Name: Spesifik Olmayan Doku Floresansını En Aza İndirmek için Spektral Konfokal Mikroskopi Kullanılarak Yüksek Pleks Görüntüleme (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-10-28T13:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 28 s
Description: Keşfedin: spektral konfokal mikroskopi ve heparin bloklama kullanarak IBEX iş akışını optimize edin. Eozinofil açısından zengin insan dokularında otofloresansı ve spesifik olmayan bağlanmayı baskılayarak yüksek pleksli uzaysal proteomik haritalama sağlayın.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<ol><li>Hagios, C., Lochter, A., Bissell, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tissue+architecture%3A+The+ultimate+regulator+of+epithelial+function%5BTitle%5D)+AND+%22Philosoph+Trans+Royal+Soc+B%3A+Biol+Sci%22%5BJournal%5D)">Tissue architecture: The ultimate regulator of epithelial function.</a> Philosoph Trans Royal Soc B: Biol Sci. 353 (1370), (1998).</li>
<li>Mincarelli, L., Lister, A., Lipscombe, J., Macaulay, I. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Defining+Cell+Identity+with+Single-Cell+Omics%5BTitle%5D)+AND+%22Proteomics%22%5BJournal%5D)">Defining Cell Identity with Single-Cell Omics.</a> Proteomics. 18 (18), (2018).</li>
<li>Macaulay, I. C., Voet, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single+Cell+Genomics%3A+Advances+and+Future+Perspectives%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Single Cell Genomics: Advances and Future Perspectives.</a> PLoS Genet. 10 (1), (2014).</li>
<li>de Vries, N. L., Mahfouz, A., Koning, F., de Miranda, N. F. C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unraveling+the+Complexity+of+the+Cancer+Microenvironment+With+Multidimensional+Genomic+and+Cytometric+Technologies%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Oncol%22%5BJournal%5D)">Unraveling the Complexity of the Cancer Microenvironment With Multidimensional Genomic and Cytometric Technologies.</a> Front Oncol. , 10(2020).</li>
<li>van Dam, S., Baars, M. J. D., Vercoulen, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplex+Tissue+Imaging%3A+Spatial+Revelations+in+the+Tumor+Microenvironment%5BTitle%5D)+AND+%22Cancers%22%5BJournal%5D)">Multiplex Tissue Imaging: Spatial Revelations in the Tumor Microenvironment.</a> Cancers. 14 (13), (2022).</li>
<li>Bressan, D., Battistoni, G., Hannon, G. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+dawn+of+spatial+omics%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">The dawn of spatial omics.</a> Science. 381 (6657), (2023).</li>
<li>Williams, C. G., Lee, H. J., Asatsuma, T., Vento-Tormo, R., Haque, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+introduction+to+spatial+transcriptomics+for+biomedical+research%5BTitle%5D)+AND+%22Gen+Med%22%5BJournal%5D)">An introduction to spatial transcriptomics for biomedical research.</a> Gen Med. 14 (1), (2022).</li>
<li>Ståhl, P. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualization+and+analysis+of+gene+expression+in+tissue+sections+by+spatial+transcriptomics%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics.</a> Science. 353 (6294), (2016).</li>
<li>Pascal, L. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Correlation+of+mRNA+and+protein+levels%3A+Cell+type-specific+gene+expression+of+cluster+designation+antigens+in+the+prostate%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genom%22%5BJournal%5D)">Correlation of mRNA and protein levels: Cell type-specific gene expression of cluster designation antigens in the prostate.</a> BMC Genom. 9, (2008).</li>
<li>Patel, S. S., Rodig, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Overview+of+Tissue+Imaging+Methods%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Overview of Tissue Imaging Methods.</a> Methods Mol Biol. 2055, (2020).</li>
<li>Ohno, M., Karagiannis, P., Taniguchi, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+expression+analyses+at+the+single+cell+level%5BTitle%5D)+AND+%22Molecules%22%5BJournal%5D)">Protein expression analyses at the single cell level.</a> Molecules. 19 (9), (2014).</li>
<li>Zimmermann, T., Marrison, J., Hogg, K., O’Toole, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clearing+up+the+signal%3A+Spectral+imaging+and+linear+unmixing+in+fluorescence+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Clearing up the signal: Spectral imaging and linear unmixing in fluorescence microscopy.</a> Methods Mol Biol. , 1075(2014).</li>
