Method Article

Deniz suyu Örnekleme ve Tahsilat

DOI:

10.3791/1159

June 17th, 2009

In This Article

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu video belgeleri kıyı deniz suyu örneklerinin toplanması ve biyokütle konsantrasyonu, nükleik asit saflaştırma, hücrenin bolluk, besin ve iz gaz analizleri de dahil olmak üzere çeşitli alt uygulamalar için işleme yöntemleri.

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu video belgeleri kıyı deniz suyu örneklerinin toplanması ve biyokütle konsantrasyonu, nükleik asit saflaştırma, hücrenin bolluk, besin ve iz gaz analizleri de dahil olmak üzere çeşitli alt uygulamalar için işleme yöntemleri. Saanich'dan Giriş HMS John Strickland işletim güverte bugünkü gösteri örnekleri için toplanmıştır. Niskin ile birlikte kullanılır ya da çok amaçlı vinç ve kablo sistemi ile derrick A-çerçevesi, Go-Flo su örnekleme şişeleri. , İletkenlik, Sıcaklık, ve Derinlik (BDH) sensörleri, aynı zamanda temel su kütlesi örnek kullanılır. Outgassing en aza indirmek için, iz gaz örnekleri toplanır. Sonra, besinler, su kimyası ve hücre sayıları belirlenir. Son olarak, sular biyokütle filtrasyon için toplanır. Tek bir döküm için set-up ve tahsilat süresi en fazla 215 metre derinlikte ~ 1.5 saat. Bu nedenle, toplam 6 saat, genellikle burada açıklanan koleksiyon serisi tamamlamak için gerekli.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bölüm 1: Su Toplama

  1. Derinlikleri her döküm atanır.
  2. Derinlikleri numune alınacak ve mevcut döküm için tahsil edilecek toplam hacmi belirlenir.
  3. Go-Flo ve Niskin şişe açıktır ve vanalar ve uçlar kapalı olduğunu sağlanır.
  4. CTD hattı alt yüklenir ve suya daha düşüktür.
  5. Döküm örneklenmiş derin derinlik için bir şişe ilk CTD sonra çizgi üzerine yüklenir; satır dirsek içine doğru takılı olduğunu sağlanır ve vidaları sıkılır.
  6. Bir haberci indirilmesinden önce (en derin hariç) her bir şişe bağlı.
  7. Hattı ilk derinliği ve gelecek arasındaki mesafe düşürdü; başka bir şişe daha sonra yüklenir. 20L filtrasyon için toplanan derinlikleri için, toplam 2 12L şişelerin dışında .75 m hakkında art arda yüklü olduğu unutulmamalıdır.
  8. Tüm şişeler on line sonra, çizgi istenilen derinliğe kadar indirilir ve 2 dakika geçmesine izin verir.
  9. Bir haberci indirdik ve tüm şişe yakın sağlamak geçmek için birkaç dakika izin verilir.
  10. Doğrultusunda reeled ve rafları üzerine gelip şişe boşaltılır.
  11. DNA ve RNA için 20L örnekleri gerektiren derinlikler için, iki Niskin şişe toplanır. Bir şişe, damacana diğer boşaltılması ise, kimyasal parametreler (aşağıya bakın) örnek kullanılır. RNA ikinci Niskin hemen toplanır. ~ 20L son hacim vermek için damacana ilk kalanı da içine boşaltılır. Düşük çözünürlüklü örnekleri için sadece su 1L steril Nalgene şişe filtrasyon için bir kenara koyun.

Bölüm 2: Gaz örnek toplama

  1. Eğer oksijen örnekleri ihtiyaç vardır, onlar ilk toplanır.
  2. Bir parça ince boru Niskin bağlı / Go-Flo tertibatı ve hortumun diğer ucunu cam serum şişeleri içine yerleştirilir.
  3. Serum şişe 3 kez numune su ile durulanır ve hiçbir hava kabarcığı mevcut olduğunu tıklım dolu.
  4. 50μl civa klorür (HgCl 2) örnek içine hava kabarcıkları tanıtmak olmayan bir şekilde serum şişesine eklenir.
  5. Şişe, bir lastik tıpa ve alüminyum bir kap ile oturtulmuş ile kapatılan ve daha sonra bir soğutucu buz saklanır.

Bölüm 3: Besin örnek toplama

  1. 60 cc şırınga numune su ile durulanır, in-line (0.2 mikron) eklenir ve biraz su acrodisc ile itilir.
  2. Polietilen şişe (durulama sırasında şişe sallamak) ~ 10 ml filtrelenmiş su ile 3 kez yıkanır.
  3. Filtreli örnek su hakkında, şişe eklenir ¾ dolu.
  4. Numune soğutucu buz üzerinde saklanır.

