-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

AR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ar

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Developmental Biology
على نطاق واسع الضوئي نقل المجهر (Nanotomy) من صحي والمصاب الزرد الدماغ
على نطاق واسع الضوئي نقل المجهر (Nanotomy) من صحي والمصاب الزرد الدماغ
JoVE Journal
Developmental Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Developmental Biology
Large-scale Scanning Transmission Electron Microscopy (Nanotomy) of Healthy and Injured Zebrafish Brain

على نطاق واسع الضوئي نقل المجهر (Nanotomy) من صحي والمصاب الزرد الدماغ

Full Text
11,580 Views
10:09 min
May 25, 2016

DOI: 10.3791/53635-v

Jeroen Kuipers1, Ruby D. Kalicharan1, Anouk H. G. Wolters1, Tjakko J. van Ham*2, Ben N.G. Giepmans*1

1Cell Biology,UMC Groningen, 2Clinical Genetics,Erasmus MC Rotterdam

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article presents a universal method for large-scale 2D electron microscopy, or nanotomy, applied to the zebrafish larval brain. The technique is utilized to investigate brain health and the effects of non-invasive brain injury.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Electron Microscopy
  • Neurodegeneration

Background

  • Nanotomy provides nanoscale resolution for tissue-wide analysis.
  • It allows for unbiased data acquisition from macromolecules to tissues.
  • This method is applicable to various disease models, including zebrafish and human tissues.
  • Challenges include managing the overwhelming amount of data generated.

Purpose of Study

  • To define alterations in the zebrafish brain at macromolecular and tissue levels.
  • To explore insights into neurodegeneration and immune maintenance.
  • To facilitate open-access data sharing through nanotomy.org.

Methods Used

  • Fixation and dehydration of zebrafish larvae.
  • Embedding in epoxy resin and sectioning using an ultramicrotome.
  • Staining with toluidine blue and basic fuchsin for visualization.
  • Scanning electron microscopy for detailed imaging.

Main Results

  • Successful acquisition of high-resolution images of zebrafish brain structures.
  • Identification of anatomical features relevant to neurodegeneration.
  • Demonstration of the method's applicability to various biological samples.

Conclusions

  • Nanotomy is a powerful tool for studying brain structure and function.
  • The technique enhances understanding of neurodegenerative processes.
  • It offers a framework for future research in neuroscience.

Frequently Asked Questions

What is nanotomy?
Nanotomy is a method of large-scale 2D electron microscopy that provides nanoscale resolution for tissue-wide analysis.
How does nanotomy benefit neuroscience research?
It allows for unbiased data acquisition from macromolecules to tissues, facilitating insights into neurodegeneration and other conditions.
What are the main challenges of using nanotomy?
The primary challenge is managing the overwhelming amount of data generated during the imaging process.
Can nanotomy be applied to human tissues?
Yes, nanotomy can be applied to various biological samples, including human tissues.
Where can I access data obtained from nanotomy studies?
Data can be shared via nanotomy.org, promoting open-access research.
What types of samples can be analyzed using nanotomy?
Nanotomy can be used on zebrafish, mouse models, cell cultures, and human tissues.

المجهر الإلكتروني ثنائي الأبعاد واسع النطاق (EM) ، أو الفحص النانوي ، هو التطبيق على مستوى الأنسجة للدقة النانوية EM. نصف هنا طريقة عالمية لبضع النانو مطبقة للتحقيق في دماغ يرقات سمك الزرد في الصحة وعلى إصابة الدماغ غير الغازية.

الهدف العام من هذا المجهر الإلكتروني واسع النطاق أو تجربة النانو هو تحديد البدائل من المستوى الجزيئي إلى مستوى الأنسجة ، في حالة اليوم ، في دماغ الزرد المتدهور. يمكن أن يساعد Nanotomy في الإجابة على الأسئلة الرئيسية في علوم الحياة. على سبيل المثال ، في التنكس العصبي وفي أبحاث مرض السكري من النوع 1.

الميزة الرئيسية لبضع النانو هي أنه يتم الحصول على معلومات غير متحيزة ، بدءا من الجزيئات الكبيرة والعضيات والخلايا إلى الأنسجة. وهذا يسمح بالقياس الكمي ومشاركة البيانات بحرية الوصول عبر nanotomy.org. على الرغم من أن بضع النانو يوفر نظرة ثاقبة للصيانة المناعية والخلايا الدبقية الصغيرة في الدماغ التنكسي العصبي لسمك الزرد ، إلا أنه يتم تطبيقه أيضا على نماذج الأمراض الأخرى ، بما في ذلك زراعة الخلايا والفأر وحتى الأنسجة البشرية.

