RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Vastus lateralis biyopsi saflaştırılmış mitokondrinin preparasyonu ve respirometrik profil için yöntemler tarif edilmiştir. Küçük kas hacminin kullanımı klinik araştırma uygulamaları için bu teknik uygundur.
İzole mitokondri Respirometrik profilleme yaygın elektron taşıma zinciri fonksiyonunu araştırmak için kullanılır. Bu, hücre dışı bir akım (XF) analiz cihazı kullanılarak, insan vastus lateralis örnekleri elde iskelet kas dokusunda en az miktarlardan mitokondri izole edilmesi için bir yöntem ve plaka bazlı respirometrik profil açıklanmaktadır. 1.0, 2.5 ve mitokondri 5.0 ug kullanılarak elde edilen Respirometrik profillerin karşılaştırılması 1.0 ug solunum ölçmek için yeterli olduğunu göstermektedir ve 5.0 mikrogram standart hataların karşılaştırılması dayalı en tutarlı sonuçlar sağlar. Mitokondriyal işaretleyici COX IV olmayan mitokondriyal doku belirteci GAPDH için izole mitokondri, Western blot analizi, bu protokol kullanılarak sınırlı olmayan mitokondriyal kirlenme olduğunu gösterir. kas dokusunun az 20 mg gibi mitokondriyal Solunum çalışma yeteneği, kullanıcıların, klinik birden çalışmanın tamamlanması için bireysel biyopsi kullanmasına olanak sağlararaştırma projeleri.
Mitokondri hücrenin birincil enerji üretim alanları ve yaşlanma önemli roller yanı sıra, kalp damar hastalıkları, Alzheimer hastalığı, diyabet, kanser ve aşırı şişmanlık gibi çeşitli yaş ile ilişkili bozukluklar vardır. İzole mitokondri Respirometrik profil elektron taşıma zinciri (OGS) fonksiyonu doğrudan analiz sağlar ve mitokondriyal biyoloji anlayışımız ve sağlık ve hastalık rolüne önemli katkılarda bulunmuştur. İzole mitokondri Bu yazıda anlatılan metodoloji insan denekler elde edilen iskelet kas dokusu biyopsi izole mitokondri Respirometrik analiz izin için optimize edilmiştir vb substrat ulaşım, ATP sentaz aktivitesi, proton sızıntısı, gibi biyoenerjitiklerin çeşitli yönlerini incelemek için kullanılır. Bu yazıda anlatılan biyopsi protokol son 12 yıldır bizim personel tarafından kullanılmıştır. Grubumuz, çeşitli yaş yetişkin 700'den fazla prosedürleri yürüttü90 yaşına kadar, ve herhangi bir olumsuz güvenlik sorunları olmaksızın çeşitli kronik hastalık koşulları ile. Bu protokolün önemli bir yönü, özellikle böylece klinik araştırmalarda kullanımını kolaylaştıran, doku az miktarda kullanmak için tasarlanmış olmasıdır.
Çeşitli protokoller mitokondri izole edilmesi için geliştirilmiştir. Fernandez-Vizarra ve ark., 1,2 çeşitli fare dokuları gibi kültürlenmiş hücrelerden mitokondri izole etmek için bir yöntem açıklamıştır. Garcia-Cazarin ve ark. 3, sıçan ve fare iskelet kaslarının mitokondri izole etmek için bir yöntem bildirmiştir. Fare beyninden alınan mitokondri izole edilmesine yönelik bir yöntem olup, aynı zamanda Iglesias-Gonzales ve ark. 4 Gross tarafından rapor edilmiştir, ve ark. 5 barocycler ve / veya PCT parçalayıcı kullanarak mitokondri izole edilmesi için bir yöntem rapor etmiştir. Son zamanlarda, Franco ve ark. 6 anti kullanarak zenginleştirilmiş mitokondri izole edilmesi için bir yöntem rapor-TOM22 Manyetik boncukları.
Bu protokoller mükemmel sonuçlar elde ederken, doku boyut gereksinimleri Bu yazıda anlatılan yönteme kıyasla yüksek. Örneğin, Gross vd. 5 gastrokinemius kası 1.5-1.8 g ve böbrek dokusu yaklaşık 2 g kullanılır. Benzer şekilde, Franco ve ark. 6 500 mg fare karaciğer dokusu kullanılır. Bizim deneyim, tipik verimleri iskelet kası (vastus lateralis) perkütan iğne biyopsisi beklenen 100-200 mg arasında değişir. Burada anlatılan protokol kullanılarak kas dokusunun 20-50 mg mitokondriyal fonksiyonunu değerlendirmek için yeteneği, diğer moleküler biyoloji deneylerinde gelecekteki kullanım için biyopsi başına ve mağaza örnekleri birden değerlendirmeler yapmalarına izin verir. Bu klinik araştırma ve örneklerin çalışkan kullanımını gerektiren diğer çalışmalarda kritik bir özelliktir. Daha önce dondurulmuş mitokondri oute bağlanmış solunum nedeniyle çalışmak için iyi olmadığını belirtmek gerekirmitokondriyal membran hasarına ve Sitokrom C aktivitesi kaybının r. Bizim yöntemi adapte Chappell ve Perry 7 tarafından yayınlanan yöntemle modifiye edilmiştir.
