Mapping mRNA Ends with RACE

RACE, or Rapid Amplification of cDNA Ends, is a PCR-based method used to find the full length of an mRNA transcript. It extends cDNA to either the 3' end or the 5' end, even when the full sequence is not already known. Because it focuses on one end of a transcript, it is also called one-sided or anchored PCR.

通常，对于新型 mRNA，只有其完整序列的一部分是已知的。mRNA 末端缺失的核苷酸序列可以使用一种称为 cDNA 末端快速扩增 （RACE） 的基于 PCR 的方法来确定。

在真核生物中，成熟的 mRNA 在两端具有独特的结构特征。在五引物末端，大多数具有甲基化鸟苷残基，通过五引物到五引物三磷酸键连接到 mRNA。这也称为五素数上限。在三素数端，大多数真核生物都有一个 20 到 250 个腺苷酸残基的尾巴，称为 poly（A） 尾巴。

现在，如果知道 mRNA 中任何位置的核苷酸序列，即使是一小段的核苷酸序列，也可以使用基因特异性引物和非特异性 oligo（dT） 引物扩增到其三引物末端的 poly（A） 尾部。RACE 技术的这个子集称为三引物 RACE，它...