Name: Erken Kanser Tespitinde Kişiselleştirilmiş Protein Korona Profilleme için Standartlaştırılmış SDS-PAGE İş Akışı (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-19T12:50:00.000+00:00
Duration: 10 min 2 s
Description: Keşfedin, pankreas kanseri erken teşhisi için kişiselleştirilmiş protein korona profilleme yöntemini. SDS-PAGE tabanlı bu standart protokol, tekrarlanabilir ve düşük maliyetli biyobelirteç tespiti sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Cai, R., Chen, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+crown+and+the+scepter%3A+Roles+of+the+protein+corona+in+nanomedicine%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Mater%22%5BJournal%5D)">The crown and the scepter: Roles of the protein corona in nanomedicine.</a> Adv Mater. 31 (45), 1805740(2019).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanotechnology+meets+oncology%3A+A+perspective+on+the+role+of+the+personalized+nanoparticle-protein+corona+in+the+development+of+technologies+for+pancreatic+cancer+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Nanotechnology meets oncology: A perspective on the role of the personalized nanoparticle-protein corona in the development of technologies for pancreatic cancer detection.</a> Int J Mol Sci. 23 (18), 10591(2022).</li>
<li>Lundqvist, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+evolution+of+the+protein+corona+around+nanoparticles%3A+A+test+study%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nano%22%5BJournal%5D)">The evolution of the protein corona around nanoparticles: A test study.</a> ACS Nano. 5 (9), 7503-7509 (2011).</li>
<li>Hajipour, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+protein+coronas%3A+A+%26%2334%3Bkey%26%2334%3B+factor+at+the+nanobiointerface%5BTitle%5D)+AND+%22Biomater+Sci%22%5BJournal%5D)">Personalized protein coronas: A &#34;key&#34; factor at the nanobiointerface.</a> Biomater Sci. 2 (9), 1210-1221 (2014).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+corona-enabled+serological+tests+for+early-stage+cancer+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Sens+Int%22%5BJournal%5D)">Protein corona-enabled serological tests for early-stage cancer detection.</a> Sens Int. 1, 100025(2020).</li>
<li>Caracciolo, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Size+and+charge+of+nanoparticles+following+incubation+with+human+plasma+of+healthy+and+pancreatic+cancer+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Colloids+Surf+B+Biointerfaces%22%5BJournal%5D)">Size and charge of nanoparticles following incubation with human plasma of healthy and pancreatic cancer patients.</a> Colloids Surf B Biointerfaces. 123, 673-678 (2014).</li>
<li>Barrán-Berdón, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Time+evolution+of+nanoparticle-protein+corona+in+human+plasma%3A+Relevance+for+targeted+drug+delivery%5BTitle%5D)+AND+%22Langmuir%22%5BJournal%5D)">Time evolution of nanoparticle-protein corona in human plasma: Relevance for targeted drug delivery.</a> Langmuir. 29 (21), 6485-6494 (2013).</li>
<li>Yu, Y., Luan, Y., Dai, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamic+process%2C+mechanisms%2C+influencing+factors%2C+and+study+methods+of+protein+corona+formation%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Biol+Macromol%22%5BJournal%5D)">Dynamic process, mechanisms, influencing factors, and study methods of protein corona formation.</a> Int J Biol Macromol. 205, 731-739 (2022).</li>
<li>Hadjidemetriou, M., Kostarelos, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+of+the+nanoparticle+corona%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Nanotechnol%22%5BJournal%5D)">Evolution of the nanoparticle corona.</a> Nat Nanotechnol. 12 (4), 288-290 (2017).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+protein+corona-enabled+blood+test+for+early+cancer+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Nanoscale%22%5BJournal%5D)">A protein corona-enabled blood test for early cancer detection.</a> Nanoscale. 9 (1), 349-354 (2017).</li>
<li>Pozzi, D., Caracciolo, G. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aPozzi%2C+D+%22Exploiting+differences+in+personal+nanoparticle+corona+profiles+for+cancer+diagnostics%22">Exploiting differences in personal nanoparticle corona profiles for cancer diagnostics</a>. , Taylor & Francis. 431-433 (2025).</li>
