Name: 真核Polyribosome剖面分析 (视频) | JoVE Journal
Uploaded: 2010-06-15T17:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 16 s
Description: 学习真核细胞多聚核糖体分析技术，通过蔗糖密度梯度离心分离单核糖体和多聚核糖体组分，利用紫外吸收监测可视化不同核糖体群体，从而研究蛋白质翻译调控机制。该方法为分子生物学研究提供了重要工具。

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作者感谢 John Woolford 为本方法提供的最初基础，TGK 获 NIH GM057483 和 AI076245 资助，PRC 获 GM77073 资助。

1. 7-47% 蔗糖梯度的制备
<ol>
	<li>在使用前一天制备蔗糖梯度，以使梯度充分连续。配制含有 50 mM NH4Cl、50 mM Tris-乙酸盐（pH 7.0）和 12 mM MgCl2 的无菌 7% 和 47% 蔗糖溶液，并于 4°C 保存1。</li>
	<li>为制备 6 条梯度，将 7% 和 47% 蔗糖储备液混合，分别配制成以下各浓度的蔗糖溶液各 48 mL。向每种蔗糖溶液中加入 DTT（1 M 储备液），使其终浓度为 1 mM。 
<table border="1" cellspacing="0" cellpadding="0">
<tbody>
 <tr>
 <td>终浓度</td>
 <td>7% 蔗糖</td>
 <td>47% 蔗糖</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>7%</td>
 <td>48 mL</td>
 <td>0</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>17%</td>
 <td>36 mL</td>
 <td>12 mL</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>27%</td>
 <td>24 mL</td>
 <td>24 mL</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>37%</td>
 <td>12 mL</td>
 <td>36 mL</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>47%</td>
 <td>0</td>
 <td>48 mL</td>
 </tr>
</tbody>
</table></li>
	<li>为灌注梯度，将 Pasteur 吸管连接至 20 mL 注射器，并用 Parafilm 密封固定，或使用长针头。向 1 × 3.5 英寸聚丙烯超速离心管底部加入 7 mL 7% 蔗糖溶液。随后，将 Pasteur 吸管尖端置于管底附近，以不超过 0.3 mL/秒的速度缓慢加入 7 mL 17% 蔗糖溶液，使其位于 7% 溶液下方。依次加入各 7 mL 的 27%、37% 和 47% 蔗糖溶液。应可观察到各层之间有清晰的分界线，表明混合程度最小。将梯度连同将用于收集样品的转子、瓶和管一起于 4°C 过夜保存。</li>
</ol>
2. 酵母提取物的制备
<ol>
	<li>将125 mL酵母培养物培养至OD600为0.8–1.0。向培养物中加入环己酰亚胺，使其终浓度为100 μg/mL，继续在30°C下振荡15分钟。</li>
	<li>同时，配制含有80 μg/mL环己酰亚胺、200 μg/mL肝素、0.2% DEPC以及10 mM Tris-HCl（pH 7.5）、0.1 M NaCl、30 mM MgCl2的裂解缓冲液。从此步骤开始，所有操作均需在冰上进行。</li>
	<li>将培养物倒入250 mL离心瓶中，并用冰填充。在4°C下以8,000 × g（SLA-1500转子中7,250 rpm）离心5分钟。用10 mL预冷裂解缓冲液洗涤沉淀一次，转移至15 mL聚丙烯管中。在4°C下以5,900 × g（SLA-600TC转子中约6,000 rpm）离心3分钟。将沉淀重悬于0.5 mL裂解缓冲液中，转移至1.5 mL离心管，并加入0.5 mL预冷、经烘烤酸洗的玻璃珠。涡旋细胞四次，每次30秒，两次之间在冰上冷却30秒。向1.5 mL离心管中再加入0.5 mL裂解缓冲液。在微量离心机中以最大速度（Eppendorf 5417R微量离心机中14,000 rpm）于4°C离心10分钟。将上清液转移至新的1.5 mL微量离心管中。取出10 μL至另一离心管，用于测定OD260/OD280比值（见下文步骤3.1）。将提取物储存于-80°C。</li>
</ol>
3. 哺乳动物细胞提取物的制备
<ol>
	<li>对于贴壁细胞，在100 mm培养皿中培养至约70%融合度。每11 ml梯度需要一个100 mm培养皿（典型产量约为20 OD260单位）。根据梯度体积的大小按比例线性调整用量。对于悬浮细胞，每11 ml梯度大约需要1 × 107个细胞。</li>
