de mutações associadas à doença mitocondrial, encefalopatia mitocondrial, acidose láctica e síndrome de episódios semelhantes a acidente vascular cerebral (MELAS), apresentaram neurogênese defeituosa e diferenciação retardada do neurônio motor16. Organoides corticais derivados de pacientes com a doença mitocondrial, síndrome de Leigh, apresentaram tamanho reduzido, defeitos na geração de brotos epiteliais neurais e perda de arquitetura cortical17. Organoides cerebrais de pacientes com síndrome de Leigh mostraram que os defeitos da doença iniciam-se ao nível das células progenitoras neurais, que não podem se comprometer com o metabolismo mitocondrial, causando ramificação neuronal aberrante e morfogênese18. Assim, os progenitores neurais podem representar um alvo terapêutico celular para doenças mitocondriais, e estratégias que promovam sua função mitocondrial podem apoiar o desenvolvimento funcional do sistema nervoso.
O uso de organoides cerebrais pode ajudar a descobrir os componentes neurodesenvolvimentos de doenças mitocondriais. As doenças mitocondriais são consideradas principalmente como neurodegeneração de início precoce5. No entanto, defeitos neurodesenvolvimentais também estão presentes em pacientes afetados por doenças mitocondriais, incluindo atraso no desenvolvimento e comprometimento cognitivo19. Organoides cerebrais específicos do paciente podem ajudar a abordar esses aspectos e elucidar como doenças mitocondriais podem afetar o desenvolvimento cerebral humano. A disfunção mitocondrial também poderia desempenhar um papel patogênico em outras doenças neurológicas mais comuns, como a doença de Alzheimer, a doença de Parkinson e a doença de Huntington4. Assim, elucidar o impacto dos defeitos mitocondriais no neurodesenvolvimento usando organoides cerebrais também pode ser fundamental para o estudo dessas doenças. Este artigo descreve um protocolo detalhado para a geração de organoides cerebrais reprodutíveis que podem ser usados para a condução da modelagem de doenças mitocondriais.
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NOTA: O uso de iPSCs humanos pode exigir uma aprovação ética. Os iPSCs utilizados neste estudo foram derivados de indivíduos de controle saudável após aprovação ética local (#2019-681). Todos os procedimentos de cultura celular devem ser realizados sob uma capa de cultura celular estéril, desinfetando cuidadosamente todos os reagentes e consumíveis antes de serem transferidos sob o capô. Os iPSCs humanos usados para diferenciação devem ter um número de passagem abaixo de 50 para evitar possíveis aberrações genômicas que podem ocorrer após uma cultura extensiva. O estado pluripotente das células deve ser validado antes da geração organoide, por exemplo, monitorando a expressão de marcadores associados à pluripotência, como NANOG ou OCT4. Os testes de mycoplasma devem ser realizados semanalmente para garantir culturas livres de mycoplasma.
1. Geração de organoides cerebrais
2. Imunostaining de organoides cerebrais
3. Perfil bioenergético de organoides cerebrais
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O protocolo aqui descrito facilita a geração robusta de organoides redondos (Figura 1A). Os organoides gerados contêm neurônios maduros que podem ser visualizados usando marcadores proteicos específicos para axônios (SMI312) e dendritos (proteína associada a microtúbulos 2 (MAP2)) (Figura 1B). Os organoides maduros contêm não apenas células neuronais (MAP2 positivos), mas também células gliais (por exemplo, posi...
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Este artigo descreve a geração reprodutível de organoides cerebrais derivados do iPSC humanos e seu uso para modelagem de doenças mitocondriais. O protocolo descrito aqui é modificado com base em um trabalho publicado anteriormente20. Uma grande vantagem do presente protocolo é que ele não requer a incorporação manual de cada organoide em uma matriz de andaimes. Na verdade, a solução matricial é simplesmente dissolvida no meio da cultura celular. Além disso, não há necessidade de empregar bioreato...
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Os autores não declaram interesses financeiros ou não financeiros concorrentes.