<li>Vence, M. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Potential+clinical+applications+of+the+personalized%2C+disease-specific+protein+corona+on+nanoparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Chim+Acta%22%5BJournal%5D)">Potential clinical applications of the personalized, disease-specific protein corona on nanoparticles.</a> Clin Chim Acta. 501, 102-111 (2020).</li>
<li>Di Domenico, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-biomolecular+corona%3A+A+new+approach+for+the+early+detection+of+non-small-cell+lung+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Physiol%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-biomolecular corona: A new approach for the early detection of non-small-cell lung cancer.</a> J Cell Physiol. 234 (6), 9378-9386 (2019).</li>
<li>Papi, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Exploitation+of+nanoparticle-protein+interactions+for+early+disease+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Phys+Lett%22%5BJournal%5D)">Exploitation of nanoparticle-protein interactions for early disease detection.</a> Appl Phys Lett. 114 (16), 163702(2019).</li>
<li>Di Santo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+corona+profile+of+graphene+oxide+allows+detection+of+glioblastoma+multiforme+using+a+simple+one-dimensional+gel+electrophoresis+technique%3A+A+proof-of-concept+study%5BTitle%5D)+AND+%22Biomater+Sci%22%5BJournal%5D)">Protein corona profile of graphene oxide allows detection of glioblastoma multiforme using a simple one-dimensional gel electrophoresis technique: A proof-of-concept study.</a> Biomater Sci. 9 (13), 4671-4678 (2021).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synergistic+analysis+of+protein+corona+and+haemoglobin+levels+detects+pancreatic+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cancers%22%5BJournal%5D)">Synergistic analysis of protein corona and haemoglobin levels detects pancreatic cancer.</a> Cancers. 13 (1), 93(2020).</li>
<li>Colapicchioni, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+liposome-protein+corona+in+the+blood+of+breast%2C+gastric+and+pancreatic+cancer+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Biochem+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Personalized liposome-protein corona in the blood of breast, gastric and pancreatic cancer patients.</a> Int J Biochem Cell Biol. 75, 180-187 (2016).</li>
<li>Di Santo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+graphene+oxide-protein+corona+in+the+human+plasma+of+pancreatic+cancer+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Bioeng+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Personalized graphene oxide-protein corona in the human plasma of pancreatic cancer patients.</a> Front Bioeng Biotechnol. 8, 491(2020).</li>
<li>Digiacomo, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+pancreatic+cancer+detection+through+personalized+protein+corona+of+gold+nanoparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Biointerphases%22%5BJournal%5D)">Efficient pancreatic cancer detection through personalized protein corona of gold nanoparticles.</a> Biointerphases. 16 (1), 011010(2021).</li>
<li>Caputo, D., Caracciolo, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-enabled+blood+tests+for+early+detection+of+pancreatic+ductal+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Lett%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-enabled blood tests for early detection of pancreatic ductal adenocarcinoma.</a> Cancer Lett. 470, 191-196 (2020).</li>
<li>Caracciolo, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Challenges+in+molecular+diagnostic+research+in+cancer+nanotechnology%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">Challenges in molecular diagnostic research in cancer nanotechnology.</a> Nano Today. 27, 6-10 (2019).</li>
<li>Ashkarran, A. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measurements+of+heterogeneity+in+proteomics+analysis+of+the+nanoparticle+protein+corona+across+core+facilities%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Measurements of heterogeneity in proteomics analysis of the nanoparticle protein corona across core facilities.</a> Nat Commun. 13 (1), 6610(2022).</li>
<li>Pederzoli, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+corona+and+nanoparticles%3A+How+can+we+investigate+on%5BTitle%5D)+AND+%22Wiley+Interdiscip+Rev+Nanomed+Nanobiotechnol%22%5BJournal%5D)">Protein corona and nanoparticles: How can we investigate on.</a> Wiley Interdiscip Rev Nanomed Nanobiotechnol. 9 (6), e1467(2017).</li>
