RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Sean F. Gilmore*1, Wei He*1, Angela C. Evans1, Delia F. Tifrea2, Sukumar Pal2, Brent Segelke1, Sandra K. G. Peters1, B. Dillon Vannest1, Nicholas O. Fischer1, Amy Rasley1, Luis M. de la Maza2, Matthew A. Coleman1,3
1Physical and Life Sciences Directorate,Lawrence Livermore National Laboratory, 2Department of Pathology and Laboratory Medicine,University of California, 3School of Medicine, Radiation Oncology,University of California Davis
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Bu protokol, alt birim aşılarda antijen olarak kullanılabilen nanodiskte desteklenen zar proteinleri üretmek için ticari, hücresiz protein ekspresyon kitlerinin kullanılmasını açıklar.
Alt birim aşılar, güvenlik, stabilite ve standart üretim açısından daha geleneksel inaktive edilmiş veya zayıflatılmış tam hücre kaynaklı aşılara göre avantajlar sunar. Etkili bir protein bazlı alt birim aşısı elde etmek için, protein antijeninin genellikle doğal benzeri bir konformasyon benimsemesi gerekir. Bu, özellikle zara bağlı proteinler olan patojen yüzey antijenleri için önemlidir. Hücresiz yöntemler, yaygın olarak nanodiskler olarak bilinen nanolipoprotein parçacıklarının (NLP'ler) birlikte çevrilmesi yoluyla doğru katlanmış fonksiyonel zar proteini üretmek için başarıyla kullanılmıştır.
Bu strateji, lipide bağlı bir ortamda zar proteinlerinden oluşan alt birim aşıları üretmek için kullanılabilir. Bununla birlikte, hücresiz protein üretimi genellikle küçük ölçekle (<1 mL) sınırlıdır. Küçük ölçekli üretim çalışmalarında üretilen protein miktarı genellikle biyokimyasal ve biyofiziksel çalışmalar için yeterlidir. Bununla birlikte, hayvan modellerinde aşı çalışmaları için yeterli protein elde etmek için hücresiz sürecin ölçeklendirilmesi, optimize edilmesi ve dikkatli bir şekilde test edilmesi gerekir. Saflaştırma, adjuvan ilavesi ve liyofilizasyon gibi aşı üretiminde yer alan diğer süreçlerin paralel olarak optimize edilmesi gerekir. Bu makale, zara bağlı bir protein alt birim aşısını eksprese etmek, saflaştırmak ve formüle etmek için ölçeklendirilmiş bir protokolün geliştirilmesini bildirmektedir.
Ölçeklendirilmiş hücresiz reaksiyonlar, formüle edilmiş nanolipoprotein partiküllerinin yüksek seviyeli üretimi için çoklu plazmit ekspresyon vektörleri, lipid seçimi ve adjuvan ilavesi kullanılırken plazmit konsantrasyonlarının ve oranlarının optimizasyonunu gerektirir. Yöntem burada bir klamidyal majör dış membran proteininin (MOMP) ekspresyonu ile gösterilmiştir, ancak diğer membran protein antijenlerine yaygın olarak uygulanabilir. Antijen etkinliği, burada gösterildiği gibi, antikor üretimini ölçmek için bağışıklama çalışmaları yoluyla in vivo olarak değerlendirilebilir.
Proteinlerin hücresiz ekspresyonu için prokaryotik veya ökaryotik lizatlar, ilgilenilen proteinleri sentezlemek için ticari ürünler olarak kolayca temin edilebilir (tam bir inceleme için, bkz. 1). Bu ekspresyon sistemleri çeşitli ölçeklerde mevcuttur ve E. coli, tütün bitkileri ve memeli kültürleri dahil olmak üzere çeşitli organizmalardan lizatları kullanır. Hücresiz lizatlar, kullanım kolaylığı ve sağlam, hızlı protein üretimi dahil olmak üzere geleneksel rekombinant protein üretim yaklaşımlarına göre birçok fayda sunar. Bu yaklaşımlar öncelikle çözünür proteinler üretmek için kullanılırken, bu grup membran proteinlerini eksprese etmek için kullanımları için bir yaklaşıma öncülük etmiştir.
