Burada verilen lezyon-belirti haritalama amacıyla açık erişim, standart görüntü işleme boru hattı için pratik bir öğretici. CT/MRG'deki manuel enfarktüs segmentasyonundan sonraki kayıttan standart alana kadar her işlem adımı için, örnek durumlarda pratik öneriler ve resimlerle birlikte adım adım gözden geçirilir.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
Lezyon-semptom Haritalama için MRG veya BT'de Beyin Enfarktüs Segmentasyonu ve Kaydı
Bu makalede
Özet
Özet
Lezyon-semptom haritalamada (LSM), beyin fonksiyonu bir grup hastada edinsel beyin lezyonlarının yerini davranışsal veya bilişsel semptomlarla ilişkilendirerek çıkarılır. Beyin görüntüleme ve görüntü işleme son gelişmeler ile, LSM bilişsel nörobilimde popüler bir araç haline gelmiştir. LSM bilişsel ve bilişsel olmayan işlevler çeşitli insan beyninin fonksiyonel mimarisi içine temel anlayışlar sağlayabilir. LSM çalışmalarının gerçekleştirilmesinde önemli bir adım, büyük bir hasta grubunun beyin taramalarındaki lezyonların segmentasyonu ve her tetkikin ortak bir stereotaksik alana kaydedilmesidir (standart alan veya standart beyin şablonu olarak da adlandırılır). Burada açıklanan açık erişimli, lsm amacıyla enfarktüs segmentasyonu ve kayıt için standart bir yöntem, hem de örnek durumlarda dayalı ayrıntılı ve eller üzerinde bir geçiş. Ct taramaları ve DWI veya FLAIR MRI dizileri beyin enfarktüslerinin manuel segmentasyonu için kapsamlı bir öğretici, farklı tarama türleri için enfarktüs tanımlama ve tuzaklar için kriterler de dahil olmak üzere sağlanmaktadır. Kayıt yazılımı heterojen edinme parametreleri ile CT ve MRI verilerinin işlenmesi için kullanılabilecek birden çok kayıt düzeni sağlar. Bu kayıt yazılımının kullanılması ve görsel kalite kontrolleri ve manuel düzeltmelerin (bazı durumlarda gerekli olan) yapılması konusunda bir öğretici sağlanır. Bu yaklaşım, araştırmacılara, verilerin toplanmasından sonuçların nihai kalite kontrollerine kadar bir LSM çalışması gerçekleştirmek için gereken beyin görüntü işleme sürecinin tamamı için bir çerçeve sağlar.
Giriş
Lezyon-semptom haritalama (LSM), ayrıca lezyon-davranış haritalama denir, insan beyninin fonksiyonel mimarisi ni incelemek için önemli bir araçtır1. Lezyon çalışmalarında, beyin fonksiyonu çıkarılan ve edinsel beyin lezyonları olan hastalar incelenerek lokalize. On dokuzuncu yüzyılda gerçekleştirilen belirli beyin konumları nörolojik belirtiler bağlayan ilk vaka çalışmaları zaten dil ve diğer birçok bilişsel süreçlerin anatomik korelasyoniçine temel anlayışlar sağladı2. Ancak, biliş ve diğer beyin fonksiyonlarının birçok yönünü nöroanatomik korelasyonlar zor kaldı. Son yıllarda, gelişmiş yapısal beyin görüntüleme yönteml....
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Protokol
Bu protokol, kurumlarımızın insan araştırma etik komitesinin yönergelerini takip eder.
1. Taramalar ve Klinik Verilerin Toplanması
- İskemik inme hastalarının beyin BT veya MRG taramalarını toplayın. Çoğu tarayıcı, taramaları sabit diske veya sunucuya kopyalanabilen DICOM (Tıpta Dijital Görüntüleme ve İletişim) dosyaları olarak kaydeder.
NOT: Her tarayıcı türünden taramalar, tarama protokolü ve MRG alan gücü kullanılabilir, 1) kullanılan tarama türü için zaman penceresi gereksinimleri karşılanır (Tablo 1'e bakınız ) ve 2) doğru enfarktüs delineation engelleyen hiçbir yapı yoktur.....
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Sonuçlar
CT(Şekil 3),DWI (Şekil 5) ve FLAIR (Şekil 6) görüntüleri ve MNI-152 şablonuna sonraki kayıt beyin enfarktüs segmentasyonları örnek durumlarda burada sağlanır. Şekil 3B ve Şekil 5C'de gösterilen kayıt sonuçları, ventrikülün ön boynuzunun yakınında yanlış hizalama olduğu için tam olarak başarılı olamadı. Bu başarısız kayıtların kayıtlı lezyon .......
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Tartışma
LSM, insan beyninin fonksiyonel mimarisini incelemek için güçlü bir araçtır. Herhangi bir lezyon-semptom haritalama çalışmasında önemli bir adım görüntüleme verilerinin ön işlenmesi, lezyonun segmentasyonu ve beyin şablonuna kayıttır. Burada, lezyon-semptom haritalama amacıyla lezyon segmentasyonu ve kayıt için standart bir boru hattı rapor ediyoruz. Bu yöntem serbestçe kullanılabilir görüntü işleme araçları ile yapılabilir, hem BT hem de yapısal MRI taramaları işlemek için kullanılabilir ve lezyon-semptom haritalama ana.......
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Açıklamalar
Yazarlar çıkar çatışması olmadığını açıklarlar.
Teşekkürler
Dr Biesbroek çalışmaları Beyin Merkezi Rudolf Magnus Üniversitesi Tıp Merkezi Utrecht bir Genç Yetenek Bursu tarafından desteklenir. Bu çalışma ve Meta VCI Harita konsorsiyumu, Hollanda'nın ZonMw, Sağlık Araştırma ve Geliştirme Örgütü'nden Geert Jan Biessels'e vici Grant 918.16.616 tarafından desteklenmiştir. Yazarlar, dr. Tanja C.W. Nijboer'a figürlerden birinde kullanılan taramaları paylaştığı için teşekkür etmek isterler.
....Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Malzemeler
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| dcm2niix | N/A | N/A | ücretsiz indirme https://github.com/rordenlab/dcm2niix |
| ITK-SNAP | N/A | N/A | ücretsiz indirme www.itksnap.org |
| MATLAB | MathWorks | N/A | Sürüm 2015a veya üzeri |
| MRIcron | N/A | N/A | ücretsiz indirme https://www.nitrc.org/projects/mricron |
| RegLSM | N/A | N/A | ücretsiz indir www.metavcimap.org/support/software-tools |
| SPM12b | N/A | N/A | ücretsiz indirme https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/ |
Kaynaklar
- Rorden, C., Karnath, H. O. Using human brain lesions to infer function: A relic from a past era in the fMRI age. Nature Reviews Neuroscience. 5 (10), 812-819 (2004).
- Biesbroek, J. M., Weaver, N. A., Biessels, G. J.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yeniden basım ve izinler