Agradecemos a Miriam Bünning pelo apoio técnico. Reconhecemos o apoio da Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) (PR1527/5-1 a A.P.), Spark e Berlin Institute of Health (BIH) (BIH Validation Funds to A.P.), the United Mitochondrial Disease Foundation (UMDF) (Leigh Syndrome International Consortium Grant to A.P.), University Hospital Duesseldorf (Forschungskommission UKD to A.P.), e o Ministério Federal alemão de Educação e Pesquisa (BMBF) (e: Bio jovem investigador conceder AZ 031L0211 a A.P.). O trabalho no laboratório da C.R.R. foi apoiado pelo DFG (FOR 2795 "Sinapses sob estresse", Ro 2327/13-1).
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| 2-mercaptoetanol | Gibco | 31350-010 | |
| Affinity Designer | Serif (Europe) Ltd | Software de layout; Editor de gráficos vetoriais | |
| Alexa Fluor 488 burro anti-cobaia | Sigma Aldrich | SAB4600033-250UL | 1:300 |
| Alexa Fluor 488 burro anti-rato | Thermo Fisher Scientific | A-31571 | 1:300 |
| Antimicina A | Sigma Aldrich | 1397-94-0 | |
| Anti-β-Tubulina III (TUJ-1) | Sigma Aldrich | T8578 | 1:2000 |
| Argônio Laser | Melles Griot | Qualquer outro Laser, por exemplo, lasers de diodo emitindo 488 também | |
| Ácido ascórbico | Sigma | A92902 | |
| B-27 com Vitamina A | Gibco | 17504044 | |
| Ágar Bacto | Becton Dickinson | 3% em PBS, armazene a solução a -20 ° C | |
| BDNF | Miltenyi Biotec | 130-093-0811 | |
| cAMP | Sigma | D0627 | |
| Cell Star cultura de células placa de 6 poços | Greiner-Bio-One | 657160 | |
| Concentrado lipídico quimicamente definido | Gibco | 11905031 | |
| microscópio confocal de varredura a laser C1 | Nikon Microscope Solutions | Microscópio confocal modular sistema | |
| Corning Matrigel Fator de Crescimento Reduzido (TFG) Matriz de membrana basal, sem fenol Sem vermelho, sem LDEV | Componente Corning | 356231 | Matrix |
| Kit de ensaio de proliferação celular CyQUANT | Thermo Fisher | C7026 | |
| DMEM/F12 | ThermoFisher | 31330038 | |
| DMSO | Sigma | D2660-100ML | |
| Burro anti-cabra Cy3 | Merck Millipore | AP180C | 1:300 |
| Donkey anti-mouse Cy3 | Merck Millipore | AP192C | 1:300 |
| Donkey anti-rabbit Cy3 | Merck Millipore | AP182C | 1:300 |
| DPBS | Gibco | 14190250 | |
| DS-Q1Mc câmera | Nikon Microscope Solutions | ||
| Eclipse 90i microscópio vertical de campo amplo | Nikon Microscope Solutions | ||
| Microscópio vertical Eclipse E 600FN | Nikon Microscope Solutions | ||
| Microscópio invertido Eclipse Ts2 | Microsope Solutions | ||
| EZ-C1 Silver Version 3.91 | Nikon Microscope Solutions | Software de imagem para microscópio confocal | |
| FCCP | Sigma Aldrich | 370-86-5 | |
| Soro Fetal Bovino | Gibco | 10270-106 | |
| GDNF | Miltenyi Biotec | 130-096-291 | |
| Glasgow MEM | Gibco | 11710-035 | |
| Pipeta de vidro Pasteur | Marca | 747715 | Inverted |
| Glutamax | Gibco | 35050-061 | |
| Helium-Neon Laser | Melles Griot | Todos os outros lasers, por exemplo, lasers de diodo emitindo 594 estão bem, também | |
| Heparina | Merck | H3149-25KU | |
| HERACell 240i CO2 Incubadora | Thermo Scientific | 51026331 | |
| Hoechst 33342 | Invitrogen | H3570 | 1:2500 |
| Imagem J 1.53c | Wayne Rasband Instituto Nacional de Saúde | Software de processamento de imagem | |
| Injekt Solo 10 mL/ Luer | Braun | 4606108V | |
