Membran Mühür Bütünlüğü Testi
Mühürlenmiş çipin bütünlüğünü test etmek için, üst kültür odası mavi boyalı yarı su ile, alt kısmı ise saf yarı su ile doldurulur. Kırplar gece boyunca bırakılır ve üst odadan membranın çevresindeki alt odaya mavi boya sızıntısı değerlendirilir.
Yöntemimizle hazırlanan tam donanımlı silikon çipler, membran bütünlüğünü bozmadan uzununa 35° açıya deforme edilebilir; şimdi üst yarıya her iki tarafta esnek PDMS harç ile bağlanır. PDMS çiplerinin deformasyonu, örneğin yarılar veya çipler petri kabına yapıştığında kullanımın normal bir parçasıdır.
Çipler, akış kaynaklı basınçla performanslarını test etmek için çift yönlü bir şırınga pompası sistemine bağlandı. PET ve PC membranlı çipler, odalar arasında sızıntı veya çiplerin patlaması olmadan 30 kPa'ya (pompaların sağladığı maksimum basınç) kadar çalıştırılabilir. Önceki çalışmalarda, çipler standart olarak 150 μL/s hızında çalıştırılır ve bu da her cihazın odalarına 0.7 Pa basınçuygular 8.
Zar bağlanmasının görselleştirilmesi
RT vakum mühürleme sonucu sıvı PDMS harcının mikroskop altında membranın 0,4 μm gözeneklerine girmesini görselleştirmek için PDMS harç Nil Kırmızısı ile boyandı. Nil Kırmızısı, hidrofobik bir boya olduğu ve sıvı haliyle PDMS ile iyi karıştığı için seçilmiştir. Boya, ışık mikroskopisi altında kırmızı renk elde etmek için sıvı PDMS ile %1 Nil Kırmızısı iyice karıştırılarak hazırlanmıştır. RT kürleme işlemi yukarıda açıklandığı gibi tekrarlandı. Boyalı harç ile membranlar parafine gömülüp mikrotom kullanılarak kesitlenmiştir. Zar dilimleri cam slaytlara monte edilip ışık mikroskobu kullanılarak görüntülendi (Şekil 4). PDMS'nin toluen ile harca inceltilmesi ve PDMS'nin membran gözeneklerine girmesi için vakum uygulanması gerekliliğini doğrulamak için, bu yöntemlerle ve olmadan zarların karşılaştırılması Ek Şekil 3'te görülebilir.
Hücre Yaşam Testi
Önceki bir çalışmada, cihazların yapımında toluen kullanımından kaynaklanan potansiyel kimyasal toksisite test edildi. Çipler, PDMS harcında toluenle ve toluen olmadan hazırlandı, insan akciğer adenokarsinomu epitelyal Calu-3 hücreleri 2 gün boyunca birleşimle yetiştirildi ve daha önce tanımlandığı gibi çiplerde 1 günkültürlendi. 8. Hücre ölümü, Trypan mavisi boyama ile değerlendirildi; cihazdan tüm hücreler çıkarıldı ve ölü hücreler (mavi) lekelenmemiş canlı hücrelere karşı sayıldı. Yayılma, reaktiflerin çip ortamında inkubasyonu yapılarak ve ardından AlamarBlue testi yapılarak değerlendirildi; plaka okuyucu aracılığıyla floresan emilimi okundu ve bu proliferasyonu yansıtıyor (Şekil 5)8.
ECM Bazal Membran Bağlanması
Bu prosedürün çeşitli zarlarla güçlü ve esnek bağlanma sağlamada genel uygulanabilirliğini göstermek için, protokol tamamen ekstrasellüler matriks (ECM) tabanlı bir zarla tekrarlandı (Şekil 6). ECM içeren bazal zar,17'den önce tarif edildiği gibi domuz idrar mesanelerinden hazırlanmıştır. Kısa bir süreliğine, 4 ila 8 aylık dişi hayvanlardan alınan domuz idrar keseleri, yerel bir mezbahaneden (Kroon Vlees b.v., Groningen, Hollanda) alındı ve toplandıktan sonra 3 saat içinde işlendi. Mesaneden bağ dokusu ve yağ çıkarıldı, mesane ters çevrildi ve epitel tabakası küt şekilde diseksiye edildi, doku oda sıcaklığında PBS olarak tutuldu. ECM iskeleleri, membran tutması prosedürü için dehidratlandırılmıştır17. Hazırlanan iskeleler, yukarıdaki protokolde açıklandığı gibi kesilip PDMS çip yarılarına bağlandı. Cihaz içinde membran esnemesi için ekstra odalar bulunan yeni bir kalıp üretildi; bu da vakumlanan silikon bağların yatay mekanik gerilime dayanabildiğini gösterdi (Ek Dosya 2).