<li>Otoo, J. A., Schlappi, T. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((REASSURED+multiplex+diagnostics%3A+A+critical+review+and+forecast%5BTitle%5D)+AND+%22Biosensors%22%5BJournal%5D)">REASSURED multiplex diagnostics: A critical review and forecast.</a> Biosensors. 12 (2), 124(2022).</li>
<li>Papi, M., Caracciolo, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Principal+component+analysis+of+personalized+biomolecular+corona+data+for+early+disease+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">Principal component analysis of personalized biomolecular corona data for early disease detection.</a> Nano Today. 21, 14-17 (2018).</li>
<li>Giulimondi, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reproducibility+of+biomolecular+corona+experiments%3A+A+primer+for+reliable+results%5BTitle%5D)+AND+%22Part+Part+Syst+Charact%22%5BJournal%5D)">Reproducibility of biomolecular corona experiments: A primer for reliable results.</a> Part Part Syst Charact. 40 (2), 2200169(2023).</li>
<li>Renzi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structuring+lipid+nanoparticles%2C+DNA%2C+and+protein+corona+into+stealth+bionanoarchitectures+for+in+vivo+gene+delivery%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Structuring lipid nanoparticles, DNA, and protein corona into stealth bionanoarchitectures for in vivo gene delivery.</a> Nat Commun. 15 (1), 9119(2024).</li>
<li>Van Dorpe, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrating+automated+liquid+handling+in+the+separation+workflow+of+extracellular+vesicles+enhances+specificity+and+reproducibility%5BTitle%5D)+AND+%22J+Nanobiotechnology%22%5BJournal%5D)">Integrating automated liquid handling in the separation workflow of extracellular vesicles enhances specificity and reproducibility.</a> J Nanobiotechnology. 21 (1), 157(2023).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+influence+of+protein+corona+on+graphene+oxide%3A+Implications+for+biomedical+theranostics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Nanobiotechnology%22%5BJournal%5D)">The influence of protein corona on graphene oxide: Implications for biomedical theranostics.</a> J Nanobiotechnology. 21 (1), 267(2023).</li>
<li>Jiříčková, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthesis+and+applications+of+graphene+oxide%5BTitle%5D)+AND+%22Materials%22%5BJournal%5D)">Synthesis and applications of graphene oxide.</a> Materials. 15 (3), 920(2022).</li>
<li>Saorin, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+redefined+protocol+for+protein+corona+analysis+on+graphene+oxide%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nanosci+Au%22%5BJournal%5D)">A redefined protocol for protein corona analysis on graphene oxide.</a> ACS Nanosci Au. , (2025).</li>
<li>Digiacomo, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-protein+corona+enhances+accuracy+of+Ca-19.9-based+pancreatic+cancer+classification%5BTitle%5D)+AND+%22Nanoscale%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-protein corona enhances accuracy of Ca-19.9-based pancreatic cancer classification.</a> Nanoscale. 17 (12), 7066-7075 (2025).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improving+the+accuracy+of+pancreatic+cancer+clinical+staging+by+exploitation+of+nanoparticle-blood+interactions%3A+A+pilot+study%5BTitle%5D)+AND+%22Pancreatology%22%5BJournal%5D)">Improving the accuracy of pancreatic cancer clinical staging by exploitation of nanoparticle-blood interactions: A pilot study.</a> Pancreatology. 18 (6), 661-665 (2018).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+decade+of+the+liposome-protein+corona%3A+Lessons+learned+and+future+breakthroughs+in+theranostics%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">A decade of the liposome-protein corona: Lessons learned and future breakthroughs in theranostics.</a> Nano Today. 47, 101657(2022).</li>
