Enhanced приведенного представления Бисульфитное секвенирование по оценке метилирования ДНК в паре оснований резолюции

27.5K просмотров

Цитируется: 115

13:47 мин.

24 февраля 2015 г.

10.3791/52246-v

24 февраля 2015 г.

27.5K просмотров

Francine E. Garrett-Bakelman^*¹ , Caroline K. Sheridan^*¹ , Thadeous J. Kacmarczyk¹ , Jennifer Ishii¹ , Doron Betel¹^,² , Alicia Alonso¹ , Christopher E. Mason³ , Maria E. Figueroa⁴ , Ari M. Melnick¹

¹Department of Medicine, Weill Cornell Medical College, ²Institute for Computational Biomedicine, Weill Cornell Medical College, ³Department of Physiology and Biophysics, Weill Cornell Medical College, ⁴Department of Pathology, University of Michigan

^* These authors contributed equally

Enhanced Reduced Representation Bisulfite Sequencing — это метод подготовки библиотек секвенирования для анализа метилирования ДНК, основанный на расщеплении фермента рестрикции в сочетании с конверсией цитозинабисульфита. Этот протокол требует 50 нг исходного материала и дает данные о разрешении пар оснований в богатых GC геномных областях.