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Research Article
Joris Guyon1, Pierre-Olivier Strale2,3, Irati Romero-Garmendia4, Andreas Bikfalvi1, Vincent Studer*2, Thomas Daubon*4
1University Bordeaux, INSERM, LAMC, U1029, 33600, Pessac, France, 2Univ. Bordeaux, CNRS, Interdisciplinary Institute for Neuroscience, IINS, UMR 5297, Bordeaux, France, 3Alvéole, Bordeaux, France, 4University Bordeaux, CNRS, IBGC, UMR5095, 33000, Bordeaux, France
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
在这里,我们提出了一个易于使用的共培养检测,以分析胶质母细胞瘤(GBM)迁移的模式神经元。我们在FiJi软件中开发了一个宏,用于简单量化神经元上的GBM细胞迁移,并观察到神经元会改变GBM细胞的侵入能力。
胶质母细胞瘤(GBMs),四级恶性胶质瘤,是人类癌症中最致命的类型之一,因为它们具有攻击性特征。尽管这些肿瘤的遗传学取得了重大进展,但GBM细胞如何侵入健康的脑帕伦奇马尚不清楚。值得注意的是,已证明GBM细胞通过不同的途径侵入永久空间:本文的主要兴趣是沿白质区(WMTs)的路线。肿瘤细胞与围产神经细胞成分的相互作用特征不充分。在此,描述了一种评估神经元对GBM细胞入侵的影响的方法。本文通过分析神经元上GBM干细胞的迁移,提出了一种先进的体外共培养检测,模拟WMT入侵。使用开源和自由访问软件的自动跟踪程序对GBM细胞在神经元存在时的行为进行监控。这种方法对许多应用都很有用,特别是对于功能和机械学研究,以及分析药理制剂对阻止GBM细胞迁移对神经元的影响。
原发性恶性胶质瘤,包括GBM,是毁灭性的肿瘤,GBM患者的中等存活率为12至15个月。目前的治疗依赖于大肿瘤大规模切除和化疗加上放射治疗,这只会延长几个月的存活率。治疗失败与跨血脑屏障(BBB)的不良药物输送以及血管间空间、脑膜和WMT1沿线的侵入性生长密切相关。血管入侵,也称为血管共同选择,是一个经过充分研究的过程,分子机制开始被阐明:然而,沿WMT的GBM细胞入侵过程并不被很好地理解。肿瘤细胞沿着舍勒的次生结构2迁移到健康的大脑中。事实上,近一个世纪前,汉斯-约阿希姆·舍勒描述了GBM的侵入性路线,现在被称为腹膜饱腹症、腹膜饱腹症、亚皮亚传播和沿WMT(图1A)的入侵。
一些化疗因子及其受体,如频闪细胞衍生因子-1+(SDF1+)和C-X-C图案化学素受体4(CXCR4),但不是血管内皮生长因子(VEGF),似乎与WMT入侵3有关。最近,一个跨细胞的T1-SOX2轴已被证明是WMT入侵GBM细胞4的重要途径。作者描述了GBM干细胞如何侵入部分未髓化神经元的脑帕奇玛,这表明GBM细胞对骨髓护套的破坏。2019年,《自然》杂志发表了三篇文章,强调了电活动在胶质瘤发育中的作用。Monje 和合作者的开创性工作揭示了电活动在神经质-3分泌中的核心作用,这种分泌物促进胶质瘤的发展。
Winkler和合作者描述了GBM细胞(微管)之间的连接在侵入性步骤中至关重要,最近,GBM细胞和神经元之间通过新描述的神经胶质瘤突触相互作用。这些结构有利于对位于GBM细胞膜的α氨基-3-羟基-5-甲基-4-异氧丙烯酸(AMPA)受体进行谷氨酸刺激,从而促进肿瘤的发展和入侵。肿瘤细胞入侵是转移或远继发的传播过程中的一个中心过程,如GBM患者所观察到的。已确定在GBM入侵中很重要的几个因素,如血栓蓬丁-1,一种转化生长因子β(TGF+调节的基质细胞蛋白,或化学素受体CXCR3)7,8。
在这里,一个简化的生物仿生模型被描述为研究GBM入侵,其中神经元在层压素的轨道上成型,GBM细胞作为单细胞或球体(图1B)播种到它上面。这两个实验设置旨在回顾神经元的入侵,这是在GBM9,10,11观察到的。这种模型过去曾被开发成对齐的纳米纤维生物材料(核心壳电平),允许通过调节机械或化学特性12来研究细胞迁移。本文中描述的共同培养模型通过定义这个过程中涉及的新分子通路,可以更好地了解 GBM 细胞如何逃逸到神经元上。
知情的书面同意是从所有患者(根据当地道德委员会的规定,从挪威卑尔根的豪克兰医院)获得的。该协议遵循波尔多大学人类和动物研究伦理委员会的指导方针。怀孕的老鼠被安置和治疗在波尔多大学的动物设施。使用二氧化碳对E18次怀孕大鼠进行安乐死。所有动物程序均按照机构准则完成,并经当地道德委员会批准。所有商业产品均参照 材料表。