<li>Wu, S. Y., An, S. S. A., Hulme, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Current+applications+of+graphene+oxide+in+nanomedicine%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Nanomedicine%22%5BJournal%5D)">Current applications of graphene oxide in nanomedicine.</a> Int J Nanomedicine. 10 Suppl 1, 9-24 (2015).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplexed+detection+of+pancreatic+cancer+by+combining+a+nanoparticle-enabled+blood+test+and+plasma+levels+of+acute-phase+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Cancers%22%5BJournal%5D)">Multiplexed detection of pancreatic cancer by combining a nanoparticle-enabled blood test and plasma levels of acute-phase proteins.</a> Cancers. 14 (19), 4658(2022).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>1.5ML Protein LoBind TÜPÜ</td><td>Eppendorf</td><td>22431081</td><td></td></tr><tr><td>10x Tris/Glisin/SDS</td><td>Biorad</td><td>1610732</td><td></td></tr><tr><td>Santrifüj</td><td>Labortechnik</td><td>Z 216 MK Hermle</td><td>18.620 RCF'de 20 dakika boyunca 4 derece ve derecede kullanıldı; C</td></tr><tr><td>ChemiDoc görüntüleme sistemi</td><td>Bio-Rad</td><td>12003153</td><td>Jel görüntü elde etmek için kullanılır</td></tr><tr><td>Kloroform</td><td>Sigma Aldrich</td><td>C2432-1L</td><td>DOTAP için çözücü</td></tr><tr><td>Corning 1-200 & mikro; L Universal Fit Toplu Paketlenmiş Pipet Uçları</td><td>Corning</td><td>4845</td><td></td></tr><tr><td>Criterion TGX Lekesiz Precast Jeller</td><td>Biorad</td><td>5678095</td><td></td></tr><tr><td>6 x 1L damıtılmış su</td><td>Thermo Fisher</td><td>15230001</td><td></td></tr><tr><td>DOTAP (1,2-dioleoyl-3-trimetilamoniyum-propan)</td><td>Avanti Polar Lipidleri</td><td>890890P-200mg</td><td>Katyonik lipozomların hazırlanmasında kullanılır; kloroformda çözünür, buharlaştırılır, hidratlanır ve ekstrüze edilir</td></tr><tr><td>Enduro 300V Güç Kaynağı&nbsp;</td><td>Labnet&nbsp;</td><td>E0303-230V</td><td></td></tr><tr><td>GloMax Discover Microplate Reader</td><td>Promega</td><td>GM3000</td><td></td></tr><tr><td>Altın nanopartiküller (sitratla stabilize edilmiş)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>742031-25ML</td><td>Nanomateryal olarak kullanılmıştır; Daha fazla arıtma olmadan kullanılmıştır</td></tr><tr><td>Gradient poliakrilamid jel (4&ntir; %20 TGX)</td><td>Bio-Rad</td><td>5678095</td><td>SDS&ndash için kullanılır; SAYFA</td></tr><tr><td>Grant Instrument&nbsp; Thermoshaker HC24N (24 x 1.5mL mikrotüpler)</td><td>Fisher bilimsel</td><td>PHMT-PSC24N</td><td></td></tr><tr><td>Grafen Oksit (GO) çözeltisi</td><td>Grafene</td><td>GO-4-1000</td><td>Nanomateryal olarak kullanılmıştır; 0,25 mg/mL'ye seyreltiltilip soniklenmiştir</td></tr><tr><td>İnsan Plazması (HP)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P9523-5ML</td><td>Nanopartikül kuluçkasında kullanılır</td></tr><tr><td>ImageLab Yazılımı</td><td>Bio-Rad. Sürüm 6.1.0.07</td><td>/</td><td>Jel görselini TIFF dosyası olarak dışa aktarmak için kullanılır</td></tr><tr><td>Laemmli yükleme tamponu 2x</td><td>Biorad</td><td>1610737</td><td>Pelletlerin yeniden süzülmesi için kullanılır</td></tr><tr><td>MATLAB</td><td>MathWorks. Versiyon R2022a</td><td>/</td><td>Görüntü işleme, veri analizi ve profil hesaplama için kullanılır</td></tr><tr><td>Mini-Ekstruder</td><td>Avanti Polar Lipidleri</td><td>610020</td><td>Lipozom hazırlamada kullanılır</td></tr><tr><td>NuPAGE Örnek İndirgetici Ajan (10X)</td><td>Termo Bilimsel</td><td>NP004</td><td></td></tr><tr><td>Fosfat Tuzlu Tamponu</td><td>Corning&nbsp;</td><td>21-031-cm</td><td>DOTAP-HP örnekleri için kullanılıyor</td></tr><tr><td>Pierce BCA Protein Analiz Seti, 1 Kit (1 L)</td><td>ThermoFisher</td><td>23225</td><td></td></tr><tr><td>Pipet uçları 0.5-10ul şeffaf</td><td>Axygen</td><td>T-300-STK</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN L P10L, 0.5-10 ve mikro; L, Metal Ejtör</td><td>Gilson</td><td>FA10002M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN P20, 2-20 & MIKRO; L, Metal Ejtör</td><td>Gilson</td><td>F144056M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN P200, 20-200 & MICRO; L, Metal Ejtör</td><td>Gilson</td><td>F144058M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAX otomatik pipetleme sistemi</td><td>Gilson</td><td>GSYS0021</td><td>Otomatik örnek işleme için kullanılır</td></tr><tr><td>Polikarbonat filtre (0.1 ve mikro; m)</td><td>Avanti Polar Lipidleri</td><td>610005-1EA</td><td>Lipozom ekstrüzyonu için kullanılır</td></tr><tr><td>Precision Plus Protein All Blue Prestained Protein Standartları</td><td>Biorad</td><td>1610373</td><td></td></tr><tr><td>Precision Plus Protein Lekesiz Standartları&nbsp;</td><td>Biorad</td><td>1610363EDU</td><td></td></tr><tr><td>Vibra hücresi sonikatörü VC505</td><td>Sonics and Materials Inc.</td><td>VC505</td><td></td></tr><tr><td>ZetaSizer</td><td>Malvern</td><td>ZS90</td><td>Dinamik ışık saçılması (DLS) ve mikroelektroforez (ME) ölçümleri için kullanılır</td></tr></tbody></table>

