RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Burada, köklerinin genç farelerin kültürlü yumurtalık içinde seri kesit olmadan ölçmek için bir protokol mevcut. Ayirt bütün organ ve doku takas kullanarak, fiziksel kesit optik kesit ile değiştirilir. Bu yöntem örnek hazırlama ve görselleştirme organ bütünlüğü korur ve belirli hücre otomatik miktar kolaylaştırır.
Memeli üreme biyolojisi alanında araştırma sık sık yumurtalıklar ve testis genel sağlık değerlendirme içerir. Özellikle, kadın, yumurtalık fitness kez görselleştirme ve köklerinin ve yumurta miktarının değerlendirilir. Çünkü yumurtalık opak bir üç boyutlu dokusu, geleneksel yaklaşımlar zahmetle doku hücreleri tüm organ boyunca görselleştirmek için çok sayıda seri bölümlere Dilimleme gerektirir. Ayrıca, miktar tarafından bu yöntem genellikle yalnızca bir alt kümesini bir oosit yaklaşık çapı tarafından ayrılan bölümler puanlama gerektirir çünkü yanlışlık için eğilimli olduğunu. Burada, bir iletişim kuralı yerine tüm organ doku takas ve köklerinin ve yumurta görselleştirmek için fare yumurtalık ayirt boyama kullanan açıklanmıştır. Daha geleneksel yaklaşımlar, bu iletişim kuralını yumurtalık hücrelerde çok sayıda nedenlerle görselleştirme için avantajlı karşılaştırılır: 1) yumurtalık numune hazırlama ve işleme; bozulmadan kalır 2) bölüm için zor olan küçük yumurtalıkların, kolaylıkla incelenebilir; 3) hücresel miktar daha kolay ve doğru bir şekilde elde edilir; ve 4) yansıma tüm organ.
Hücresel kompozisyon ve memeli yumurtalık morfolojik özelliklerinin çalışması için bilim adamları çoğunlukla parafin gömülü yumurtalık immunohistological boyama tarafından takip vivo deneyler kullanır. Son zamanlarda tüm yumurtalık organı kültür tekniği daha iyi görselleştirme ile birleştiğinde olabilir çünkü yumurtalık işlev1,2,3,4 çalışma için etkili bir alternatif olduğu ispatlanmıştır rağmen daha fazla ve miktar araçları. Geleneksel olarak, yeniden inşa üç boyutlu yumurtalık mimari gömülü parafin seri bölümlerden ama zahmetli ve zaman tüketmek, seri olarak gömülü parafin doku kesit olmanın yanı sıra yumurtalık Morfoloji analizi bağlıdır değil garanti uygun yeniden yapılanma organ yapar ve bölümler kez kaybolan veya süreç içinde yanlış emretti.
Teknik sorunlar seri kesit ile ilişkili ek olarak, ayrıca düzenli olarak yumurtalık5,6başına folikül numara ölçmek için kullanılan yöntemleri değişimler vardır. Şu anda kullanılan metodolojik değişkenlik meta-analiz yumurtalık rezervinin çalışmaları5,7bozar. Örneğin, farklı araştırma makaleleri folikül numaralardan 10 kat veya daha fazla belirli zorlanma6içinde benzer gelişimsel yaş arası değişebilir. Bu büyük farklılıklar bildirilen folikül miktar karışıklığa yol açabilecek ve çapraz-çalışma karşılaştırmalar engel. Deneysel, folikül miktar geleneksel yaklaşımlar seri bölümlerden bölümleri önceden tanımlanmış bir dizi köklerinin sayarak gerçekleştirilir (Örneğin, her beşinci, onuncu, veya diğer bölüm). Bu yaklaşımı kullanarak folikül sayıları değişkenlik değil sadece hangi bölümlerin sayılır içinde periyodik olarak aynı zamanda varyasyonlarından bölüm kalınlığı ve seri bölümler5,6üreten teknik deneyim ortaya çıkar. Onun değişkenliği ek olarak, geleneksel doku kesit başka bir dezavantaj genç hayvanlardan küçük yumurtalıkların kesit özellikle zorlu ve doku yönlendirme8son derece bağımlı olmasıdır.
