Yumuşak Agar koloni formasyon deneyi

Özet

Yumuşak agar koloni oluşum testi, in vitro hücresel ankrajdan bağımsız büyümeyi doğrulamak için kullanılan bir yöntemdir. Bu protokolün amacı, transforme olmuş hücrelerin tümörjenik potansiyelinin ve proteinlerin transforme olmuş hücreler üzerindeki tümör baskılayıcı etkilerinin tespiti için sıkı bir yöntem göstermektir.

Özet

Ankrajdan bağımsız büyüme, dönüştürülmüş hücrelerin katı bir yüzeyden bağımsız olarak büyüme yeteneğidir ve karsinogenezin ayırt edici özelliğidir. Yumuşak agar koloni oluşumu testi, bu yeteneği in vitro olarak karakterize etmek için iyi bilinen bir yöntemdir ve hücrelerde malign transformasyon için en katı testlerden biri olarak kabul edilir. Bu test aynı zamanda çeşitli tedavi koşullarına yanıt olarak bu yeteneğin yarı kantitatif değerlendirmesine de izin verir. Burada, Wnt sinyal yolunun iki üyesi olan Wnt7A ve Frizzled-9'un (Fzd-9) tümör baskılayıcı etkilerini göstermek için bir murin akciğer karsinomu hücre hattı olan CMT167 kullanarak yumuşak agar kolonisi oluşum testini göstereceğiz. Wnt7a ve Fzd-9'un eşzamanlı aşırı ekspresyonu, CMT167 hücrelerinde koloni oluşumunun inhibisyonuna neden oldu. Bu, Wnt7a ligandının ve Frizzled-9 reseptörünün ekspresyonunun, bir murin akciğer karsinomu modelinde tümör büyümesini baskılamak için yeterli olduğunu göstermektedir.

Giriş

Yumuşak Agar koloni formasyon deneyi yaygın in vitro hücresel dönüşümü değerlendirmek için kullanılan bir tekniktir. Tarihsel olarak, Puck ve diğ., 1956 yılında bir deney, klonojenik analiz, koloniler ¹ oluşturmak için hücre yeteneğini değerlendirmek için kullanıldı. Bu teknikte, hücreler, kültür plakası üzerine dağıtılmıştır ve gerektiğinde büyüme faktörleri temin etmek üzere "besleyici" hücreler ya da şartlandırılmış ortam varlığında yetiştirilir. Bu tekniğin sınırlama sadece koloni oluşumu ile ilgili bilgi verdi oldu. Normal hücreler nedeniyle anoikis ² olarak apoptotik ölümden belirli bir tür için, ankrajdan bağımsız büyüme engellenir. Bununla birlikte, dönüştürülmüş hücreler, bir alt-tabakaya bağlanma olmaksızın, büyüme yeteneği ve bölme vardır. Bu kavram yararlanmak için, araştırmacılar yumuşak agar koloni formasyonu testi geliştirdi. Yumuşak Agar koloni formasyon deneyi yana sp gidermek için, daha yakın yıllarda, değiştirilmişecific ihtiyaçları. Bir varyasyon yüksek verimli koloni sayımı için izin florometrık boya dahil edilmesini içerir. Başka bir varyasyon proteini ya da DNA numuneleri gerekli olduğunda koloni oluşumu ile işaretlemeden sonra yaşayabilir hücreler bulunmaya izin vermek için özel bir agar çözeltisi kullanılmasını içerir.

Geleneksel yumuşak agar koloni formasyon deneyi, hücreler, hücre kültür ortamı ile karıştırılmış yumuşak agar, bir başka tabaka üzerinde bulunur, hücre kültür ortamı ile karıştırılmış, yumuşak bir agar tabakası içinde yetiştirilen ama agar daha yüksek bir konsantrasyonunu ihtiva eden edilir. Bu kültür plakasına yapışmasını hücreleri engeller, ama görünür koloniler oluşturmak üzere hücrelerin transforme sağlar. Bu tekniğin arkasındaki mantık, normal hücrelerin büyümesine ve bölmek mümkün hücre dışı matris temas hücreye bağlı olmasıdır. Tersine, dönüştürülmüş hücrelerin büyümesine ve ne olursa olsun, çevresini bölmek yeteneğine sahiptir. Bu nedenle, bir ankrajdan bağımsız bir şekilde bunların koloni oluşturabilme özelliklerini hücreleri ° C,onsidered dönüştürülmüş ve kanserojen olması. Bu yöntemin genel amacı, bir yarı-niceliksel ve sıkı şekilde hücreler, bu yeteneği ölçmektir.

