Bu el yazması bir iletişim kuralı tarafından γH2AX ve 53BP1 ayirt mikroskobu DNA çift iplikli kırılmalara analiz için sağlar.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
Bu el yazması bir iletişim kuralı tarafından γH2AX ve 53BP1 ayirt mikroskobu DNA çift iplikli kırılmalara analiz için sağlar.
DNA çift iplikli kırılmalara (DSB) ciddi DNA lezyonlardir. Oluşumu ve DSB tamiri analizi araştırma alanlarına genom bütünlük, genotoxicity, radyasyon biyolojisi, yaşlanma, kanser ve ilaç geliştirme de dahil olmak üzere geniş bir yelpazede uygun olur. DSB yanıt olarak, Histon H2AX serin 139 ayrı nükleer foci tespit şekillendirme birkaç megabase çiftleri bir bölgede, ayirt mikroskobu tarafından fosforile. Buna ek olarak, 53BP1 (p53 bağlayıcı protein 1) başka bir önemli DSB-duyarlı protein DSB tamiri katılarak nonhomologous sonu-homolog rekombinasyon önlenmesi ise teşvik olduğunu. ΓH2AX ve 53BP1 belirli fonksiyonları göre γH2AX ve 53BP1 ayirt mikroskobu ile kombine analizi DSB ayrıntılı bir analiz için makul bir yaklaşım olabilir. Bu el yazması teknik gerçekleştirmek için metodik notları ile desteklenmiş bir adım adım iletişim kuralı sağlar. Özellikle, hücre döngüsünün etkisi γH2AX foci örgülerine hücre kültürünü NHDF normal fibroblastlar içinde gösterilmiştir. Ayrıca, γH2AX resimde değeri bir biyomarker olarak sağlıklı bir bireyin ışınlanmış x-ray lenfosit tasvir edilir. Son olarak, genetik istikrarsızlık tarafından γH2AX ve 53BP1 ayirt mikroskobu hücrelerdeki CD34 + olan bir hastanın akut myeloid lösemi soruşturma.
DNA sürekli zarar görmüş endojen tarafından (örneğin, çoğaltma stres, Reaktif oksijen türleri, DNA'ın iç istikrarsızlık) ve eksojen (örneğin, kimyasal radikaller, ışınlama) (Resim 1)1,2 kaynakları ,3,4. DNA hasarı arasında DNA çift iplikli kırılmalara (DSB) özellikle ciddi lezyonlardir ve hücre ölümü veya karsinojenezis neden olabilir. Yaklaşık 50 DSB hücre ve hücre döngüsü5başına ortaya çıkabilir. Memeli hücrelerinde homolog rekombinasyon (İK) ve nonhomologous sonu-katılma (NHEJ) DSB (Şekil 2) tamiri için büyük yollar olarak geliştirilmiştir. Saat geç S/G2 aşamasında oluşur ve sağlam bir kız kardeşi kullanır Kromatit potansiyel olarak hatasız onarım için bir şablon olarak. Baz çifti eklendiğinde veya kırık uçları ligasyonu önce rezeke karşılık, hücre döngüsü boyunca aktif ve potansiyel olarak mutajenik NHEJ. Buna ek olarak, alternatif son katılma NHEJ eksikliği6,7durumunda yavaş mutajenik yedekleme onarım mekanizması olarak meşgul olabilir.
DSB fosforilasyon Histon H2AX serin 139 birkaç megabase çiftleri her DSB çevresinde bir bölgede, bir neden. Şekillendirme nükleer resimde γH2AX foci adlı ve ayirt mikroskobu8tarafından algılanabilir. ΓH2AX daha fazla DSB-duyarlı protein alımı teşvik ve Kromatin remodeling, DNA tamiri ve sinyal iletim9ilgilenmektedir. Her γH2AX odak tek bir DSB temsil etmek için kabul edilir gibi DSB miktar ayirt mikroskobu tarafından hangi kanser hücre satırları ve hasta örnekleri10,11, göstermiş olduğu, mümkün 12 , 13 , 14. 53BP1 (p53 bağlayıcı protein 1) DSB onarım arabuluculuk içinde başka bir anahtar protein olduğunu. DSB-duyarlı proteinler, denetim noktası sinyal ve DSB biter15synapsis istihdamı ilgilenmektedir. Buna ek olarak, 53BP1 DSB onarım yolu seçiminde kritik bir rol oynamaktadır. İK EngellediBRÜKSEL16iken NHEJ doğru DSB tamiri tetikler. ΓH2AX ve 53BP1 DSB tamir hakiki fonksiyonları göz önüne alındığında, γH2AX ve 53BP1 ayirt mikroskobu tarafından eş zamanlı analiz oluşumu ve DSB tamiri kesin çözümleme için yararlı bir yöntem olabilir.