	<li>裂解前，加入环己酰亚胺至终浓度100 μg/mL，37°C孵育15分钟。将培养皿置于冰上，用预冷的PBS洗涤细胞两次。后续所有步骤必须在0–4°C条件下进行。</li>
	<li>通过抽吸彻底去除PBS（将培养皿倾斜放置于冰上使其充分沥干），加入1 mL裂解缓冲液，刮取细胞并转移至预冷的1.5 mL离心管中。裂解缓冲液的组分需根据细胞类型和培养条件进行优化。推荐的起始缓冲液组成为：20 mM HEPES-KOH（pH 7.4）、15 mM MgCl2、200 mM KCl、1% Triton X-100（v/v）、100 μg/mL环己酰亚胺、2 mM DTT和1 mg/mL肝素。关键变量包括镁离子和氯化钾的浓度，以及是否添加非离子型去污剂，以提高细胞骨架或膜结合多聚核糖体的提取效率。通过27号针头反复吹打两次，或使用B型研杵进行5–10次Dounce匀浆来裂解细胞。注射器或匀浆器在使用前应预先冷却。</li>
	<li>在预冷的微量离心机中以14,000 × g离心5分钟。将新鲜裂解液转移至蔗糖梯度中（对于哺乳动物细胞，蔗糖梯度使用不含Triton X-100和肝素的裂解缓冲液配制，其余成分如1.2和1.3所述），或立即在液氮中速冻以备后续使用。</li>
</ol>
4. 梯度离心
<ol>
	<li>将多聚核糖体裂解液在冰上解冻。取预留的10 μL样品加入1 mL水中，用分光光度计测定OD260/OD280比值，以确定裂解液中核酸浓度。按照所述方法培养的酵母菌液，典型产量为50 OD单位。</li>
	<li>使用移液器，将枪头紧贴离心管壁靠近梯度液表面处，缓慢将25 OD260单位的裂解液加至梯度液上方。对于35 mL梯度液，通常上样量为500 μL。可使用裂解缓冲液调整，确保所有梯度液上样体积相等。上样量较少时可获得更佳分辨率。用镊子小心将梯度管放入甩平转子的离心桶中。</li>
	<li>在4°C条件下，以100,000 × g（Surespin 630转子23,000 rpm）离心4小时。本方案可适用于较小体积的梯度液。</li>
</ol>
5. 数据与组分的收集
<ol>
	<li>在完成4小时离心前约30分钟，将针头连接至Model 184管穿刺器。将记录笔连接至在线Isco Model UA-5吸光度/荧光监测仪。开启吸光度监测仪电源，使其在分析样品前达到稳定的基线。通过将DI-148U数据采集单元（DATAQ Instruments）连接至图表记录仪，可轻松实现多聚核糖体图谱的电子采集。随后可使用配套的WinDaq软件实时采集图谱并保存以供后续标注。</li>
	<li>使用反向流动和快速设置，用50 mL Fluorinert填充注射泵。确保其中无气泡存在。将注射器的软管连接至管穿刺器，并短暂开启正向Fluorinert流动（3 mL/min），以清除软管中的任何气泡。</li>
	<li>在流动池末端的软管下方放置一个废液烧杯或一系列收集管，用于收集流出的样品。</li>
	<li>小心地从离心机转子中取出含有蔗糖梯度的聚丙烯离心管，并将其置于冰上（可用空管预先在冰中压出凹槽，以避免扰动梯度）。</li>
	<li>如需分析细胞提取物，将梯度管放置于管穿刺器上。将管的顶部连接至出口并固定。升起底部平台，使针头刺入离心管底部。一旦针头完全穿透离心管底部，即以6 mL/min的流速开始正向Fluorinert流动。</li>
	<li>当Fluorinert开始流入管中后，监测在线吸光度监测仪上指针的移动。一旦指针开始移动，将图表移动速度设置为60。监测仪将记录OD254，起始于游离物质，随后检测40S核糖体亚基，并继续通过多聚核糖体复合物。若需收集用于RNA或蛋白质分析的组分，通常每0.2分钟收集一次（1 mL）。对于RNA分析，应直接将组分收集至含有Trizol（Invitrogen）、苯酚或SDS/蛋白酶K的离心管中，具体取决于所选的提取方法。</li>
	<li>当多聚核糖体图谱结束时，关闭流向离心管的Fluorinert流动，并停止吸光度/荧光监测仪的图表移动。</li>
	<li>通过快速启动反向流动，将离心管中的Fluorinert回吸至注射器中，注意不要将蔗糖从管中吸入注射器。旋下离心管，降低针头，并取下离心管。</li>
	<li>对每个蔗糖梯度重复步骤5.5至5.8。</li>
	<li>当所有蔗糖梯度分析完成后，将软管中的Fluorinert回吸至注射器中。拆下分部收集器的各个部件（包括管穿刺器、流动池以及顶部的废液软管），并用清水充分冲洗。</li>
</ol>
6. 代表性结果
<img src="/files/ftp_upload/1948/1948fig1.jpg" alt="沉降图谱曲线；核糖体亚基、多聚核糖体；密度与A254nm分析。" data-altupdatedat="1788235205000" data-alt="图1"> 图1. 在环己酰亚胺存在下，从酵母菌株BY4741（mata his3Δ1 leu2Δ0 met15Δ0 ura3Δ0）制备的核糖体提取物的代表性图谱。核糖体提取物通过7–47%蔗糖梯度离心分离，并使用连接紫外检测器的泵注射装置进行分析。图中所示为多聚核糖体以及80S、60S和40S核糖体所在峰的位置。