İletişim kuralı aşağıdaki rutin olarak kullanılan yumurtalık kültür tekniği1 açıklanır ama fiziksel takas doku ile kesit ve optik confocal mikroskopi8 kullanarak kesit yerine kullanarak geleneksel folikül miktar geliştirir ,9. Bir üre ve sorbitol-tabanlı içinde doku daldırma (ezelî belgili tanımlık lüzum için Transkraniyal perfüzyon veya Elektroforez) kullanarak Temizleme (Örneğin, ScaleS(0)10) çözüm immunostaining ile uyumlu olduğunu kanıtladı ve azaltılması için izin zaman görüntüleme derinliğini ödün vermeden temizlemek. Diğer bildirilen yolu (örneğin, ScaleA28,10, SeeDB11, berrak12ve ClearT212) ya daha fazla zaman alıcı veya derinlemesine optik çözünürlük örnek izin vermez. O daha az emek yoğun olması ve organ'ın üç boyutlu mimari7,8tutar optik kesit avantajlıdır. Örnekleri hazırlanması doku temizlemek için pahalı reaktifler gerektirmez ve göreli kolaylıkla yapılabilir Bu yaklaşımın başka bir şeydir.
Özellikle, açıklanan protokol kültürlü fare yumurtalık için doğum sonrası gün beş optimize edilmiş ama doğum sonrası gün 0 - 10 arasında değişen yumurtalıklarda gerçekleştirilmiştir. Yöntem doku doğal olarak membran üzerinde bu kültürlü, organ işleme ve işleme kolaylaştırmak için verdiği bir yumurtalık kültür sistemi kullanır. Açıklanan kültür sistemi 10 güne kadar ve ne kadar farklı deneysel koşullar değerlendirmek için explanted yumurtalıkların yumurta hayatta kalma13ile girişime neden olabilir korumak için kullanılabilir. Açıklanan miktar yordam ticari olmayan görüntü işleme paket FIJI-ImageJ14 kullanılarak gerçekleştirilir ve çoğu kişisel bilgisayarda yapılabilir. Ayrıca, miktar için kullanılan görüntüleri böylece gelecek meta-analiz için izin bilimsel topluluk için yaygın olarak kullanılabilir duruma getirilebilir.
Cornell Üniversitesi'nin kurumsal hayvan bakım ve kullanım Komitesi (IACUC) burada, JCS iletişim kuralına 2004-0038 altında açıklanan tüm yöntemleri onayladı.
1. hazırlanması kültür ortam ve aygıtlar
2. yumurtalık diseksiyon ve Organ kültür
Not: Sigara-ideal sıcaklık maruz en az olduğu sürece yumurtalık oda sıcaklığında disseke.
3. doku fiksasyon
4. bütün Dağı ayirt
5. yumurtalık temizlenmesi ve görüntüleme
6. oosit miktar
Not: Hücreleri ölçmek mümkün birçok farklı bilgisayar programları vardır. Aşağıda açıklanan kullanarak ticari olmayan görüntü işleme paketi, FIJI-ImageJ14yumurta miktar için bir protokoldür.
Bu iletişim kuralı 6 önemli adımları içerir diseksiyon yumurtalıklar, şekil 1' de özetlenen takip. Resim 2 , Şekil 3 , Şekil 4 optimizasyonu yumurtalıklar ve FIJI-ImageJ kullanarak tüm doku oosit miktar için Temizleme doku dahil en yeni şekil-in bu protokolü. Şekil 2A (sağ) ekleyerek takas çözüm yumurtalık için sonra bir kültürsüz 5 günlük doğum sonrası sabit yumurtalık önce (sol) ve 1 h görüntüleri gösterir. Yumurtalık çözüm takas sular altında dakika şeffaf olmaya başlayacak. Bir kez temizlenmiş, şekil 2A görüntüsü bir gibi küçük yumurtalıkların zarar vermeden işlemek zor olur. Bu nedenle, kültürlü explanted yumurtalık ile çalışma çünkü onlar kültürlü olduğunuz Ekle membran gözenekli yüzeye bağlı olmak avantajlıdır. Yumurtalık eki ekle membran için membran Ekle yerine yumurtalık kendisi (şekil 2B ve şekil 3) işlemek deneyci sağlar. Ayrıca, yakın kültürlü yumurtalık sigorta ve şekil 2B gösterir önce (sol) erimiş yumurtalık bağlı ve örnekleri (sağda) Hematoksilen temizledikten sonra lekeli.