Bu el yazması ayirt mikroskobu, γH2AX ve 53BP1 hücre çekirdeği içinde gerçekleştirmek için adım adım bir protokol sağlar. Özellikle, teknik hücre kültürünü NHDF, x-ışını ışınlanmış lenfositler sağlıklı bir bireyin ve CD34 + bir hastada akut myeloid lösemi hücrelerinin normal fibroblastlar uygulanır. Yöntem ayrıntıları sunulan sonuçları bağlamında dikkat çekti.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Tüm yöntem tanımlamak burada Heidelberg Üniversitesi Tıp Fakültesi Mannheim Etik Komitesi II tarafından onaylanmıştır. Aydınlatılmış onam tüm bireyler elde edilen yazılı.
1. hazırlık malzemeleri
2. Örnekleri hazırlanması
3. γH2AX ve 53BP1 ayirt boyama
4. ΓH2AX ve 53BP1 analizi Foci
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
ΓH2AX foci hücrelerdeki G0/G1 evresi ve ne zaman γH2AX foci farklı floresan noktalar (5A rakam) görünür G2 faz en doğru analizidir. Buna ek olarak, γH2AX foci S aşamasında hücrelerdeki analizi (şekil 5B) çoğaltma işlemi tarafından neden dağınık pan-nükleer γH2AX speckles tarafından karmaşıktır.
Hücreleri fiksasyonu %4 ile gerçekleştirilen PFA (10 dakika) ve % 0.1 ile pe...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
ΓH2AX ve 53BP1 ayirt mikroskobu oluşumu ve DSB tamiri araştırma konuları geniş bir yelpazede yapılan analiz etmek için kullanışlı bir yöntemdir. Deneyler sonucu etkileyen kritik hücre döngüsünün fiksasyon ve permeabilization hücrelerinin antikor ve donanım seçimi ve floresan mikroskop bilgisayar yazılımı için kullanılan ajanlar aşamasında parametreleridir.
Hücre döngüsünün etkisi γH2AX foci örgülerine katlanarak büyüyen hücre kültürünü NHDF normal fibroblastlar tarafından sunuldu. ΓH2AX resimd...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarlar ifşa gerek yok.
Proje Alman Jose Carreras lösemi Vakfı (DJCLS 14 R/2017) tarafından desteklenmiştir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| RPMI ortamı | Sigma-Aldrich | R0883 | Hücre kültürü için |
| ortam Heparin sodyum | oranı | PZN 3029843 | Heparin 5.000 IU / mL |
| Sodyum klorür çözeltisi% 0.9 | B. Braun | PZN 1957154 | Antikoagülan stok çözeltisinin bileşeni |
| Ficoll-Paque Premium | GE Healthcare | 17-5442-02 | Mononükleer hücrelerin izolasyonu için ortam |
| Tripsin çözeltisi 10X | Sigma-Aldrich | 59427C | Hücre kültüründe fibroblastların ayrışması için enzim |
| CD34 Mikro Boncuk Kiti | Miltenyi Biotec | 130-046-702 | CD34+ miyeloid progenitör hücrelerin izolasyonu |
| Tanısal mikroskop slaytları | Thermo Scientific | ER-203B-CE24 | Mikroskop slaytları |
| Megafuge 1.0 R | Heraeus | 75003060 | Masa üstü santrifüj |
| Cytospin cihazı | |||
| Kapağı | Heraeus | 76003422 | Mikro tüpler olmadan çalışmak için kapak |
| Cyto konteyner | Heraeus | 75003416 | 2 konik delikli Cyto konteyner |
| Klips taşıyıcı | Heraeus | 75003414 | Bir cyto kabı ve bir sürgü tutmak için taşıyıcı |
| Destek eki | Heraeus | 75003417 | eki bir klips taşıyıcı tutan |
| Triton X-100 (Okoksinol 9) | Thermo Scientific | 85112 | Hücre zarlarının geçirgenliği için deterjan |
| Potasyum hidroksit çözeltisi 1M | Merck Millipore | 109107 | Paraformaldehit çözeltisini hazırlamak için gereklidir |
| Paraformaldehit | Sigma-Aldrich | P6148 | Fiksasyon ajanı |
| Fosfat tamponlu salin | Sigma-Aldrich | D8537 | Dengeli tuz çözeltisi |
| Chemiblocker | Merck Millipore | 2170 | Bloke edici ajan |
| Fare monoklonal anti-&gama; H2AX antikoru (JBW301) | Merck Millipore | 05-636 | &gamma tespiti için birincil antikor; H2AX |
| Poliklonal tavşan anti-53BP1 antikoru (NB100-304) | Novus Biologicals | NB100-304 | 53BP1'in tespiti için birincil antikor |
| Alexa Fluor 488-konjuge keçi anti-fare antikoru | Invitrogen | A-11001 | İkincil antikor |
| Alexa Fluor 555-konjuge eşek anti-tavşan antikoru | Invitrogen | A-31572 | İkincil antikor |
| Vectashield montaj ortamı | Vektör Laboratuvarları | H-1200 | DNA'nın boyanması için DAPI içerir |
| Axio Scope.A1 | Zeiss | 490035 | Floresan mikroskobu, |
| Cool Cube, 1, CCD kamera | Metasystems | H-0310-010-MS | Dijital kayıt için kamera sistemi |
| Isis yazılımı, Metasystems | , Uygulanamaz | Mikroskop yazılımı |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.