RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Mevcut protokol, mavi-LED aydınlatma tekniğini kullanarak TLC plakasındaki bileşiklerin verimini tahmin etmek için bir yöntem geliştirdi. Bu yaklaşımın avantajları, güvenli, etkili, ucuz olması ve araştırmacının aynı anda birden fazla örneği ölçmesine izin vermesidir.
İnce tabaka kromatografisi (TLC), bilinmeyen numunelerin verimini ölçmek için organik kimya araştırmalarında yaygın olarak kullanılan erişilebilir bir analitik tekniktir. Bu çalışma, mavi-LED aydınlatıcıyı kullanarak bir TLC plakasındaki numunelerin verimini tahmin etmek için etkili, ucuz ve güvenli bir yöntem geliştirdi. Aspergillus terreus'tan ekstrakte edilen Lovastatin, bu çalışmada kullanılan örnek bileşiktir. Lovastatin verimini değerlendirmek için lovastatin standardına dayanan regresyon modelleri kullanılmıştır. Üç yöntem karşılaştırıldı: biyotahlil, UV algılama ve mavi-LED aydınlatma. Sonuç, mavi-LED aydınlatma yönteminin UV algılama ve biyotahlil yöntemlerinden önemli ölçüde daha fazla zaman etkili olduğunu göstermiştir. Ek olarak, mavi-LED aydınlatma, biyotahlil yöntemindeki biyolojik tehlikeler (örneğin, mikrobiyal enfeksiyon) ve UV algılama yönteminde ultraviyole maruziyeti endişesi nedeniyle nispeten güvenli bir seçenekti. GC, HPLC ve HPTLC gibi bağımsız olarak çalışmadan önce özel cihazlar ve uzun süreli eğitim gerektiren pahalı yöntemlerle karşılaştırıldığında, mavi-LED aydınlatıcıyı kullanmak, bir TLC plakasından numunelerin verimini tahmin etmek için ekonomik bir seçenekti.
İnce tabaka kromatografisi (TLC), organik kimya alanında kalitatif ve kantitatif bir teknik olarak yaygın olarak kullanılmaktadır 1,2,3. TLC'nin başlıca avantajları, hızlı algılama, esnek numune gereksinimleri sağlaması ve özel ekipman gerektirmemesidir4. Bugüne kadar, birçok gelişmiş yaklaşım oluşturulmuş olmasına rağmen, TLC hala bir karışımdaki bilinmeyen numuneleri tanımlamak için ana yöntemdir. Bununla birlikte, bu yaklaşımın zorluğu, özellikle sınırlı bütçeli laboratuvarlar geliştirmek için numune verimini ölçmek için güvenli ve ucuz ekipman eksikliğidir. Bu nedenle bu çalışma, numunelerin verimini tahmin etmek için TLC ile birleşen verimli, güvenli ve ucuz bir yöntem geliştirmeyi amaçlamıştır.
Yüksek performanslı TLC (HPTLC), yüksek performanslı sıvı kromatografisi (HPLC) ve gaz kromatografisinin (GC) aksine, katı numune gereksinimleri, zaman alıcı ve numune hazırlama1,5 için çok adımlı katılım, TLC çeşitli avantajlar göstermiştir. İlk olarak, numune hazırlama için, HPLC ve GC ham ekstraktı tespit edemez, çünkü ham ekstrakt HPLC ve GC sütununu tıkayabilir. İkincisi, numuneler UV açısından uygun olmadığında (HPLC analizi için önemli) veya düşük uçuculukta (GC analizi için önemli), bu numunelere TLC uygulanabilir ve görselleştirme reaktifinin kullanılması, izole edilmiş numuneleri ince tabakalar üzerinde görünür kılar 6,7,8. Üçüncüsü, genel kullanıcılar için, HPLC ve GC genellikle TLC'ye kıyasla bağımsız olarak çalışmadan önce nispeten uzun bir ön eğitim gerektirir. Ek olarak, yüksek performanslı TLC (HPTLC) olarak bilinen nicel TLC analizi, son derece hassas bir tarayıcıyla TLC plakasındaki bilgileri dijitalleştirebilir. Bununla birlikte, HPTLC sisteminin maliyeti nispeten pahalıdır. Bu nedenle, TLC plakasındaki numuneleri ölçmek için uygun maliyetli ve hızlı bir yaklaşım geliştirmek önemli bir konudur.
