RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Hücre ölümü değerlendirilmesi için doğru bir yöntem açıklanmıştır. Protokol birincil hücre hücre hatları ve geniş bir yelpazede hayvan modellerinde% 40 yalancı pozitif olaylar kadar ekran geleneksel Annexin V / propidium iyodür (PI) protokolleri, üzerine geliştirir.
Hücresel apoptozis Çalışmaları flow sitometri tabanlı yöntemler sunulmasından bu yana önemli ölçüde etkilendi. Propidium iyodür (PI) hücreler, plazma zarı bütünlüğü ve geçirgenliği 1,2 farklılıklar üzerinden, canlı, apoptotik veya nekrotik eğer belirlemek için yaygın Annexin V ile birlikte kullanılır. Annexin V / PI protokolü apoptotik hücre 3 çalışmak için yaygın olarak kullanılan bir yaklaşımdır. Hücreleri 4,5 yaşayan boya hariç kapasitesini dayalı, ekonomik, istikrarlı ve hücre canlılığı iyi bir göstergedir, çünkü PI diğer nükleer lekeleri göre daha sık kullanılır. Bir hücreye girmek için PI yeteneği membran geçirgenliği bağlıdır; PI, sağlam bir plazma zarı 1,2,6 varlığı nedeniyle canlı ya da erken apoptotik hücre leke yapmaz . Geç apoptotik ve nekrotik hücreler, plazma ve nükleer membran bütünlüğünü sağlayarak, PI, membranlar yoluyla geçmesi, nükleik asitler içine enterkale ve kırmızı floresan 1,2,9 gösterilecek 7,8 azalır . Ne yazık ki, bu geleneksel Annexin V / PI protokollerini 10 sitoplazmik bölmesi içinde RNA PI boyama ile ilgili önemli sayıda yanlış pozitif olaylar (% 40), yol bulabilirsiniz. Gösteren yüksek oluşumu 10: (sitoplazmik oranları <0.5 nükleer) Birincil hücre ve hayvan modellerinde geniş bir yelpazede büyük hücreler ile hücre hatları etkilenir. Burada, geleneksel yöntemlere kıyasla hücre ölümü değerlendirilmesi için önemli bir gelişme sağlayan bir değiştirilmiş Annexin V / PI yöntemi göstermektedir. Bu protokol RNaz, boyama aşağıdaki hücre içine girişini teşvik etmek için hücre sabitleme sırasında hücresel geçirgenlik değişikliklerin yararlanır. Zamanlama ve RNaz konsantrasyonu her ikisi de bir sitoplazmik RNA kaldırılması için optimize edilmiştir. Sonuç olarak geleneksel Annexin V / PI protokolleri (sitoplazmik PI boyama <% 5 olaylar) üzerinde önemli bir gelişmedir.
Bu prosedür, 500 mcL silikonlu tüpler veya 6 ml polistiren yuvarlak alt FACS tüpler yapılabilmektedir. İkincisi, diğer prosedürleri ile birlikte canlılığını analizi yaparken normal olarak kullanılır. 6 ml polistren yuvarlak alt FACS tüpler için verilen tüm birimleri. 500 mcL silikonlu borular için tüm birimler, 1 / 5 oranında azaltır.
Flow sitometri analizi için optimum konsantrasyonu 200 mcL hacim başına 2-4 x 10 6 hücre. Hücre kaybı bu yordamı neden olabilir ve böylece biz her numune prosedürün başlangıcında 4 x 10 6 hücre oluşur.
1. Hücre Hazırlık
2. Annexin V / PI Uygulama Leke
3. Temsilcisi Sonuçlar:
Hücre tipleri ve hücre hatları, yanlış pozitif PI boyanma değişen derecelerde örnekleri Şekil 1'de gösterilmiştir. (Şekil 2B) RNaz tedavi uğramadı hücrelere göre yanlış pozitif olayların sayısında önemli bir azalma yanlış pozitif olaylar için hesap için, hücreler fikse edildi ve daha sonra bu sonuçlar RNaz A. ile tedavi. Şekil 2C hiçbir RNaz tedavisi görmüş hücrelere kıyasla RNaz tedavi uygulandı hücreleri temsil eden görüntüler gösterir. Şekil 3 fiksasyon ve RNaz tedavi adımları ile modifiye Annexin V / PI protokolü, yanlış pozitif boyanma olayların sayısının sınırlandırılması geleneksel protokoller üzerinde nasıl geliştirdiğini gösteriyor.

Şekil 1. Konvansiyonel propidium iyodür boyama protokolleri önemli sayıda yanlış pozitif olayların yol açar. Daha önce, hayvan modellerinin çok geniş bir yelpazeden yanı sıra çeşitli hücre hatları 10 birincil hücreler boyunca yanlış pozitif boyanma yaygınlığı değerlendirilir . Temsilcisi görüntüleri üç benzersiz hücre popülasyonları (RAW makrofaj ve iki birincil hücreler fare kemik iliği makrofajlar (BMM) ve Japon balığı primer böbrek makrofajlar (PKM) yaygın olarak kullanılan hücre hattı) yanlış pozitif boyanma ölçüde göstermektedir. Gerçek pozitif olayların nükleer bölmesi içinde beklenen PI ve DRAQ5 arasındaki ortak lokalizasyonu (PI ve DRAQ5 sarı alanlar arasında ko tasvir) gösterir. DRAQ5 yüksek membrane geçirgen boya, canlı ve ölü hücreleri 10,11,12 hem doğru lekeleri nükleer bölmesi. Ko DRAQ5 daha kolay görsel tespiti için leke yeşil pseudocolour verildi.