ECM Zar Bütünlüğü Testi
Membran mühürü bütünlük testi yukarıda belirtildiği gibi yapıldı. Sonrasında, esneme çipi şırınga pompalarına bağlandı ve cihazın yan odalarında vakum çekerek ECM membranında gece boyunca 1 mm yatay gerilme oluştu (Şekil 7).
Standart Hava Yolu Çipte PET membranında epitel hücrelerinin ve Fibroblast ortak kültürünün farklılaşması
Sağlanan çipin ALI hücresi için Hava Yolu Çip olarak performansını doğrulamak amacıyla, önceki bir çalışmada insan akciğer adenokarsinomu epitelyal Calu-3 hücreleri (ATCC, Manassas, VA, ABD) birleşim noktasına yetiştirildi ve cihazda havaya maruz kaldı. 8. 10 gün süren apikal hava maruziyetinden sonra, Calu-3 epitel hücrelerinin mukus üreten hücrelere ayrıldığı görülebilir; bu, Alcian mavisi boyama ile ölçülen mukus üretimiyle gösterilir (Şekil 8)8.
Uzun süreli sızıntısız akış ve ortak kültür prosedürümüzü doğrulamak için, önceki bir yayından bir örnek görülebilir; Tam hücre kültürü metodolojisi için bumakaleye bakınız 8. İnsan hava yolu epitel hücreleri, çipin apikal kültür odasında sürekli hava akışı altında 21 gün boyunca kültürlendi; primer hava yolu fibroblastları ise zarın karşı tarafında ters olarak kültürlendi. Kısacası, birincil hava yolu epitel hücreleri proteaz tedavisi (HBSS'de 0,2 mg/mL, 2 saat, 37 °C), hücre kazıması ve daha fazla bilgi bulunmayan 3 sağlıklı akciğer bağışçısından kalan trakeobronşial dokudan alınan hücrelerin kriyokonservasıyla izole edildi. İnsan hava yolu fibroblastları (AF'ler), tek bir donörden nakledilen KOAH akciğer dokusunun bronşiyal dokusundan aynı şekilde izole edildi.
Şekil 9'da, çipin ve yukarıda bahsedilen hücrelerin cihazın odalarından nasıl geçtiğinin bir grafiği görülebilir.
ECM zarında Fibroblastlarla birlikte kültürde epitel hücrelerinin kültürü
Bazal zar içeren iskele, epitel ve mezenkimal hücre kültürünü kolaylaştırır. Ölümsüzleştirilmiş insan keratinositleri (HaCaT hücreleri), zarın epitel (iç) tarafında 60 x 103 hücre/cm2 yoğunlukta tohumlanmış, 24 saat sonra canlılık %95 iken, plastik hücre kültür şişesinde %91 olmuştur (Şekil 10A). Sonrasında, normal insan akciğer MRC-5 fibroblastları, stromal (dış) tarafa 60 x 103 hücre/cm2 yoğunlukta tohumlanarak HaCat hücreleriyle birlikte 14 gün boyunca birlikte kültür içinde yetiştirildi (Şekil 10D). Epitel hücreleri, zarın iç tarafında birleşen bir monotabaka oluştururken, fibroblastlar ECM zarının dış yüzeyinde daha az yoğun dağılımla ancak karakteristik iğne benzeri morfolojilerini korudular (Şekil 10C). 3D yeniden yapılandırma videosu Ek Dosya 417'de görülebilir.
