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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
功能性定点荧光测定法是一种实时研究蛋白质结构域运动的方法。该技术在天然细胞中的应用修改现在允许检测和跟踪来自小鼠分离骨骼肌纤维中电压门控Ca2+ 通道的单电压传感器运动。
功能性定点荧光测定法一直是研究许多膜蛋白(包括电压门控离子通道)的结构-功能关系的首选技术。这种方法主要用于异源表达系统,以同时测量膜电流、通道活性的电表现和荧光测量,报告局部结构域重排。功能性定点荧光测量将电生理学、分子生物学、化学和荧光结合到一个广泛的技术中,允许分别通过荧光和电生理学研究实时结构重排和功能。通常,这种方法需要一个工程电压门控膜通道,其中包含可以通过硫醇反应性荧光染料测试的半胱氨酸。直到最近,用于蛋白质的定点荧光标记的硫醇反应化学仅在非洲爪蟾卵母细胞和细胞系中进行,将该方法的范围限制在原代不可兴奋细胞上。本报告描述了功能性定点荧光测定法在成人骨骼肌细胞中的适用性,以研究激发-收缩耦合的早期步骤,即肌纤维电去极化与肌肉收缩激活相关的过程。本协议描述了使用体内电穿孔将半胱氨酸工程的电压门控Ca2 +通道(CaV1.1)设计和转染到成年小鼠短指屈肌纤维中的方法,以及功能性定点荧光测量所需的后续步骤。这种方法可以适用于研究其他离子通道和蛋白质。使用哺乳动物肌肉的功能性定点荧光测定法与研究兴奋性的基本机制特别相关。
响应活细胞中已知电刺激而跟踪离子通道构象重排的能力是分子生理学有价值的信息来源1。电压门控离子通道是感知跨膜电压变化的膜蛋白,其功能也受电压变化的影响2。上个世纪电压钳技术的发展使生理学家能够实时研究电压门控离子通道响应膜去极化而携带的离子电流3。电压钳技术的使用对于理解可兴奋细胞(如神经元和肌肉)的电特性至关重要。在 1970 年代,电压钳优化允许检测电压门控钙 (Ca V) 和钠 (NaV) 通道4,5 中的门控电流(或电荷移动)。门控电流是非线性电容电流,由电压传感器的运动产生,以响应细胞膜6上的电场变化。门控电流被认为是分子重排的电表现形式,在离子通道打开之前或伴随7。虽然这些电流测量提供了有关通道功能的宝贵信息,但离子电流和门控电流都是电压门控通道7的分子间和分子内构象重排的间接读数。
功能性定点荧光测定法(FSDF;也称为电压钳式荧光测定法,VCF)是在1990年代初开发的8,并且首次提供了直接查看局部构象变化和通道蛋白功能的能力实时。使用通道诱变、电生理学和异源表达系统的组合,可以荧光标记和跟踪特定通道或受体的运动部分,以响应激活刺激9,10。该方法已被广泛用于研究电压门控离子通道8,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19中的电压传感机制。权威评论见10,20,21,22,23。
Ca V和NaV通道对于电信号的启动和传播至关重要,由一个主α1亚基组成,该亚基具有一个中心孔和四个不相同的电压传感域2。除了它们独特的一级结构外,Ca V和NaV通道还表示为具有辅助亚基24的多亚基复合物。电压依赖性钾通道(K V)由四个亚基组成,看起来像NaV或CaV25的单个结构域。Ca V 和 NaV 通道的孔形成和电压感应 α1 亚基由单个多肽编码六个独特跨膜段的四个独立结构域(S1-S6;图1A)24,26.由S1至S4跨膜段组成的区域形成电压传感域(VSD),S5和S6跨膜段形成孔域26。在每个VSD中,S4 α螺旋含有带正电荷的精氨酸或赖氨酸(图1A,B),它们响应膜去极化而移动7。数十年的研究和高度多样化的实验方法的结果支持这样一个前提,即S4段向外移动,产生门控电流,以响应膜去极化6。