TLC verim ölçümü için benzer yöntemler geliştirilmiştir; Örneğin, Johnson9, bir bilgisayara bağlı düz yataklı bir tarayıcı kullanarak TLC plakasındaki numunelerin miktarının belirlenmesine izin veren bir teknik bildirmiştir. 2001 yılında, El-Gindy ve ark.10, bileşiği optik yoğunlukla tespit etmek için kullanılan TLC-dansitometrik yöntemini geliştirdi ve teknik Elkady ve ark.11 tarafından da uygulandı. 2007 yılında Hess2, UV ışığı ile birleştirilmiş bir dijital kamera kullanarak TLC plakası üzerindeki bir bileşiğin verimini tespit etmek için uygulanan dijital olarak geliştirilmiş TLC (DE-TLC) yöntemini sundu. Hess ayrıca HPTLC ve DE-TLC yöntemi arasındaki maliyet farklarını karşılaştırdı ve DE-TLC yönteminin uygun maliyetli olması nedeniyle lise ve üniversite laboratuvarlarında kullanılabileceği sonucuna vardı2. Bununla birlikte, TLC-densitometrik yöntemin maliyeti hala pahalıydı ve ultraviyole ışığın çalışması, kullanıcıların ultraviyole radyasyona maruz kalabileceği durumlarda yeterli ön eğitim gerektiriyordu. Bu nedenle, TLC ile uyumlu, numune verimini ölçmek için verimli, güvenli ve ucuz bir yöntem geliştirmek arzu edilir.
Bu çalışma, mavi-LED aydınlatıcıyı kullanarak bir TLC plakası üzerindeki numuneyi tespit etmek için bir protokol tanımladı ve bantların boyutlarını ölçmek ve ardından bileşik verimini belirlemek için yüksek güvenilirliğe (yüksek R-kare değeri) sahip bir regresyon modeli geliştirdi. Son olarak, mavi-LED aydınlatma yönteminin nispeten güvenli olduğu bulunmuştur (vs. UV algılama yöntemi), ucuz (vs. GC, HPLC ve HPTLC) ve verim ölçümü için etkili (biyotahlil yöntemine karşı) yaklaşım.
Mevcut protokol örnek olarak lovastatin kullanılarak açıklanmıştır. Lovastatin, bir haftalık Aspergillus terreus'tan çıkarıldı.
1. Bileşik ekstraksiyon
NOT: Bileşik ekstraksiyonu ile ilgili ayrıntılar için lütfen Şekil 1'e bakınız.
2. Ham ekstraktın normal faz (NP) adsorpsiyon sütunu ile ayrılması
3. İnce tabakalı kromatogram (TLC) plakaların hazırlanması ve yüklenmesi
4. Mavi-LED aydınlatıcı ile analiz
5. Regresyon modeli ile verim tahmini
Bu çalışmada, bileşiklerin verimini tahmin etmek için mavi-LED aydınlatma yöntemi sunulmuş ve bu yöntem biyotahlil ve UV ile saptanan yöntemlerle doğrulanarak karşılaştırılmıştır (Tablo 1). Regresyon modelleri, numunelerin verimini tahmin etmek için sırasıyla üç yöntem için bantların boyutlarına ve standartların konsantrasyonuna dayanarak geliştirilmiştir. İlk olarak, biyotahlil yönteminin sonuçlarında, inhibisyon bölgesinin boyutları ile lovastatin standartları arasındaki R-karesi 0.99 idi ve örnek verimi regresyon modeli tarafından öngörülen 0.56 mg idi (Şekil 2). İkincisi, UV tespit yönteminde, lovastatin standartları ile TLC plakasındaki bantların boyutu arasındaki R-karesi 0.97 idi ve regresyon modeli tarafından öngörülen numunenin verimi 0.53 mg idi (Şekil 3). Özellikle, bandın kenarları bulanıktı ve nispeten düşük sinyal yoğunluğu bantları gözlendi (Şekil 3A). Üçüncüsü, mavi-LED aydınlatma yönteminde, lovastatin standartları ile TLC plakasındaki bantların boyutu arasındaki R-karesi 0.98 idi ve örnek verimi regresyon modeli tarafından öngörülen 0.54 mg idi (Şekil 4). Mavi-LED aydınlatıcı kullanılarak tahmin edilen verim, biyotahlil yöntemine (kontrol olarak ayarlanmış) daha yakındı. Bandın boyutu lovastatin miktarı ile orantılıydı ve berrak bantlar mavi-LED aydınlatma yöntemiyle elde edildi. Ek olarak, biyotahlil, UV algılamalı ve mavi-LED aydınlatma yöntemlerinin çalışma saatleri sırasıyla yaklaşık 24 saat, 2 saat ve 1 saat idi; (Not: çalışma saati, lovastatinin verim incelemesi için harcanan toplam süre anlamına gelir).