Mevcut çalışma, çipin manuel işlenmesinden kaynaklanan bozulmalara direnç gösterebilen ve 0.7 Pa'ya kadar basınçlarla akış altında uzun süreli kültür sağlayan güçlü bir PDMS-membran bağlantısı üreten geliştirilmiş bir membran sızdırmazlık prosedürü sundu. Bu zarların, kültür membranlarını gözeneklerinden geçerken silikon ile bağlandığını gösterdik; bu da iki çip yarısı ile vakumlanmış PDMS harç arasında kovalent silan bağlarının oluşmasını sağladı. Ayrıca, sunulan prosedür, doğru şekilde uygulandığı sürece sitotoksisiteyi oluşturmaz. Ayrıca, üretilen çipler uzun vadeli epitelyal mono- ve epitelyal-mezenkimal ko-kültürlerin oluşmasını kolaylaştırmıştır. Bu işlem yalnızca gözenekli zarlar için geçerli olsa da, güvenilir ve hücre kültürüne hazır ALI-çiplerinin üretimi için düşük girdili bir prosedür olmaya devam etmektedir.

Şekil 1. PDMS çip-yarı üretimi ve membran hazırlığı grafikleri. PDMS çip-yarı üretimi için (adım 1.2), çip kalıpları geniş bir nozullu şırıngalı sıvı PDMS ile doldurulur; üst kalıbda 4.4 mL, alt kalıpta ise 2.4 mL. PDMS yarıları 65 °C'de 2 saat boyunca kürlenir, ardından üst çip yarısındaki 4 giriş odanın uçlarında ve kalıpta belirtilen noktalarda delinir. Membran hazırlama için (adım 1.3) baskılı zar şablonu zar yüzeyine sıkıca tutulur. Yeni bir bıçak kullanılarak, şablonun etrafını kesip çevredeki parça membranı çıkarılır. Zarlar hücre kültürü için kaplanabilir veya doğrudan 2. adımda kullanılabilir. BioRender'da oluşturuldu. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2. Zar bağlama prosedürü. PDMS harç kullanımdan hemen önce yukarıda açıklandığı gibi karıştırılır. Harç, kültür odasının dört köşesine damlatılır ve pipetin açılı ucuyla zar bağlanma noktasının etrafına nazikçe yayılır. Zarın bir ucu harmanın üzerine yerleştirilir, ardından kültür odasıyla hizalandıktan sonra nazikçe yerine oturmasına izin verilir. Harç damlalı olarak tekrar uygulanır ve membranın kenarlarına büyük özenle boyanır; kültür alanındaki membran yüzeyine silikon dokunmaması büyük özen gösterilir. Çipli yarı bağlı membranlar, mikro kabarcıkları temizlemek, yüzeye ve gözeneklere silikon invazını sağlamak ve zara kimyasal saldırıyı en aza indirmek için tolueni çıkarmak için hemen vakum odasına yerleştirilir. BioRender'da oluşturuldu. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3. Zar yerleştirme örnekleri. (A) Başarılı bir şekilde membran yerleştirilmesi, RT hızında kürlenme. (B) Membran bağlanması fırında (RT yerine 65 °C'de, ısıtıldıktan sonra silikon kasılırken membranın odaya doğru genişlediği görülebilir. (C) Doğru PET ve PC membran yerleşimiyle tam çipler. (D) Yanlış membran yerleşimi, çipin her iki tarafının hacminin zar hareketiyle değişmesine neden olur; bu da değişken akışa yol açar ve çip içindeki hücrelere ve çipe bağlı pompalara stres uygular. BioRender'da oluşturuldu. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 4. Dilimlenmiş ve monte edilmiş PET ve PC zarlarının ışık mikroskobu görüntüleri. Vakumlu RT kürleme işlemimiz sonucunda silikon sızıntısı membran gözeneklerine sızıyor. (A) Aynı membranın PDMS uygulanmamış görüntüleri, şeffaf gözenekler ve polarize görüntüde temiz bir yüzey görülebilir. (B) PDMS Harcı Nil Kırmızısı ile boyanmıştır ve silikonun magenta renginde gözenekleri başarıyla işgal ettiği ve vakumda yüzeyi ince bir şekilde kapladığı görülebilir. Beyaz/magenta renklerle vurgulanmış. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 5. Çip cihazlarındaki hücre canlılığı, PDMS harcında inceltici madde olarak toluen olup olmadan yapılması nedeniyle değişmemiştir. Calu-3 hücreleri, çip başına 6,5 × 10-4 hücre arasında tohumlanmış, birleşmeye ulaştıktan sonra gece boyunca kuluçka edilmiş, ardından süpernatan üzerinde AlamarBlue testi ve hücrelerde TrypanBlue testi yapılmış. Toluenle ve toluensiz (n=4) gruplar arasındaki farklar, eşleşmemiş Öğrenci t testi ile test edildi, p > 0.05 = ns (anlamlı değil)8. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 6. Taban zar çipleri. (A) PDMS/toluen harcı yeterince hızlı vakumlanamadığı için zar bütünlüğü bozuldu; Bu durum matris proteinlerine zarar vermiş ve çip kapamasını bozmuştur. (B) Membran ve yonga sızdırmazlığı başarılı olmuştur, ancak zar gevşek bir durumda kapatılmıştır. (C) Başarılı membran ve yonga sızdırmazlığı, çip akış ve gerilme için işlevseldir. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 7. ECM çipinin gerildiği iki görüntü. (A) Hareketsiz halde çip. (B) 1,2 mm yatay gerilme altında parça. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 8. Alcian Blue (Çekirdekler magenta, mukoz mavi) insan akciğer Calu-3 epitel hücrelerinin boyaması, cihazda hava maruziyetinden sonra çiplerde yetiştirilmiştir. Calu-3 hücreleri birleşmeye kadar yetiştirildi ve bazal bölmede 150 μL/s sürekli akış hızı altında 10 gün boyunca kültürlendi ve apikal taraftan orta veya hava ile maruz kaldı. Akış, 37 °C ve %5CO2 sıcaklıkta bir kuluçka makinesi içinde peristaltik pompa ile üretildi. Kültürün sonunda zarlar çıkarılıp boyandı. 10 gün boyunca suyun altında yetiştirilen Calu-3 hücrelerinin Alcian Mavisi boyamasının enine görünümü (A) ve havaya maruz kalan (B)8. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 9. Cihaz içinde genişletilmiş ortak kültürde birincil insan epitel hücreleri ve fibroblastların görselleştirilmesi. Hava yolu fibroblastları cihaza tohumlanarak gece boyunca tutunmasına izin verildi, ardından cihaz ters çevrildi ve zarın diğer tarafına epitel hücreleri tohumlandı. Hücreler, 37 °C ve %5CO2 sıcaklıkta bir inkübatör içinde peristaltik pompa ile üretilen 150 μL/s sürekli akış hızı altında birleşerek yetiştirildi, havaya maruz kaldı ve 21 gün boyunca kültürlendi. Membranlar kültür sonrası çıkarıldı, sabitlendi, gömüldü ve boyamadan önce slaytlara monte edildi. Epitel hücreleri, mukusun bir bileşeni olan Mucin 5AC (MUC5AC)18 ve kirpik üretimi için sinyal iletiminde rol alan forkhead box proteini J1 (FOXJ1)19 için boyandı. Fibroblastlar, hücresel fosfolipid çift katmanlarını görselleştirmek için buğday tohumu agglutinin (WGA) ile boyandı. Hücreler, HBSS'de 5 μg/mL ile 15 dakika kuluçka edildi ve görüntülemeden önce PBS ile üç kez yıkandı. Tüm hücre çekirdekleri DAPI ile görselleştirildi. (A) Kesit görünümü: (B) ve (C)'nin Z-yığını projeksiyonundan üretilir. (B) Chip membranında epitelyal MUC5AC/FOXJ1/DAPI boyaması. (C) Bazal odadaki fibroblast tabakasının tam dış yapısı8. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 10. Bazaz zar iskelesi üzerinde hücre canlılığı ve kokültür. (A) EPITEL TARAFINA TOHUMLANAN HaCaT hücrelerinin canlı/ölü canlılığı, 3 bağımsız örnek test edildi, her örnekten 3 rastgele alan alındı (n = 3). Tavaline tek yönlü ANOVA testi ve Tukey düzeltmesi yapıldı. Grafik, ortalama ve standart sapmayı gösterir. Epitel tarafında (B) HaCaT hücrelerinin ve bazal zarın stromal tarafında MRC-5 akciğer fibroblastlarının kokültürü ve kollajen lifleriyle çevrili iskele, ölçek çubukları 50 μm'dir. (D) Üst ve alt izometrik görünümlerden kokültürün 3D görünümü, ölçek çubukları 100 μm, animasyonlu görselleştirme Ek Şekil 4'te bulunabilir. (E) Decellularizasyon öncesi ve sonrası bazaz zar iskelesinin kalınlığı, 14 mukoza ölçüldü ve bunlardan 6'sı (üçgenlerle gösterilen) decellularizasyon için alındı. Her örnekte üç rastgele alan taranmış ve her alan için en az 10 puanölçülmüş 17. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Şekil 1. Standart PET/PC çipinin üst ve alt yarısı için çip kalıp tasarımları. (A) Çipin alt kalıbının görüntüsü, bu parçadan üretilebilen . STL Ek Dosya 1'de. (B) Çipin üst kalıbının görüntüsü, bu parçadan üretilebiliyor. STL Ek Dosya 2'de. (C) Çip için membran kesim için zar şablonunun görüntüsü, bu çip için üretilebilen . STL Ek Dosya 3'te. Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Şekil 2. Esneklik ECM membran çipinin üst ve alt yarıları için yonga kalıp tasarımları. (A) Çipin alt kalıbının görüntüsü, bu parçadan üretilebilen . STL Ek Dosya 4'te. (B) Çipin üst kalıbının görüntüsü, bu parçadan üretilebiliyor. STL Ek Dosya 5'te. Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Şekil 3. Sızdırmazlık prosedürünün doğrulanması: PDMS'nin toluen olmadan gözeneklere girmesinin karşılaştırılması, harcın viskozitesini düşürmek ve vakumsuz RT'de kürlenmek. Tüm koşullar PET membranlarıyla (0,4 μm gözenekler) ilgilidir; PDMS (Nil Kırmızısı %1) tedavisinden sonra membranlar parafine gömülmüştür, montaj ve ışık mikroskobu görüntülemesi yapılır. (A) İnceltilmemiş PDMS'ler bir PET membranına vakumlanmış. Membranın yüzeyinde kalın bir PDMS tabakası görülürken, gözeneklere giren (beyaz kutularla vurgulanmış) hiçbir PDMS tabakası gözlemlenmemektedir. (B) İnceltilmiş PDMS harcı bir PET membranına süpürülmüştür. Membranın yüzeyinde bir PDMS tabakası görülürken, gözeneklere (beyaz kutularla vurgulanmış) herhangi bir PDMS girdiği gözlemlenmemektedir. (C) İnceltilmiş PDMS harcı PET membranına vakumlanmış. Zarın yüzeyinde ince bir PDMS tabakası ve membran boyunca gözeneklere girme görülebilir (beyaz kutularla vurgulanmıştır). Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Şekil 4. 3D Domuz ECM iskelesinde HaCat (epitelyal) ve MRC-5 (stromal) hücrelerinin görselleştirilmesi. Üst ve alt izometrik görünümlerden cokültürün animasyonlu 3D görünümü, görüntüleri Şekil 10D'de görülebilir, ölçek çubukları 100 μm'dir. Bu Dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Dosya 1. 3D. Alt kalıbın STL dosyası. Kalıp, standart çipin alt yarısını 3D baskı veya eşdeğer bir üretim yöntemiyle üretmek için kullanılabilir. Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Dosya 2. 3D. Üst kalıpın STL dosyası. Kalıp, standart çipin üst yarısını 3D baskı veya eşdeğer bir üretim yöntemiyle üretmek için kullanılabilir. Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Dosya 3. 3D. Membran şablonunun STL dosyası. Şablon, sağlanan çip için doğru boyutta membranlar üretmek için kullanılabilir ve 3D baskı veya eşdeğer bir üretim yöntemiyle üretilebilir. Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Dosya 4. 3D . Streç çipin alt kalıbının STL dosyası. Kalıp, esneğe alınan çipin alt yarısını 3D baskı veya eşdeğer bir üretim yöntemiyle üretmek için kullanılabilir. Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Dosya 5. 3D. STL dosyası, streç çipin üst kalıbından. Kalıp, esnebilir çipin üst yarısını 3D baskı veya eşdeğer bir üretim yöntemiyle üretmek için kullanılabilir. Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.