Süreksiz yoğunluk gradyanı kullanılarak bakterilerin kapsül miktarına göre ayrılması

Polivinilpirolidon ile kaplanmış toksik olmayan kolloidal silika parçacıkları kullanılarak hazırlanan, önceden ayarlanmış bir süreksiz yoğunluk gradyanı içeren bir tüp ile başlayın.

Degrade, yukarıdan aşağıya artan yoğunluk sırasına göre düzenlenmiş, örtüşmeyen üç katmandan oluşur.

Rastgele transpozon kaynaklı mutasyonlara sahip bakteri suşlarının havuzlanmış bir süspansiyonu olan bir bakteriyel transpozon mutant kütüphanesini ele alalım.

Bu mutasyonların bir alt kümesi, bakteri hücre duvarını çevreleyen bir polisakkarit tabakası olan kapsülü düzenleyen genleri bozar ve bu da değişen kapsül miktarlarına sahip suşlara neden olur.

Bakteri kitaplığını, arayüzü karıştırmadan çok yavaş bir şekilde gradyanın üstüne ekleyin.

Tüpü orta hızda santrifüjleyin.

Gradyan, bakterilerin kapsül miktarlarına bağlı olarak diferansiyel göçünü kolaylaştırır.

Hidratlı polisakkarit tabakaları nedeniyle daha az yoğun olan hiper kapsüllü suşlar, tepeye yakın lokalize olur.

Zayıf kapsüllenmiş suşlar ortada yerleşir ve kapsüllenmemiş, daha yoğun suşlar dibe göç eder.

Ayrılan bakteri suşları, sonraki analizler için hazırdır.

Hazırlanan hücrelerin 600 mikrolitresini tüpteki gradyanın üstüne dikkatlice ekleyin. Ardından