erken kanser tespitinde kişiselleştirilmiş protein korona profilleme için standartlaştırılmış sds-page İş akışı

Standardized SDS-PAGE Workflow for Personalized Protein Corona Profiling in Early Cancer Detection

Erken Kanser Tespitinde Kişiselleştirilmiş Protein Korona Profilleme için Standartlaştırılmış SDS-PAGE İş Akışı

The formation of a personalized protein corona (PC) on nanoparticles (NPs) upon exposure to biological fluids has emerged as a promising, minimally ...

standardized-sds-page-workflow-for-personalized-protein-corona

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Kanser Araştırmaları

Kolorektal kanser (CRC) uygulanabilir tek bir hücre üretmek için, daha sonra yüzey antijenleri (DotScan ÇHS mikroarray) tanıyan özelleştirilmiş antikor mikrodizinlerinde yakalanır ayrıştırılmasıyla için bir prosedür nitelendirdi. Mikroarray bağlı hücrelerin alt popülasyonlarda floresan boya ile monoklonal antikorlar kullanılarak floresans çoklama profilli olabilir.

Kolorektal Kanser Hücre Yüzey Protein Profil Antikor Mikroarray ve Floresans Multiplexing

RPPA floresan etiketli antikorlar kullanılarak, aynı anda sorgulanmak üzere nitroselüloz slaytlar basılı örnekleri yüzlerce, protein ekspresyonu sağlar. Bu teknik, şeffaf hücreli böbrek karsinomu olan ilaç tedavisi heterojenliğin etkisini araştırmak için uygulanmıştır.

Bireysel Renal Hücreli Kanserlerde içinde Protein Ekspresyonu Varyasyon kaynakları için Ters Faz Protein Diziler (RPPA) ve Kullanımı

Kanser hücresi proteomlarının derinlemesine analizleri, yeni ilaç hedeflerinin ve tanısal biyobelirteçlerin tanımlanmasını kolaylaştırır. Sıvı ve katı tümörlerden türetilen kanser hücresi alt popülasyonlarındaki (fosfo-) proteomların kantitatif analizi için deneysel bir iş akışı açıklıyoruz. Bu, hücresel zenginleştirme stratejilerinin kantitatif Super-SILAC tabanlı kütle spektrometresi ile birleştirilmesiyle elde edilir.

Sıvı ve Katı Tümörler Kaynaklanan Kanser hücre Proteomlar Kantitatif Kitle Spektrometrik Profil

Bu videonun amacı klinik ortamda nadir mutasyonları tespit etmek formalin ile fikse parafine gömülü (FFPE) referans standart hücre hatları ve dijital damlacık PCR (ddPCR) analizden otomatik DNA ekstraksiyon gerçekleştirmek için nasıl göstermektir. FFPE örneklerde mutasyonları tespit edilmesi FFPE örneklerinde ddPCR klinik faydasını ortaya koyar.