Bu yazıda anlatılan yöntemleri kullanarak, son zamanlarda insan vastus izole mitokondri Respirometrik profil doğrudan yürüyüş hızı 8 olarak ölçülen fiziksel yeteneği ile ilişkilidir lateralis olduğunu bildirmiştir.
NOT: Tıp Wake Forest Okulu Kurumsal Değerlendirme Kurulu tarafından onaylanmıştır açıklanan protokol. Aydınlatılmış onam yazılı elde edilmiştir. Tüm katılımcılar 23-35 arasında değişen BYES ile, her iki cinsiyette sağlıklı yaşlı yetişkinler (65-79 yaş) idi.
1. İskelet Kası Biyopsi
2. Mitokondriyal İzolasyon
<ol>3. Yıkama Mitokondri
4. tahmin bir BCA Protein Deney kiti kullanarak protein konsantrasyonunu ölçme ile mitokondriyal İçerik
Rogers, GW ve diğerleri tarafından tarif edildiği gibi 5. XF tahlilleri yapın. 12
NOT: pmole O 2 / dk O 2 tüketimi oranını (OCR) gözünüzde canlandırın, ya da veri çıkışı O 2 ve pH mutlak seviyeleri.
6. Western Blot
NOT: Son örnek mitokondri zenginleştirme sağlamak için Western blot ile mitokondriyal işaretleyici COX IV ve tüm doku GAPDH belirleyin
Şekil 1, tüm protokol ayrıntılı akış şemasını göstermektedir.
COX IV / GAPDH (Şekil 2), Western blot profilleri mitokondriyal protein COX IV olmayan mitokondriyal marker, GAPDH ekspresyonu tasvir etmektedir. COX IV ve GAPDH hem ifadesi, tüm kas hücresi içerisinde belirgindir. Mitokondri, bu protokol açıklanan tekniği kullanılarak izole sonra GAPDH aynı pozlama de yokken, COX IV bantları hala belirgindir. Uzun poz bir soluk GAPDH bandı ortaya çıkarabilir. Bu lekeler izole mitokondri az olmayan mitokondriyal kontaminasyonu sahip olduğunu göstermektedir. Ayrıca, izole edilmiş bir mitokondri COX IV ekspresyonu örnekler arasında tutarlıdır.
Şekil 3 1.0 ug, 2.5 ug, ve mitokondri 5.0 ug kullanılarak kompleks II (süksinat ve rotenone) tarafından tahrik tipik Respirometrik profillerini göstermektedir. Beklendiği gibi, genel olarak, OCR ağırlık arttırılıri mitokondri yüksek miktarlarda. Bu deney için hesaplanan solunum kontrol oranı (RCR) mitokondriyal hazırlık kaliteli olduğunu belirten, 7.95. Ayrıca, devlet 3u OCR mitokondriyal kalitesini onaylayan, devletin 3 biraz daha yüksektir.
Mitokondri farklı miktarlarda profil oluşturma sırasında sonuç tutarlılığı karşılaştırma amacıyla, ANOVA (Varyans Analizi) oluşturulmuş ve kullanılarak varyans gerçek değerleri olarak kareler (SS) toplamı hesaplanır 1.0 ug, 2.5 ug, ve mitokondri 5.0 ug başına yüklenmiştir iyi (Şekil 4). SS devlet 2, devlet 3, devlet 3U, Antimisin ve RCR sunulmuştur. Devlet 2 ve devlet 3 ölçümler için, tek yönlü ANOVA (sırasıyla, p <0.01 ve p <0.05) istatistiksel olarak anlamlı idi. Benzer şekilde, tek yönlü ANOVA antimycin ve RCR (p <0.01 ve p <0.0001 istatistiksel olarak anlamlı idi, sırasıyla. Anlamlı fark gruplar arasında devlet 3U görüldü. These sonuçlar kuyu başına mitokondri 5,0 mikrogram diğer konsantrasyonlara göre düşük SS verdi ve katılımcıların bizim nüfusa sahip XF 24 sistemde kullanılacak optimum miktarda olduğunu göstermektedir.