بشكل عام ، يكافح العلماء الجدد في هذه التقنية لأن كمية البيانات هائلة. يمكن أن يكون هذا أكثر بألف مرة مما تم الحصول عليه باستخدام EM التقليدي. بعد تثبيت يرقات الزرد وفقا لبروتوكول النص ، قم بقطع رؤوس اليرقات بشكل مستقيم إلى الدماغ الخلفي لتسهيل تغلغل الأوزميوم. ضع اليرقات في 1٪ رابع أكسيد الأوزميوم ، 1.5٪ فيروسيانيد البوتاسيوم ، في 0.1 مولار كاكوديلات الصوديوم واحتضانها على الجليد لمدة ساعتين.

ثم استخدم الماء المقطر المزدوج لشطف الأجنة ثلاث مرات لمدة خمس دقائق في كل مرة. قبل التضمين ، يجب تجفيف العينات في سلسلة من الإيثانول. لتضمين الأجنة ، بعد احتضانها في راتنجات الايبوكسي المخففة طوال الليل وفقا لبروتوكول النص ، قم بإزالة الراتنج المخفف واستخدم الراتنج النقي لاستبداله.

احتضن لمدة 30 دقيقة ، ثم استبدل الراتنج مرة ثانية واحتضنه لمدة 30 دقيقة أخرى. بعد تحديث الراتنج للمرة الثالثة ، احتضنه في درجة حرارة الغرفة لمدة ثلاث ساعات. ثم احتضن عند 58 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة.

أخيرا ، احتضن تحت ضغط منخفض في درجة حرارة الغرفة لمدة ساعة واحدة. بعد ذلك ، تحت مجهر التشريح ، استخدم إبرة أو عود أسنان لتوجيه الرؤوس في قوالب التضمين المسطحة المصنوعة من السيليكون المتوفرة تجاريا. ثم بلمرة راتنجات الايبوكسي عند 58 درجة مئوية بين عشية وضحاها.

عندما تصلب العينة بالكامل ، استخدم شفرات الحلاقة لتقليم الراتنج الزائد من كعب الروتين. للكشف عن الموضع الصحيح ، استخدم سكينا زجاجيا أو سكينا مسيطيا من الماس على ميكروتوم فائق الصغر لقطع أقسام اليرقات شبه الرقيقة للفوكسين الأزرق / الأساسي. انقل الأقسام شبه الرقيقة إلى شرائح مجهرية عن طريق التقاطها باستخدام ماصة باستور زجاجية تم إغلاق طرفها عن طريق صهرها في اللهب.

يجف على طبق ساخن حتى لا يتبقى الماء. بعد ذلك ، ضع العينات في 1٪ تولويدين أزرق في الماء واحتضان الأقسام على طبق ساخن لمدة 10 ثوان لتلطيخها. ثم ، بعد استخدام الماء لشطف الأقسام ، استخدم 05٪ فوكسين أساسي في 1٪ من رباعي الصوديوم لتلطيخ العينات لمدة 10 ثوان إضافية.

باستخدام مجهر ضوئي عادي من 10X إلى 40X ، افحص العينات. عند الوصول إلى الموقع أو الاتجاه الصحيح ، استخدم الهياكل التشريحية التي يمكن التعرف عليها بسهولة ، بما في ذلك الحفر الشمية أو العينين أو حدود المادة الرمادية والبيضاء ، لتحديد منطقة الدماغ محل الاهتمام أثناء التقسيم الرقيق للغاية وضبط زاوية التقسيم عند إمالة العينة. استمر في تقسيم كتلة راتنجات الايبوكسي بسكين ماسي لقطع مقاطع فائقة النحافة 70 نانومتر.

قم بتركيب كل قسم على فتحة واحدة L2 × 1 شكل شبكة نحاسية مشفرة للسماح بالاقتناء دون انقطاع بواسطة قضبان الشبكة. قد يبدو المليمتر المربع صغيرا. سوف يتناسب فقط مع الافتتاح.

بهذه الطريقة ، نمنع أشرطة الشبكة التي تحجب عينتنا. أدرك أنه سيتم تسجيل كل القطع الأثرية المقدمة في عينتنا مقارنة ب EM التقليدية. قارن العينات بالمعادن الثقيلة وفقا لبروتوكول النص وقم بتخزينها في صندوق شبكي. لتركيب العينة في المجهر الإلكتروني الماسح ، أو SEM ، ضع الشبكة من صندوق النقل مع القسم الموجود في حامل عينة الشبكة المتعددة وانقلها إلى غرفة SEM.

بعد محاذاة الكاشف وفقا لبروتوكول النص ، قم بتشعيع العينة مسبقا عن طريق التصغير بحيث تناسب المنطقة الكاملة المراد مسحها ضوئيا نافذة الصورة. بمجرد تغيير الفتحة إلى 120 ميكرومتر وإلغاء تركيز الصورة ، استخدم خيار مسح المنطقة المخفضة لجعل المنطقة الممسوحة ضوئيا ضيقة قدر الإمكان. بعد ذلك ، قم بتعيين معدل الإطارات لمسح الإطار ضوئيا في ثانية إلى ثانيتين تقريبا.