Wnt sinyal yolu embriyogenezin kritik ve genellikle tumorigenezden ^3-6'da de-regüle olduğunu. Wnt sinyal ile ilişkili birden fazla yol vardır. Kanonik yolu transkripsiyonel koaktivatör beta-katenin üzerindeki etkileri aracılığıyla Wnt sinyalizasyon ve aşağı gen transkripsiyonu düzenlenmesini içerir. Wnts aynı zamanda, örneğin, bir kaç kurallı olmayan yollar aracılığıyla sinyal, endoplazmik retikulum ⁸ kalsiyum salınımını regüle iskelet yapısı ⁷ içinde yer alan elemanları düzenleyen düzlemsel hücre kutup yolu, ve Wnt-kalsiyum yolağı. Wnt ligandlar Frizzled reseptörlere bağlanma yoluyla faaliyetlerini gösterirler. Birkaç Wnts akciğer kanserinde yukarı-regüle edilmesi gösterilmiş olmasına rağmen, Wnt7a olmayan Smal aşağı-regüle edilmesi gösterilmiştirpromotör metilasyonu ile ⁹ l hücreli akciğer kanseri. Wnt7a olmayan bir kurallı yolu aracılığıyla bir tümör baskılayıcı olarak Fzd9 ve eylemleri bağlar. Wnt-7a ve FZD-9 restorasyonu küçük hücreli olmayan akciğer kanseri hücreleri ¹⁰ büyümesini inhibe eder. Wnt7a / Fzd9 etkileri ERK-5, sırayla, peroksizom proliferatörünün aktive ettiği reseptör γ yi (PPARy), ^11,12 aktivasyonu ile aracılık eder. Burada, Wnt7a ve Fzd9 fazla sentezlenmesi bir murin akciğer karsinoma hücre çizgisinin ankrajdan bağımsız büyümenin bastırılması ile sonuçlandığı göstermektedir. Murin CMT167 hücreleri, C57BL / lcrf farelerde ¹³ bir akciğer karsinomu elde edilmiştir ve kalıcı bir şekilde Wnt7A ve Fzd9 ile transfekte edilmiştir. Wnt7A ve Fzd9 aşırı ekspresyonu nicel PCR (Q-PCR) ile Wnt7A ve Fzd9 aşırı ifadesinin işlevselliği ile teyit edildi PPARy alt baş aktivasyonu sureti ile teyit edilmiştir.

Protokol

Materyaller ve Reaktifler 1. hazırlanması

1. Etiket, bir doku kültürü içinde her bir oyuğa her bir hücre hattı veya bir durum için uygun bir 6-yuvalı plaka tedavi araştırılmaktadır.
2. Toz ortamın 1 g ve 50 ml lik bir son hacme kadar deiyonize su içinde bir sodyum bikarbonat, 0.2 g çözülmesiyle 2x hücre kültürü ortamı hazırlayın.
3. Sterilize etmek için bir 0.2 mikron filtre içinden bu orta geçirin.
4. Ilgi konusu hücre çizgisinin normal kültür için gerekli ek bileşenler ekleyin. Örneğin,% 10 FBS ve% 1 penisilin / streptomisin solüsyonu ile takviye edilmiş RPMI 1640 ortamı içinde CMT 167 hücre çizgisi büyür. Kullanmak için sıcak su banyosu içinde 37 ° C'ye ısınmaya orta önce.
5. Eğer söz konusu hücre çizgisinin, normal hücre kültürü için olduğu gibi ayrı ayrı 1x hücre kültür ortamı hazırlayın.
6. Deiyonize su asil agar 100 ml 1 g ekleyerek% 1 asil agar hazırlayın.
   NOT: Noble Agar yalnız ajitasyon tamamen çözülür olmaz.
7. Hazırlamak% 0.6 deiyonize edilmiş su, 100 ml ağarla 0.6 g eklenerek ağarla. Her iki agar solüsyonları, uzun süreli depolama için kapatılabilir bir kapak 100 ml bir cam şişe içinde yapılabilir.
8. Sterilize etmek asil agar karışımları otoklavlayın. Bu karışımlar, önceden yapılmış ve 4 ° C'de saklandı, ancak, agar tamamen çözülene kadar Deney zamanında yeniden ısıtılması gerekmektedir edilebilir.
9. 1000 ml nihai hacme kadar _H2O PO ₄ HPO ₄ 1x PBS (8 gr NaCl, 0.2 g KCI, 1.44 g ₂ Na 1 mg / ml'lik bir stok solüsyonu yaparak nitro mavi tetrazolyum klorür çözeltisi hazırlanmakta ve 0.24 g KH ₂ ). Bu, örneğin koloni boyamak için deney sonunda kullanılacaktır.