Şekil 5 çok mitokondriyal protein ilk kas örneklem büyüklüğü dayalı beklenebilir nasıl göstermek için bir rehber olarak hizmet vermektedir. Beklendiği gibi işlenmiş kas (mg) miktarı ve son numune toplam mitokondriyal protein içeriği (mg) arasında güçlü bir ilişki vardır.
| Chappel-Perry tampon I (TÜFE) | |
| Kimyasal | Konsantrasyon |
| KCI | 100 mM |
| MOPS | 50 mM |
| EDTA | 1 mM |
| MgSO 4 | 5 mM |
| ATP | 1 mM | pH | 7.4 |
| Chappel-Perry tampon II (CPII) | |
| Kimyasal | Konsantrasyon |
| KCI | 100 mM |
| MOPS | 50 mM |
| EDTA | 1 mM |
| MgSO 4 | 5 mM |
| ATP | 0.2 mM |
| Yağ-asidi serbest BSA | 0.50% |
| pH | 7.4 |
| Mitokondriyal Deneyi Çözüm (MAS) (2X) | |
| Kimyasal | Konsantrasyon |
| Sakaroz | 35 mM |
| Mannitol | 110 mM |
| KH 2 PO 4 | 2.5 mM |
| MgCI2 | 2.5 mM |
| HEPES | 1.0 mM |
| EGTA | 0.5mM |
| Yağ-asidi serbest BSA | % 0.10 |
| pH | 7.4 |
| Karmaşık II başlangıç koşulları ile Mitokondriyal Testi Çözümü (MAS) | |
| Kimyasal | Konsantrasyon |
| 1X MAS | |
| Suksinat | 10 mM |
| Rotenone | 2 uM |
| pH | 7.4 |
| Karmaşık Ben başlangıç koşulları ile Mitokondriyal Testi Çözümü (MAS) | |
| Kimyasal | Konsantrasyon |
| 1X MAS | |
| Piruvat | 5 mM |
| Malat | 5 mM |
| pH | 7.4 |
| * Tüm tamponlar deiyonize su içinde yapılacak |
Tablo 1. Çözüm ve tampon tarifleri.
| Protokol Adımları | ||
| StartProtocol | ||
| Komuta | Zaman (dk) | Liman |
| Ayarlamak | 0.00 | |
| Bekleyin | 10.00 | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Bekleyin | 3.00 | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Bekleyin | 3.00 | |
| Karıştırmak | 0.50 | |
| Tedbir | 3.00 | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Tedbir | 3.00 | |
| Karıştırmak | 0.50 | |
| Enjekte etmek | Bir | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Tedbir | 6.00 | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Enjekte etmek | B | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Tedbir | 3.00 | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Enjekte etmek | C | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Tedbir | 3.00 | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Enjekte etmek | D | |
| Karıştırmak | 1.00 | |
| Tedbir | 3.00 | |
| EndProtocol |
Tablo 2. Mix, ölçmek ve respirometredeki için çevrim ayarını karıştırın.

Şekil tüm protokol 1. Akış Şeması. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
/ftp_upload/52350/52350fig2highres.jpg "/>
Şekil 2. bütün iskelet kası dokusu hem de izole mitokondri için temsili bir Western blot. Tüm doku ekstraktı olarak izole mitokondri olmayan mitokondriyal kontrol mitokondriyal işareti ve GAPDH antikor gibi COX IV antikoru ile bağışık edilmiştir. Hiçbir GAPDH bandı olmayan mitokondriyal kaynaklardan az veya hiç bulaşmayı gösteren izole mitokondri gözlendi. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

İnsan Vastus izole mitokondri Şekil 3. Temsilcisi Respirometrik profil lateralis. Izole mitokondri üç konsantrasyonları, 5.0 ug, 2.5 ug ve 1.0 ug biz Bu tahlilde kullanılan re. Liman enjeksiyondan sonra bileşiklerin Final konsantrasyonları 2 mM ADP (port A) idi; 2 mcM oligomycin (B portu); 6 mcM FCCP (port C); ve 2 mcM A (port D) antimycin. Bu çalışma için hesaplanan RCR 7.95 oldu. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

5.0 ug, 2.5 ug ve 1.0 ug mitokondri kullanarak farklı mitokondriyal solunum devletler ve RCR için kareler Şekil 4. karelerinin toplamı. Toplamı. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
ig5highres.jpg "/>
. Şekil 5. Bu ilk kas numune ağırlığı Regresyon analizine dayalı beklenebilir mitokondriyal protein miktarını tahmin etmek için bir rehber olarak kullanılabilir: kas (mg) ve toplam mitokondriyal protein verimi (mg) miktarı. Beklendiği gibi, kas miktarı ve elde edilen toplam mitokondriyal protein arasında doğrudan bir korelasyon vardır.