Bu yeni yaklaşım, ekspresyon için iki protein ürününü, bir apolipoproteini ve ilgilenilen zar proteinini kodlayan DNA'yı dahil ederek mevcut hücresiz ekspresyon sistemlerinde küçük değişiklikler yapar. Eksprese edilen apolipoprotein (ApoA1 veya ApoE4'ün türevleri), kendiliğinden (~ 20 nm) NLP'leri birleştirmek için hücresiz lizata eklenen lipitlerle etkileşime girer. İlgilenilen bir membran proteini ile birlikte çevrildiğinde, NLP ve membran proteini, membran proteininin NLP lipid çift tabakası içine gömüldüğü çözünür bir nanopartikül kompleksi oluşturur. Bu nedenle, membran proteini, çözünür, ayrık parçacıklar içinde bulunduğundan, sonraki uygulamalar için daha erişilebilirdir. Bu yaklaşım, NLP çift tabakası2 içinde fonksiyonel oligomerik protein kompleksleri üretebilir ve daha sonra in vivo değerlendirme için uygun ko-lokalize antijen ve adjuvan içeren bir nanopartikül aşısı oluşturmak için lipofilik adjuvanlarla karıştırılan bir alt birim aşının antijen bileşenini üretebilir.
Bu geçerli yöntem, daha önce yayınlanmış bir protokol3'ten değiştirilmiştir. Anahtar modifikasyonlar, hücresiz reaksiyonun ölçeklendirilmesine ve ardından protein-NLP kompleksinin saflaştırılmasına odaklanmıştır. Başka bir modifikasyon, hücresiz reaksiyona eklenmeden önce lipitlerle karıştırılan telodendrimer olarak bilinen amfifilik bir polimerin eklenmesini içerir. Telodendrimer ve lipitlerin varlığında plazmitlerin birlikte translasyonu, bir telodendrimer NLP (tNLP) üretir. Telodendrimerin eklenmesi, elde edilen tNLP nanopartiküllerinin boyutunu ve monodispersitesini modüle etmeye de yardımcı olur4. Bu protokol, membrana bağlı bir alt birim antijen proteini olan klamidyal MOMP 5,6'yı üretmek için büyük ölçekli aşı çalışmaları için özel olarak optimize edilmiştir. Yöntem, MOMP oligomerizasyonunu koruyan yüksek oranda çözünür bir MOMP-tNLP kompleksi oluşturmak için tNLP ile ilişkili rekombinant MOMP üretir. Tipik bir 3 mL ölçek büyütme üretimi, >1.5 mg saflaştırılmış MOMP verir. Hücresiz üretilen MOMP-tNLP, in vivo immünojenisite testi için hızlı adjuvan ilavesine uygundur.
Tüm hayvan çalışmaları, Kaliforniya Üniversitesi, Irvine'de, Kurumsal Hayvan Bakımı ve Kullanımı Komitesi tarafından belirlenen yönergelere uygun olarak Halk Sağlığı Hizmeti (PHS) güvenceli tesislerde gerçekleştirildi.
1. Züccaciye hazırlama
NOT: Hayvanlar için aşı sınıfı formülasyonların üretiminde kullanılan tüm malzemeler endotoksin içermez.
2. Tampon hazırlama
3. Reaksiyon hazırlığı
4. Alt birim aşı formülasyonları için MOMP-tNLP'lerin hücresiz üretimi
5. MOMP-tNLP saflaştırma
6. SDS-PAGE ile Analiz
NOT: Tüm elüsyon fraksiyonları, ilgilenilen proteinin miktarını ve saflığını taramak için SDS-PAGE ile analiz edilmelidir.
7. Batı ve nokta lekeleri ve depolama
8. Endotoksin değerlendirmesi
9. Liyofilizasyon
10. Adjuvan ilavesi
NOT: Bu ve diğer benzer NLP bazlı alt birim aşı formülasyonları, CpG-ODN1826 ve FSL-1 gibi lipofilik adjuvanları kolayca içerebilir. CpG-ODN1826, 5' kolesterol parçasına (5'-chol-C6) sahip tam bir fosforotiyoat omurgasına sahip, modifiye edilmiş bir B Sınıfı CpG oligonükleotididir (5'-tccatgacgttcctgacgtt-3'). CpG-ODN1826'in tNLP'lere konjugasyonuna, kolesterol kısmı ile tNLP'nin fosfolipid çift tabakası arasındaki hidrofobik etkileşimler aracılık eder ve daha önce bildirildiği gibi gösterilmiş ve iyi karakterize edilmiştir 9,10.