Agar Alt Katmanı 2. Kaplama

1. Yaklaşık 1-2 dakika boyunca% 1 asil agar ve mikrodalga şişesinin kapağını gevşetin. Bir mikrodalga ısıtırken, üzerine kaynar önlemek için yakından çözümünün takipçisi. Aralıklı karıştırma sırasında, ısıtma, Devamagar tamamen çözülene ve kadar çözelti açıktır.
   NOT: ısıttıktan sonra şişeyi işlemek için ısıya dayanıklı eldiven kullanın. Aksi takdirde yanığına veya ciddi yaralanmalara neden olabilir.
2. Sıcak musluk suyu (42 ° C) ile dolu bir buz kovası erimiş agar çözeltisi ve önceden ısıtılmış 2x kültür ortamı yerleştirin. Ayrıca sıcak su ile buz kovası bir tüp tutucu bir 50 ml konik tüp yerleştirin. Sonraki adımlar için hücre kültürü kaputu kova aktarın.
3. Agar alt tabaka için, bir 6-yuvalı plaka içinde çukur başına bir agar karışımı, orta, 1.5 ml gerekir.
4. Karışımının yeterli bir miktarını temin etmek üzere, her bir 6-yuvalı plaka için 12 ml 'lik bir toplam hazırlar.
5. 50 ml'lik konik tüpe kültür ortamı 6 ml ve% 1 asal ağar çözeltisi daha sonra 6 ml ekleyerek başlayın.
6. Karıştırmak için konik tüpü birkaç kez ters çevirin. Tempolu bir tempoda çalışan yumuşak ağar erken sertleşmesine engel olacaktır.
7. 5 ml serolojik pi karışımın içine yaklaşık 5.5 ml çizinPette.
8. Hava kabarcıkları her kuyuya, bu karışımın 1.5 ml kaplanmasından önce pipet sütunun üstüne yükselmesine izin verir. Plaka kuyuların içine herhangi bir hava kabarcığı birikmesini önlemek için dikkatli kullanın.
9. Plakaları kapak ve ağar karışım 30 dakika için, hücre kültürü kaputu, oda sıcaklığında katılaşacağı için olanak sağlar.

3. Kaplama Agar İçeren Hücreleri Üst Katman

1. Agar alt tabaka katılaştıktan sonra, üst tabakanın hazırlanmasını başlar.
2. (Tripsin 1 ml örneğin orta 4 ml) kültür ortamı içinde 5, 15 ml konik bir tüp içinde: İlk olarak, tripsinizasyon ile hasat hücreleri ve onları: 1 seyreltin.
3. Hücre sayımı ve bu süre zarfında, bir nihai hücre süspansiyonunu hazırlamak için oyuk başına gerekli olan hücre sayısını hesaplayın. Bu sayı, hücre tipine bağlı olarak değişecektir. 5,000 hücre / sıra bir başlangıç ​​noktası kullanmak ve gerektiği gibi ayarlayın. Bu hücre sayısı için, örneğin, her bir wel (6667 hücre / ml'lik bir hücre süspansiyonunu hazırlamakL Bu süspansiyonun 0.75 ml ve 1.5 ml toplam hacim için agar 0.75 ml alır; 5,000 olan bir nihai toplam hücre sayısı) 2: hücrelerin konsantrasyonu da 1 seyreltilir.
4. 6 gözlü bir plakanın her bir kuyucuğu başına gerekli olan hücre süspansiyonu hacmi tekrar 1,5 ml olacaktır. 6 plaka başına 12 ml toplam ek hücre süspansiyonu hazırlayın.
5. Yukarıdaki gibi, bir mikrodalga% 0.6 agar çözeltisi eritin ve bir tüp tutucuya 50 ml konik bir tüp ve Adım 3,3 nihai hücre süspansiyonu ile birlikte sıcak su ihtiva eden buz kovası içine koyun.
6. Sonraki adımlar için hücre kültürü kaputu erimiş% 0.6 agar ile buz kovası aktarın.
7. 6-çukurlu plaka başına 12 ml'lik toplam hacim hazırlanması, 1: 1 oranında% 0.6 agar ve hücre süspansiyonu karıştırılır. 1.5 mi oyuk başına gerekli olacak, fakat ek olarak, yukarıda yapılmalıdır.
8. Pipet 50 ml konik bir tüp içine hücre süspansiyonu 6 ml.
9. Sonra, tüpe% 0.6 agar, 6 ml ilave ediniz.
   NOT: Bu karışımın sıcaklığı olmalıdırerken sertleşmesine önlemek ve hücre canlılığını maksimize etrafında 42 ° C tuttu.
10. Pipet hücreleri dağıtmak için bu karışımı 2-3x, hızlı çalışma, daha sonra 5 ml serolojik pipet karışımın içine 5.5 ml kadar çizin.
11. Herhangi bir hava kabarcığı her kuyuya, bu karışımın 1.5 ml kaplanmasından önce pipet sütunun üstüne yükselmesine izin verir. Plaka kuyuların içine herhangi bir hava kabarcığı birikmesini önlemek için dikkatli kullanın.
12. Hücre / agar karışımı, 37 ° C sıcaklıkta nemlendirilmiş bir hücre kültürü inkübatöründe yerleştirmeden önce, 30 dakika süre ile, hücre kültürü kaputu, oda sıcaklığında katılaşacağı için izin verin.
13. Yeterli koloni oluşumu için gereken süre, yaklaşık 21 gün, tipik olarak, her bir hücre hattı için değişir.
14. Büyüme ortamının bir tabaka kuruma önlemek için üst agar tabakası üzerine muhafaza edilmelidir. Haftada iki kez ortam ilave 100 ul bu amaç için yeterlidir.