FSDF 测量与离子通道或其他蛋白质上的特定半胱氨酸残基(即 S4 α-螺旋)偶联的硫醇反应性染料的荧光变化,通过定点诱变工程,因为通道响应膜去极化或其他刺激起作用10。事实上,FSDF最初是为了研究KV通道中的S4段(被提议为通道的主要电压传感器)是否在门控电荷响应膜电位8,10的变化而移动时移动。在电压门控离子通道的情况下,FSDF可以解析四个VSD的独立构象重排(在任何给定时间跟踪一个VSD),同时进行通道函数测量。事实上,使用这种方法,已经表明单个VSD似乎在通道激活和失活的特定方面存在差异性参与12,27,28,29,30。确定每个VSD对通道功能的贡献具有高度相关性,可用于进一步阐明通道操作并潜在地确定药物开发的新靶点。
FSDF在异源表达系统中的使用对于我们从还原论的角度进一步理解通道功能非常有帮助10,23。像许多还原论方法一样,它有优点,但也有局限性。例如,一个主要的限制是异源系统中通道纳米环境的部分重构。通常,离子通道与许多辅助亚基和许多其他改变其功能的蛋白质相互作用31。原则上,使用多个蛋白质编码构建体或多顺反子质粒可以在异源系统中表达不同的通道及其附属亚基,但它们的天然环境不能完全重建30,32。
我们小组最近在天然解离的骨骼肌纤维中发表了FSDF的变体,用于研究激发 - 收缩耦合(ECC)的早期步骤33,34,肌肉纤维电去极化与肌肉收缩的激活相关的过程35,36。这种方法首次允许在成人分化肌纤维37的天然环境中对来自电压门控L型Ca2+通道(CaV1.1,也称为DHPR)的单个S4电压传感器进行运动跟踪。这是通过考虑这种细胞类型的多种特征来实现的,包括细胞的电活动允许快速刺激诱导的自我传播去极化,通过体内电穿孔表达cDNA质粒的能力,细胞内通道的自然高表达和区室组织,以及它与高速成像和电生理记录设备的兼容性。以前,我们使用高速线扫描共聚焦显微镜作为检测设备37。现在,使用光电二极管进行信号采集,介绍了该技术的变体。这种基于光电二极管的检测系统可以促进该技术在其他实验室中的实施。
本文描述了一种在天然电池中利用FSDF研究CaV1.1的单个电压传感器运动的分步协议。虽然CaV1.1通道在整个手稿中被用作一个例子,但该技术可以应用于其他离子通道,受体或表面蛋白的细胞外可访问结构域。
该协议已获得马里兰大学机构动物护理和使用委员会的批准。以下协议分为多个子部分,包括(1)分子构建体设计和半胱氨酸反应染料选择,(2) 体内 电穿孔,(3)肌肉解剖和纤维分离,(4)采集设置说明,(5)评估增强绿色荧光蛋白(EGFP)阳性纤维电活性和半胱氨酸染色,以及(6)信号采集和处理。此外,在每节的开头,在骨骼肌纤维中应用FSDF时,会详细介绍一些相关的注意事项。所有方案部分都应使用适当的个人防护设备进行,包括实验室外套和手套。
1. 分子构建体设计及半胱氨酸反应染料选择

图1:跨膜α螺旋界面处的硫醇-半胱氨酸反应示意图。 (A)L型CaV1.1膜拓扑结构。加号表示S4 α螺旋内的基本残基,橙色星星表示半胱氨酸通过定点诱变引入的位置。(B)兔CaV1.1的S4I到S4IV的序列比对(UniProtKB:P07293)。对电压检测至关重要的带正电荷的精氨酸和赖氨酸残基以红色突出显示,而工程半胱氨酸替代品以橙色表示。该面板改编自参考文献37。(C)半胱氨酸-硫醇荧光分子反应。(D)说明跨膜电压敏感α螺旋内半胱氨酸诱变插入的图表。半胱氨酸应在休息时埋在膜中,并在去极化后可通过细胞外进入(ΔV;如果去极化(II)之前已经可以从细胞外空间获得目标半胱氨酸,或者在去极化后无法从细胞外空间进入半胱氨酸(III),则半胱氨酸示踪通常不太可能发生。(E)与硫醇荧光分子反应后,响应去极化的α螺旋运动降低了MTS-5-TAMRA荧光发射。荧光信号由S4螺旋的运动以及随后的染料相对于膜平面和水环境的运动产生。请点击此处查看此图的大图。