11. Serum testi
1 mL hücresiz reaksiyondan MOMP-tNLP'nin Ni afinite saflaştırmasının SDS-PAGE profili Şekil 1B'de gösterilmektedir. Reaksiyon, hem MOMP hem de Δ49ApoA1 proteini için yüksek düzeyde ekspresyon ile sonuçlandı. Önceki sonuçlar, DMPC ve telodendrimer varlığında Δ49ApoA1'in hücresiz ekspresyonunun telodendrimer nanolipoprotein parçacıklarının (tNLP'ler) oluşumuna yol açtığını göstermiştir4. MOMP'nin Δ49ApoA1 ile birlikte elüksiyonu, MOMP'nin tNLP'lerle ilişkili olduğunu gösterdi, çünkü His-tag MOMP'de değil, yalnızca tNLP iskelesi Δ49ApoA1'de bulunur. MOMP, yalnızca membran proteinlerinin çözünmesini kolaylaştırdığı gösterilen tNLP'lerle kompleks oluşturma yoluyla ayrıştırılabilen, yüksek oranda çözünmeyen bir proteindir.
MOMP-tNLP'leri içeren elüsyon fraksiyonları bir araya getirildi ve toplam protein konsantrasyonu, floresan bazlı bir kantitasyon cihazı veya üreticinin protein kantitasyonu için talimatlarını izleyerek 280 nm'de absorbans yoluyla konsantrasyonu ölçen bir cihaz kullanılarak belirlendi. MOMP aşısının hassas dozlanmasına izin vermek için, saflaştırılmış komplekslerdeki MOMP konsantrasyonunun belirlenmesi de önemlidir. Jel dansitometrisine dayalı olarak MOMP'yi ölçmek için bir yöntem geliştirdik (Şekil 2), burada standart olarak bilinen konsantrasyona sahip saflaştırılmış bir rekombinant MOMP kullanıldı. Standart eğriyi oluşturarak ve bunu MOMP-tNLP örneğiyle karşılaştırarak, MOMP konsantrasyonu doğru bir şekilde ölçülebilir. Saflaştırılmış numunede MOMP konsantrasyonunun belirlenmesi, çeşitli ölçeklerde hücresiz reaksiyonlarda MOMP veriminin tahmin edilmesini sağlamıştır, bu da sonraki çalışmalara uygun reaksiyon kurulumunun planlanması için önemlidir (Tablo 3).
MOMP'nin güçlü bir bağışıklık tepkisi ortaya çıkarmak için oligomerler oluşturması gerekir11. MOMP'nin oligomerik durumunu test etmek için, MOMP-tNLP hem ısı hem de indirgeyici ajan ditiyotreitolün varlığında ve yokluğunda analiz edildi (DTT, 50 mM, Şekil 3A). MOMP'nin daha yüksek dereceli oligomerleri, numuneler ısı ve DTT ile muamele edilmediğinde SDS-PAGE aracılığıyla tanımlandı. Buna karşılık, DTT varlığında ısı ile muamele edilen numuneler, jel üzerinde MOMP ve Δ49ApoA1'e (sırasıyla yaklaşık 40 kDa ve 22 kDa) karşılık gelen iki farklı bant gösterdi. Bu sonuçlar, etkinliği için kritik olan MOMP'nin oligomer oluşumuna atfedilen jel bantlama modeline çok benzemektedir.
MOMP proteininin değişken alanındaki doğrusal epitopa karşı bir antikor olan MAb40 kullanılarak yapılan daha ileri western blot analizi, denatüre olmayan durumda MOMP proteini tarafından oligomer oluşumunu doğrulayan benzer bir bantlama modeli gösterdi (Şekil 3B). MOMP oligomer oluşumunu etkileyen önemli bir faktör, hücresiz reaksiyon kurulumu sırasında MOMP plazmidi ile Δ49ApoA1 plazmidi arasındaki orandır. Tablo 4 , plazmitlerin oranını ve sonuçta ortaya çıkan MOMP'nin tNLP'lere eklenme oranını listeler. Önceki çalışmalar, klamidyal MOMP ve diğer dış zar proteinlerinin öncelikle trimer olarak var olabileceğini göstermiştir12. Hücresiz reaksiyonda trimer oluşumunu en üst düzeye çıkarmak için, ekleme hızının NLP başına üç MOMP proteinine yakın olması arzu edilir, bu da ~25:1 MOMP-Δ49ApoA1 plazmit oranına karşılık gelir.
