本文描述了测试秀丽隐杆线虫(C. elegans)关联学习以及短期和长期关联记忆的方法。这些群体实验利用了线虫向挥发性气味物质趋化的能力,通过将食物与趋化吸引剂丁酮配对,使线虫形成正向关联。增加训练周期的次数可诱导形成长期记忆。
方法文章
本文描述了测试秀丽隐杆线虫(C. elegans)关联学习以及短期和长期关联记忆的方法。这些群体实验利用了线虫向挥发性气味物质趋化的能力,通过将食物与趋化吸引剂丁酮配对,使线虫形成正向关联。增加训练周期的次数可诱导形成长期记忆。
对经历和所学信息的记忆对于生物体做出有利于其生存的选择至关重要。C. elegans 通过特定神经元对食物和化学气味的感知来导航其环境1, 2,并能够将营养状态与化学气味3、温度4以及食物来源的致病性5相关联。
本文介绍了秀丽隐杆线虫(C. elegans)的关联学习以及短期和长期关联记忆的检测方法。我们对一种已有的厌恶性嗅觉学习范式6进行了改良,使其产生正向反应;该检测方法包括将约400条线虫饥饿处理后,在AWC神经元感知的挥发性化学吸引物丁酮存在的情况下进行喂养,丁酮浓度选择为仅引起较低趋化指数的水平(类似于Toroyama et al.7 的方法)。随后通过标准的群体趋化性检测1,可在训练后立即或数分钟至数小时后检测线虫对气味物质的趋化吸引力。
经过条件化处理后,野生型动物对丁酮的趋化性增加约0.6个趋化指数单位,即其“学习指数”。这种联合学习依赖于训练过程中食物与丁酮的同时存在。将食物与丁酮配对进行一次条件化处理(“集中训练”)可产生持续约2小时的短期联合记忆。而多次条件化处理并中间间隔休息期(“分散训练”)则可形成长期联合记忆(<40小时),该过程依赖于cAMP反应元件结合蛋白(CREB)6,CREB是一种在多种物种中均必需的长时程记忆相关的转录因子8。
本方案还包括用于快速、准确测定趋化性指数的图像分析方法。通过MatLab中的线虫计数软件,采集并分析趋化性实验平板上动物的高对比度图像。该软件采用形态学顶帽变换校正背景不均匀问题9。随后使用Otsu方法确定阈值,以区分线虫与背景10。软件自动去除极小颗粒,通过手动选择去除较大的非线虫区域(如平板边缘或琼脂打孔区域)。接着,软件通过忽略超过指定最大尺寸的区域,并计算剩余区域的中位尺寸,来估算单条线虫的大小。最后,将被识别为线虫占据的总面积除以单条线虫的估算尺寸,从而估计线虫数量。
我们发现,学习能力以及短期和长期记忆可以被区分开来,且这些过程与高等生物共享相似的关键分子。6,8 我们的检测方法能够快速验证在 C. elegans 中影响学习以及短期或长期记忆的新候选基因或分子,这些发现具有跨物种的相关性。
C. elegans 的关联学习与记忆检测需要提前准备。有关建议的准备时间表,请参见图 1A 所示的时间线。还需注意,物理扰动(如剧烈移液、离心、涡旋)可能会干扰线虫的记忆,而环境中过强的气味(如香水等)可能会干扰其初始趋化行为。
1. 实验动物的准备
2. 预处理饥饿
3. 短期联想记忆(密集)训练
短期关联记忆检测流程图见图1B。
4. 长时间关联记忆(间隔式)训练
长期关联记忆检测流程见图1C。
5. 趋化性实验
6. 通过图像分析进行线虫计数
7. 材料说明
8. 代表性结果:
野生型线虫对10%丁酮的典型初始趋化指数(CI)约为0.2(图4A)6。集中训练(1次)或间隔训练(7次)通常可在训练后即刻(0时)使趋化指数提高至0.7–0.8(图4A、C–D),从而获得约0.6的学习指数(LI = 训练后CI - 初始CI)6。集中或间隔训练所诱导的学习效应非常显著。当学习指数低于0.5时,通常表明初始趋化实验存在问题,且动物的初始CI值应达到0.3或更高。这种情况通常源于线虫在漂白后至实验开始前的培养过程中处于饥饿状态或培养板上密度过高,或在洗涤后于M9缓冲液中静置时间过长而开始饥饿;环境中的气味也可能导致初始CI升高。饥饿状态的线虫对10%丁酮的初始CI显著升高(图4B)6。我们发现,通过改善线虫的饲养与培养条件,通常可解决初始趋化实验中的问题。