2. 体内 电穿孔
注意:电穿孔实验如前所述进行38 ,并进行修改。在下一节中,该协议设计用于鼠标单脚垫的电穿孔。如果准备了两个爪子,则需要调整体积。

图 2:cDNA 注射和电穿孔电穿孔电极在用于电穿孔的小鼠脚垫中的定位图。 (A)透明质酸酶和cDNA注射的针头位置在小鼠脚垫下。箭头表示通过皮肤插入的点。(B)注射后应暂时观察皮肤轻微变色和爪子尺寸略有增加。(C) 电穿孔的电极阵列定位。请点击此处查看此图的大图。
3. 肌肉解剖和纤维隔离
注意:骨骼肌纤维解离按照前面描述的37,40,41 进行修改。在下一节中,该协议适用于鼠标的两个脚垫。

图3;肌肉FDB纤维解剖和解离。 (A)在踝关节上方进行足部解剖(虚线)后,去除脚爪下的皮肤,沿着虚线露出FDB肌肉(B)。肌肉被解剖并放置在胶原酶溶液中。(C)孵育后,对肌肉进行研磨以解离并获得单个肌肉纤维。(D)在将肌纤维转移到层粘连蛋白涂层的玻璃底培养皿之前,使用细镊子去除非肌肉组织和碎片。 请点击此处查看此图的大图。
4. 采集设置说明
注意:采集设置与之前描述的42 相当,但进行了修改(图4A)。

图 4:记录系统的说明。 (A) 说明记录系统不同组件之间连接的图表。该装置包括一个带电动载物台的倒置显微镜、一个发光二极管(LED)光源、一个快门、一个具有跟踪保持功能的基于光电二极管的定制光监控电路43、一个AD/DA转换器(来自膜片钳放大器)、一个模拟脉冲发生器、一个耦合到场刺激电极的外部场刺激单元、 电动机械手,以及用于协议采集、同步和生成的商业软件。用于场刺激的电极由两根铂丝制成,这些铂丝焊接到通过BMC连接器连接到脉冲发生器的铜电缆上。特定的激励和发射滤波器用于检测EGFP和MTS-5-TAMRA信号。为了激发EGFP,使用带有488 nm(± 20 nm)激发(Ex)滤光片和LP510 nm Em滤光片的氙气灯。对于MTS-5-TAMRA,使用530 nm LED光源和LP550 nm Em滤光片。(B) 表达 EGFP-CaV1.1-cys 构建体的光纤视图,其中双场刺激电极(黑色圆圈)在光纤主轴(虚线)的方向正确(左)和不正确(右)。黑色未填充的圆圈表示采集区域,其直径由光圈开口控制,放置在光源前面。请点击此处查看此图的大图。
5. EGFP阳性纤维电活性和半胱氨酸染色的评估
注意:骨骼肌纤维场刺激如前41 所述进行修改。该方法用于(1)识别健康,功能性和电响应的纤维,(2)用半胱氨酸反应性荧光染料染色纤维,以及(3)记录荧光信号以响应传播的动作电位。本节和后续的每一步都应在弱光环境中进行,以减少荧光染料漂白。
6. 信号采集与处理
注意:在进行荧光测量之前,必须仔细设计信号采集,以获得最佳的信噪比。较慢的采样率允许更多的光检测,同时减少在蛋白质构象重排期间获取的点数。在EGFP-CaV1.1-cys的情况下,由动作电位波形引起的电荷运动发生在~1-10ms37。为了获得多个点来跟踪运动随时间的变化,采集设置为每点50 μs。

图 5:在没有 MTS-5-TAMRA 染色和代表性原始荧光记录的情况下表达 EGFP-CaV1.1-cys 的成像肌肉纤维。 (A)表达EGFP-CaV1.1 VSD-III构建体的解剖而非解离肌肉的透射(左)和荧光(右)图像的示例。比例尺:100 μm。 (B)在MTS-5-TAMRA染色之前(左)和之后(右)表达EGFP-CaV1.1 VSD-III构建体的肌肉纤维的代表性图像。非转染纤维的内源性半胱氨酸也被染料染色。比例尺:30 μm。 (C) EGFP-Ca V 1.1 VSD-III 构建体的共聚焦图像(左)和 MTS-5-TAMRA 染色(右)显示了肌纤维横向小管系统上 CaV1.1 定位的经典双带模式特征(底部)。比例尺:25 μm。 (D)响应两个刺激的代表性荧光记录,并在用N-苄基-对甲苯磺酰胺(BTS)固定纤维之前(蓝色迹线)和之后(红色迹线)用光电二极管测量。上面的黑线表示通过外部场刺激进行光纤去极化的协议。请点击此处查看此图的大图。