Dijital Damlacık PCR Formalin sabit Parafin gömülü Referans Standart Hücre Hatlarında BRAF V600E mutasyonları tespit etmek istihdam

Solid tümör dokularının kantitatif immün profillerini belirlemek ve immün-onkoloji biyomarker keşfi için klinik kohortlardan yararlanmak için RNA tabanlı bir yaklaşımın kullanımı moleküler ve enformatik protokollerle açıklanmıştır.

Solid Tümörlerin Prediktif İmmün Modellemesi

Burada, tümör mikro ortamını daha iyi karakterize etmek ve spesifik hücre popülasyonlarını tanımlamak için Spatial Omics teknolojileri için ilgi çekici bölgelere (ROI'ler) ince ayar yapmak için bir protokol açıklıyoruz. Proteomik testler için, otomatik özelleştirilmiş protokoller ROI seçimine rehberlik edebilirken, transkriptomik tahliller 50 μm kadar küçük ROI'ler kullanılarak ince ayarlanabilir.

Dokuda Protein ve RNA Ekspresyonunun Uzamsal Profillemesi: Sanal Mikrodiseksiyona İnce Ayar Yapmaya Bir Yaklaşım

Proteomik disregülasyon, yaygın olarak infiltre eden gliomların yayılmasında önemli bir rol oynar, ancak birkaç ilgili protein tanımlanmamıştır. Dijital mekansal işleme (DSP), infiltratif gliomların invazyonu ve göçüne katkıda bulunabilecek aday proteinlerin diferansiyel ekspresyonunu karakterize etmek için verimli, yüksek verimli bir yaklaşım sunar.

Yetişkin Tipi Yaygın Olarak Sızan Gliomada Mikroçevrenin Karakterizasyonu için Dijital Uzamsal Profilleme

Burada, formalinle sabitlenmiş, parafine gömülü doku kesitlerinde izole edilmiş ilgi alanlarını kullanarak kütle spektrometresi tabanlı bir proteomik yöntem oluşturuyoruz. Bu protokol, arşivlenmiş formalinle sabitlenmiş, parafine gömülü doku kesitlerindeki belirli doku alanlarından proteomu analiz etmek için kullanılır.

Seçilmiş Doku Bölgelerini Kullanan Kütle Spektrometresi Tabanlı Proteomikler için Kolaylaştırılmış Bir Yaklaşım

Burada, kimyasal problar ve kütle spektrometrisi kullanarak doğal hücrelerden ve dokulardan hastalığa özgü protein-protein etkileşimlerinin yakalanmasını ve tanımlanmasını sağlamak için bir protokol sunuyoruz. Ortaya çıkan etkileşim veri kümeleri, dinamik ağ işlev bozukluklarını ve hastalıkla bağlantılı yol değişikliklerini ortaya çıkarmak için özel bir web tabanlı platform aracılığıyla analiz edilir.

Hastalıkta İşlevsel Olmayan Protein-Protein Etkileşimlerinin Haritalanması

Bu protokol, erken metastatik hastalığı tespit etmek ve makrometazelere sonraki ilerlemeyi tahmin etmek için meme kanseri kemik metastazlarının sıçan modelinde manyetik rezonans görüntüleme (MRG) ve pozitron emisyon tomografisinden (PET/BT) elde edilen görüntüleme parametrelerinin bir kombinasyonunu kullanmak üzere bir makine öğrenme algoritması yetiştirmek üzere tasarlanmıştır.

Deneysel Bir Sıçan Modelinde Kemik Metastazlarının Erken Teşhisi İçin Makine Öğrenme Algoritmaları

Keşfedin, pankreas kanseri erken teşhisi için kişiselleştirilmiş protein korona profilleme yöntemini. SDS-PAGE tabanlı bu standart protokol, tekrarlanabilir ve düşük maliyetli biyobelirteç tespiti sağlar.

Erken Kanser Tespitinde Kişiselleştirilmiş Protein Korona Profilleme için Standartlaştırılmış SDS-PAGE İş Akışı

Daha fazla video keşfet