Şekil 1: Protokolün çalışma akışı. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: Biyotahlil yöntemi. (A) Neurospora crassa'ya karşı lovastatin biyotahlili (30 °C'de 24 saat boyunca inkübe edilir). Denemenin sonunda, 90 mm'lik agar plakaları görünür ışık altında fotoğraflandı. (B) Altı lovastatin standardının konsantrasyonları şunlardı: No. 1 (1 mg / mL), No. 2 (0.75 mg / mL), No. 3 (0.5 mg / mL) ve No. 4 (0.25 mg / mL). 5 numaralı örneklem ×0.25'e (1:4) seyreltildi. 6 numaralı örnek, 0.5× (1:2) kadar seyreltildi. İnhibisyon bölgesi boyutu (mm2) görüntüleme yazılımı ile ölçüldü. (C) Standartların inhibisyon bölgesi boyutuna dayalı veri analizi ve grafik yazılımı kullanılarak bir regresyon modeli geliştirilmiştir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: UV ışığına maruz kalan ince tabaka kromatogram (TLC) plakası. (A) TLC analizinde mobil faz olarak n-hekzan:etil asetat (2:3 v/v) kullanılmış ve TLC plakası geliştiriciye batırıldıktan sonra UV ışığına (365 nm) maruz bırakılmıştır (H2SO4). (B) Altı lovastatin standardının konsantrasyonları şunlardı: No. 1 (1 mg / mL), No. 2 (0.75 mg / mL), No. 3 (0.5 mg / mL) ve No. 4 (0.25 mg / mL). 5 numaralı örneklem ×0.25'e (1:4) seyreltildi. 6 numaralı örnek, 0.5× (1:2) kadar seyreltildi. İnhibisyon bölgesi boyutu (mm2) görüntüleme yazılımı ile ölçüldü. (C) TLC plakası üzerindeki lovastatin standart bantlarının boyutuna dayalı veri analizi ve grafik yazılımı kullanılarak bir regresyon modeli geliştirilmiştir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 4: Mavi-LED aydınlatıcı tarafından taranan ince katmanlı kromatogram (TLC) plakası. (A) TLC analizinde mobil faz olarak n-hekzan:etil asetat (2:3 v/v) kullanıldı ve TLC plakası mavi-LED aydınlatıcı tarafından tarandı. (B) Altı lovastatin standardının konsantrasyonları şunlardı: No. 1 (1 mg / mL), No. 2 (0.75 mg / mL), No. 3 (0.5 mg / mL) ve No. 4 (0.25 mg / mL). 5 numaralı örneklem ×0.25'e (1:4) seyreltildi. 6 numaralı örnek, 0.5× (1:2) kadar seyreltildi. İnhibisyon bölgesi boyutu (mm2) görüntüleme yazılımı ile ölçüldü. (C) TLC plakası üzerindeki lovastatin standart bantlarının boyutuna dayalı veri analizi ve grafik yazılımı kullanılarak bir regresyon modeli geliştirilmiştir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
| Biyotahlil | Mavi-LED Aydınlatıcı | UV algılamalı | |
| Sonuç gözlemi | Göz | Mavi-LED aydınlatıcı ve gözler | UV ışığı ve gözler |
| Görüntü çözünürlüğü | Orta | Yüksek | Alçak (bulanık ve soluk görüntü) |
| Yaklaşık zaman maliyeti | 24 saat | 1 saat | 2 saat |
| Gerekli analiz becerisi | Orta | Alçak | Orta |
| Emniyet | Mikrobiyal enfeksiyon | Çok güvenli | UV ışığına maruz kalma |
| Regresyon denklemi | y = 0,0019x + 0,0304 | y = 0,0399x - 0,1271 | y = 0,0657x - 0,6405 |
| R-kare | 0.99 | 0.98 | 0.97 |
| Yamaç | 0.0019 | 0.0399 | 0.0657 |
| Durdur | 0.0304 | -0.1271 | -0.6405 |
| Standart eğim hatası | 8,94E-05 | 3.54E-03 | 6.28E-03 |
| Standart durdurma hatası | 0.03032 | 0.07115 | 0.12375 |
Tablo 1: Bu çalışmada kullanılan üç tespit yönteminin karşılaştırılması.
