Fare doku veri toplama maksimize etmek için farklı teknikler bir arada sunulmaktadır.
Yöntem makalesi
Fare doku veri toplama maksimize etmek için farklı teknikler bir arada sunulmaktadır.
Tek bir genin işlevini gen düzenleyici ağların içine derin kesmek ötesine geçerek, tek bir hayvan kombine birden fazla mutasyonlar gerektirir. Bu tür iki veya daha fazla gen analiz hücresel ve doku ifade değişiklikler ayrıntılı çözümü için, bütün monte gelişmekte olan organ veya bölümleri, diğer genler, ya da proteinlerin immünohistokimya in situ hibridizasyon ile tamamlanması gerekiyor. Birden fazla gen değişiklikleri birleştiren CRE veya flipase koşullu genleri silmek ve embriyonik öldürücülüğü önlemek için kullanılmasını gerektirir. Gerekli ıslah planları dramatik çaba geliştirmek ve istenilen genetik değişiklikler tam bir repertuar ile çok az sayıda hayvan bir sonucu mutasyona uğramış genlerin sayısı ile doğru orantılıdır maliyet. Amortizing birden fazla mutasyonları taşıyan bu birkaç değerli örnekleri elde etmek için çaba ve zaman büyük miktarda doku optimizasyonu gerektirmektedir. Ayrıca, birden fazla tekniği ile tek bir hayvan soruşturma daha kolay ifade profilleri ile ilişkili gen delesyonu kusurları yapar. Biz belirli bir hayvan daha kapsamlı bir analiz elde etmek için bir teknik geliştirdik; monte edilmiş hem de tüm organları ve bölümleri aynı örnekten yanı sıra, gen ve protein ifade gibi tüm birkaç farklı histolojik olarak tanınabilir yapılar analiz etme yeteneğine sahip. Fareler, bu tekniğin etkinliğini göstermek için kullanılmıştır olmasına rağmen hayvanların geniş bir yelpazede uygulanabilir. Bunu yapmak için, maksimum olası veri miktarı ayıklamak için, in situ hibridizasyon, immünhistokimya ve histoloji lipofilik boya izleme, tüm montaj birleştirir.
1. Lipofilik Boya enjeksiyon
Doku hazırlanması:
Bütün doku diseksiyonlar ve manipülasyon uygun boyutta iğne ile peristaltik pompa kullanarak transcardial perfüzyon 0.1 M fosfat tamponu (pH 7.4),% 4 paraformaldehid (PFA) sabit hayvanlarda yapılmaktadır. 6 aya kadar Doku% 4 PFA buzdolabında saklanabilir. Tüm hazırlıklar ve manipülasyon görüntüleme için gliserol ile montaj kadar% 0.4 veya daha yüksek PFA yapılmaktadır. Bu miktar PFA RNases etkin bir şekilde ortadan kaldırır ve in situ hibridizasyon RNA korur.
Boya Depolama:
Tüm boyalar, ışığa duyarlı olarak, en aza indirmek için hava sirkülasyonu ve parlak gün ışığına maruz karanlık bir kapalı bölmeye saklanan olmalıdır. Çapraz kontaminasyonu engellemek için, ayrı bir enstrüman seti, her boya ele kullanılmalıdır.

Şekil 1. Deney şematik bakış kulak, tüm yapılar görünüm için izin maruz kalmaktadır . Lipofilik boya enjekte edilir ve sonra diffüz izin verilir. Difüzyon sonra farklı nöron popülasyonları farklı boyalar etiketli görülebilir. Sonra, in situ hibridizasyon (Sox2) kulak ve etiketler mRNA yapılır. İmmünohistokimya sonra gerçekleştirilen(Myo7, tubulin) protein ekspresyonu görselleştirmek için. In situ hibridizasyon ve immünohistokimya görüntülenebilmekte hangi histolojik kesitlerde izledi.
2. Situ Hibridizasyon.
(Lipofilik boyalar ile takibi mümkün olacak sonra) in situ hibridizasyon ile başlamak istiyorum durumda doku hazırlanması, Bölüm 1 bakınız. Her yıkama, belirtilmediği sürece, bir inverter / karıştırıcı oda sıcaklığında 2 mL solüsyon ile yapılır. Temiz, RNaz ortamda çalışmak için emin olun.
| Tablo 1. Fare doku proteinaz K sindirimi. | |
| YAŞ (embriyonik gün) | ZAMAN (dakika) |
| E8.5 | 6 |
| E9.5 | 10 |
| E10.5 | 13 |
| E11.5 | 15 |
| E12.5 | 17 |
| E14.5 | 18 |
| E16.5 + | 20 + |
* Örnekler bu aşamada görüntülü ve / veya immünohistokimya adımdan sonra (Bölüm 3) eklenir olabilir.