<li>Radtke, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((IBEX%3A+an+iterative+immunolabeling+and+chemical+bleaching+method+for+high-content+imaging+of+diverse+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">IBEX: an iterative immunolabeling and chemical bleaching method for high-content imaging of diverse tissues.</a> Nat Protoc. 17 (2), (2022).</li>
<li>Radtke, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((IBEX%3A+A+versatile+multiplex+optical+imaging+approach+for+deep+phenotyping+and+spatial+analysis+of+cells+in+complex+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Aca+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">IBEX: A versatile multiplex optical imaging approach for deep phenotyping and spatial analysis of cells in complex tissues.</a> Proc Natl Aca Sci U S A. 117 (52), (2020).</li>
<li>Kothurkar, A. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((%E2%80%99Iterative+Bleaching+Extends+Multiplexity%E2%80%99+facilitates+simultaneous+identification+of+all+major+retinal+cell+types%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">’Iterative Bleaching Extends Multiplexity’ facilitates simultaneous identification of all major retinal cell types.</a> J Cell Sci. 137 (23), (2024).</li>
<li>Cohn, D. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Delineating+spatial+cell-cell+interactions+in+the+solid+tumour+microenvironment+through+the+lens+of+highly+multiplexed+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Immunol%22%5BJournal%5D)">Delineating spatial cell-cell interactions in the solid tumour microenvironment through the lens of highly multiplexed imaging.</a> Front Immunol. 14, (2023).</li>
<li>Radtke, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((IBEX%3A+An+open+and+extensible+method+for+high+content+multiplex+imaging+of+diverse+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22arXiv%22%5BJournal%5D)">IBEX: An open and extensible method for high content multiplex imaging of diverse tissues.</a> arXiv. , (2021).</li>
<li>Radtke, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+IBEX+Knowledge-Base%3A+A+central+resource+for+multiplexed+imaging+techniques%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">The IBEX Knowledge-Base: A central resource for multiplexed imaging techniques.</a> PLoS Biol. 23 (3), e3003070(2025).</li>
<li>Croce, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Light+and+Autofluorescence%2C+Multitasking+Features+in+Living+Organisms%5BTitle%5D)+AND+%22Photochem%22%5BJournal%5D)">Light and Autofluorescence, Multitasking Features in Living Organisms.</a> Photochem. 1 (2), (2021).</li>
<li>Wizenty, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Autofluorescence%3A+A+potential+pitfall+in+immunofluorescence-based+inflammation+grading%5BTitle%5D)+AND+%22J+Immunol+Methods%22%5BJournal%5D)">Autofluorescence: A potential pitfall in immunofluorescence-based inflammation grading.</a> J Immunol Methods. 456, (2018).</li>
<li>Donaldson, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Immunofluorescence+Staining%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Immunofluorescence Staining.</a> Curr Protoc Cell Biol. 69 (1), 4.3.1-4.3.7 (2015).</li>
<li>Sicherre, E., Favier, A. L., Riccobono, D., Nikovics, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Non-specific+binding%2C+a+limitation+of+the+immunofluorescence+method+to+study+macrophages+in+situ%5BTitle%5D)+AND+%22Genes%22%5BJournal%5D)">Non-specific binding, a limitation of the immunofluorescence method to study macrophages in situ.</a> Genes. 12 (5), (2021).</li>
<li><a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Monique+Hartlen%C2%A0Histotechnology+Lab+Manual%22">Monique Hartlen Histotechnology Lab Manual</a>. , NSCC. (2022).</li>
<li>Stephen Peters Frozen Section Technique. , Pathology Innovations, LLC. 
 <a target="_blank" href="https://pathology-innovations.squarespace.com/frozen-section-technique">https://pathology-innovations.squarespace.com/frozen-section-technique</a> (2023).</li>
<li>Stringer, C., Wang, T., Michaelos, M., Pachitariu, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cellpose%3A+a+generalist+algorithm+for+cellular+segmentation%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Cellpose: a generalist algorithm for cellular segmentation.</a> Nat Methods. 18 (1), (2021).</li>
<li>Mayeno, A. N., Hamann, K. J., Gleich, G. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Granule-associated+flavin+adenine+dinucleotide+%28FAD%29+is+responsible+for+eosinophil+autofluorescence%5BTitle%5D)+AND+%22J+Leukocyte+Biol%22%5BJournal%5D)">Granule-associated flavin adenine dinucleotide (FAD) is responsible for eosinophil autofluorescence.</a> J Leukocyte Biol. 51 (2), (1992).</li>