| TLC-densitometrik yöntem | TLC-görüntü analizi | |||||||
| El-Gindy · ve ark.10 |
Arjantin ve ark.11 |
Müşerref ve ark.12 |
Johnson9 · | Hess2 | Mavi-LED Aydınlatıcı yöntemi (Bu çalışma) |
|||
| Örnek | Asebutolol HCL | Siprofloksasin HCL | Metronidazol | Danazol | Kolesterol | Vanilin | Nikotinamid | Lovastatin |
| Sonuç -ları | UV dedektör |
TLC tarayıcı |
TLC tarayıcı |
Düz yataklı tarayıcı | Dijital fotoğraf makinesi UV lambalı |
Mavi LED aydınlatıcı | ||
| Dalga boyu | 230 nm | 280 mil | 280 mil | 291 nm | NA | 254 deniz mili | NA | |
| Korelasyon katsayısı | 0.996bir | 0.9991a | 0.9994a | 0.996bir | 0.998bir | 0.971b | 0.987b | 0.99a 0.98milyar |
| Regresyon denklemi | NA | y = 5.7853x +19.9383 |
y = 1.1104x + 6.9755 |
y = 7.949x + 2460 | y = 0,96x | NA | NA | y = 0,0399x -0.1271 |
| a: Pearson korelasyon katsayısı | ||||||||
| b: R-kare |
Tablo 2: Önceki yöntemler ile mevcut çalışmanın karşılaştırılması.
Ek Şekil 1: Ampisilinli ince tabakalı kromatogram (TLC) plakası mavi-LED aydınlatma yöntemi ile taranmıştır. (A) Etil asetat: metanol (9: 13 v / v), TLC analizinde mobil faz olarak kullanıldı ve TLC plakası mavi-LED aydınlatıcı tarafından tarandı. (B) Dört ampisilin standardının konsantrasyonu şunlardı: No. 1 (100 mg / mL), No. 2 (75 mg / mL), No. 3 (50 mg / mL) ve No. 4 (25 mg / mL). Bantların boyutu görüntüleme yazılımı ile ölçüldü. (C) TLC plakasındaki ampisilin standart bantlarının boyutuna dayanan veri analizi ve grafik yazılımı kullanılarak bir regresyon modeli geliştirilmiştir. Bu Dosyayı indirmek için lütfen tıklayınız.
Ek Şekil 2: Mavi-LED aydınlatma yöntemi ile taranan aframisin içeren ince tabakalı kromatogram (TLC) plakası. (A) Metanol: Su (6: 5 v / v) TLC analizinde mobil faz olarak kullanılmış ve TLC plakası mavi-LED aydınlatıcı tarafından taranmıştır. (B) Dört aframisin standardının konsantrasyonu şunlardı: No. 1 (50 mg / mL), No. 2 (40 mg / mL), No. 3 (30 mg / mL) ve No. 4 (20 mg / mL). Bantların boyutu görüntüleme yazılımı ile ölçüldü. (C) TLC plakasındaki apramisin standart bantlarının boyutuna dayalı veri analizi ve grafik yazılımı kullanılarak bir regresyon modeli geliştirilmiştir. Bu Dosyayı indirmek için lütfen tıklayınız.
Tüm yazarlar çıkar çatışması olmadığını beyan ederler.
Mevcut protokol, mavi-LED aydınlatma tekniğini kullanarak TLC plakasındaki bileşiklerin verimini tahmin etmek için bir yöntem geliştirdi. Bu yaklaşımın avantajları, güvenli, etkili, ucuz olması ve araştırmacının aynı anda birden fazla örneği ölçmesine izin vermesidir.
Bu çalışma Tayvan Bilim ve Teknoloji Bakanlığı (MOST 108-2320-B-110-007-MY3) tarafından desteklenmiştir.
| Amerikan bakteriyolojik Agar | Condalab | 1802.00 | |
| Aspergillus terreus | ATCC 20542 | ||
| Mavi-LED aydınlatıcı | MICROTEK | Bio-1000F | |
| Santrifüj | Thermo Scientific | HERAEUS Megafuge 8 | |
| Kompakt UV lambası | UVP | UVGL-25 | |
| Etil Asetat | MACRON | MA-H078-10 | |
| Filtre Kağıdı 125mm | ADVANTEC | 60311102 | |
| ImageJ | NIH | Ücretsiz | https://imagej.nih.gov/ij/download.html |
| Lovastatin standardı | ACROS | A0404262 | |
| MiBio Fluo | MICROTEK | V1.04 | |
| n-Hekzan | C-ECHO | HH3102-000000-72EC | |
| OriginPro | OriginLab | 9.1 | https://www.originlab.com/origin |
| Patates dekstroz suyu H | STBIO MEDIA | ||
| 110533 Döner buharlaştırıcı | EYELA | SB-1000 | |
| Sülfürik asit | Fluka | 30743-2.5L-GL | |
| TLC silika jel 60 F254 | MERCK | 1.05554.0001 | |
| Trifloroasetik asit | Alfa Aesar | 10229873 | |
| Ultrasonik titreşim makinesi | DELTA | DC600 |