Получение замороженных островков плода плода примата для комбинированного одноядерного РНК-секвенирования и ATAC-секвенирования, а также объемной метаболомики

1K просмотров

03:39 мин

8 ноября 2024 г.

1K просмотров

Darian T. Carroll¹ , Sarah R. Lindsley² , Melissa Kirigiti² , Alex Buko³ , Angela Jones⁴ , Paul Kievit² , Maureen Gannon¹^,⁵^,⁶^,⁷

¹Department of Molecular Physiology and Biophysics, Vanderbilt University, ²Division of Metabolic Health and Disease, Oregon National Primate Research Center, ³Human Metabolome Technologies (HMT) America, ⁴Vanderbilt Technologies for Advanced Genomics, Vanderbilt University Medical Center, ⁵Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, ⁶Department of Veterans Affairs Tennessee Valley, ⁷Department of Cell and Developmental Biology, Vanderbilt University

В этом протоколе описаны процедуры выделения высококачественных ядер из замороженных островков поджелудочной железы приматов, не являющихся человеком, для использования в одновременном секвенировании одноядерных РНК и секвенировании ATAC с сохранением объемной цитозольной фракции для метаболомных анализов из тех же образцов.

Больше видео

Chapters in this video

0:00

Inroduction

1:09

Cellular Fractionation of Rhesus Macaque Pancreatic Islets for Single‐Cell RNA Sequencing and Metabolomics