这些实验中记忆的持续时间是指训练后趋化指数恢复到 naive 水平所需的时间,此时学习指数等于 0。在野生型动物中,短期关联记忆通常在集中训练后1 小时内开始下降,持续约 2 小时,并且不依赖于转录因子 CREB(图 4C)6。长期关联记忆通常在间隔训练后 16 小时才开始显著下降,可持续长达 40 小时,并且依赖于 CREB(图 4D)6。在某些情况下,长期关联记忆可能无法达到其完全潜力:(1)线虫在 30 分钟的条件训练期间没有获得足够的 OP50 E. coli;(2)在饥饿期间细菌残留在 M9 缓冲液中;或(3)线虫在实验过程中受到损伤(例如,线虫被移液枪吹打至离心管管壁上)。
对于每种基因型在每个时间点进行4次或更多次趋化性实验时,结果通常具有统计学显著性。每种基因型进行六次重复实验通常可获得非常显著的结果,且工作量仍可控制;然而,初学者可考虑从每种基因型仅进行三次重复开始。通常情况下,对于已熟悉这些学习与记忆实验的研究人员而言,同时处理2至3种基因型或实验条件较为适宜。
在趋化性实验平板上手动计数线虫非常耗时,可能在不同实验或实验人员之间引入变异性,并且在数据分析和解释过程中还可能产生偏差。通过图像分析进行线虫计数(第6节)可实现全实验室范围内的数据采集与分析标准化,平均而言,有经验的实验人员的数据分析时间可缩短至手动计数所需时间的五分之一。将基于人工计数计算的趋化性指数与使用Count_worms软件确定的结果进行比较时,我们发现平均误差为3.07(±1.19)%。
| 第1天 | |
| 时间 | 步骤 |
| 9:00 | 在M9缓冲液中饥饿处理1小时 开始初始趋化性实验 |
| 10:00 | 条件#1(含食物和丁酮的60 mm NGM平板),30分钟 结束初始趋化性实验 |
| 10:30 | 饥饿处理#1(60 mm NGM平板),30分钟 |
| 11:00 | 条件#2,30分钟 |
| 11:30 | 饥饿处理#2,30分钟 |
| 12:00 | 条件#3,30分钟 |
| 12:30 | 饥饿处理#3,30分钟 |
| 13:00 | 条件#4,30分钟 |
| 13:30 | 饥饿处理#4,30分钟 |
| 14:00 | 条件#5,30分钟 |
| 14:30 | 饥饿处理#5,30分钟 |
| 15:00 | 条件#6,30分钟 |
| 15:30 | 饥饿处理#6,30分钟 |
| 16:00 | 条件#7,30分钟 |
| 16:30 | 开始0小时趋化性实验 将剩余线虫转移至维持平板,存放16–40小时 |
| 17:30 | 结束0小时趋化性实验 |
| 第2天 | |
| 时间 | 步骤 |
| 8:30 | 开始16小时趋化性实验 |
| 9:30 | 结束16小时趋化性实验 |
表1. 长期关联记忆实验的代表性时间安排。在此示例中,实验于第1天上午9点开始,首先进行1小时的饥饿处理。随后交替进行30分钟的条件处理和饥饿处理,直至线虫完成七次训练。在训练开始前( naïve 状态)和训练结束时(0小时)分别进行趋化性实验。整个实验从开始到结束共耗时8.5小时。从第2天开始,在训练后16至40小时,对保存在暂存平板上的线虫进行丁酮趋化性测试。

图 1. 短期与长期关联记忆实验流程图。(A)建议的实验前准备时间线,直至进行实验的当天。(B)短期关联记忆实验:饥饿的线虫经过1小时的条件化处理后,立即通过趋化性实验检测1次学习(0分钟);或在条件化处理后转移至含食物的维持培养板上,分别在0.5、1或2小时后检测。(C)长期关联记忆实验:饥饿的动物在训练期间接受7轮条件化/饥饿训练,之后在训练结束16–40小时后检测学习或长期关联记忆(LTAM)。

图 2. 趋化性实验装置示意图。(A)趋化性实验平板示意图。借助直尺或其他引导工具,在平板上标记出起始点(底部)、丁酮和乙醇(左右)的位置。(B)在丁酮和乙醇的位置各加入 1 μL NaN3。(C)在平板左侧或右侧的对应位置分别加入 1 μL 的 10% 丁酮和 95% 乙醇。(D)将 200–400 条悬浮于 M9 缓冲液中的线虫加入平板的起始点。(E)将 KimWipe 纸捻成尖头状,用于吸收 M9 缓冲液并将线虫释放到实验平板上。

图3. 利用图像分析进行线虫计数。(A)“count_worms_v0.5.3”软件的图像粒子选择窗口示例。程序自动打开原始高对比度黑白图像(左侧),并弹出带有阈值处理后图像的窗口(中间)。可使用矩形工具高亮并剔除不需要的非线虫“颗粒”,例如检测板上的标记(1)、板边缘(2)或琼脂穿刺孔(3)。(B)Murphy实验室趋化性检测成像工作站的照片。趋化性检测板从底部打光,以生成分析所需的高对比度图像。(C)趋化性成像站中使用的定制成像平台的示意图。