Şekil 2. PI nükleer boyanma doğruluğunu artırma. (A) DRAQ5 için iyi karakterize nükleer lekeleri çok sayıda (BrdU, 7-AAD ve DAPI) benzerlik derecesine göre PI nükleer boyanma doğruluğu değerlendirildi. BrdU hızla çoğalan hücrelerin DNA içine dahil olup, sadece nükleer bölmesi gibi içinde leke sentetik bir nükleozid. 7-AAD, sağlam bir plazma zarı geçemez, PI benzer bir DNA yüksek afinite ve vardır. DAPI DNA için de güçlü bir ilgisi vardır ve en yaygın olarak kullanılan nükleer floresan mikroskopi leke. Doğru RAW 264,7 makrofaj hücre çekirdeğinde leke yeteneğini vurgulayarak, BrdU, 7-AAD, DAPI ve DRAQ5 arasında benzerlik derecesi>% 99 oldu. Buna karşılık, geleneksel protokoller dayalı sitoplazmik PI boyama DRAQ5 için göreli boyama yüzde benzerlik belirgin bir azalmaya yol açar. Fare kemik iliği makrofajlar (BMM) ve Japon balığı primer böbrek makrofajlar (PKM): (B) Benzer sonuçlar test iki birincil hücreler gözlenir. 50 mcg / ml RNaz A boyama prosedürü içinde belirli bir aşamada dahil edilmesi, nükleer olmayan PI boyama kaldırır ve DRAQ5 boyama göre benzerlik derecesi önemli ölçüde artırır. (C) primer böbrek makrofajlar Temsilcisi görüntüleri ve RNaz tedavi olmadan hücrelerin ölçüde benzerlik göstermektedir. Tedaviler arasında farklılıklar daha kolay görsel tespiti için, DRAQ5 yeşil verildi. Sarı alanlar arasında ko BrdU ve DRAQ5 ve PI ve DRAQ5 betimliyor.

Şekil 3. Modifiye Annexin V / PI yanlış apoptozis / nekrotik olaylar önemli ölçüde azaltır. İlköğretim goldfish böbrek makrofajlar (PKM), geleneksel ve modifiye Annexin V / PI protokolleri ile boyandı. Saçılım Annexin V / PI goldfish PKM leke betimliyor. Soldaki saçılım PKM hücrelerinin geleneksel Annexin V / PI boyama (RNaz yok) gösterir. Sağda saçılım modifiye Annexin V / PI protokolü (RNaz) ile boyandı PKM hücreleri gösterir. Ayrıca yanlış pozitif lekeleri kaldırılması nedeniyle PI boyama belirgin bir azalma RNaz sonuçları. PKM hücreler daha sonra farklı kültürlerin erken atalarıdır içinde nüfus (AP), monositler (Mono) ve olgun makrofajlar (Mat mac) dayalı analiz edildi. Yanlış pozitif olayların kaldırılması nedeniyle, olumlu PI olayların sayısında azalma, küçük erken progenitör hücreleri daha büyük olgun makrofaj hücreleri daha belirgindir. Geleneksel protokollerine dayalı sonuçlar hatalı hücre ölüme daha olgun makrofaj altkümelerini için pozitif bir korelasyon önerilen olurdu.
Hücre ölümü değerlendirilmesi için doğru bir yöntem açıklanmıştır. Protokol birincil hücre hücre hatları ve geniş bir yelpazede hayvan modellerinde% 40 yalancı pozitif olaylar kadar ekran geleneksel Annexin V / propidium iyodür (PI) protokolleri, üzerine geliştirir.
Bu çalışmada, Doğa Bilimleri ve Mühendislik Konseyi, Kanada (NSERC) araştırma bursu ve bir Alberta Tarım DRB Finansman Konsorsiyum hibe tarafından desteklenmiştir. AMR bir NSERC Vanier Kanada Yüksek Lisans Bursu, Alberta asistanlığa bir üniversite ve bir Kraliçe Elizabeth II yüksek lisans bursu ile desteklenmektedir.
| 1 x PBS-/- | |||
| 1 x Annexin V Bağlayıcı Tampon | BD Biosciences | 556454 | |
| Annexin V-Alexa Fluor 488 | Moleküler Problar, Yaşam Teknolojileri | A13201 | |
| Propidyum iyodür (PI) | Sigma-Aldrich | P4864 | H < altı > 2 O |
| 2% 2 Formaldehit | Sigma-Aldrich | F1268 | içinde 1 mg / mL |
| Sığır pankreasından RNase A | Sigma-Aldrich | R4642 | |
| DRAQ5 | Biyodurum | DR50050 | 1 x PBS-/- içinde 1:60 oranında seyreltin |