ثم قم بتكبير 100X على الأقل وامسح مساحة صغيرة لمدة 10 ثوان. إذا استمر السطوع في المنطقة في التغير ، فاستمر في التشعيع المسبق. عندما لا تغير هذه المنطقة السطوع مقارنة بمحيطها ، يكون التشعيع المسبق كافيا.

أثناء التركيز البؤري ، حدد المنطقة الأخف وزنا أو الميزة واضبط سرعة المسح الضوئي بحيث تكون التفاصيل مرئية. في برنامج المجهر ، اضبط السطوع والتباين من خلال مشاهدة الرسم البياني بعناية للحفاظ على جميع وحدات البكسل في النطاق الديناميكي. افعل الشيء نفسه مع المناطق والميزات الأكثر قتامة.

ارجع إلى المنطقة الساطعة وتحقق مرة أخرى بحيث يكون هناك بعض المساحة على جانبي الرسم البياني. بالنسبة للخطوات من الرابعة من ستة إلى أربعة ثمانية، يجب أن يتم ضبط السطوع والتباين بعناية فائقة بحيث تكون المنطقة بأكملها ضمن النطاق الديناميكي. قم بالتصغير بحيث تناسب المنطقة الكاملة المراد مسحها ضوئيا نافذة التخيل وابدأ برنامج اكتساب مساحة كبيرة.

ثم استخدم خيار المعالج لإعداد فسيفساء عن طريق تحديد منطقة من الشاشة. استخدم حجم بكسل من اثنين إلى خمسة نانومترات ، اعتمادا على التفاصيل الضرورية ، وقم بتعيين وقت مكوث يبلغ ثلاثة ميكروثانية لمسح المجهر الإلكتروني للإرسال ، أو STEM. اضغط على تحسين للتحقق من إعدادات المجهر وسيتم عرض الوقت اللازم.

ثم قم بتشغيل منشئ الفحص الخارجي مرة أخرى واضغط على متابعة. لتحليل بيانات STEM ، افتح برنامج عارض ملفات EM واسع النطاق وافتح الملف المسمى معلومات الفسيفساء ، والذي سيفتح ملفات tif المتجانبة. اختر الخيار Auto Stitch Whole Mosaic واختر المعلمات التالية: وضع التداخل يساوي النصف ، وعتبة الخياطة تساوي 0.90 ، وتقليل الضوضاء يساوي تلقائيا.

إذا تعذر استيفاء معايير الخياطة، فقم بالتكبير ووضع اللوحة يدويا في موضعها وانقر فوق متابعة كما هو.تصدير البيانات كملف HTML أو كملف TIF واحد. قم بتضمين حجم البكسل النهائي واسم الملف لتمكين القياسات لاحقا ، ثم قم بتحليل البيانات وفقا لبروتوكول النص. كما هو موضح هنا ، يكشف القطع النانوي لأقسام الدماغ الضابطة عن ميزات البنية التحتية النموذجية للأنسجة العصبية للدماغ الأمامي المنقاري بما في ذلك حزم الألياف الشمية والنوى العصبية والأجزاء الفرعية العصبية بما في ذلك نقاط الاشتباك العصبي.

هنا ، تشتمل الهياكل تحت الخلوية على أشكال وبؤر نووية مختلفة في أنواع الخلايا والعضيات المختلفة بما في ذلك جهاز جولجي ، والشبكة الإندوبلازمية ، والميتوكوندريا ، والحويصلات المشبكية ، وكثافات ما بعد التشابك العصبي. بشكل غير متوقع ، تكون نوى الخلايا المبطنة للبطين كثيفة الإلكترون للغاية مقارنة بالخلايا الأخرى المنتشرة بشكل جانبي في الدماغ. في الخلايا الدبقية الصغيرة ، تظهر النوى أيضا بؤر داكنة ، ربما غيرية الكروماتين ، غائبة في الخلايا الأخرى في الدماغ.

تكشف هذه الصورة من EM واسع النطاق لقسم إكليلي في يرقة الزرد التي تخضع للاستئصال العصبي عن الخلايا الدبقية الصغيرة البلعمة. تم العثور أيضا على السمات المميزة للخلايا الدبقية الصغيرة في خلايا الثدييات في هذه الخلايا ، بما في ذلك جهاز جولجي البارز والعديد من الشوائب مثل الجسيمات الحالة بمجرد إتقانها ، يمكن إجراء الاستحواذ في غضون يوم واحد ، حيث سيكلفك EM التقليدي أسبوعا على الأقل.