MOMP ve tNLP'nin varlığını tespit etmek için daha akıcı bir yöntem olarak bir nokta leke testi kullanıldı. MAb40 antikoru total MOMP'yi saptamak için kullanıldı. tNLP'nin Δ49ApoA1 iskelesindeki His-tag'ı hedefleyen MAbHIS antikoru, tNLP'nin varlığını değerlendirmek için kullanıldı. MAb40 ve MAbHIS antikorlarının birlikte sinyal vermesi MOMP-tNLP oluşumunu gösterdi. Kontrol reaksiyonu, yalnızca MAbHIS'ten pozitif bir sinyal gösteren boş tNLP üretti (Şekil 3C). Hücresiz reaksiyonda üretilen MOMP-tNLP'lerin immünojenisitesini test etmek için, MOMP-tNLP'yi CpG + FSL-1 ile adjuvanlaştırdık ve yukarıda tarif edildiği gibi bir prime-boost rejiminde farelere intramüsküler olarak (im) enjekte ettik. Aşılanmış farelerden serumlar toplandı ve MOMP'ye özgü IgG antikoru western blot testi kullanılarak ölçüldü (Şekil 4). Adjuvanlı MOMP-tNLP enjekte edilen farelerden elde edilen serumlar, MOMP-tNLP'nin in vivo bir bağışıklık tepkisi ortaya çıkarabileceğini gösteren güçlü MOMP bağlanması gösterdi.

Şekil 1: MOMP-tNLP'nin ekspresyonu ve saflaştırılması . (A) GFP plazmidi olmayan lizatlara (solda) kıyasla UV ışık kaynağı altında (sağda) yanan GFP kontrollerini başarıyla ifade eden hücresiz bir reaksiyonun küçük alikotlarını içeren tüplerin görüntüsü. (B) SDS-PAGE'den sonra SYPRO Ruby ile boyanmış Protein Jeli, MOMP-tNLP'nin saflaştırma profilini gösterir. MOMP 40 kDa'da ve 49ApoA1 22 kDa'da göç eder. Kısaltmalar: MOMP = klamidyal majör dış zar proteini; tNLP = telodendrimer nanolipoprotein partikülü; MOMP-tNLP = MOMP-tNLP kompleksi; GFP = yeşil floresan protein kodlayan plazmit; MW = Moleküler ağırlık belirteci; T = toplam hücresiz lizat; FT = akış; R1-R3 = hücresiz reaksiyon alikotları; W1, W6 = 1 ve 6'yı yıkar; E1-E7 = 1'den 7'ye kadar olan Aşamalar; Δ49ApoA1 = Etiketli fare ApoA1 türevi. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: MOMP-tNLP örneklerinde MOMP miktarının belirlenmesi . (A) MOMP'nin miktar tayini için SYPRO Ruby ile boyanmış SDS-PAGE jeli. Konsantrasyonu bilinen rekombinant MOMP, standart eğriyi elde etmek için jel üzerine yüklendi. Her şerit 0.1 μg, 0.5 μg, 1.0 μg, 2.0 μg ve 4.0 μg MOMP içeriyordu. Miktarı belirlenmekte olan MOMP-tNLP numuneleri aynı jel üzerine yüklendi. (B) MOMP konsantrasyon standart eğrisi dansitometri kullanılarak oluşturulmuştur. Normalleştirilmiş bant yoğunluğu ve MOMP miktarı ile ilgili bir denklem kuruldu. Denklem, bilinmeyen örneklerdeki MOMP içeriğini hesaplamak için kullanıldı. Kısaltmalar: MOMP = klamidyal majör dış zar proteini; tNLP = telodendrimer nanolipoprotein partikülü; MOMP-tNLP = MOMP-tNLP kompleksi; SDS-PAGE = sodyum dodesilsülfat poliakrilamid jel elektroforezi. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: Hücresiz üretilen MOMP-tNLP, MOMP'nin daha yüksek dereceli yapılar oluşturmasına izin verir. (A) SYPRO Ruby ile boyanmış, ısı ve indirgeyici ajan DTT ile muamele edilmiş ve edilmemiş MOMP-tNLP'nin SDS-PAGE jeli. Isı ve DTT ile, MOMP öncelikle ~ 40 kDa'da bir monomer bandı olarak ortaya çıktı, çünkü ısı ve indirgeyici ajan yüksek dereceli MOMP yapısının çoğunu bozdu. Isı ve DTT'nin yokluğunda, MOMP oligomer konformasyonunu gösteren daha yüksek dereceli bantlar mevcuttu. (B) MOMP-tNLP ve MOMP'nin tek başına, işlenmemiş ve ısı ve DTT ile işlenmiş Batı lekesi. Transferden sonra, membran MAb40 (1:1.000 seyreltme) ile incelendi. SYPRO Yakut lekeli jele benzer bir bantlama modeli gözlemlendi ve daha yüksek moleküler ağırlıklı bantların gerçekten MOMP oligomerleri olduğunu doğruladı. (C) MAb40 ve MAbHIS ile incelenen MOMP-tNLP ve boş tNLP örneklerinin (iki kopya halinde) nokta lekesi. Kısaltmalar: MOMP = klamidyal majör dış zar proteini; tNLP = telodendrimer nanolipoprotein partikülü; MOMP-tNLP = MOMP-tNLP kompleksi; SDS-PAGE = sodyum dodesilsülfat poliakrilamid jel elektroforezi; DTT = ditiyotreitol. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 4: Hücresiz üretilen MOMP-tNLP oldukça immünojeniktir. Aşılanmış farelerden alınan serum, güçlü anti-MOMP IgG sinyali gösterdi. Fareleri immünlemek için CpG + FSL-1 ile adjuvanlı MOMP-tNLP kullanıldı. Altı aşılanmış fareden alınan serumlar toplandı, bir araya getirildi ve MOMP-tNLP'yi araştırmak için kullanıldı. Serum, batı lekeleme testinde MOMP'ye bağlanabildi ve güçlü IgG sinyali gösterdi (solda). Birincil antikor olarak MAb40 kullanan western blot (sağda) benzer bantlar gösterdi, bu da serumun MOMP'ye özgü IgG içerdiğini gösterdi. Kısaltmalar: MOMP = klamidyal majör dış zar proteini; tNLP = telodendrimer nanolipoprotein partikülü; MOMP-tNLP = MOMP-tNLP kompleksi; CpG = kolesterol modifiye CpG adjuvanı; FSL-1 = lipofilik adjuvan. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
| Arabellek adı | NaH2PO4 | NaCl (Sıvı Değeri) | İmidazol | Ph |
| Bağlayıcı Tampon | 50 milyon | 300 milyon | 10 milyon | 8.0 |
| Yıkama Tamponu | 50 milyon | 300 milyon | 20 milyon | 8.0 |
| Elüsyon Tamponu 1 | 50 milyon | 300 milyon | 250 milyon | 8.0 |
| Elüsyon Tamponu 2 | 50 milyon | 300 milyon | 500 milyon | 8.0 |
Tablo 1: Nikel afinite saflaştırması için gerekli tamponların listesi, her bir bileşenin konsantrasyonlarını ve pH'ı detaylandırır.
| Çalışma zamanı | 50 dk |
| Akış hızı | 6.0 mL/dk |
| Degrade türü | İkili |
| Tampon A | H20 içinde 10 mM TEAA |
| Tampon B | MeCN (İngilizce) |
| Gradyan | % Tampon B |
| 0 dk | 25% |
| 30 dk | 60% |
| 30.5 dk | 100% |
| 40 dk | 100% |
| 40.5 dk | 25% |
| 50 dk | 25% |
Tablo 2: Kolesterolü modifiye edilmiş CpG'nin ters faz HPLC saflaştırması için koşullar. Kısaltmalar: TEAA = trietilamonyum asetat; MeCN = asetonitril.