<ol><li>Baim, S. B., Pietras, D. F., Eustice, D. C., Sherman, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+mutation+allowing+an+mRNA+secondary+structure+diminishes+translation+of+Saccharomyces+cerevisiae+iso-1-cytochrome+C%5BTitle%5D)+AND+%22Mol.+Cell.+Biol%22%5BJournal%5D)">A mutation allowing an mRNA secondary structure diminishes translation of Saccharomyces cerevisiae iso-1-cytochrome C.</a> Mol. Cell. Biol. 5, 1839-1846 (1985).</li>
<li>Ripmaster, T. L., Vaughn, G. P., Woolford, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DRS1+to+DRS7%2C+novel+genes+required+for+ribosome+assembly+and+function+in+Saccharomyces+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22Mol.+Cell.+Biol%22%5BJournal%5D)">DRS1 to DRS7, novel genes required for ribosome assembly and function in Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol. Cell. Biol. 13, 7901-7912 (1993).</li>
<li>Anand, M., Chakraburtty, K., Marton, M. J., Hinnebusch, A. G., Kinzy, T. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Functional+interactions+between+yeast+translation+eukaryotic+elongation+factor+%28eEF%29+1A+and+eEF3%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Functional interactions between yeast translation eukaryotic elongation factor (eEF) 1A and eEF3.</a> J Biol Chem. 278, 6985-6991 (2003).</li>
<li>Serikawa, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+transcriptome+and+its+translation+during+recovery+from+cell+cycle+arrest+in+Saccharomyces+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Proteomics%22%5BJournal%5D)">The transcriptome and its translation during recovery from cell cycle arrest in Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Cell Proteomics. 2, 191-204 (2003).</li>
<li>Ingolia, N. T., Ghaemmaghami, S., Newman, J. R., Weissman, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+analysis+in+vivo+of+translation+with+nucleotide+resolution+using+ribosome+profiling%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Genome-wide analysis in vivo of translation with nucleotide resolution using ribosome profiling.</a> Science. 324, 218-223 (2009).</li>
<li>Valasek, L., Szamecz, B., Hinnebusch, A. G., Nielsen, K. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+stabilization+of+preinitiation+complexes+by+formaldehyde+cross-linking%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Enzymol%22%5BJournal%5D)">In vivo stabilization of preinitiation complexes by formaldehyde cross-linking.</a> Methods Enzymol. 429, 163-183 (2007).</li>
<li>Fletcher, J. E., Copeland, P. R., Driscoll, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Polysome+distribution+of+phospholipid+hydroperoxide+glutathione+peroxidase+mRNA%3A+evidence+for+a+block+in+elongation+at+the+UGA%2Fselenocysteine+codon%5BTitle%5D)+AND+%22Rna%22%5BJournal%5D)">Polysome distribution of phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase mRNA: evidence for a block in elongation at the UGA/selenocysteine codon.</a> Rna. 6, 1573-1584 (2000).</li>
<li>Ruan, H. J., Brown, C. Y., Morris, D. R. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aRuan%2C+HJ+%22Analysis+of+mRNA+formation+and+function%22">Analysis of mRNA formation and function</a>. Richter, J. D. , Academic Press. 305-321 (1997).</li>
<li>Martin, G. W. 3rd, Berry, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Selenocysteine+codons+decrease+polysome+association+on+endogenous+selenoprotein+mRNAs%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Cells%22%5BJournal%5D)">Selenocysteine codons decrease polysome association on endogenous selenoprotein mRNAs.</a> Genes Cells. 6, 121-129 (2001).</li>
<li>Lee, Y. Y., Cevallos, R. C., Jan, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+upstream+open+reading+frame+regulates+translation+of+GADD34+during+cellular+stresses+that+induce+eIF2alpha+phosphorylation%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">An upstream open reading frame regulates translation of GADD34 during cellular stresses that induce eIF2alpha phosphorylation.</a> J Biol Chem. 284, 6661-6673 (2009).</li>
</ol>