Çözümler:
3. İmmünohistokimya
Adım 1 ve 2 Bölüm 2 tamamlanmış ise atlanabilir. Bu durumda, gliserol veya diğer montaj orta yıkanıp olduğundan emin olun. Tüm antikorlar hala proteinaz K sindirimi sonra epitop algılamak için mümkün olacağını unutmayın. (Bkz. Tablo 2) kendi özgünlüklerini korumak memeli dokusunda in situ hibridizasyon ile birlikte kullanılabilir antikorların kısa bir liste var.
Çözümler
| Tablo 2. Proteinaz K sindirilir doku ile çalışmak Antikorlar. | ||
| Kedi # | Madde | Işportacı |
| 25-6790 | Anti-Myosin-VIIA Poliklonal | Proteus Biosciences |
| 25-6791 | Anti-Myosin-VI Poliklonal | Proteus Biosciences |
| 9661 | Cleaved Kaspaz-3 Poliklonal | Hücre Sinyalizasyonu |
| T7451 | Anti-Asetillendirilmiş tubulin Monoclonal | Sigma |
| SORUN-238C | Poliklonal Prox1 | Covance |
4. Histoloji
Histoloji juvenil beyinleri ya da 2 veya 3 Parça tamamlanmasından sonra kalın bütün bağlar izleme lipofilik boya çözünürlüğü artırmak için Bölüm 1 sonra sokulabilir. Seri beyin bölümler için tek tip kesit kalınlığı elde etmek için Compresstome VF-700 mikrotom (Precisionary Instruments Inc, Greenville, Kuzey Carolina) önermektedir. Frozen kesit süreci 3 sırasında daha fazla boya sızıntısı nedeniyle daha az optimum olan . Bütün bağlar veya yüzey bağlar ilgi doku bölgelerin yeterli görselleştirme izin vermez seri bölümlerinin hazırlanması ve gliserol 4 montaj doku hazırlanması tercih edilen yöntemdir. Doku daha sonra epoksi reçine de gömülü ve TEM için cam veya elmas bıçak kullanarak 1-2 mikron kalınlığında kesilmiş olabilir. Alkol ve epoksi reçine içinde çözülür bu tekniği kullanarak en immünofloresan kalır ve plastik gömme sonra daha istikrarlı olacaktır, ancak, tüm lipofilik izleme bu aşamada tamamen kaybetmiş olacak. Gömülü kadar örnekleri ışığa duyarlı olacak gibi çekin.
Compresstome VF-700 mikrotom kesit için Precisionary Instruments Inc önerileri izleyin
Epoksi gömülmesi / Kesit:
Çözümler
5. Temsilcisi Sonuçlar

Şekil 2. Lipofilik boya bir fare embriyo yerleştirilmesi ve görüntüleme Üç farklı dalga boyu lipofilik boyalarla enjekte edilir ve trigeminal sinirin (TN), glossofaringeal sinir (GN) ve vagus siniri (VN) merkezi projeksiyonları görselleştirme izin inkübe edildi. A), üç kraniyal sinirlerin periferik parçaya Lipofilik boya yerleşim merkezi süreçlerin görünüm için beyin difüzyon izin verecek. NeurVue Maroon ve VN: NeuroVue Jade TN NeuroVue Kırmızı, GN ile etiketlenir. B) (A) sonra kuluçka gibi aynı fare. Bazı difüzyon aydınlık mikroskobu ile görülebilir. C) aynı fare gibi (A ve B). Beyin disseke ve düz olarak monte edilmiştir. Etiketli üç sinirlerin merkezi süreçlerinin bazı etiketleme aydınlık mikroskobu ile görülebilir. (C) D) Konfokal görüntü. Konfokal özel nöronların görülebileceği ve diğerleri ile ilgili olarak her nüfus dağılımının değerlendirilmesi için üç farklı boyaların kullanımı sağlar. Boyalar sırayla görüntülenmiştir. NeuroVue Jade, 488 nm ve 500-550 nm emisyon uyarma görüntülendi. NeuroVue Kırmızı 550-600 nm, 535 nm ve emisyon bir uyarım görüntülendi. 643 nm ve 650-700 nm dalga boyunda emisyon uyarma NeuroVue Maroon görüntülendi.

Şekil 3 deney şematik bir bakış . Kulak, tüm yapılar görselleştirme için izin maruz kalmaktadır. Lipofilik boyaenjekte edilir ve sonra diffüz izin. Difüzyon sonra farklı nöron popülasyonları farklı boyalar etiketli görülebilir. Sonra, in situ hibridizasyon (sox2) kulak ve etiketler mRNA yapılır. İmmünohistokimya sonra protein ekspresyonu (Myo7, tubulin) görselleştirmek için yapılmaktadır. In situ hibridizasyon ve immünohistokimya görüntülenebilmekte hangi histolojik kesitlerde izledi.
