Hi-C: genomların Üç boyutlu Mimari Eğitim Bir Yöntem.

415.9K görüntülenme

509 kez atıf aldı

22:27 dk.

6 Mayıs 2010

10.3791/1869-v

6 Mayıs 2010

415.9K görüntülenme

Nynke L. van Berkum^*¹ , Erez Lieberman-Aiden^*²^,³^,⁴^,⁵ , Louise Williams^*² , Maxim Imakaev⁶ , Andreas Gnirke² , Leonid A. Mirny³^,⁶ , Job Dekker¹ , Eric S. Lander²^,⁷^,⁸

¹Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, ²Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, ³Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, ⁴Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University , ⁵Department of Applied Mathematics, Harvard University , ⁶Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, ⁷Department of Systems Biology, Harvard Medical School, ⁸Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology

^* These authors contributed equally

Hi-C yöntemi kromatin etkileşimler (1) tarafsız, genom kimlik sağlar. Hi-C çiftler yakınlık ligasyonu ve güçlü paralel sıralama. Ortaya çıkan veriler farklı ölçeklerde genomik mimarlık eğitimi için kullanılabilir: ilk sonuçlar, kromozom toprakları, segregasyon, açık ve kapalı kromatin ve megabase ölçekte kromatin yapısı gibi özellikleri tespit.