<li>Jenvey, C. J., Stabel, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Autofluorescence+and+Nonspecific+Immunofluorescent+Labeling+in+Frozen+Bovine+Intestinal+Tissue+Sections%3A+Solutions+for+Multicolor+Immunofluorescence+Experiments%5BTitle%5D)+AND+%22J+Histochem+Cytochem%22%5BJournal%5D)">Autofluorescence and Nonspecific Immunofluorescent Labeling in Frozen Bovine Intestinal Tissue Sections: Solutions for Multicolor Immunofluorescence Experiments.</a> J Histochem Cytochem. 65 (9), (2017).</li>
<li>Vlaminck, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+importance+of+local+eosinophilia+in+the+surgical+outcome+of+chronic+rhinosinusitis%3A+A+3-year+prospective+observational+study%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Rhinol+Allergy%22%5BJournal%5D)">The importance of local eosinophilia in the surgical outcome of chronic rhinosinusitis: A 3-year prospective observational study.</a> Am J Rhinol Allergy. 28 (3), (2014).</li>
<li>Skinner, B. M., Johnson, E. E. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nuclear+morphologies%3A+their+diversity+and+functional+relevance%5BTitle%5D)+AND+%22Chromosoma%22%5BJournal%5D)">Nuclear morphologies: their diversity and functional relevance.</a> Chromosoma. 126 (2), (2017).</li>
<li>Duhamel, R. C., Johnson, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+nonfat+dry+milk+to+block+nonspecific+nuclear+and+membrane+staining+by+avidin+conjugates%5BTitle%5D)+AND+%22J+Histochem+Cytochem%22%5BJournal%5D)">Use of nonfat dry milk to block nonspecific nuclear and membrane staining by avidin conjugates.</a> J Histochem Cytochem. 33 (7), (1985).</li>
<li>Valnes, K., Brandtzaeg, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Selective+inhibition+of+nonspecific+eosinophil+staining+or+identification+of+eosinophilic+granulocytes+by+paired+counterstaining+in+immunofluorescence+studies%5BTitle%5D)+AND+%22J+Histochem+Cytochem%22%5BJournal%5D)">Selective inhibition of nonspecific eosinophil staining or identification of eosinophilic granulocytes by paired counterstaining in immunofluorescence studies.</a> J Histochem Cytochem. 29 (5), (1981).</li>
<li>Panchuk-Voloshina, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Alexa+dyes%2C+a+series+of+new+fluorescent+dyes+that+yield+exceptionally+bright%2C+photostable+conjugates%5BTitle%5D)+AND+%22J+Histochem+Cytochem%22%5BJournal%5D)">Alexa dyes, a series of new fluorescent dyes that yield exceptionally bright, photostable conjugates.</a> J Histochem Cytochem. 47 (9), (1999).</li>
<li>Bystrom, J., Amin, K., Bishop-Bailey, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysing+the+eosinophil+cationic+protein+-+a+clue+to+the+function+of+the+eosinophil+granulocyte%5BTitle%5D)+AND+%22Respiratory+Res%22%5BJournal%5D)">Analysing the eosinophil cationic protein - a clue to the function of the eosinophil granulocyte.</a> Respiratory Res. , 12(2011).</li>
<li>Rahman, A. H., Tordesillas, L., Berin, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Heparin+reduces+nonspecific+eosinophil+staining+artifacts+in+mass+cytometry+experiments%5BTitle%5D)+AND+%22Cyt+Part+A%22%5BJournal%5D)">Heparin reduces nonspecific eosinophil staining artifacts in mass cytometry experiments.</a> Cyt Part A. 89 (6), (2016).</li>
<li>Saitou, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tissue+intrinsic+fluorescence+spectra-based+digital+pathology+of+liver+fibrosis+by+marker-controlled+segmentation%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Med%22%5BJournal%5D)">Tissue intrinsic fluorescence spectra-based digital pathology of liver fibrosis by marker-controlled segmentation.</a> Front Med. 5 (DEC), (2018).</li>
<li>Acuña-Rodriguez, J. P., Mena-Vega, J. P., Argüello-Miranda, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live-cell+fluorescence+spectral+imaging+as+a+data+science+challenge%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+Rev%22%5BJournal%5D)">Live-cell fluorescence spectral imaging as a data science challenge.</a> Biophys Rev. 14 (2), (2022).</li>
<li>Constantinou, P., Dacosta, R. S., Wilson, B. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Extending+immunofluorescence+detection+limits+in+whole+paraffin-embedded+formalin+fixed+tissues+using+hyperspectral+confocal+fluorescence+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microscopy%22%5BJournal%5D)">Extending immunofluorescence detection limits in whole paraffin-embedded formalin fixed tissues using hyperspectral confocal fluorescence imaging.</a> J Microscopy. 234 (2), (2009).</li>