当响应于重复场刺激而触发传播动作电位时,可以跟踪特定电压传感器的运动以响应特定的去极化频率。 如图6A所示,可以跟踪VSD-II标记螺旋的运动,以响应在10 Hz(即间隔100 ms)施加的两个连续去极化中的每一个。信号漂白可以通过减去迹线的基线来校正(图6B)。对第一和第二响应的进一步时间放大(图6C)可以精确观察这些快速发展的VSD-II螺旋运动。来自场刺激触发器的时间标记允许以10 μs的精度对第一和第二响应进行相对时间对齐。两个信号都可以通过它们各自的最小值(即最小峰值)进行归一化,以便在两个响应之间进行动力学比较(图6D)。从这些相对荧光记录中可以观察到,该电压传感器的连续去极化之间的峰值时间相当。
这种方法可用于跟踪具有各种去极化频率和多个动作电位的单个电压传感器的运动,以研究它们的激活以及与电荷运动、钙电流或钙瞬变的关系,这些可以在不同的光纤集中并行研究,如之前报道的那样37。

图 6:由 10 Hz 下两次连续去极化触发的 EGFP-CaV1.1 VSD-II 的代表性荧光记录。 (A)表达EGFP-Cav1.1 VSD-II的光纤中的ΔF/F0荧光信号在10 Hz和基线校正曲线(紫色)下刺激两次。上面的黑线表示诱导去极化。(B)ΔF/F0基线校正信号的两个独立响应(C)。图上的值对应于峰值处的最小范围。(D)相对于去极化和归一化的信号对齐由它们各自的最小峰值显示VSD-II域运动,两种刺激的动力学相当。 请点击此处查看此图的大图。
| 试剂 | 最终浓度(毫米) | 分子量 | 克/升 |
| 氯化钠 | 150 | 58.44 | 8.766 |
| 氯化钾 | 4 | 74.55 | 0.298 |
| 氯化钙2 | 2 | 110.9 | 0.222 |
| 氯化镁2 | 1 | 95.22 | 0.095 |
| D-葡萄糖 | 5 | 180.2 | 0.901 |
| 赫佩斯 | 10 | 238.3 | 2.383 |
| pH 值调节至 7.4,含 1 M 氢氧化钠 |
表1:改良的林格氏溶液组成。
作者报告没有利益冲突。
功能性定点荧光测定法是一种实时研究蛋白质结构域运动的方法。该技术在天然细胞中的应用修改现在允许检测和跟踪来自小鼠分离骨骼肌纤维中电压门控Ca2+ 通道的单电压传感器运动。
我们感谢J. Vergara博士(加州大学洛杉矶分校)分享EGFP-CaV1.1(兔)野生型质粒。我们感谢耶鲁大学生理学系电子实验室,特别是Henrik Abildgaard设计和建造具有跟踪和保持电路的光电二极管。这项工作得到了美国国立卫生研究院拨款R01-AR075726和R01-NS103777的支持
| 透明质酸酶 | SIGMA ALDRICH | H3884-50mg | |
| 0.5 mL Eppendorf 管 | Millipore Sigma | EP022363719-500EA | |
| 1 mL 注射器 | Millipore Sigma | Z683531-100EA | 结核核滑尖 |
| 1/2" 长 29 号无菌胰岛素针头和注射器 | Becton Dikinson | 324702 | |
| 35 mm 无涂层塑料板 | Falcon, 康宁 | 353001 | |