| Hücresiz lizat (mL) | DMPC lipid (mg) | Telodendrimer (mg) | MOMP plazmidi (μg) | Saflaştırılmış MOMP verimi (mg) |
| 1 | 4 | 0.4 | 15 | 0.5 |
| 2 | 8 | 0.8 | 30 | 1.1 |
| 3 | 12 | 1.2 | 45 | 1.6 |
| 5 | 20 | 2 | 75 | 2.7 |
Tablo 3: Farklı ölçeklerde hücresiz reaksiyonlar için kullanılan lipitlerin, telodendrimerlerin ve plazmitlerin miktarı ve bunlara karşılık gelen verimler. Kısaltmalar: MOMP = klamidyal majör dış zar proteini; DMPC = 1,2-dimyristoyl-sn-glisero-3-fosfokolin.
| Plazmit giriş oranları, MOMP : Δ49ApoA1 | 1:1 | 5:1 | 10:1 | 25:1 | 50:1 | 100:1 |
| Üretilen protein miktarının oranları, MOMP : Δ49ApoA1 | 0.02 | 0.32 | 0.64 | 3.46 | 6.55 | 20.04 |
| tNLP başına tahmini MOMP ekleme sayısı | 0.03 | 0.37 | 0.75 | 4.04 | 7.65 | 23.39 |
Tablo 4: Hücresiz bir reaksiyondaki plazmit oranları ve ortaya çıkan MOMP ekleme oranları. Kısaltmalar: MOMP = klamidyal majör dış zar proteini; tNLP = telodendrimer nanolipoprotein partikülü; Δ49ApoA1 = Etiketli fare ApoA1 türevi.
Yazarlar, bu yazıda bildirilen çalışmayı etkilemiş gibi görünebilecek bilinen hiçbir rakip mali çıkarları veya kişisel ilişkileri olmadığını beyan ederler.
Bu protokol, alt birim aşılarda antijen olarak kullanılabilen nanodiskte desteklenen zar proteinleri üretmek için ticari, hücresiz protein ekspresyon kitlerinin kullanılmasını açıklar.
Bu çalışma, Ulusal Alerji ve Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü'nden Halk Sağlığı Hizmeti hibesi R21 AI20925 ve U19 AI144184 tarafından desteklenmiştir. Bu çalışma, ABD Enerji Bakanlığı'nın himayesinde, Lawrence Livermore Ulusal Laboratuvarı tarafından DE-AC52-07NA27344 [LLNL-JRNL-822525, LLNL-VIDEO-832788] Sözleşmesi kapsamında gerçekleştirilmiştir.
| Toz olarak 1,2-dimiristoil-sn-glisero-3-fosfokolin (DMPC) | Avanti Polar Lipidler | 850345 | |
| 1.5 mL endotoksin içermeyen santrifüj tüpleri | Eppendorf | 2600028 | |
| 1 M Trizma hidroklorür çözeltisi | Millipore Sigma | T2194 | |
| Asetik asit, buzul, ACS reaktifi, vb; %99,7 | Millipore Sigma | 695092 | |
| Bio-Dot aparatı | XCell | 1706545 SureLock | |
| Life Technologies | EI0012 | ||
| C24 İnkübatör çalkalayıcı | New Brunswick Scientific Hücresiz | ||
| İfade Sistemi için ProteoMaster E. coli HY Kiti | BiotechRabbit | BR1400201 | |
| cOmplete His-Tag Saflaştırma Reçinesi | Roche Moleküler Tanı | 5893682001 | |
| cOmplete, EDTA İçermeyen Proteaz İnhibitörü Kokteyli Roche | Moleküler Tanı | 4693132001 | |
| CpG-ODN1826 | Biyoaraştırma Teknolojileri | T9449 | |
| D-(+)-Trehaloz dihidrat | Millipore Sigma | 71509 | |
| Diyaliz tüpleri D-Tüp Diyaliz Cihazı Maxi | Millipore Sigma | 71508-3 | |
| Tek kullanımlık, polipropilen fritli kolonlar 10 mL kapasiteli | Bio-Rad | 7311550EDU | |
| Dulbecco' s Fosfat Tamponlu Tuzlu Su (PBS) | Millipore Sigma | D8537 | |
| Elektroforez Güç Kaynağı | |||
| Endosafe PTS kartuşu | Thermo Fisher Scientific | NC9594798 | |