<li>Enninful, A., Baysoy, A., Fan, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unmixing+for+ultra-high-plex+fluorescence+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Comm%22%5BJournal%5D)">Unmixing for ultra-high-plex fluorescence imaging.</a> Nat Comm. 13 (1), (2022).</li>
<li>Chang, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+Mass+Cytometry%5BTitle%5D)+AND+%22Cyt+Part+A%22%5BJournal%5D)">Imaging Mass Cytometry.</a> Cyt Part A. 91 (2), (2017).</li>
<li>Angelo, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplexed+ion+beam+imaging+of+human+breast+tumors%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Med%22%5BJournal%5D)">Multiplexed ion beam imaging of human breast tumors.</a> Nat Med. 20 (4), (2014).</li>
<li>Baharlou, H., Canete, N. P., Cunningham, A. L., Harman, A. N., Patrick, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mass+Cytometry+Imaging+for+the+Study+of+Human+Diseases%E2%80%94Applications+and+Data+Analysis+Strategies%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Immunol%22%5BJournal%5D)">Mass Cytometry Imaging for the Study of Human Diseases—Applications and Data Analysis Strategies.</a> Front Immunol. 10, (2019).</li>
<li>Goltsev, Y., Nolan, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CODEX+multiplexed+tissue+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Immunol%22%5BJournal%5D)">CODEX multiplexed tissue imaging.</a> Nat Rev Immunol. 23 (10), 613-613 (2023).</li>
<li>Black, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CODEX+multiplexed+tissue+imaging+with+DNA-conjugated+antibodies%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">CODEX multiplexed tissue imaging with DNA-conjugated antibodies.</a> Nat Protoc. 16 (8), (2021).</li>
<li>Vorobjev, I. A., Kussanova, A., Barteneva, N. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+Spectral+Imaging+Cytometry%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Development of Spectral Imaging Cytometry.</a> Methods Mol Biol. 2635, (2023).</li>
<li>Hernandez, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplex+Immunofluorescence+Tyramide+Signal+Amplification+for+Immune+Cell+Profiling+of+Paraffin-Embedded+Tumor+Tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Mol+Biosci%22%5BJournal%5D)">Multiplex Immunofluorescence Tyramide Signal Amplification for Immune Cell Profiling of Paraffin-Embedded Tumor Tissues.</a> Front Mol Biosci. 8, (2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>2N sülfürik asit (H2SO4) çözeltisi</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>500 mL beğen</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>6-kuyu plakası</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>BCL-6 - Alexa Fluor 647</td><td>BD Biosciences</td><td>561525</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>BD Cytofix/Cytoperm Fiksasyon/Permeabilizasyon Kiti</td><td>BD Biosciences</td><td>554722</td><td></td></tr><tr><td>Tezgah üstü diseksiyon mikroskobu</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>Sığır Serum Albümini (BSA)</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>A4503</td><td></td></tr><tr><td>CD11c - Alexa Fluor 700</td><td>BD Biosciences</td><td>561352</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>CD138/Syndecan-1 - PE</td><td>BioLegend</td><td>356503</td><td>Sulandırma faktörü 1:200</td></tr><tr><td>CD20 - Alexa Fluor 488</td><td>Invitrogen</td><td>53020282</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>CD21 - Alexa Fluor 532</td><td>NovusBio</td><td>NBP2-60733AF532</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>CD23 - PE</td><td>BioLegend</td><td>338507</td><td>Sulandırma faktörü 1:200</td></tr><tr><td>CD3 - iFluor 594</td><td>AAT Bioquest</td><td>100320C0</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>CD31 - Alexa Fluor 700</td><td>BioLegend</td><td>303134</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>CD34 - iFluor 594</td><td>AAT Bioquest</td><td>103400C0</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>CD38 - Alexa Fluor 700</td><td>BioLegend</td><td>303523</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>CD4 - Alexa Fluor 647</td><td>BioLegend</td><td>300520</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>CD45 - Alexa Fluor 532</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>58045942</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>CD54/ICAM-1 - Alexa Fluor 647</td><td>BioLegend</td><td>353113</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>Krom Alum-Jelatin Yapıştırıcı</td><td>Yeni Gelen Tedarik</td><td>1033A</td><td></td></tr><tr><td>Kriyomod</td><td>Fisher Scientific&nbsp;</td><td>NC9511236</td><td>Ayrıca, daha büyük örnekler için Katalog No.50-465-347</td></tr><tr><td>DAPI kalibrasyon slaytı</td><td>Agar Scientific</td><td>AG2273</td><td></td></tr><tr><td>DAPI çözeltisi, 1 mg/mL</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>62248</td><td>Sulandırma faktörü 1:3000</td></tr><tr><td>E-cadherin/CD324 - Alexa Fluor 647</td><td>BioLegend</td><td>147307</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>EpCAM/CD326 - Alexa Fluor 594</td><td>BioLegend</td><td>324228</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>Eppendorf/falcon tüpleri</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>Fluoromount-G</td><td>SouthernBiotech</td><td>0100-01</td><td></td></tr><tr><td>Forseps</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>FoxP3 - eFluor 660</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>50577382</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>Buzlu uçlu mikroskop slaytları</td><td>Kimya Bilimi</td><td>GEW45-2575-W</td><td></td></tr><tr><td>GL7 - Alexa Fluor 488</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>53590282</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>Heparin sodyum tuzu</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>H3393</td><td>10KU</td></tr><tr><td>HLA-DR - PE</td><td>NovusBio</td><td>NB100-77855PE</td><td>Sulandırma faktörü 1:200</td></tr><tr><td>İnsan TruStain FcX (Fc Reseptör Bloke Edici Çözeltisi)</td><td>BioLegend</td><td>422302</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>Nem odası</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>Kapaklı buz kovası</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>IgD - Alexa Fluor 488</td><td>BioLegend</td><td>348215</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>IL4Ra/CD124 - PE</td><td>BioLegend</td><td>144803</td><td>Sulandırma faktörü 1:200</td></tr><tr><td>Imaris Dosya Dönüştürücü</td><td>OXFORD enstrümanları</td><td>Yok</td><td>Herhangi bir resim dosya formatını .ims formatına kapsa (https://imaris.oxinst.com/microscopy-imaging-software-free-trial#file-converter)</td></tr><tr><td>İzopentan (2-Metilbütan)</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>Ki-67 - Alexa Fluor 488</td><td>BD Biosciences</td><td>558616</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>Kimberly-Clark Profesyonel Kimtech Science Kimwipe Hassas Görev Silecekleri, 1 Katlı</td><td>Kimtech Bilimi</td><td>06-666</td><td></td></tr><tr><td>Büyük (yani 25 cm uzunluğunda) pensler</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>Sıvı Azot</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>Lityum borohidrit (LiBH4)</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>222356</td><td></td></tr><tr><td>MECA-79 - Alexa Fluor 488</td><td>Invitrogen</td><td>53603680</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>Mikroskop Slayt Kapağı Cam No.1 22x50 mm</td><td>Fisher Scientific&nbsp;</td><td>12-542A</td><td></td></tr><tr><td>Milli-Q su</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>MUC2 - Alexa Fluor 488</td><td>NovusBio</td><td>NB120-11197AF488</td><td>Sulandırma faktörü 1:100</td></tr><tr><td>Nunc Lab-Tek Odalı Kapak Cam</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>155380</td><td></td></tr><tr><td>PAP kalemi</td><td>abcam</td><td>AB2601</td><td></td></tr><tr><td>Fosfat tamponlu tuzlu (PBS) çözeltisi</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>Skalpel</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Laboratuvarda mevcut olan/kullanılan her şey</td></tr><tr><td>SimpleITK Imaris Uzantıları</td><td>Yok</td><td>Yok</td><td>Farklı turlardan görüntüleri hizalamak için kullanılan yazılım (https://github.com/niaid/imaris_extensions)</td></tr><tr><td>Sucrose</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>S0389</td><td></td></tr><tr><td>Tissue-Tek O.C.T. Bileşimi</td><td>Sakura Finetek USA</td><td>4583</td><td></td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>X100</td><td></td></tr><tr><td>Zeiss LSM 980</td><td>ZEISS Mikroskopisi</td><td>Yok</td><td>Bu çalışmada kullanılan görüntüleme sistemi</td></tr><tr><td>Zen Blue</td><td>ZEISS Mikroskopisi</td><td>Yok</td><td>Alım sonrası görüntü işleme için kullanılan yazılım</td></tr></tbody></table>

