Name: Radyosensitif ve radyodirençli genleri ortaya çıkarmak için genom çapında CRISPR ekranı (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-05-23T13:25:00.000+00:00
Duration: 8 min 32 s
Description: Keşfedin, akciğer kanserinde radyosensitif ve radyodirençli genleri belirlemek için genom çapında CRISPR/Cas9 tarama yöntemini. Bu protokol, radyasyon tedavisine direnç mekanizmalarını anlamaya yardımcı olur.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Barrangou, R., Marraffini, L. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas+systems%3A+Prokaryotes+upgrade+to+adaptive+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas systems: Prokaryotes upgrade to adaptive immunity.</a> Mol Cell. 54 (2), 234-244 (2014).</li>
<li>Joung, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-scale+CRISPR-Cas9+knockout+and+transcriptional+activation+screening%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout and transcriptional activation screening.</a> Nat Protoc. 12 (4), 828-863 (2017).</li>
<li>Sanjana, N. E., Shalem, O., Zhang, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+vectors+and+genome-wide+libraries+for+CRISPR+screening%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Improved vectors and genome-wide libraries for CRISPR screening.</a> Nat Methods. 11 (8), 783-784 (2014).</li>
<li>Arroyo, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Genome-wide+CRISPR+death+screen+identifies+genes+essential+for+oxidative+phosphorylation%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Metab%22%5BJournal%5D)">A Genome-wide CRISPR death screen identifies genes essential for oxidative phosphorylation.</a> Cell Metab. 24 (6), 875-885 (2016).</li>
<li>Sidik, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+genome-wide+CRISPR+screen+in+toxoplasma+identifies+essential+apicomplexan+genes%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">A genome-wide CRISPR screen in toxoplasma identifies essential apicomplexan genes.</a> Cell. 166 (6), 1423-1435 (2016).</li>
<li>Jing, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+CRISPR+activation+screening+in+senescent+cells+reveals+SOX5+as+a+driver+and+therapeutic+target+of+rejuvenation%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Stem+Cell%22%5BJournal%5D)">Genome-wide CRISPR activation screening in senescent cells reveals SOX5 as a driver and therapeutic target of rejuvenation.</a> Cell Stem Cell. 30 (11), 1452-1471 (2023).</li>
<li>Shifrut, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+CRISPR+screens+in+primary+human+t+cells+reveal+key+regulators+of+immune+function%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Genome-wide CRISPR screens in primary human t cells reveal key regulators of immune function.</a> Cell. 175 (7), 1958-1971 (2018).</li>
<li>Shalem, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-scale+CRISPR-Cas9+knockout+screening+in+human+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells.</a> Science. 343 (6166), 84-87 (2014).</li>
<li>Katti, A., Diaz, B. J., Caragine, C. M., Sanjana, N. E., Dow, L. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR+in+cancer+biology+and+therapy%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Cancer%22%5BJournal%5D)">CRISPR in cancer biology and therapy.</a> Nat Rev Cancer. 22 (5), 259-279 (2022).</li>
<li>Sasmal, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthetic+host-guest+assembly+in+cells+and+tissues%3A+Fast%2C+stable%2C+and+selective+bioorthogonal+imaging+via+molecular+recognition%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Synthetic host-guest assembly in cells and tissues: Fast, stable, and selective bioorthogonal imaging via molecular recognition.</a> Anal Chem. 90 (19), 11305-11314 (2018).</li>
<li>Roos, W. P., Thomas, A. D., Kaina, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+damage+and+the+balance+between+survival+and+death+in+cancer+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Cancer%22%5BJournal%5D)">DNA damage and the balance between survival and death in cancer biology.</a> Nat Rev Cancer. 16 (1), 20-33 (2016).</li>
<li>Huang, R., Zhou, P. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+damage+repair%3A+Historical+perspectives%2C+mechanistic+pathways+and+clinical+translation+for+targeted+cancer+therapy%5BTitle%5D)+AND+%22Signal+Transduct+Target+Ther%22%5BJournal%5D)">DNA damage repair: Historical perspectives, mechanistic pathways and clinical translation for targeted cancer therapy.</a> Signal Transduct Target Ther. 6 (1), 254(2021).</li>