图4. 典型的关联学习与记忆结果。(A)野生型线虫对10%丁酮的初始趋化指数在集中训练(1次)后增加。这种习得的关联需要食物(OP50大肠杆菌)与丁酮的配对。 coli)和丁酮。柱状图上方的数字代表“学习指数”(LI = CI训练后 - CI幼稚)。(B) 野生型线虫对10%丁酮的天然趋化性在饥饿16小时后显著增强。图A-D改编自Kauffman 等, 2010.6 (C)野生型短期关联记忆持续约2小时,且不依赖于转录因子CREB。(D)野生型长期关联记忆持续约40小时,且依赖于CREB。
补充信息
C. elegans 的嗅觉关联学习与记忆检测方法可区分集中式学习、间隔式学习、短期记忆和长期记忆等不同过程。这些检测依赖于线虫感知环境中食物和化学气味的能力,以及在两者之间建立正向关联的能力1,26。因此,该检测对起始动物群体的饥饿状态极为敏感,必须格外注意确保线虫在训练前后均处于充分喂养状态。单次集中训练可产生短期关联记忆。与其它生物类似,增加训练次数并采用间隔训练范式,对于在 C. elegans 中获得长期关联记忆至关重要6,8。或许可对该检测方法进行改进,以生成不同条件刺激与非条件刺激之间关联的长期记忆。
我们的关联学习与记忆检测方法可用于比较野生型与衰老或遗传突变动物的学习和记忆能力。例如,尽管在衰老的野生型线虫中,关联学习能力和长期关联记忆能力均会下降,但胰岛素信号减弱的动物随着年龄增长,其学习能力维持时间更长;而在热量限制的动物中,学习和记忆能力随年龄增长的维持时间更长。6 这些检测方法同样适用于对秀丽隐杆线虫(C. elegans)进行RNA干扰(RNAi)处理或药物干预。例如,用针对daf-2基因的RNAi处理线虫可改善其短期和长期关联记忆;相反,在间隔训练期间使用药物(分别为放线菌素D和环己酰亚胺)阻断基因转录和蛋白质合成,则会破坏长期记忆的形成。6
长期记忆是所有动物生存过程中至关重要的一个过程,而对经典条件反射记忆所涉及的分子机制似乎从线虫到哺乳动物都具有高度保守性6。利用这些嗅觉检测方法能够区分并检验关联学习、短期记忆和长期记忆的能力,使 C. elegans 成为深入研究记忆机制的优良模型系统,并可能为导致人类学习与记忆丧失的神经退行性过程提供重要见解。
我们感谢 W. Ryu 对我们初始成像装置的建议,Z. Gitai 提议使用 ImageJ13 来计数线虫,以及 J. Ashraf 在使用 Google SketchUp 方面提供的帮助。CTM 是生物医学科学 Pew 学者、McKnight 学者和 Keck 学者。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 叠氮化钠 | Fisher Scientific | S227 | 用蒸馏水配制 1 M 浓度溶液 |
| 190 证明乙醇 | Pharmco-AAPER | DSP-CT-18 | >95% 乙醇可能含有干扰趋化实验的杂质 |
| 2-丁酮 99+% | Acros Organics | 14967-0010 | |
| Basler IEEE-1394/FireWire 面扫描 CMOS 相机 | Edmund Scientific | NT56-683 | |
| InfiniMite 视频镜头 – Alpha Industrial | Edmund Scientific | NT56-202 | |
| Dolan-Jenner MI-150 光纤照明器 | Edmund Scientific | NT55-718 | |
| 8” x 8” 背光源 | Schott AG | A08927 | |
| 标准悬臂支架 | Edmund Scientific | NT54-120 | |
| 3/4” 悬臂支架接头适配器 | Edmund Scientific | NT54-124 | |
| 标准固定式 1/4-20 安装板 | Edmund Scientific | NT54-122 |
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