$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Bu deneysel protokol, miyeloid türevli hücrelerin M1 veya M2 fenotiplerine etkili polarizasyonunu açıklar, buna GFP etiketli Mtb'nin çeşitli makrofaj alt kümelerinde görselleştirilmesine ve derin karakterizasyonuna izin veren 10 renkli akış sitometri paneli ile değerlendirme de dahildir. TB eski bir insan hastalığı olmasına rağmen, şu anda Mtb-makrofaj etkileşimlerini incelemek için altın standart bir model yoktur ve makrofajların çok renkli akış sitometrisi lenfosit yanıtlarının analizlerine kıyasla karmaşık olabilir. İnsan monositlerinin makrofajlara in vitro farklılaşması için mevcut birkaç protokol, üretilen makrofajların türü hakkında derin bilgi sunar. Makrofaj polarizasyonu ve akış sitometrik değerlendirmesi için temel bir protokol, katı bir işaret paneli kullanarak makrofaj aktivasyonunun bu tür bir karakterizasyonu kolaylaştırabilir ve farklı koşullar altında tedavi edilen polarize hücrelerin ek özelliklerini keşfetme fırsatları sunabilir. Bu, in vitro kültürlü hücrelerin analizlerinin yanı sıra klinik örneklerde in vivo hücrelerin analizlerini, yani vücut sıvılarından (örneğin, bronkoalveoler lavaj) veya homojenize dokudan pbmc ve tek hücreli süspansiyonları içerir. Buna göre hastalardan elde edilen monosit ve makrofajların farklılaşması ve/veya aktivasyon durumu hastalık sonucu ile ilişkili olabilir. Pulmoner TBhastalarında periferik kanda CD16 + CD163+ monositlerin genişlemesi bildirilmiştir30. Atopik dermatit hastalarının iltihaplı derisinde cd163+ hücre sıklığının arttığı da tespit edildi31. Benzer şekilde, CD206+ M2 benzeri makrofajların adipozit dokusunun mikroçevrimi32'deki hücrelerin çoğalmasını ve farklılaşmasına engel olduğu ve akut miyeloid lösemi (AML)29hastalarından kemik iliği örneklerinde zenginleştirildiği gösterilmiştir. Osteoartritli hastaların tam kanında CD64 (M1) ile CD163 (M2) hücrelerinin yüksek oranının hastalık şiddeti33ile ilişkili olduğu bulunmuştur. Başka bir çalışmada, dokudaki yüksek M1 ekspresyonunun kötü huylu beyin tümörlerinin bir alt grubunda daha kötü sonuçla ilişkili olduğunu göstermek için CD86 (M1) ve CD163 (M2) kullanıldı34.
Bu deneysel M1/M2 akış sitometrisi protokolünün birkaç önemli avantajı vardır. Bu model, virülan Mtb enfeksiyonuna doğuştan gelen immün yanıtları inceleme fırsatı sağlar ve karışık lenfosit reaksiyonlarında (MLR' ler) M1 veya M2 makrofajları ile birlikte otolog T hücreleri ekleyerek uyarlanabilir immün yanıtların çalışmalarını içerecek şekilde geliştirilebilir. Protokol ayrıca farklı immünomodülatör ve antimikrobiyal bileşiklerin ilaç taraması ve testleri için de uygundur. Burada, daha önce D vitamini ve histone deacetylaz inhibitörü fenilbütiratın Mtb enfeksiyonundan sonra miyeloid türevli hücreler üzerindeki etkilerini inceledik25,35. M1/M2 akış sitometrisi, hücre kültürü süpernatantları veya hasta plazması ile koşullandırmadan sonra makrofaj aktivasyonunu değerlendirmek için de kullanılabilir. HIV veya helmintler veya TB-diyabet ko-morbiditesi ile TB ko-enfeksiyonu in vivo çalışmaları zor olsa da, daha az karmaşık M1 / M2 modeli in vitro eş morbiditelerin çalışmalarını kolaylaştırabilir. Aynı şekilde, protokol, hücrelerin Mtb enfektivitesini incelemek veya bireysel M1/M2 hücrelerinin fagositik ve antijen sunum kapasitesini araştırmak için iletim çalışmaları için kullanılabilir. M1/M2 akış sitometrisi, biyobelirteç ve aşı çalışmalarında, tedavi sırasında hastalık prognozlarını takip etmek ve miyeloid türevi hücreleri hedef alan tedavileri test etmek için de çekicidir. Daha da önemlisi, konfokal mikroskopi (Şekil 3D),gerçek zamanlı PCR, batı blot, multipleks tahlilleri ve kültür süpernatantındaki çözünür faktörlerin ELISA'sının yanı sıra GFP ekspresyonu (akış sitometrisi ve konfokal mikroskopi) ve koloni oluşturan birimler (CFU) kullanılarak hücre içi bakteriyel enfektivite ve büyümenin değerlendirilmesi. M1 veya M2 hücrelerinin Mtb-GFP bakterisi ile enfeksiyonu, tek hücre-RNA dizileme analizi için enfekte olmayan ve Mtb ile enfekte olmuş hücrelerin aynı örnekten sıralanarak sıralanarak sıralanarak enfekte olduğunu da sağlar.