أثناء محاولة هذا الإجراء ، من المهم أن يلعب مشغل المجهر دورا مهما في الحصول على صور عالية الجودة. هذه ليست مجرد تقنية بضغطة زر. لقد طبقنا الآن بضع النانو ليس فقط على نموذج الزرد للتنكس العصبي ، ولكننا استخدمناه أيضا لوضع العلامات المناعية للخلايا ولدراسة أنسجة الذباب والأنسجة البشرية والمزيد.

هذه التقنية تمهد الطريق لأي باحث في أي مجال. يمكنهم إعادة النظر في مجموعات البيانات عبر الإنترنت على nanotomy.org. يمكنهم بعد ذلك استكشاف التعديلات المفترضة ، بدءا من النانومتر إلى مقياس المليمتر وجميع النماذج المدروسة.

بعد مشاهدة هذا الفيديو ، يجب أن يكون لديك فهم جيد لكيفية تطبيق بضع النانو على سؤال البحث الخاص بك والنظام الخلوي أو الأنسجي الذي تحقق فيه. لا تنس أن المحترف فقط هو الذي يجب أن يقوم بإعداد العينة بسبب الكواشف السامة والاعتبارات الأخلاقية ، ولكن يمكن للجميع تجربة موقع الويب nanotomy. org في المنزل.

Explore More Videos

علم الأحياء التنموي العدد 111 على نطاق واسع المجهر الإلكتروني والمسح الضوئي EM nanotomy الزرد EM الكمي المجهري المترابطة

Related Videos

يعيش تصوير الدماغ الجنينية اسماك الزرد بواسطة الميكروسكوب متحد البؤر

07:11

يعيش تصوير الدماغ الجنينية اسماك الزرد بواسطة الميكروسكوب متحد البؤر

Related Videos

19.4K Views

تشريح دماغ أسماك الزرد: تقنية علم الأعصاب للأسماك

03:54

تشريح دماغ أسماك الزرد: تقنية علم الأعصاب للأسماك

Related Videos

11.2K Views

التحقيق في إصابة دماغ يرقات الزرد باستخدام الفحص المجهري الإلكتروني لنقل المسح على نطاق واسع

03:22

التحقيق في إصابة دماغ يرقات الزرد باستخدام الفحص المجهري الإلكتروني لنقل المسح على نطاق واسع

Related Videos

704 Views

التصوير والإعمار 3D من الهياكل الدماغية في الجنينية اسماك الزرد

08:00

التصوير والإعمار 3D من الهياكل الدماغية في الجنينية اسماك الزرد

Related Videos

15.4K Views

طعنة الإصابة بالجروح من اسماك الزرد الكبار الدماغ الانتهائي: طريقة المعنية بالتحقيق في تكوين الخلايا العصبية والدماغ الفقارية التجديد

09:16

طعنة الإصابة بالجروح من اسماك الزرد الكبار الدماغ الانتهائي: طريقة المعنية بالتحقيق في تكوين الخلايا العصبية والدماغ الفقارية التجديد

Related Videos

16.2K Views

تصور الدماغ النامية في سمك الحمار الوحشي المعيشة باستخدام Brainbow والوقت الفاصل Confocal التصوير

07:28

تصور الدماغ النامية في سمك الحمار الوحشي المعيشة باستخدام Brainbow والوقت الفاصل Confocal التصوير

Related Videos

9.6K Views

في التصوير الحي لأنسجة الدماغ النشطة بالكامل في يرقات حمار وحشي مستيقظا والأحداث عن طريق إزالة الجمجمة والجلد

05:25

في التصوير الحي لأنسجة الدماغ النشطة بالكامل في يرقات حمار وحشي مستيقظا والأحداث عن طريق إزالة الجمجمة والجلد

Related Videos

5.8K Views

نموذج قابل للتطوير لدراسة آثار إصابة القوة الحادة في سمك الحمار الوحشي البالغ

08:13

نموذج قابل للتطوير لدراسة آثار إصابة القوة الحادة في سمك الحمار الوحشي البالغ

Related Videos

3.8K Views

نموذج إصابة جرح الطعنة للتكتوم البصري البالغ باستخدام الزرد و Medaka للتحليل المقارن للقدرة التجديدية

06:12

نموذج إصابة جرح الطعنة للتكتوم البصري البالغ باستخدام الزرد و Medaka للتحليل المقارن للقدرة التجديدية

Related Videos

2.3K Views

المجهر الفلوري ثلاثي الفوتون للأنسجة العميقة في دماغ الفأر وسمك الزرد السليم

08:26

المجهر الفلوري ثلاثي الفوتون للأنسجة العميقة في دماغ الفأر وسمك الزرد السليم

Related Videos

5.3K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code