Буферы могут использоваться для оценки соединений при определенных значениях pH. В этом разделе вы будете записывать спектр поглощения индикатора нейтральным красным цветом в различных буферах. Протонированная форма нейтрального красного цвета — красная, а депротонированная — желто-оранжевая, что означает, что они поглощают зеленый и сине-фиолетовый свет соответственно. Таким образом, кислотная и основная формы имеют различные длины волн поглощения. Связывание с белками изменяет свойства нейтрального красного цвета, изменяя как его абсорбцию, так и pKa.
После измерения спектра поглощения свободного нейтрального красного цвета при нескольких значениях pH вы добавляете в растворы рибофлавин-связывающий белок, или RP, и снова измеряете абсорбцию. Интенсивность поглощения связана с концентрацией, поэтому вы будете использовать спектры для определения pKa свободного и связанного нейтрального красного цвета после лабораторных работ.
-
Нарисуй следующую таблицу в своем лабораторном блокноте. Пронумеруйте кюветы от 1 до 10 и перечислите девять значений pH буфера, которые вы будете использовать. 10-я кювета будет представлять собой деионизированную водную заготовку.
заметка: Всегда держите кюветы за текстурированные стороны и протирайте прозрачные стороны непосредственно перед тем, как поместить кювету в спектрофотометр. Не забудьте выровнять прозрачные стороны с лучом света в спектрофотометре.
Таблица 2: Поглощение свободного и связанного нейтрального красного цвета
| Кювета # | Буферный pH | Abs. at λmax (Free NRH+) | Abs. at λmax (Bound NRH) |
| 1 | 5.0 | | |
| 2 | 5.5 | | |
| 3 | 6.0 | | |
| 4 | 6.5 | | |
| 5 | 7.0 | | |
| 6 | 7.5 | | |
| 7 | 8.0 | | |
| 8 | 8.5 | | |
| 9 | 11 | | |
| 10 | blank | | |
Нажмите здесь, чтобы скачать таблицу 2
-
Возьмите десять кювет и колпачков объемом 1,5 мл и обозначьте колпачки от 1 до 10, чтобы они соответствовали таблице в вашем лабораторном блокноте.
-
Пометьте стакан объемом 25 мл как 'DIH2O' и наполните его деионизированной водой.
-
Слейте нейтральные водные отходы в канализацию и перемаркируйте стакан как "водные буферные отходы".
-
Пометьте стакан объемом 400 мл для использованных наконечников для микропипеток.
-
Прикрепите наконечник к микропипетке объемом 1 мл и используйте его для дозирования 1000 мкл деионизированной воды в кювету 10. Это ваша заготовка для растворителя.
-
Поместите 925 μл буфера мононатрийфосфата pH 7.0 в кювету 5.
-
Перенесите оставшиеся пустые кюветы в буферную таблицу. Следуя таблице в лабораторном блокноте, распределите 925 мкл каждого буфера в соответствующую кювету с помощью маркированных микропипеток. Будьте осторожны и не используйте один и тот же наконечник для дозатора для разных буферов.
-
Как только вы закончите, верните буферы обратно на свой рабочий стол. Там установите микропипетку объемом 200 мкл для дозирования 75 мкл и прикрепите наконечник к микропипетке.
-
Нанесите 75 μL нейтрального красного в каждую из девяти буферных кювет. Переверните каждую кювету несколько раз, чтобы тщательно перемешать растворы. заметка: Замените наконечник пипетки, если он соприкасается с буфером.
-
После того как вы смешали нейтральный красный цвет с каждым буфером, сделайте снимок или запишите цвета растворов.
-
Включите ручной спектрофотометр и дайте источнику света нагреться. Как только он будет готов, создайте новый эксперимент для измерения зависимости поглощения от длины волны для свободного нейтрального красного цвета.
-
Вставьте кювету с деионизированной водой и получите спектр деионизированной воды. Установите его в качестве сольвентного фона или заготовки.
-
Затем удалите заготовку и вставьте кювету нейтрального красного цвета в буфер с самым низким pH, который будет иметь самую высокую концентрацию протонированного нейтрального красного.
-
Получите спектр, который должен показать один сильный пик. Определите длину волны, соответствующую самой высокой точке этого пика, или максимуму. Запишите эту длину волны в лабораторный блокнот как lambda max для протонированного свободного нейтрального красного цвета.
-
Сохраните данные и удалите кювету. Запишите поглощение в блокнот, затем соберите спектры для кювет 2 - 9, используя ту же процедуру.
-
Запишите длину волны изобестической точки в свой лабораторный блокнот. Именно здесь все спектры пересекаются на одной длине волны. Если в этой точке спектр не пересекается, опорожните и очистите кювету, приготовьте новый образец и повторите попытку.
-
Как только вы закончите собирать спектры для всех девяти кювет, сохраните и экспортируйте данные.
-
Создайте новый эксперимент для измерения зависимости поглощения от длины волны для ограниченного нейтрального красного.
-
Установите новый наконечник на микропипетку объемом 200 мкл и добавьте 75 мкл раствора рибофлавин-связывающего белка в каждую кювету, включая бланк. Извлеките наконечник, закрепите крышки кюветы и несколько раз переверните кювету, чтобы перемешать растворы.
-
Вставьте кювету 10 в спектрофотометр и установите ее в качестве заготовки для растворителя.
-
Получите спектр образца с самым низким pH и определите длину волны, соответствующую максимуму самого интенсивного пика. Запишите его в лабораторный блокнот как лямбда-максимум нейтрального красного цвета, связанного с протонированием.
-
Получите спектры для кювет 2 - 9 так же, как вы делали это для бесплатных нейтральных красных образцов. Запишите интенсивности в максимальной точке лямбда для протонированного нейтрального красного цвета в таблице, а также длину волны в изобестической точке.
-
Когда вы закончите, сохраните свои данные, экспортируйте их для последующего анализа и выключите спектрофотометр.
-
Уберите все оборудование и выбросьте использованные наконечники для пипеток в утвержденный контейнер для отходов или мусорное ведро.
-
Вылейте кюветы в стакан для отходов водного буфера и промойте кюветы в стакане деионизированной водой.
-
Вылейте излишки NaOH в основные отходы и промойте градуированный цилиндр водой.
-
Смойте основные водные отходы в канализацию обильной водой из-под крана, вместе с другими водными отходами.
-
Мойте стеклянную посуду, крышки кювет и мешалку в соответствии со стандартными процедурами вашей лаборатории. Протрите рабочие поверхности влажным бумажным полотенцем и выбросьте использованные бумажные полотенца и лабораторные салфетки в мусорное ведро.