spesifik olmayan doku floresansını en aza İndirmek için spektral konfokal mikroskopi kullanılarak yüksek pleks görüntüleme

High-plex Imaging using Spectral Confocal Microscopy to Minimize Non-specific Tissue Fluorescence

Spesifik Olmayan Doku Floresansını En Aza İndirmek için Spektral Konfokal Mikroskopi Kullanılarak Yüksek Pleks Görüntüleme

Highly multiplexed imaging enables the study of functionally diverse cells and their niches within their native tissue environments. Iterative Bleaching ...

high-plex-imaging-using-spectral-confocal-microscopy-to-minimize-non

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

İmmünoloji ve Enfeksiyon

Biz daha iyi bir yaklaşım knock-in ve spektral kullanarak reseptör floresan protein etiketleme dahil yaklaşımların bir arada kullanılarak nikotin bağımlılığı mekanizmalarını anlamak için MSS nöron spesifik alt tiplerinin Subselüler bölgeler içinde nikotinik asetilkolin reseptör değişiklikleri nicel yeni bir teknik geliştirdik konfokal görüntüleme.

Kronik Nikotin İdaresi fareler Knock-in içinde floresan etiketli Nikotinik Reseptör Spektral Konfokal Görüntüleme

Hücreler içinde birden fazla floresan etiketli molekül türünü aynı anda görüntülemek için floresan fotoaktivasyon lokalizasyon mikroskobunun (FPALM) kullanımını gösteriyoruz. Açıklanan teknikler, tek hücreler içinde onlarca nanometrelik bir hassasiyetle binlerce ila yüz binlerce ayrı floresan etiketli proteinin lokalizasyonunu sağlar.

Floresan Fotoaktivasyon Lokalizasyon Mikroskobu ile Biyolojik Yapıların Eş Zamanlı Çok Renkli Görüntülenmesi

Organellerin ve diğer hücre altı yapıların dinamik davranışlarını in vivo olarak görüntülemek, fizyolojik ve hastalık durumlarındaki işlevlerine ışık tutabilir. Burada, iki organeli, sentrozomları ve mitokondriyi genetik olarak etiketlemek ve dinamiklerini geniş alan ve konfokal mikroskopi kullanarak canlı zebra balığı embriyolarında görüntülemek için yöntemler sunuyoruz.