Açıklanan protokolün hem teknik hem de bilimsel dezavantajları da dahil olmak üzere bazı sınırlamaları vardır. İnsan kanı bağışçılarından monosit türevli makrofajların kullanılmasının dezavantajı, donör değişkenliğinin genellikle yüksek olması ve hücrelerin insan dokularının fizyolojik ortamında polarize olmamasıdır. M1/M2 polarizasyon etkinliğindeki büyük değişkenlik veya donörler arasındaki Mtb-enfeksiyözlüğü, hem deneyim içi hem de deneyimsel varyasyonlarda sorunlara, düşük istatistiksel güce ve güvenilir sonuçlar elde etmek için birçok bağışçıyı dahil etme ihtiyacına neden olabilir. Ek olarak, PBMC'lerden monositlerin plastik yapışması, sonunda Mtb enfeksiyonundan sonra makrofaj polarizasyonunu ve hücre canlılığını etkileyebilecek rastgele bir MOI sağlayabilecek donöre bağımlı sayıda monosit / kuyu ile sonuçlanır. Protokoldeki kritik adımlar, makrofaj polarizasyonunu da etkileyebilecek hücre kültürlerini kirletmek için diğer hücre türlerini önlemek için uygun yıkamayı içerir. Çok düşük bir MOI gizli TB enfeksiyonunu taklit edebilirken, çok yüksek bir MOI hücreleri öldürür ve uygun bir MOI kullanmanın önemini vurgular. Ayrıca, akış sitometrisi analizleri için kullanılan bazı makrofaj alt kümelerinin önyargılı bir şekilde temsil edilmesine neden olabilecek, kopma üzerine sıkıca yapışan hücreleri almak zor olabilir. Akış sitometrisi analizinde önemli bir adım, boncuk kompanzasyon matrisinin doğru kullanımını ve doğru manuel gating sağlamak için lekelenmemiş hücreler veya FMO (Floresan Eksi Bir) kontrolleri gibi negatif kontrolleri içerir.
Diğer bir sınırlama, yerel doku ortamından değil, kandan elde edilen monositlerin polarizasyonunu içerir. İnsan TB'nin ayırt edici özelliği Mtb ile enfekte dokularda granülom oluşumudur ve bu nedenle TB'deki immünopatoloji tercihen lokal doku bölgesinde çalışılmalıdır. Bununla birlikte, monositler, hücrelerin GM-CSF12gibi enflamatuar sitokinlerin varlığında makrofajlara farklılaşabileceği iltihaplanma / enfeksiyon üzerine periferik kandan akciğere işe alınmaktadır. Daha da önemlisi, doku in vivosunun fizyolojik milieu'sunda, tb enfeksiyonunun kaderine katkıda bulunan çeşitli M1 ve M2 benzeri makrofaj popülasyonlarının bir karışımı ve farklı oranları da dahil olmak üzere makrofaj polarizasyonunun büyük bir heterojenliği muhtemeldir36. Daha önce TB37'demakrofaj aracılı granülom oluşumunun 3D etüdlerini sağlayan bir insan organotipik akciğer dokusu modeli geliştirdik. Deneysel dokuda TB granülom oluşumunu, efektör fonksiyonlarını ve M1/M2 oranını daha fazla incelemek için akciğer dokusu modeli ile birlikte mevcut M1/M2 polarizasyon protokolünün istismar edilmesi ilginç olabilir.
Bu M1/M2 akış mikropları protokolü, inhibitör ve inflamatuar yanıtlarla ilişkili özelliklerin değerlendirilmesi için yararlı olan genişletilmiş bir miyeloid belirteç panelini içerecek şekilde kolayca uyarlanabilir. Makrofaj yanıtlarını modüle edebilecek PD-1, SIRP-α, IDO ve arginazlar gibi inhibitör immün kontrol noktası moleküllerine büyük bir araştırma ilgisi vardır38. Bu bağlamda, miyeloid hücrelerin polarizasyonu, TB38dahil olmak üzere çeşitli hastalıklarda rol aldığı gösterilen immünoregülatör makrofajları (Mreg) veya miyeloid türevli baskılayıcı hücreleri (MDSC) destekleyen diğer uyaranları da içerebilir. M1/M2/Mreg makrofaj alt kümelerinin daha gelişmiş akış sitometri panelleri ayrıca sitokinlerin/kemokinlerin hücre içi boyanmasını içerebilir IL-1β, TNF-α, IL-10 ve MCP-1 veya indüklenebilir nitrik oksit (iNOS) ve antimikrobiyal peptitler gibi diğer çözünür faktörler veya efektör moleküller. Bu, T hücreleri için kapsamlı olarak açıklananlara benzer şekilde poli işlevli makrofaj yanıtlarını inceleme olanaklarını artırabilir39.
Şu anda, akış sitometri boyama panelleri, aynı anda birden fazla hücre alt kümesini ve moleküllerini immünofenotipleme yeteneği sağlayan 30-40 renge kadar içerebilir. Bu M1/M2 akış sitometri protokolünün temel deneysel kurulumu, çoğu eski ve yeni akış sitometreleri ile uyumlu bir omurga olarak kullanılabilir ve BSL-3 ortamında virülan Mtb ile çalışmanın getirdiği zorluklar da dahil olmak üzere bireysel ihtiyaçlara göre inşa edilebilir ve uyarlanabilir. Günümüzde, UMAP gibi boyutsallık azaltma teknikleri, yüksek boyutlu verilerin daha iyi görselleştirilmesi ve yorumlanması için gerekli olan tek hücreli çalışmalarda üretilen çok sayıda parametrenin analizini sağlayan akış sitometri yazılımının yeni sürümlerinde mevcuttur40. Akış sitometristindeki sürekli teknolojik gelişmeler, çok parametrik fenotiplemenin modern hücre sıralama yetenekleri ile kombinasyonu da dahil olmak üzere önümüzdeki yıllarda devam edecektir, burada bu protokol birkaç makrofaj bazlı Mtb enfeksiyonu testlerinde yararlı olabilir.