| 60 mm 无涂层塑料板 | Falcon, 康宁 | 351007 | |
| 酒精鞭 | PDI | B60307 | |
| Alexa-533 立方体 LP | Chroma | 49907 | Ex: 530/30x;BS:532;Em: 550lp |
| 弧光灯 | 萨特仪器 | LB-LS 672 | |
| 人工泪液霜 | Akorn | NDC 59399-162-35 | |
| 硼硅酸盐玻璃 巴斯德移液管 5 3/4" | VWR | 14672-200 | |
| BTS(N-苄基-对甲苯磺酰胺) | SIGMA ALDRICH | 203895 | |
| I型胶原酶 | SIGMA ALDRICH | C0130-1g | |
| 棉签 | VWR | VWR-76048-960-BG | |
| 双电极阵列 (用于电穿孔) | BTX 哈佛仪器 | 45-0120 | 10 毫米 2 针阵列尖端 |
| EGFP 立方体 | Chroma | 39002AT | Ex: 480/30x;BS 505;Em: 535/40m |
| 电穿孔仪设备 | BTX 哈佛仪 | ECM 830 | |
| EPC10 | HEKA Elektronik GmbH (哈佛生物科学) | 895000 | |
| FBS | Biotechne, 研发&D Systems | RND-S11150H | 胎牛血清 - 高级,热灭活 |
| 玻璃盖玻片 35 毫米培养皿 | MatTek Life Science | P35G-1.5-14-C | |
| 异氟醚 | 氟醚(异氟醚)吸入液 | 502017-250ml | |
| 等温加热垫 | Braintree scientific inc | 39DP | |
| 层粘连蛋白 | Thermo Fisher | INV-23017015 | 层粘连蛋白小鼠蛋白,天然 |
| 乳胶灯泡 | VWR | 82024-554 | |
| LED 530 nm | 萨特仪器 | 5A-530 | |
| 低结合蛋白 0.2 &μ;m 无菌过滤器 | 颇 | 尔FG4579 | acrodisk 注射器过滤器 0.2um 超膜 低蛋白结合 非热原 |
| MEM | Invitrogen | INV-11380037 | |
| MTS-5-TAMRA | Biotium | 89410-784 | MTS-5-TAMRA |
| OriginPro 分析软件 | OriginLab Corporation | OriginPro 2022(64 位)SR1 | |
| 光电二极管 | 定制 | NA | |
| PlanApo 60x 油 1.4 N.A/∞/0.17 | 奥林巴斯 | BFPC2 | |
| 铂丝 0.5 毫米,99.9% 金属基 | SIGMA | 267228-1G | 制造场刺激电极 |
| 脉冲发生器 | WPI | Pulsemaster A300 | |
| 快门驱动控制器 | Uniblitz | 100-2B | |
| Shuttter | Uniblitz | VS2582T0-100 | |
| S-MEM | Invitrogen | INV-11380037 | |
| 无菌工作台垫 | VWR | DSI-B1623 | |
| 无菌盐水 | SIGMA ALDRICH | S8776 | |
| Sylgard 184 硅胶弹性体套件 | 道康宁 | 1419447-1198 | |
| 麻醉蒸发器 | Parkland Scientific | V3000PK | |
| 电压发生器 | Custom Made | NA |