| Knockout Serum Replacement | Gibco | 10828010 | |
| Laser (407 nm) | Coerente | Qualquer outro Laser, por exemplo, lasers de diodo emitindo 407 também está bem | |
| Map2 | Synaptic Systems | No. 188004 | 1:1000 |
| Maxisafe 2030i | |||
| MEM NEAA | Gibco | 11140-050 | |
| mTeSR Plus | Centrífuga | Multifuge X3R média iPSC | 85850 |
| Detecção de Mycoplasma MycoAlert | # LT07-218 | ||
| Suplemento N2 | Gibco | 17502-048 | |
| TW) | Neoject | 10016 | |
| NIS-Elements Aadvanced Research 3.2 | Nikon | Software de imagem | |
| Oligomicina A | Sigma Aldrich | 75351 | |
| Orbital Shaker Heidolph Unimax 1010 | Heidolph | 543-12310-00 | |
| PAP Pen | Sigma | Z377821-1EA | Para desenhar barreira hidrofóbica em slides. |
| Kit de Sistema de Dissociação de Papaína | Worthington | LK003150 | |
| Paraformaldeído | Merck | 818715 | 4% em PBS, solução de loja a -20 ° C |
| Pipeta Pasteur 7mL | VWR | 612-1681 | Graduada até 3 mL |
| Penicilina-Estreptomicina | Gibco | 15140-122 | |
| Plan Apo VC 20x / 0.75 ar DIC N2 ∞/0.17 WD 1.0 | Nikon Microscope Solutions | Dry Microscope | |
| Objective Plan Apo VC 60x / 1.40 óleo DIC N2 ∞/0.17 WD 0.13 | Nikon Microscope Solutions | Placa de | |
| (100 mm) | Greiner Bio-One | 664161 | |
| com tampa de filtro de células (5 mL) | Falcon | 352235 | |
| Cloreto de potássio | Roth | 6781.1 | |
| ProLong Glass Antifade Moutant | Invitrogen | P36980 | |
| Papel de filtro qualitativo | VWR | 516-0813 | |
| Inibidor de Rochas | Merck | SCM075 | |
| Rotenone | Sigma | 83-794 | |
| S100β | Abcam | Ab11178 | 1:600 |
| SB-431542 | Cayman Chemical Company | 13031 | |
| Lâminas de bisturi | Heinz Herenz Hamburq | 1110918 | |
| SMI312 | Biolegend | 837904 | 1:500 |
| Bicarbonato de sódio | Merck/Sigma | 31437-1kg-M | |
| Cloreto de sódio | Roth | 3957 | |
| Sódio dihidrogenofosfato | Applichem | 131965 | |
| Pyruvate de Sódio | Gibco | 11360070 | |
| SOX2 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-17320 | 1:100 |
| Reagente de Dissociação de Células Accutase StemPro | Gibco/StemPro | A1110501 | Reagent A |
| Super Glue Gel | UHU | 63261 | Gel adesivo |
| SuperFrost Plus | VWR | 631-0108 | |
| Seringa para uso único (1 mL) | BD Plastipak | 300015 | |
| TB2 Thermoblock | Biometra | ||
| TC Placa 24 Poços | Sarstedt | 83.3922 | |
| TC Placa 6 Poços | Sarstedt | 83.392 | |
| TGFbeta3 | Miltenyi Biotec | 130-094-007 | |
| Capuz de Cultura de Tecidos | ThermoFisher | 51032711 | |
| TOM20 | Santa Cruz Biotechnology | SC-11415 | 1:200 |
| Triton-X | Merck | X100-5ML | |
| UltraPure 0.5M EDTA | Invitrogen | 15575020 | |
| Vibratome Microm HM 650 V | Thermo Scientific | Produção terminada, qualquer outro micrótomo ajustável também está bem. | |
| Lâmina de Barbear Clássica Vibratome Wilkinson | Espada Wilkinson | 70517470 | |
| Whatman Benchkote | Merck/Sigma | 28418852 | |
| Wnt Antagonista I | EMD Millipore Corp | 3378738 | |
| XF 96 analisador de fluxo extracelular | Seahorse Bioscience | 100737-101 | |
| XF Ensaio DMEM Médio | Seahorse Bioscience | 103680-100 | |
| Solução Calibrante XF | Seahorse Bioscience | 100840-000 | |
| XFe96 FluxPak (microplaca de 96 poços) | Seahorse Bioscience | 102416-100 |
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