Визуализация формирования развивающихся органов, а также прогрессирования и лечения заболеваний часто в значительной степени зависит от возможности оптического исследования молекулярных и функциональных изменений в неповрежденных живых организмах. Большинство существующих методов оптической визуализации недостаточно эффективны для получения изображений в масштабах, находящихся между пределами проникновения современной оптической микроскопии (0,5-1 мм) и пределами оптической макроскопии, обусловленными диффузией (>1 см) [1]. Таким образом, многие важные модельные организмы, например, насекомые, эмбрионы животных или конечности мелких животных, остаются недоступными для оптической визуализации in vivo.
Несмотря на растущий интерес к разработке методов оптической визуализации с нанометровым разрешением, было предпринято немного успешных попыток увеличить глубину проникновения при формировании изображения. Возможность проведения визуализации in-vivo за пределами пределов микроскопии на практике сталкивается с трудностями, связанными с рассеянием фотонов в тканях. Например, недавние попытки визуализировать целые эмбрионы [2,3] требуют специальной химической обработки образца для устранения рассеяния — процедуры, которая делает их пригодными только для посмертной визуализации. Однако эти методы подтверждают необходимость визуализации более крупных образцов, чем те, что обычно доступны при двухфотонной или конфокальной микроскопии, особенно в биологии развития и при поиске новых лекарственных средств.
Нами был разработан новый метод оптической визуализации, получивший название мезоскопическая флуоресцентная томография [4], который подходит для неинвазивной визуализации in-vivo в диапазоне размеров от 1mm до 5mm. Данный метод жертвует разрешением в пользу глубины проникновения, но обеспечивает беспрецедентные возможности томографической визуализации. Он был разработан для того, чтобы добавить время в качестве нового измерения в наблюдениях в области биологии развития (и, возможно, в других областях биологических исследований), предоставляя возможность визуализировать эволюцию флуоресцентно-меченных ответов во времени. Таким образом, этот метод может ускорить изучение морфологических или функциональных зависимостей от генных мутаций или внешних стимулов и, что немаловажно, позволяет получить полную картину развития или функционирования тканей за счет лонгитюдной визуализации в режиме таймлапс одного и того же развивающегося организма.
В данном методе используется модифицированный лабораторный микроскоп и многопроекционная подсветка для сбора данных при 360-градусном проецировании. В нем применяется упрощение Ферми к решению уравнения Фоккера-Планка для уравнения переноса фотонов в сочетании с принципами геометрической оптики для создания реалистичной схемы инверсии, подходящей для мезоскопического диапазона. Это позволяет осуществлять прижизненную визуализацию всего тела непрозрачных трехмерных структур в образцах размером до нескольких миллиметров.
Мы продемонстрировали эффективность данного метода in-vivo, визуализировав трехмерные структуры развивающихся тканей Drosophila in-vivo и отслеживая морфогенез крыльев в непрозрачных куколках Drosophila в режиме реального времени в течение шести последовательных часов.