4. Plakaları Boyama ve Sayma Kolonileri

1. 200 eklenerek Leke hücreleri _6; ve 37 ° C'de gece boyunca plakalar kuluçkaya nitro mavi tetrazolyum klorür solüsyonu ilave edin.
2. Koloniler lekeli sonra, bir görüntüleme kullanılarak kuyuların fotoğraflarını çekmek ve görüntü analiz yazılımı kullanarak kolonileri saymayın.

Sonuçlar

Bizim yumuşak agar koloni formasyon deneyi ile gösterildiği gibi CMT167 hücrelerinde Wnt7A ve Fzd9 ekspresyonu tümör bastırılmasında etkindir. Başlangıçta, biz Wnt7A ve Fzd9 mRNA CMT167 hücrelerinde düşük seviyelerde eksprese olduğunu göstermek üzere, Q-PCR kullanılmıştır. MLE-12 hücreleri, bir SV40 ile dönüştürülmüş faregiller akciğer epitelyal hücre hattı (Şekil 1) ile karşılaştırıldığında CMT167 hücreleri, endojen Wnt7A ve Fzd9 düşük seviyeleri göstermişlerdir. Daha sonra, iki retrovirütik aşın vektö...

Tartışma

Sinyal gönderme proteinleri, tümör baskılayıcı fonksiyonu in vitro teyit de zordur. Bu özelliği araştırmak için mevcut en sıkı deneylerden biri yumuşak agar koloni formasyonu testtir. Burada, stabil bir şekilde, parental CMT167 hücre hattına göre Wnt7a ve Fzd9 aşırı ifade eden bir murin akciğer karsinoma hücre soyu kullanılarak, yumuşak agar koloni formasyon deneyi gösterdik.

Yumuşak agar tahlil ilgili dikkate alınması gereken birkaç önemli nokta vardır. Bu tahlilde en önem...

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi

Ad	Şirket	Katalog numarası	Yorumlar
Kanser Hücresi İlgi Alanı	Sigma-Aldrich	10032302	CMT-167 Hücreleri
Toz RPMI 1640 Orta	Gibco	31800-089	2x hücre kültürü ortamı hazırlamak için kullanılır.
Sıvı RPMI 1650 Orta	Cellgro	10-040-CV	1x hücre kültürü ortamı olarak adlandırılır.
Fetal Sığır Serumu	HyClone	SH30910.03	Hücre kültürü ortamını desteklemek için kullanılır.
Penisilin / Streptomisin	CellGro	30-002-Cl	Hücre kültürü ortamında kullanılır.
Difco Noble Agar	BD Biosciences	214230	%1.0 ve %0.6 agar hazırlamak için kullanılır.
Sodyum Bikarbonat	Fisher	BP-328-1	2x hücre kültürü ortamında kullanılır.
Tripsin	Cellgro	25-050-Cl
Steril Şişe Üstü Filtreler	Fisher	09-761-126	2x orta steril filtre için kullanılır.
Lipofektamin Reaktifi	Invitrogen	18324-020	PPAR-RE lusiferaz testinde kullanılır.
6 oyuklu Plakalar Doku Kültürü Tedavi Edildi
37 & # 176; C/5% CO2 İnkübatör
Chemi-Doc Görüntüleyici	Bio-Rad		Kolonilerin fotoğraflarını çekmek için kullanılır.
Miktar Bir Yazılım	Bio-Rad		Hücre kolonilerini saymak için kullanılır.
15 ml Konik Tüpler
50 ml Konik Tüpler
250 ml Erlenmeyer Şişeleri
Mikrodalga
5 ml Serolojik Pipetler
Pipet Yardımı Mikropipet
Pipet Uçları
Ters Işık Mikroskobu
Santrifüj
Isıya Dayanıklı Eldiven
Saran Wrap
Buz Kovası