<li>O'Connor, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeting+the+DNA+damage+response+in+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">Targeting the DNA damage response in cancer.</a> Mol Cell. 60 (4), 547-560 (2015).</li>
<li>Lord, C. J., Ashworth, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+DNA+damage+response+and+cancer+therapy%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">The DNA damage response and cancer therapy.</a> Nature. 481 (7381), 287-294 (2012).</li>
<li>Carusillo, A., Mussolino, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+Damage%3A+From+threat+to+treatment%5BTitle%5D)+AND+%22Cells%22%5BJournal%5D)">DNA Damage: From threat to treatment.</a> Cells. 9 (7), 1665(2020).</li>
<li>Li, X., Heyer, W. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Homologous+recombination+in+DNA+repair+and+DNA+damage+tolerance%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Res%22%5BJournal%5D)">Homologous recombination in DNA repair and DNA damage tolerance.</a> Cell Res. 18 (1), 99-113 (2008).</li>
<li>Chang, H., Pannunzio, N. R., Adachi, N., Lieber, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Non-homologous+DNA+end+joining+and+alternative+pathways+to+double-strand+break+repair%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Non-homologous DNA end joining and alternative pathways to double-strand break repair.</a> Nat Rev Mol Cell Biol. 18 (8), 495-506 (2017).</li>
<li>Andratschke, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((European+society+for+radiotherapy+and+oncology+and+European+organization+for+research+and+treatment+of+cancer+consensus+on+re-irradiation%3A+Definition%2C+reporting%2C+and+clinical+decision+making%5BTitle%5D)+AND+%22Lancet+Oncol%22%5BJournal%5D)">European society for radiotherapy and oncology and European organization for research and treatment of cancer consensus on re-irradiation: Definition, reporting, and clinical decision making.</a> Lancet Oncol. 23 (10), e469-e478 (2022).</li>
<li>Olivares-Urbano, M. A., Grinan-Lison, C., Marchal, J. A., Nunez, M. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CSC+radioresistance%3A+A+therapeutic+challenge+to+improve+radiotherapy+effectiveness+in+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cells%22%5BJournal%5D)">CSC radioresistance: A therapeutic challenge to improve radiotherapy effectiveness in cancer.</a> Cells. 9 (7), 1651(2020).</li>
<li>Schaue, D., McBride, W. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Opportunities+and+challenges+of+radiotherapy+for+treating+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Clin+Oncol%22%5BJournal%5D)">Opportunities and challenges of radiotherapy for treating cancer.</a> Nat Rev Clin Oncol. 12 (9), 527-540 (2015).</li>
<li>Allen, C., Her, S., Jaffray, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Radiotherapy+for+cancer%3A+Present+and+future%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Drug+Deliv+Rev%22%5BJournal%5D)">Radiotherapy for cancer: Present and future.</a> Adv Drug Deliv Rev. 109, 1-2 (2017).</li>
<li>Xue, C., Greene, E. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+repair+pathway+choices+in+CRISPR-Cas9-Mediated+genome+editing%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">DNA repair pathway choices in CRISPR-Cas9-Mediated genome editing.</a> Trends Genet. 37 (7), 639-656 (2021).</li>
<li>Tzelepis, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+CRISPR+dropout+screen+identifies+genetic+vulnerabilities+and+therapeutic+targets+in+acute+myeloid+leukemia%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">A CRISPR dropout screen identifies genetic vulnerabilities and therapeutic targets in acute myeloid leukemia.</a> Cell Rep. 17 (4), 1193-1205 (2016).</li>
<li>Rottner, A. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+genome-wide+CRISPR+screen+identifies+CALCOCO2+as+a+regulator+of+beta+cell+function+influencing+type+2+diabetes+risk%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">A genome-wide CRISPR screen identifies CALCOCO2 as a regulator of beta cell function influencing type 2 diabetes risk.</a> Nat Genet. 55 (1), 54-65 (2023).</li>