1. 准备图案幻灯片
2. 为共同培养准备神经元和GBM细胞
3. 活细胞成像
4. 图像分析
注:使用斐济,使用自制和用户友好的工具(可在此地址:https://github.com/Guyon-J/Coculture_Gliomas-Neurons/blob/main/README.md)半自动预处理或处理二维 (2D) 图像堆栈,该工具栈以 IJ1 宏语言(图 2A)编写。自动化工作流程和程序在 图 2B中进行总结。
与荧光GBM细胞共同培养的模式神经元按照协议部分的描述进行了培养,并进行了跟踪实验。GBM细胞在神经元上迁移时迅速改变其形状(图1B:面板6 和 视频1)。细胞沿着神经元扩展迁移,以随机运动(视频1)。荧光GBM细胞和非荧光神经元可以很容易地区分,这允许使用斐济宏跟踪细胞运动,如协议部分(图2)所述。斐济是一个开放的许可证软件,方便图像处理和分析。分析大量图像相对耗时的人工程序可以在宏中自动进行。图像通过拖放程序导入、处理和量化,生成使用投资回报率管理器提供的数据。
当存入Fiji.app |宏|工具集文件夹时,Gliomas-神经元工具可在更多工具菜单中找到,并显示多个图标(图 2A)。图像处理的工作流程,通过点击图标获得,在图2B(i-iv)中说明。细胞形状可以在神经网络上分析(图2B,i)。通过使用两个不同的图像过程,可以从细胞跟踪中获取多个参数(图 2B、ii)或多个单元格(图 2B,iii)。也可以分析神经元上球状GBM细胞的恢复速度(图2B,iv)。播种到神经元的细胞在神经元区域(图3A,i)后呈现出多发性突起的拉长形状,但当直接在层压素上培养时,具有圆形(图3A,ii)。在神经元上培养的细胞有效地改变了它们的形状,尽管它们在层压素(图3A,iii-v)上培养时没有拉长。在后期与神经元共同培养的细胞中,可以看到薄突起,有时连接两个细胞(视频1)。
将神经元上播种的GBM细胞的迁移能力与直接在层蛋白上播种的细胞进行比较。神经元上播种的细胞比单靠层蛋白具有更大的迁移能力(图3B,i,ii)。在这两种条件下都检测到P3细胞的随机运动,神经元上的P3细胞距离更大,如轨迹图(图3B,i,ii)所示。细胞运动性按平均方位移 (MSD) 进行定量估计,其日志表示具有线性函数14(图 3B,iii)。方向和平均速度也计算这两个条件(图3B,iv,v)。P3球体的细胞迁移也随之而来,检测神经元上的荧光区,并与单单层蛋白的迁移(图3C,i,ii和视频2)进行比较。神经元的模式有一半在500分钟后被GBM细胞覆盖在线性轮廓中;然而,球体不坚持层压素模式(图3D,iii和视频2)。

图1:在模式化神经元上迁移的胶质母细胞的实验设置。(A) 胶质母细胞通过语料库卡洛苏姆侵入反向半球的表示。(B) 实验设置。在第 1 步中,板面涂有防污 PEG 层。照片启动器在第 2 步中添加,覆盖整个涂层。在第 3 步中,通过显微镜的目标投射紫外线宽场图像,显微镜可局部激活光启动器分子。激活的光启动器局部切割PEG分子,并允许随后吸附层蛋白。在第5步中,神经元被播种并粘附在层压素阵列上。P3 (GFP/番茄核) 胶质母细胞然后沉积在神经元模式,图像被获取(步骤6)。缩写:PEG = 聚乙二醇;紫外线=紫外线:GFP=绿色荧光蛋白。请单击此处查看此图的较大版本。

图2:斐济工具演示和分析工作流程。(A) 当将宏添加到 Fiji.app 文件夹中时,称为Gliomas-神经元的工具在"更多工具"菜单中可用,|宏|工具集(左面板)。它由以下几个操作工具(右面板)组成。(B )网络工具:图像处理,用于以简化的表示方式绘制神经网络和胶质瘤细胞。ii.单细胞跟踪工具:图像处理,用于绘制和选择细胞运动区域,用于分析单细胞的位移。iii.跟踪工具:使用预安装的斐济跟踪插件的图像预处理步骤。iv.相对迁移工具:用于在手动选择的模式上确定相对单元格迁移的图像处理。某些参数可以通过左键单击工具按钮进行校准。缩写:CSE = 对比度拉伸增强;SED=索贝尔边缘探测器;F = 双重过滤;CM=转换为面膜:Sk=骨架化:EP = 消除颗粒;或(合并) = 选定投资回报率的联盟运营商;和=选定投资回报率的联合操作员。请单击此处查看此图的较大版本。