Bu video, belirli bir hayvan içinde veri ilişkilendirerek (Şekil 3) veri toplama ve dayanışmanın en üst düzeye çıkarmak için dört teknikleri birleştirmek için bir yöntem ortaya koymaktadır. Bu yaklaşım, ıslah miktarını azaltmak ve böylece ortak yerelleştirme ve mutantlar bağıntılı etkileri hakkında bilgi artırırken yayınlanabilir veri elde etmek için gerekli. Bu video, yetişkin farenin yanı sıra tavuk, Xenopus ve Zebra balığı gibi diğer hayvanların embriyonik fareler kullanılmıştır rağmen de bu teknikleri kullanılarak analiz edilebilir. Diğer türler kullanırken proteinaz k sindirim değişmiş gerekebilir. Burada özellikle ilgi üç nöron popülasyonları etiket farklı floresanlama NeuroVue boyaları kullanabilirsiniz. Bu boyaların yararı sadece ya da analiz edilecek mutasyonlar tarafından etkilenmiş olabilir ya da olmayabilir immünohistokimya dayanarak sorunlu olabilir mutant fareler, kullanılabilir olması, ve onlar retrograd ve anterogradely 5 nöronlar etiket . Yeni yapılan bir çalışmada da aynı anda altı 2 etiketli olabilir nöron popülasyonları sayısı artmıştır . Sonra, aynı ilgi doku izleme lipofilik boya sonra gen transkripsiyonu analizi için, in situ hibridizasyon kullanarak analiz edilebilir ve daha sonra protein dağıtımı için immunhistokimya ile analiz edilebilir. Son analizi fenotip karakterizasyonu 6 ekleyebilirsiniz detaylı histoloji eklenebilir. Bu çok yönlü analiz aksi imkansız ya da en azından daha geniş bir protokol ve fare üreme ihtiyacı olabilir aynı hayvan içinde bağıntılı analizi yoluyla yeni anlayışlar kazanmak için bir potansiyele sahiptir.
Görüntüleme için Iowa Carver Merkezi Üniversitesi'nde Konfokal görüntüleri elde edildi. Finansman SBIR hibe (MH079805) tarafından sağlanan bu proje için farelerde üreme için ek destek BF BF NIDCD (5R01DC00559007) tarafından sağlanan
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| in situ Hibritleme: | |||
| PC DIG yıkama + bloklama tampon seti | Roche Group | 1585762 | |
| Premix 20x SSC Tamponu | Roche Group | 1666681 | |
| Proteinaz K 20mg/ml | Ambion | AM2546 | |
| Dietil Pirokarbonat (DEPC) | Research Products International Corp. | D43060 | |
| Formamid | Sigma-Aldrich | F9037 | |
| Dekstran Sülfat | Research Products International Corp. | D20020 | |
| BM Purple | Roche Group | 11442074001 | |
| Anti-Dig-AP Fab fragmanları | Roche Group | 11093274910 | |
| RNaz A enzimi 10mg/ml | Fermentas | EN0531 | |
| RNase Away | Research Products International Corp. | 7003 | |
| Somon Spermi DNA'sı 10mg/ml | Invitrogen | 15632-011 | |
| Stericup Filtre Ünitesi 0.22μm; 500ml | EMD Millipore | SCGVU05RE | |
| Filtre Diskleri 0.2μm; 25mm | Whatman, GE Healthcare | 6780-2502 | |
| Fosfat tamponlu salin pH 7.4 paketleri | Sigma-Aldrich | P-5368 | |
| İmmünohistokimya: | |||
| Keçi Serumu | Sigma-Aldrich | G9023 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8532 | |
| H–chst Boyası | Polysciences, Inc. | 9460 | |
| Histoloji: | |||
| Poly/Bed 812 Gömme Ortamı/DMP-30 Kiti | Polysciences, Inc. | 08792-1 | |
| Propilen oksit | Sigma-Aldrich | 110205 | |
| Gluteraldehit Çözeltisi %50 | Fisher Scientific | G151 | |
| DPX Kapatma Ortamı | Fluka | 44581 | |
| Sallayıcı | MidSci | 55D1114 | |
| Isıtma Bloğu | Fisher Scientific | 11-715-125D | |
| Rotator | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 400110Q | |
| 60°'ye ayarlı inkübatör | Fisher Scientific | 11-690-625D | |
| Boya izleme: | |||
| Mikro makas | Geuder | G-19775 | |
| Hassas Pens | E.M.S | 72680-F | |
| NeuroVue boyası: Maroon, Red, Jade | MTTI | FS-100(1,2,6) | |
| 1X fosfat tamponlu salin (PBS) | Sigma-Aldrich | P-5368 | |
| Diseksiyon mikroskobu | Leica Microsystems | M205 FA | |
| 36°'ye ayarlı inkübatör | Fisher Scientific | 11-690-506DQ | |
| Konfokal Mikroskop | Leica Microsystems | LSM 510 | |
| Lamlar | Surgipath | 00240 | |
| Lameller | Surgipath | 00106 | |
| RPI | Gliserol | G22025-0.5 | |
| Paraformaldehit (%4 ve %0,4) | Fisher Scientific | T353-500 |