<li>Chen, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas9+for+cancer+therapy%3A+Opportunities+and+challenges%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Lett%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas9 for cancer therapy: Opportunities and challenges.</a> Cancer Lett. 447, 48-55 (2019).</li>
<li>Gupta, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas9+system%3A+A+new-fangled+dawn+in+gene+editing%5BTitle%5D)+AND+%22Life+Sci%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas9 system: A new-fangled dawn in gene editing.</a> Life Sci. 232, 116636(2019).</li>
<li>Li, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+CRISPR+screen+identifies+host+dependency+factors+for+influenza+A+virus+infection%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Genome-wide CRISPR screen identifies host dependency factors for influenza A virus infection.</a> Nat Commun. 11 (1), 164(2020).</li>
<li>Hung, K. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeted+profiling+of+human+extrachromosomal+DNA+by+CRISPR-CATCH%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Targeted profiling of human extrachromosomal DNA by CRISPR-CATCH.</a> Nat Genet. 54 (11), 1746-1754 (2022).</li>
<li>Bhattacharya, D., Van Meir, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+genotyping+method+to+detect+small+CRISPR-Cas9+induced+indels+by+agarose+gel+electrophoresis%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">A simple genotyping method to detect small CRISPR-Cas9 induced indels by agarose gel electrophoresis.</a> Sci Rep. 9 (1), 4437(2019).</li>
<li>Razavi, Z., Soltani, M., Souri, M., Van Wijnen, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR+innovations+in+tissue+engineering+and+gene+editing%5BTitle%5D)+AND+%22Life+Sci%22%5BJournal%5D)">CRISPR innovations in tissue engineering and gene editing.</a> Life Sci. 358, 123120(2024).</li>
<li>Wang, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+genome-wide+CRISPR-based+screen+identifies+KAT7+as+a+driver+of+cellular+senescence%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">A genome-wide CRISPR-based screen identifies KAT7 as a driver of cellular senescence.</a> Sci Transl Med. 13 (575), eabd2655(2021).</li>
<li>Xu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Engineered+miniature+CRISPR-Cas+system+for+mammalian+genome+regulation+and+editing%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">Engineered miniature CRISPR-Cas system for mammalian genome regulation and editing.</a> Mol Cell. 81 (20), 4333-4345 (2021).</li>
<li>Huang, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((FACS-based+genome-wide+CRISPR+screens+define+key+regulators+of+DNA+damage+signaling+pathways%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">FACS-based genome-wide CRISPR screens define key regulators of DNA damage signaling pathways.</a> Mol Cell. 83 (15), 2810-2828 (2023).</li>
<li>Feng, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+CRISPR+screen+identifies+synthetic+lethality+between+DOCK1+inhibition+and+metformin+in+liver+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Protein+Cell%22%5BJournal%5D)">Genome-wide CRISPR screen identifies synthetic lethality between DOCK1 inhibition and metformin in liver cancer.</a> Protein Cell. 13 (11), 825-841 (2022).</li>
<li>Saurat, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+CRISPR+screen+identifies+neddylation+as+a+regulator+of+neuronal+aging+and+AD+neurodegeneration%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Stem+Cell%22%5BJournal%5D)">Genome-wide CRISPR screen identifies neddylation as a regulator of neuronal aging and AD neurodegeneration.</a> Cell Stem Cell. 31 (8), 1162-1174 (2024).</li>
<li>Du, Y., Liu, Y., Hu, J., Peng, X., Liu, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR%2FCas9+systems%3A+Delivery+technologies+and+biomedical+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Asian+J+Pharm+Sci%22%5BJournal%5D)">CRISPR/Cas9 systems: Delivery technologies and biomedical applications.</a> Asian J Pharm Sci. 18 (6), 100854(2023).</li>
<li>Shi, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+genome-wide+CRISPR+screen+identifies+WDFY3+as+a+regulator+of+macrophage+efferocytosis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">A genome-wide CRISPR screen identifies WDFY3 as a regulator of macrophage efferocytosis.</a> Nat Commun. 13 (1), 7929(2022).</li>
