CRISPR Girişim Tabanlı Gen Susturma: Patojenik Leptospira'da Gen Fonksiyonunun Hedefli Baskılanması İçin Bir Teknik

0 views • 7:27 min • July 8th, 2025

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

CRISPR girişimi veya CRISPRi, gen fonksiyonunu baskılayan hedeflenen gen susturma için devre dışı bırakılmış bir Cas9 varyantı olan dCas9'u kullanır.

CRISPRi'yi gerçekleştirmek için, hem E. coli hem de Leptospira bakterilerine karşılık gelen replikasyon kökenlerini içeren ve her iki türde de yayılmayı kolaylaştıran bir mekik vektör yapısı kullanın.

Vektör ayrıca, hedef diziyi tanımak için dCas9 genine özgü bir dizi ve tek kılavuzlu bir RNA veya sgRNA içerir.

Başlangıçta, mekik vektörü donör E. coli'nin içinde bulunur. Konjugasyonu kolaylaştırmak için donör E. coli kültürünü konakçı Leptospira ile destekleyin. Konjugasyon, organizmalar arasında doğrudan hücreden hücreye temas kurarak Leptospira tarafından mekik plazmid alımını kolaylaştırır. Hücrenin içinde, plazmit yapısı sgRNA dizileri üretir ve dCas9 proteinlerini eksprese eder.

sgRNA, Leptospira DNA'sı üzerindeki tamamlayıcı hedef bölgesini tanıyan, protospacer bitişik motifine veya PAM'a yakın bir protospacer bölgesi içerir - konakçı DNA üzerinde kısa bir tanıma dizisi. Bu, dCas9'un, gen transkripsiyonu başlangıç bölgesine akış aşağısındaki hedef bölgedeki sgRNA ile bir kompleks oluşturmasına yardımcı olur.

sgRNA-dCas9 kompleksinden dCas9, DNA zincirlerini parçalamak için katalitik aktiviteye sahip değildir, bunun yerine, mRNA oluşturan RNA polimeraz enzim hareketi için fiziksel bir bariyer görevi görür ve sonunda gen transkripsiyonunu inhibe eder. Daha fazla test için gen susturulmuş Leptospira'yı kullanın.

Konjugasyon için, Leptospira hücreleri HAN ortamında 29 veya 37 santigrat derecede büyütülür. Konjugasyondan bir gün önce, donör E. coli hücreleri, Diaminopimelik asit - DAP ve spektinomisin ile desteklenmiş LB ortamında büyütülür.

Daha sonra, konjugasyon gününde, doymuş E. coli kültürlerini LB artı DAP'ta büyütün. Bir biyogüvenlik kapağının içinde, membran filtreyi cam tabanın üzerine yerleştirerek ve ardından 15 mL cam huni uygulayarak filtrasyon aparatını monte edin. Her iki parça da yaylı kelepçe ile bir arada tutulur. Ardından camı bir vakum pompasına bağlayın. Huniye 5 ml Leptospira kültürü ekleyin.

Daha sonra, ilgilenilen plazmidi içeren E. coli β2163 suşunu ekleyin. Hacim, kültürün optik yoğunluğuna göre değişecektir. 1:1 hücre oranını hedefliyoruz. Vakum pompasını çevirin. Şimdi, sıvılar zardan geçecek ve hücreler zarın üzerinde yoğunlaşacak.

Filtreyi alın ve bakteriyel tarafı yukarı bakacak şekilde EMJH plakası artı DAP'a yerleştirin. Plakaları 24 saat boyunca 29 santigrat derecede inkübe edin. Ardından, filtreleri plakalardan kurtarın ve 50 mL'lik konik tüpe yerleştirin.

Pipetleme yoluyla hücreleri filtreden geri kazanmak için 1 mL sıvı HAN ortamı kullanın. Kurtarılan hücreleri karanlık alan mikroskobu ile görselleştirin.

Bu aşamada E. coli ve Leptospires'in eşdeğer sayıları görülebilir. Bakterileri spektinomisin içeren iki HAN plakasına yaymak için 100 ila 200 mikrolitre kullanılır. Bu aşamada, DAP ihmal edilir ve E. coli büyümez. Plakalar 37 santigrat derece ve% 3 CO2'de inkübe edilir. Koloniler 8 ila 10 gün arasında belirgin olmalıdır.

09:12

Nanopartikül aracılı siRNA Gene susturmak yetişkin zebra balığı kalbinde

Related Videos

0 Views

11:05

CRISPR-Cas9-tabanlı rekabet deneyleri kullanarak genetik bağımlılıkları incelenmesi

Related Videos

0 Views

11:32

MACROPHAGE ve T Hücre Hatlarında CRISPR/Cas9 ve Hücre Sıralama tarafından Gen Knock-in

Related Videos

0 Views

08:25

Hedeflenen Srna faj aracılı teslim Gen İfade Knock Down için oluşturur E. E. coli

Related Videos

0 Views

11:28

Tasarımı, Ambalaj ve Yüksek Titre CRISPR Retro ve Lentivirüslerden teslimi Stereotaksik enjeksiyon yoluyla

Related Videos

0 Views

11:35

Memeli Hücrelerinde CRISPR / Cas9 aracılı Gen Knockout'larının Seçime Bağlı ve Bağımsız Üretimi

Related Videos

0 Views

11:27

Verimli üretim ve Model sistem Danio rerio kimlik CRISPR/Cas9 tarafından oluşturulan Gene altını gizleme

Related Videos

0 Views

09:16

Akut Miyeloid Lösemi Hücrelerinde CRISPR/Cas9 Ribonükleoprotein ile RUNX1 Intronic Susturucunun Transkripsiyonel Rolünün İncelendirin

Related Videos

0 Views

14:49

Leptospira'nın Patojenik Türlerinde Gen Susturma için CRISPR Parazitinin (CRISPRi) Uygulanması

Related Videos

0 Views

10:40

MicroRNA Küme Ağ Analizi için CRISPR Gen Düzenleme Aracı

Related Videos

0 Views

Last updated: 18 July 2026