Yaşayan Zebra balığı Embriyo Hücre alt yapıları görüntüleme

Amiloid birikimi farklı hastalıklar özelliğidir ve birçok farklı organları afflicts. Bu kağıt Işıksaçan konjuge oligothiophene floresan Floresans mikroskobu teknikleri ile birlikte boyama uygulaması açıklanır. Bu boyama yöntemi algılama ve klinik ve bilimsel kurulumları protein toplamları keşfi için güçlü bir araç temsil eder.

Amiloid doku Imaging ile Işıksaçan konjuge Oligothiophenes Hyperspectral tarafından Confocal mikroskobu ve floresan ömür boyu görüntüleme lekeli

Hedef reseptörleri hücre yüzeyinde bağlanan antikorlar uyum ve küme değişikliklerini görüşmek. Bu dinamik değişiklikler ilaç geliştirme hedef hücrelerdeki karakterize konusunda da etkileri vardır. Bu iletişim kuralı confocal mikroskobu ve görüntü korelasyon spektroskopisi ile hücre yüzeyinde kümeleme reseptör kapsamını ölçmek için ImageJ/FIJI kullanır.

Confocal mikroskobu ortaya hücre yüzey reseptör toplama görüntü korelasyon spektroskopisi ile

Spektral görüntüleme, birden fazla floresan sinyalin tek bir örnekte tanımlanması ve ayrılması için güvenilir bir çözüm haline gelmiştir ve ilgi sinyallerini arka plandan veya otofloresanstan kolayca ayırt edebilir. Uyarma-tarama hiperspektral görüntüleme aynı anda sinyal-gürültü oranını artırırken gerekli görüntü edinme süresini azaltarak bu tekniği geliştirir.

Floresan Sinyallerini Etkin Bir Şekilde Ayırt Etmek Için Uyarma-Tarama hiperspektral görüntüleme mikroskobu

Biz dondurulmuş dokularda multispektral görüntüleme gerçekleştirmek için hızlı bir boyama yöntemi açıklar.

Dondurulmuş Doku Kesitlerinin Multispektral Floresan Görüntülemesi için Hızlı Bir Yöntem

Burada açıklanan, immünofloresan mikroskobu ile beş veya daha fazla floresan parametreyi görüntülemek için kullanılabilecek bir yöntemdir. Bu görüntülerden tek hücrelerin çıkarılması ve doku bölümlerindeki hücre alt kümelerini tanımlayabilen akış sitometrisi benzeri geçit stratejileri yoluyla tek hücre analizi yapmak için bir analiz boru hattı ana hatlarıyla belirtilmiştir.

Histoflow Sitometri ile Yüksek Parametreli Histoloji Görüntülerinin Oluşturulması ve Analiz Edilmesi

Bu protokol, yüksek çözünürlüklü hücresel ve alt hücresel görüntüleme için çoklu dizi dedektörüyle entegre edilmiş lazer taramalı konfokal mikroskop sisteminin gelişmiş görüntüleme uygulamalarını ve paylaşılan kaynak yönetimini detaylandırır. Bu iş akışı, tek bir platform içinde konfokalden süper çözünürlükle (~120 nm) çok modal görüntülemeyi mümkün kılarak nano ölçekli görselleştirmeyi daha erişilebilir kılar.

Süper Çözünürlüklü Görüntüleme ve Paylaşılan Yönetim: Multiplex Algılama ile Konfokal Mikroskopi İçin Bir Protokol

Bu görüntülenmiştir deney canlı konfokal görüntüleme deneyleri için HIV floresan moleküler klon kullanan için bir rehber.

HIV ve Live Konfokal Mikroskop Floresan Klonlar kullanılarak HIV görselleştirme Hücre-hücre Transferi

Keşfedin: spektral konfokal mikroskopi ve heparin bloklama kullanarak IBEX iş akışını optimize edin. Eozinofil açısından zengin insan dokularında otofloresansı ve spesifik olmayan bağlanmayı baskılayarak yüksek pleksli uzaysal proteomik haritalama sağlayın.

Spesifik Olmayan Doku Floresansını En Aza İndirmek için Spektral Konfokal Mikroskopi Kullanılarak Yüksek Pleks Görüntüleme

Daha fazla video keşfet