<li>Liu, N., Olson, E. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR+modeling+and+correction+of+cardiovascular+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Circ+Res%22%5BJournal%5D)">CRISPR modeling and correction of cardiovascular disease.</a> Circ Res. 130, (2022).</li>
<li>Feng, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+CRISPR+screens+using+isogenic+cells+reveal+vulnerabilities+conferred+by+loss+of+tumor+suppressors%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Adv%22%5BJournal%5D)">Genome-wide CRISPR screens using isogenic cells reveal vulnerabilities conferred by loss of tumor suppressors.</a> Sci Adv. 8 (19), 6638(2022).</li>
<li>Ghaemi, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas9+genome+editing+delivery+systems+for+targeted+cancer+therapy%5BTitle%5D)+AND+%22Life+Sci%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas9 genome editing delivery systems for targeted cancer therapy.</a> Life Sci. 267, 118969(2021).</li>
<li>Derry, W. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR%3A+Development+of+a+technology+and+its+applications%5BTitle%5D)+AND+%22FEBS+J%22%5BJournal%5D)">CRISPR: Development of a technology and its applications.</a> FEBS J. 288 (2), 358-359 (2021).</li>
<li>Sharma, G., Sharma, A. R., Bhattacharya, M., Lee, S. S., Chakraborty, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas9%3A+A+preclinical+and+clinical+perspective+for+the+treatment+of+human+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ther%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas9: A preclinical and clinical perspective for the treatment of human diseases.</a> Mol Ther. 29 (2), 571-586 (2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>150 mm hücre ve doku kültürü kabı</td><td>Wuxi NEST Biotechnology Co., Ltd.</td><td>715011</td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>35 mm hücre ve doku kültürü kabı</td><td>Wuxi NEST Biotechnology Co., Ltd.</td><td>706011</td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>A549 hücre hattı</td><td>ATCC</td> <td>-</td><td></td></tr> <tr><td>Hücre sayma kiti-8</td><td>Shanghai Beyotime Biotech Inc</td><td>C0041</td><td>Hücre canlılığı testi için</td></tr><tr><td>CO2 bağımsız ortam</td><td>PHCbi</td><td>MCO-50AIC</td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>Kontes 3 FL otomatik hücre sayacı</td><td>Themo Scientific</td><td>AMQAF2001</td><td>Hücre sayımı için</td></tr><tr><td>EDTA</td><td>Gibco 25200056</td><td></td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>Fetal sığır serumu</td><td>Gibco</td><td>10099141</td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>Floresan mikroskobu</td><td>LEICA</td><td>ebq 100-04</td><td>Floresan mikroskobu için</td></tr><tr><td>Genom çapında CRISPR lentiviral kütüphanesi</td><td>Shanghai OBiO Technology Co., Ltd.</td><td>H5070</td><td>Lentiviral enfeksiyon için</td></tr><tr><td>MiniAmp plus PCR</td><td>Themo Scientific</td><td>C37835</td><td>PCR amplifikasyonu için</td></tr><tr><td>NEST hücre kültürü plakaları, 12 kuyulu</td><td>Wuxi NEST Biotechnology Co., Ltd.</td><td>712002</td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>NEST hücre kültürü plakaları, 6 kuyulu</td><td>Wuxi NEST Biotechnology Co., Ltd.</td><td>703002</td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>NEST hücre kültürü plakaları, 96 kuyulu</td><td>Wuxi NEST Biotechnology Co., Ltd.</td><td>701001</td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>PBS</td><td>Gibco</td><td>C10010500BT</td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>PCR ileri astar (AATGGACTATCATATGCTTACCGTAACTTGAAAGTATTTCG)</td><td>Beijing AuGCT Biotech Co., Ltd.</td><td>-</td><td>PCR amplifikasyonu için</td></tr><tr><td>PCR ters astar (GATGTGCGCTCTGCCCACTGACGGGCA)</td><td>Beijing AuGCT Biotech Co., Ltd.</td><td>-</td><td>PCR amplifikasyonu için</td></tr><tr><td>Polybrene</td><td>Shanghai Beyotime Biotech Inc</td><td>C0351</td><td>Lentiviral enfeksiyon için</td></tr><tr><td>Puromycin</td><td>MCE</td><td>HY-K1057</td><td>Seletion sonrası lentiviral enfeksiyon için</td></tr><tr><td>RPMI 1640 hücre kültürü ortamı</td><td>Gibco</td><td>23400-021</td><td>Hücre kültürü</td></tr><tr><td>TIANGENamp genomik DNA kiti</td><td>Beijing TIANGEN Biotech Co.,Ltd.</td><td>DP304</td><td>Genomik DNA ekstraksiyonu için</td></tr><tr><td>X-ışını toz difraktometresi</td><td>PerkinElmer</td><td></td><td>Radyoterapi için</td></tr></tbody></table>