| Endosafe-PTS Test Sistemi | Charles River | ||
| Jel yıkama solüsyonu: %10 metanol, %7 asetik asit | |||
| HCl ve NaOH çözeltileri UV | vis diyot dizi dedektörü ile pH ayarı|||
| HPLC | Shimadzu | ||
| HyClone HyPure kültür sınıfı su | VWR | 82007-328 | |
| iBlot 2 Kuru Kurutma Sistemi | Yaşam Teknolojileri | ||
| iBlot 2 Transfer Yığınları, PVDF | Yaşam Teknolojileri | IB24001 | |
| Image Studio V2.0 yazılımı | Li-COR Biiosciences | ||
| İmidazol | Millipore Sigma | I5513 | |
| Immun-Blot PVDF Membran | Bio-Rad | 1620177 | |
| LI-COR Odyssey Fc görüntüleyici | Li-COR Biiosciences | ||
| Liyofilizatör | Labconco | ||
| Metanol (≥ %99,9) | Millipore Sigma | 34860 | |
| Mikrosantrifüj | |||
| Mikrodalga fırın | |||
| NanoDrop One/OneC Mikrovolume UV-Vis Spektrofotometre | Thermo Fisher Scientific | ND-ONE-W | |
| NuPAGE %4 ila %12, Bis-Tris, 1.0 mm | Yaşam Teknolojileri | NP0321 | |
| NuPAGE LDS Numune Tamponu (4x) | Yaşam Teknolojileri | NP0007 | |
| NuPAGE MES SDS Çalıştırma Tamponu (20x) | Yaşam Teknolojileri | NP000202 | |
| NuPAGE Numune Azaltıcı Ajan (10x) | Life Technologies | NP0009 | |
| TBS'de Odyssey Engelleme Tamponu % 0.2 Tween 20 | Li-COR Biosciences | 927-50000 | |
| Orbital Shaker | |||
| içeren PBS-T (1x PBS,% 0.2 Tween 20, pH 7.4) | |||
| PEG5K-CA8 Telodendrimer (özel sentez ürünü) | |||
| pIVEX2.4d vektör | Roche Moleküler Teşhis | ||
| Plazmid Maxi Kiti | Qiagen | 12162 | |
| Birincil antikor: MAb40 (C. muridarum MOMP, de la Maza laboratuvarının değişken alanı 1'e (VD1) karşı monoklonal antikor)4 | |||
| Birincil antikor: MAbHIS, Penta-His antikoru | Qiagen | 34660 | |
| Prob sonikatörü | |||
| Qubit 3.0 Florometre | Yaşam Teknolojileri | Q33216 | |
| Kübit Protein Testi Kit | Life Technologies | Q33212 | |
| Rainin Pipet uçları: LTS 1000 ve mikro; L | Rainin | 17002428 | |
| Rainin Pipet uçları: LTS 20 ve mikro; L | Rainin | 17002429 | |
| Rainin Pipet uçları: LTS 200 ve mikro; L | Rainin | 17002426 | |
| Rainin Pipetleri | Rainin | ||
| İkincil antikor: IRDye 800CW keçi (poliklonal) anti-fare IgG (ağır ve hafif) | Li-COR Biosciences | 926-32210 | |
| SeeBlue Plus2 Önceden Boyanmış Protein Standart | Yaşam Teknolojileri | LC5925 | |
| Sodyum klorür NaCl | Millipore Sigma | S7653 | |
| Sodyum fosfat monobazik NaH2PO4 | Millipore Sigma | S0751 | |
| Superdex 200, 5/150 GL sütunu | Cytiva | GE28-9909-45 | |
| Sentetik diasillenmiş lipoprotein-TLR2/6 FSL-1 | İnvivojen | ve nbsp; tlrl-fsl | |
| SYPRO Yakut Protein Jel Leke | Yaşam Teknolojileri | S12001 | |
| TWEEN 20 | Millipore Sigma | P1379 | |
| UV ışık kaynağı | |||
| Vacufuge Tezgah Üstü Santrifüj | Eppendorf | ||
| Vortexer | |||
| VWR 15 mL konik (89039-666) | VWR | ||
| VWR 50 mL konikler (89039-656) | VWR | ||
| XCell SureLock Mini-Cell (Yaşam Teknolojileri) | Yaşam Teknolojileri | EI0001 |