图3:对P3细胞或球体在图案神经元与层压素涂层的比较。(A) 在神经元或层压素上分离的P3 GFP/番茄核细胞的形状描述。在i.图案神经元或二。层压素涂层。比例杆 = 50μm. iii.模式化神经元或层压素的平均细胞面积。iv.形成因素是圆周与规范化区域与圆的区域的比率,提供细胞拉长和细胞分支的参数。v.纵横比是主轴与细胞小轴的比率。在iii、 iv和v 中,每个领域分析了 15 个单元格:4 个独立模式;数据表示为平均± S.E..M (B) 分离的 P3 细胞的跟踪分析。(i)图案神经元上的细胞图和(ii)层蛋白涂层上的细胞的一个代表性图表图。iii. P3细胞的MSD在神经元或层压素涂层上迁移。X/Y 值处于对数级。iv.方向性比率。v.平均细胞速度迁移。在iii、 iv和v 中,每个领域分析了 15 个单元格:4 个独立模式;数据表示为P3 GFP球体的平均±S.E..M(C)迁移分析。在(i)图案神经元或(ii)层蛋白涂层上 P3 球形的不同时间点的代表性图像。比例杆 =100μm. iii.以模式汇流为代表的球形迁移;4 个独立模式;数据表示为平均± S. e. .M 缩写: Gfp = 绿色荧光蛋白;S.E..M= 平均标准误差;MSD=平均方位移。请单击此处查看此图的较大版本。
视频1:神经元或层压素上的P3细胞记录超过8小时(每5分钟成像一次)。该视频显示P3单细胞迁移神经元(左)和层压素涂层(右)。细胞表示绿色荧光蛋白(GFP,绿色)和核番茄(红色)。酒吧 = 50μm.请点击这里下载此视频。
视频2:在神经元或层压素上的P3球体记录超过8小时(图像每5分钟)。该视频显示P3球形迁移在神经元(左)和层压素涂层(右)。细胞表示绿色荧光蛋白(GFP,绿色)。酒吧 = 100μm.请点击这里下载此视频。
作者宣称他们没有利益冲突。
在这里,我们提出了一个易于使用的共培养检测,以分析胶质母细胞瘤(GBM)迁移的模式神经元。我们在FiJi软件中开发了一个宏,用于简单量化神经元上的GBM细胞迁移,并观察到神经元会改变GBM细胞的侵入能力。
这项工作得到了ARC基金会2020年,联赛癌症(吉隆德委员会),ARTC,计划癌症2021年,INCA PLBIO的支持。阿尔韦奥勒得到国家雷彻奇(格兰特·拉贝克斯·布雷恩-10-LABX-43)的支持。乔里斯·古永是图卢兹大学医院(楚图卢兹)的奖学金获得者。
| (3-氨丙基)三乙氧基硅烷 | Sigma | 440140-100ML | 氨基可用于 mPEG-SVA |
| 96 孔圆底板 | 的生物偶联Sarstedt | 2582624 | 用于制备球状体 |
| Accutase | Gibco | A11105-01 | 储存在 -20 °;C(长期)或 4 °C(短期),球解离酶 |
| B27 | Gibco | 12587 | 在 -20 °C 下储存;C、使用前解冻 |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | Peprotech | 100-18B | 储存在 -20 °C;C、使用前解冻 |
| Countess 细胞计数室载玻片 | Invitrogen | C10283 | 用于细胞计数 |
| 盖玻片 | Marienfeld | 111580 | 细胞培养底物 |
| Dessicator 卡盒 | Sigma | Z363456-6EA | 用于减少(3-氨丙基)三乙氧基硅烷处理过程中的气沉 |
| DPBS 10x | Pan Biotech | P04-53-500 | 储存在 4>C |
| 斐济软件,MTrack2 宏观 | ImageJ | 用于分析 | |
| 图片 培养瓶 75 cm² | Falcon | 10497302 | |
| HBSS | Sigma | H8264-500ML | |
| 肝素钠 | Sigma | H3149-100KU | 储存在 4 °C |
| 层粘连蛋白 | 114956-81-9 | 促进神经元粘附 | |
| Leonardo 软件 | 加载设想的微模式 | ||
| MetaMorph 软件 | Molecular Devices LLC | NA | 显微镜自动化软件 |
| 甲基纤维素 | Sigma | M0512 | 用 NBM 稀释至 2% 终浓度 |
| Neurobasal 培养基 | Gibco | 21103-049 | 储存在 4 °C;C |
| 尼康 TiE (S Fluor, 20x/0.75 NA) | 配备电动载物台的倒置显微镜 | ||
| 青霉素 - 链霉素 | Gibco | 15140-122 | 储存在 4 &°g;C |
| PLPP | 肺泡 | PLPPclassic_1ml | 用于降解 PEG 刷的光引发剂 |
| 聚乙二醇)-琥珀酰亚胺戊酸酯 (mPEG-SVA) | Laysan Bio | VA-PEG-VA-5000-5g | 用作防污涂层 |
| PRIMO | 肺泡 | PRIMO1 | 基于数字微镜器件 (DMD) 的紫外线投影仪 |
| 台盼蓝 0.4% | ThermoFisher | T10282 | 用于细胞计数 |
| 胰蛋白酶-EDTA | Sigma | T4049-100ML | 用于分离贴壁细胞 |