radyosensitif ve radyodirençli genleri ortaya çıkarmak için genom çapında crispr ekranı

Genome-Wide CRISPR Screen for Unveiling Radiosensitive and Radioresistant Genes

Önde gelen ölüm oranına sahip akciğer kanseri, oldukça agresif ve yaygın bir tıbbi hastalığı temsil eder. Tarama koşulu olarak radyasyon ile genom çapında bir CRISPR ekranı yürütmek için örnek olarak akciğer kanseri hücre hattı A549'u kullanarak, şematik iş akışı Şekil 1'de gösterilmektedir. İlk olarak, klon oluşumu ve CCK8 deneyleri yoluyla A549 hücrelerinin farklı radyasyon dozlarına duyarlılığını keşfedin (Şekil 2). Klonojenik tahlilde, koloni sayısı 2 Gy'de ...

Radyosensitif ve radyodirençli genleri ortaya çıkarmak için genom çapında CRISPR ekranı

The CRISPR-Cas9 system has been harnessed and repurposed into a powerful genome editing tool. By leveraging this technology, researchers can precisely ...

genome-wide-crispr-screen-for-unveiling-radiosensitive-radioresistant

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Kanser Araştırmaları

Bu videoda, genomu CRISPR-Cas9 kullanılarak modifiye edilen transgenik Drosophila sineklerini tanımlamak için bir tarama yöntemi açıklanmaktadır. CRISPR-Cas9, bilim insanlarının bir organizmanın genomunu manipüle etme biçiminde devrim yaratan güçlü bir genom düzenleme aracıdır. Örnek protokolde, bir transaktivasyon dizisinin eklenmesinin dalsız (bnl) genin ilk eksonunun yerini aldığı ve böylece bnl genine özgü bir sürücü hattı olan bnl-LexA'nın oluşturulduğu CRISPR tarafından üretilen...

Genomik Modifikasyonların Taranması: Drosophila'da CRISPR Tarafından Üretilen Mutantları Tanımlamak İçin Bir Yöntem

Floresan polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) jel elektroforezi kılcal çiftler burada tarif edilen genotipleme tekniği, nükleaz aracılı nakavt klonları yüksek verimli genotipleme için izin verir. Diğer Genotipleme teknikleri karşılaştığı sınırlamaları ortadan ve dizileme yöntemleri maliyet açısından daha etkilidir.

CRISPR genotipine bir Floresan PCR kılcal jel elektroforezi Tekniği / yüksek verimli bir Format Nakavt Mutants Cas9 aracılı

Somatik hücre dizilerini genetik olarak manipüle etme becerisindeki son gelişmeler, temel ve uygulamalı araştırmalar için büyük potansiyele sahiptir. Burada, CRISPR / Cas9'un ürettiği nakavt üretimi ve seçilebilir işaretlerin kullanılıp kullanılmadığı memeli hücre hatlarında tarama için iki yaklaşım sunuyoruz.