Bölüm 4: Amonyak örnek toplama

  1. Örnek tüpleri, numune su ile durulanır.
  2. Örnek tüpleri, numune su ile tamamen doldurulur.
  3. Numune su 5ml, 10ml pipetlemeyin kullanarak dışarı alınır; tüp içindeki suyun geri kalanı atılır ve pipetlemeyin uç örnek tüpe 5ml değiştirilir.
  4. Tüm derinliklerinden örnekleri sonra amonyum çalışan reaktif 7.5ml her tüpe eklenir.

Bölüm 5: hücre sayımı için örnek toplama

  1. 5.4 ml% 37 formaldehit içeren bir ön etiketli 50 ml Falcon tüp final konsantrasyon% 4 üst doludur. Bakım dökmemeye alınır.

Bölüm 6: hidrojen sülfit ölçümler için örnek toplama

  1. % 20 çinko asetat (Zn (O 2 CCH 3) 2) içeren bir ön etiketli 50 ml Falcon tüp üst doludur. Bakım dökmemeye alınır.

Bölüm 7: biyokütle konsantrasyonu Küçük hacimli toplama

  1. 1 litrelik şişelerde üst doldurulur.

Bölüm 8: biyokütle konsantrasyonu Büyük hacimli toplama

  1. 20 litrelik bidonlarda doldurulur.

Bölüm 9: Temsilcilik Sonuçlar

Nihai sonucu yaklaşık 12 çözünmüş oksijen örnekleri, 32-48 gaz numunesi, 16 besin örnekleri, 32 amonyum örnekleri, 16 hidrojen sülfür örnekleri, hücre sayımı için 16 örnek, 6 20-litrelik bidonlarda, 16 adet 1 litrelik şişe deniz suyu numune sonuçları 4 Sterivex 0.22μm filtreleri içeren mikrobiyal biyokütle daha sonra RNA ile korunmuştur.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Genel olarak, bu tip örnekleme için gerekli hazırlık ve planlama büyük bir anlaşma, bu nedenle gezisi sonrasında her şeyin temizlenmesi için sipariş ve bir gün şeyler almak için bütçe 2 gün önce. Genel olarak, tuzlu su veya saha ekipmanları taşımak için kullanılan alüminyum Zarges kutuya peristaltik pompa ile temas etmesine izin vermeyin. Saygılı davranın ve ekipman gelmek için uzun bir zaman için iyi bir performans sergileyecektir.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.

Acknowledgements

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yenilik, British Columbia Bilgi Kalkınma Fonu ve Ulusal Bilimler ve Mühendislik Araştırma Konseyi (NSERC) Kanada Kanada Vakfı Biz, kıyı ve açık okyanus sularında düşük oksijen bölgelerde devam eden çalışmalar destek için teşekkür etmek istiyorum. Buna ek olarak, DAW NSERC, Killam ve TULA vakıf Mikrobiyal Çeşitlilik ve Evrim finanse Merkezi burs tarafından desteklenmiştir.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
20L DamacanaFisher Scientific02-960-15
3/8 "TygonCole-Parmer06429-36
Sterivex filtrelerFisher ScientificSVG010RS
Ön Filtre Muhafaza ÜnitesiAMD501200
Luer Bağlantı ElemanıCole-Parmer31507-27
1/4 "Tygon boruCole-Parmer06429-24
1/4 " Tygon boruCole-Parmer06429-24
1/4 " Tygon boruCole-Parmer06429-24
50ml Plastik tüpler
Cam Örnek Toplama
Cam serum şişeleri için septa ve alüminyum kapaklar
El Kıvırıcı
20-200ul Pipet ve Uçlar
Cam TüplerAmonyum Örnek Toplama
30ml Plastik ŞişelerBesin Toplama
Akrodisk FiltrelerEMD Millipore
5 ml TüplerNitrit Numune Toplama
%37 FormaldehitReaktifiHücre sayımı numuneleri için
%20 Çinko AsetatReaktifiSülfür numuneleri için
Mercuric KlorürReaktifigaz numuneleri için
milliQ suReaktifi
Amonyum Çalışma ReaktifiReaktifiBorat tamponu, sodyum sülfit, ortofaladialdehit
SülfanilamidReaktif5g 450ml suya ve 50ml HCl
N- (1-naftil)-etilendiamin dihidroklorür çözeltisiReaktif0.5g 500ml suya
Cam Serum Şişeleri

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Cline, J. D. Spectrophotometric determination of hydrogen sulfide in natural waters. Limnology & Oceanography. 14, 454-458 (1969).
  2. Holmes, R. M., Aminot, A., Kerouel, R., Hooker, B. A., Peterson, B. J. A simple and precise method for measuring ammonium in marine and freshwater ecosystems. Canadian Journal of fisheries and Aquatic Science. 56, 1801-1808 (1999).

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Seawater SamplingWater CollectionCTD SensorsNiskin BottlesGo Flo BottlesTrace Gas SamplingNutrient AnalysisCell CountingBiomass FiltrationRNA Purification

Related Articles