Takas mümkün olmadan kültürlü yumurtalık optik kesit gerçekleştirme; Ancak, hücrelerin doku içinde derin arka plandan ayırt etmek zordur bir sinyal ve uygun oosit miktar (şekil 3A) açık sinyal bu eksikliği engellemektedir. Şekil 3Aaksine, şekil 3B oosit miktar tüm organ boyunca olanaklı olduğu temizlenen örneği temsilcisi bir görüntüdür. Şekil 3B bir gösterilmiştir (şekil 3B) kolayca sayısal olarak temizlenen kültürlü yumurtalık bütün organ görüntüleme önemli sinyal derin doku ve görüntü içinde kaybı olmadan yapılabilir olduğunu gösterir. Yumurta gibi bu örnekte miktarının için bir optik bölümleri Z-yığın dizi içine bir maksimum yoğunluk projeksiyon dönüştürerek ve sonra başka bir görüntü işleme paketi dosyasıyla işleme yaklaşımdır. Şekil 4 ve tamamlayıcı şekil 1 şekil 3B yumurta sayısını ölçmek için kullanılan adımları FIJI-ImageJ kullanarak vurgulayın. Ek tablo 1 FIJI-ImageJ'ın parçacık (oosit) miktar içerir. Miktar parçacıkların da bu yöntemi kullanarak verir çünkü her iki parçacık sayısı ve her bir parçacık karşılık gelen alan hakkında bilgi yazılım tarafından hesaplanan ve sağlanan yumurta büyüklüğüne göre farklı köklerinin analizi için kullanıcı.

Şekil 1: tüm iletişim kuralının şematik gösterim. Protokolü başında görsel Özeti (1), yumurtalık diseksiyon ile yumurtalık kültür (2), doku fiksasyon % 4 ile izledi PFA (3), belirli antikor (4), (5) görüntüleme, optik bölümünü kullanarak alma derin doku takas kullanarak immunostaining bir confocal mikroskop (6) ve yumurta miktar (7) ile biten. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Şekil 2: doku opaklık un temizlenmiş ve temizlendi yumurtalık arasındaki farkı. (A) yumurtalıktan postnatal günde beş (solda) takas olmadan ve 1 h (sağda) hafif takas sonra kuçu kuçu. (B) birden fazla yumurtalıkların birbirlerine yakın yedi gün boyunca kültürlü. İki farklı büyüklüklerde her örneğinin gösterilir. Takas ve en sağdaki görüntüleri ile takas olmadan en soldaki görüntülerdir. Yumurtalık kültür Ekle membran için eklemek olacaktır ve daha iyi boyunca protokolünün bağlı tutulması halinde ele alınabilir. Doku beyaz ışık kullanarak görüntüleme için karşıtlığı artırmak amacıyla, yumurtalık Hematoksilen 5 min için yapılan fiksasyon sonra sular altında. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Şekil 3: un temizlenmiş ve temizlendi yumurtalık ayirt görüntüleme. Yumurtalık doğum sonrası 5 gün pups üzerinden 7 gün boyunca kültürlü ve açıklanan protokol boyama bütün Dağı ayirt göre lekeli. Kırmızıyla gösterilen fare vasa homolog (MVH germ hücreleri tanımlamak için) ile ve yeşil etiketli hücreleri nükleer oosit özgü marker, p63 ile etiketli hücreleri vardır. DAPI, Mavili, tüm hücre çekirdeği etiketlemek için kullanıldı. (A) ayirt görüntüsü yumurtalık takas olmadan. Yumurtalık temizlenmesi ile (B) ayirt görüntüsü. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Şekil 4: görsel iş akışı için nasıl yumurta FIJI-ImageJ yazılım kullanarak ölçmek için. Veri analizi kolaylaştırmak için confocal uçak elde edilen görüntüleri maksimum yoğunluk projeksiyon bir 3D görüntü yerine azaltılabilir. Maksimum yoğunluk projeksiyon ile kullanıcı hedef parçacıklar belirgin hale gelir şekilde görüntü eşik parametreleri tanımlayabilirsiniz. Basitleştirilmiş görüntü alındıktan sonra yazılımı yumurta saymak için kullanılır. Parametreler ayarlanırken görüntüleri eleştirel incelenmesi çok önemlidir. Bu şekilde nasıl parçacık/oosit eşik ayarlayabilirsiniz bir örnek gösterilmektedir. Her görüntü yukarıdaki metin FIJI-ImageJ o görüntü elde etmek için kullanılan parametre vurgulamaktadır. Belgili tanımlık bilgisayar yazılımı (bkz. ek tablo 1) parçacıklar alan ölçümü içeren bir tablo oluşturur. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Tamamlayıcı şekil 1: görsel iş akışı için nasıl yumurta FIJI-ImageJ yazılım (alt büyütme) kullanarak ölçmek için. Bu şekilde yakın iki yumurtalık için oosit miktar gösterilir. Gerçekleştirilen adımlar şekil 4ile aynıdır. 2,436 parçacıklar/köklerinin yazılım tarafından sayıldı. Yazılım lisansı alınan miktar verileri ek tablo 1' de bulunabilir. Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.