Memeli Hücrelerinde CRISPR / Cas9 aracılı Gen Knockout&#39;larının Seçime Bağlı ve Bağımsız Üretimi

CRISPR/sgRNA Kütüphane protein kodlayıcı genlerin sorguya için uygulanmıştır. Ancak, işlev bir CTCF sınır gen düzenlemesi içinde ortaya çıkarmak için bir sgRNA kitaplığı fizibilite keşfedilmemiş kalır. Burada, CTCF sınırları içinde HOX loci fonksiyon aydınlatmak için HOX loci belirli sgRNA Kütüphane açıklayın.

HOX Loci odaklı CRISPR/sgRNA Kütüphane eleme tanımlayan kritik CTCF sınırları

CRISPR-Cas9 teknolojisi, memeli lerin genomunu herhangi bir hücre tipinde tam olarak dizmek için etkili bir yöntem sağlar ve genom çapında genetik ekranlar gerçekleştirmek için yeni bir araç tır. Havuzlu genom genişliğindeCRISPR-Cas9 ekranlarının başarılı bir şekilde performans alabildikleri adımları tartışan ayrıntılı bir protokol burada verilmiştir.

Memeli Hücrelerinde Havuzlu CRISPR Tabanlı Genetik Ekranlar

Bu el yazması, hücre dışı reseptör-ligand etkileşimlerini tanımlamak için genom ölçeğinde hücre tabanlı tarama yaklaşımını açıklamaktadır.

Genom ÖlçeğiCRISPR/Cas9 Genetik Ekranlar Kullanılarak Hücre Yüzey Reseptör Tanımlama

Burada, immün yetmetik farelerin deri ve ağız boşluğundaki çeşitli genlerin işlevlerini aynı anda değerlendirmek için utero embriyonik lentiviral enjeksiyonlarda ultrason güdümlü ultrason güdümlü kullanarak hızlı ve doğrudan bir in vivo CRISPR / Cas9 tarama metodolojisini açıklıyoruz.

Fare Derisi ve Ağız Boşluğundaki Gen İşlevlerini Aynı Anda Değerlendirmek için Vivo CRISPR/Cas9 Taraması

CRISPR gibi teknolojilerin önündeki önemli bir engel, hayati genleri bozabilecek hedef dışı olaylardır. 'Dizileme ile Bölünme Etkilerinin İn Vitro Raporlaması için Döngüselleştirme' (CIRCLE-seq), istenmeyen bölünme bölgelerini belirlemek için tasarlanmış bir tekniktir. Bu yöntem, CRISPR-Cas9'un genom çapındaki aktivitesini yüksek hassasiyetle ve önyargısız olarak haritalandırır.

Hedef Dışı Gen Düzenlemenin Sorgulanması için CIRCLE-Seq

Makale, sağlıklı donör kimerik antijen reseptörü T hücrelerinde genom çapında bir CRISPR nakavt ekranını tamamlamak için tükenme için bir in vitro modelin uygulanması için bir protokolü açıklamaktadır.

Kimerik Antijen Reseptörü T Hücrelerinde İn Vitro Genom Çapında CRISPR Nakavt Taraması Gerçekleştirme

Burada, hematopoietik kök ve progenitör hücrelerin anormal proliferatif kapasitesi için çok önemli olan aday genleri tanımlamak için CRISPR / Cas9 teknolojisini Hücre Sayma Kiti-8 (CCK-8) testi ile entegre eden bir protokol sunuyoruz.

Hematopoetik Kök ve Progenitör Hücrelerin Anormal Büyüme ile İlgili Genlerinin CRISPR/Cas9 Teknolojisi ile Hücre Sayımı ile Birleştirilerek Değerlendirilmesi

Keşfedin, akciğer kanserinde radyosensitif ve radyodirençli genleri belirlemek için genom çapında CRISPR/Cas9 tarama yöntemini. Bu protokol, radyasyon tedavisine direnç mekanizmalarını anlamaya yardımcı olur.

Radyosensitif ve radyodirençli genleri ortaya çıkarmak için genom çapında CRISPR ekranı

Daha fazla video keşfet