Yazar George Rogers, bu makalede kullanılan enstrümanı üreten Seahorse Bioscience'ın bir çalışanıdır. Açık Erişim ücretleri Seahorse Biosciences tarafından desteklendi.
Vastus lateralis biyopsi saflaştırılmış mitokondrinin preparasyonu ve respirometrik profil için yöntemler tarif edilmiştir. Küçük kas hacminin kullanımı klinik araştırma uygulamaları için bu teknik uygundur.
Boston Üniversitesi Tıp Fakültesi'nden Dr. Marc Liesa'ya, yararlı tartışmalara, Wake Forest Tıp Fakültesi'nden Bayan Karin Murphy'ye, Bayan Heather Gregory'ye ve Bay John Stone'a, bu protokolün geliştirilmesindeki yardımcı teknik yardımları için teşekkür ederiz.
| Ekipman | |||
| Homojenizatör Bio-Gen PRO200 | BioExpress | ||
| Eppendorf Santrifüj 5804 R | Fisher Scientific | ||
| Deepwell geç Rotor | Fisher Scientific | ||
| 6 mm Üniversite Koleji Hastanesi İğne | Kadansı | ||
| 60 cc şırınga | Fisher Scientific | ||
| 96 kuyulu plaka okuyucu | Tecan (Genios-basic) | ||
| Denizatı XF 24-3 analizörü | Denizatı Biosciences, Inc. | ||
| Protein jel sistemi | Yaşam Teknolojileri (Invitrogen) | ||
| Kodak Jel Mantık 112 | Carestream Health, Inc | ||
| Kodak kamera düzeneği | Carestream Health, Inc | ||
| Sarf malzemeleri | |||
| XF24 V7 Hücre Kültürü Mikroplaka ve XF24 sensör kartuşu | Denizatı Biyobilim | 100850-001 | |
| 100867-100 | |||
| Potasyum hidroksit (KOH) | Sigma-Aldrich Co | 221473 | |
| Hidroklorik asit (HCl) | Acros | 12421-0010 | |
| Dulbecco'nun Fosfat tamponlu tuzlu suyu | Lonza | 17-512F | |
| Potasyum klorür (KCl) | Fisher Scientific | P333 | |
| MOPS | Fisher Scientific | BP308 | |
| EDTA | Fisher Scientific | BP118 | |
| Magnezyum sülfat (MgSO4) | Sigma-Aldrich Co | M7506 | |
| ATP | Sigma-Aldrich Co | A9187 | |
| Yağ asidi içermeyen BSA | Calbiochem | 126575 | |
| Sükroz | Sigma-Aldrich Co | S0389 | |
| Bakteriyel proteinaz | Sigma-Aldrich Co | P-8038 | |
| D-Mannitol | Sigma-Aldrich Co | M9546 | |
| KH2< / sub>PO < sub>4< / sub> | Fisher Scientific | P284 | |
| Magnezyum klorür (MgCl2) | Sigma-Aldrich Co | M9272 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich Co | H3784 | |
| EGTA | Sigma-Aldrich Co | E3889 | |
| BCA protein test kiti | Sigma-Aldrich Co | PI23227 | |
| Süksinik Asit* | Sigma-Aldrich Co | S3674 | |
| Pirüvik asit* | Sigma-Aldrich Co | P5280 | |
| Malik asit* | Sigma-Aldrich Co | 2288 | |
| ADP(K+ tuzu)* | Sigma-Aldrich Co | A5285 | |
| XF Hücre mito stres testi kiti | Denizatı Biyolojik Bilimler | 101706 | |
| Tween-20 | Santa Cruz Biyoteknoloji, Inc. | SC-29113 | |
| NuPAGE %12 Bis-Tris Jel | Yaşam Teknolojileri (Invitrogen) | NP0343BOX | |
| İmmobilin Transfer Membranları (0.45 um) | Milipore | IPVH20200 | |
| MOPS SDS Koşu Tamponu (20X)-500 ml | Yaşam Teknolojileri (Invitrogen) | NP0001 | |
| NuPAGE Transfer Tamponu (20X)-1 litre | Yaşam Teknolojileri (Invitrogen) | NP0006-1 | |
| Primer antikorlar (mAB ila VDAC1/Porin) | Abcam | ab14734 | |
| Primer antikorlar (mAB ila GAPDH) | Abcam | ab9484 | |
| Anti-Fare IgG (Keçi), HRP etiketli | PerkinElmer | NEF822E001EA | |
| Anti-Tavşan IgG (Keçi), HRP etiketli | PerkinElmer | NEF812E001EA | |
| * ADP, süksinik asit, pirüvik asit ve malik asit sadece KOH ile pH 7.4'e ayarlanmalıdır |