Ek tablo 1: folikül miktar FIJI-ImageJ tarafından hesaplanan. Bu tablo sayılan köklerinin ve tamamlayıcı şekil 1' deki görüntüden oluşturulan karşılık gelen alan listesini içerir. Miktar için kullanılan partikül büyüklüğü 10 µm2den kuruldu-Infinity. Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.
Yazarlar ifşa gerek yok.
Burada, köklerinin genç farelerin kültürlü yumurtalık içinde seri kesit olmadan ölçmek için bir protokol mevcut. Ayirt bütün organ ve doku takas kullanarak, fiziksel kesit optik kesit ile değiştirilir. Bu yöntem örnek hazırlama ve görselleştirme organ bütünlüğü korur ve belirli hücre otomatik miktar kolaylaştırır.
Biz Rebecca Williams ve Cornell BRC görüntüleme Johanna Dela Cruz ve Andrew Recknagel yararlı öneriler ve teknik yardım için teşekkür ederiz. Bu eser Ulusal Sağlık grant Enstitüleri için desteklenen S10-OD018516 (için Cornell tesis görüntüleme), T32HD057854 J.C.B. için ve R01-GM45415 J.C.S. için
| Mikro diseksiyon makası 4.5", düz, keskin noktalar | Roboz | RS-5912 | Mikro diseksiyon makası |
| Kuyumcular tarzı forseps 4-3/8", stil 5 | Integra Miltex | 17-305X | İnce uçlu forseps |
| Mikro İris Makası 4", düz, keskin noktalar | Integra Miltex | 18-1618 | Mikro diseksiyon iris makas veya mikro diseksiyon yaylı makas |
| 1X Minimal Temel Medya (MEM) | ThermoFisher Scientific | 11090-081 | |
| Fetal Sığır Serium | Corning | 35011CV | |
| HEPES (1M) | Gibco | 15630080 | |
| Antibiyotik-Antimikotik (100X) | Adım1.3.1'de Kullanılan | Gibco | 15240062 |
| 35mm Doku Kültürü Uygulanmış Çanak | Corning | 430165 | |
| Nunc&ticaret; Hücre Kültürü Ekleri için 24 Kuyulu Taşıyıcı Plaka | ThermoFisher Scientific | 141006 Gözenek boyutu: 8μ m | |
| Paraformaldehit (PFA) | Elektron Mikroskobu Bilimleri | 15710 | %16 çözelti |
| 1X Fosfat Tamponlu Salin (PBS) | Gibco | 10010023 | |
| Nutatör karıştırıcı GyroTwister & trade; | Labnet | S1000-A-B | üç boyutlu çalkalayıcı |
| Normal Keçi Serumu | VWR | 103219-578 | |
| Sığır Serumu Albümini (BSA) | VWR | 97061-416 | |
| Sodyum Azid (NaN3) | Sigma-Aldrich | S2002-25G | |
| Sodyum borhidrür çözeltisi (NaBH4) | Sigma-Aldrich | 452904-25ML | Bununyerine çözeltiyi kullanın. tablet veya toz form |
| Polivinil Alkol (PVA) | Sigma-Aldrich | P8136-250G | Soğuk suda çözünür |
| Triton ve ticaret; X-100 | Sigma-Aldrich | 93443-100ML | polietilen glikol tert-oktilfenil eter |
| Şırınga filtreleri | ThermoFisher Scientific | 725-2520 | 25mm |
| 10mL Şırıngalar | BD | 309695 | |
| Fare anti-p63 antikoru (4A4) | Biocare Medical | CM 163A | Seyreltme 1:500 |
| Tavşan anti-MVH antikoru | Abcam | ab13840 | Seyreltme 1:600 |
| Alexa Fluor® keçi anti-fare 594 | ThermoFisher Scientific | A-11032 | Seyreltme 1:1000 |
| Alexa Fluor® keçi anti-tavşan 488 | ThermoFisher Scientific | A-11034 | Seyreltme 1:1000 |
| 4,6-Diamidino-2-fenilindol (DAPI) | ThermoFisher Scientific | 62248 | |
| D-(-)sorbitol | Sigma-Aldrich | 240850-100G | |
| Gliserol | Sigma-Aldrich | G9012-100ML | |
| Üre | Sigma-Aldrich | U5378-500G | |
| Dimetil sülfoksit (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650-5X10ML | |
| FIJI-ImageJ | Görüntü işleme yazılımı | ||
| Tek kullanımlık plastik transfer pipetleri | VWR | 414044-034 |