未声明任何利益冲突。

通过多核糖体图谱获得的信息可为细胞的翻译状态提供有价值的见解。此外，还可确定核糖体亚基自身组装的状态2。例如，图谱中出现半聚体（halfmers）或80S及更大的峰，并在右侧略有肩峰，表明40S亚基已结合但尚在等待60S亚基的结合。在未添加环己酰亚胺或其他延伸抑制剂的条件下进行实验，可分析核糖体“脱离”（run off）的速率，从而判断翻译延伸过程是否发生改变3。所收集的各组分本身是丰富的试剂来源，可用于后续通过Northern印迹或Western印迹分析特定mRNA或蛋白质与核糖体亚群的结合情况。通过关联的微阵列分析4或深度测序分析5，可确定与活性核糖体结合的全部mRNA池。此外，通过适当添加交联试剂，还可稳定蛋白质的相互作用6。
哺乳动物细胞的多聚核糖体分析也值得提及，因其在建立获得稳定多聚核糖体所需条件方面存在明显的困难。文献中报道的缓冲体系差异较大7-10，因此可能需要针对不同细胞类型对裂解缓冲液进行优化；或者同样有可能的是，缓冲体系的重要性不如在低温条件下使用新鲜裂解物时的细致操作。据我们所知，目前尚未见系统评估影响哺乳动物多聚核糖体形成各参数的相关报道。

<table><tbody><tr><td>聚烯烃超速离心管</td><td>Beckman Coulter Inc.</td><td>326823</td><td>1 x 3.5 英寸 (25x89mm)</td></tr><tr><td>氟化惰性液（Fluorinert）</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>F9755</td><td></td></tr><tr><td>环己酰亚胺（Cycloheximide）</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C-7698</td><td></td></tr><tr><td>肝素（Heparin）</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>H3393</td><td></td></tr><tr><td>BY4741</td><td>Open Biosystems</td><td>YSC1048</td><td>其他菌株同样适用</td></tr></tbody></table>

真核生物多聚核糖体图谱分析

Eukaryotic Polyribosome Profile Analysis

蛋白质合成是一个在多个层面受到调控的复杂细胞过程。例如，多种细胞应激（如氨基酸饥饿或生长因子撤除）可在翻译起始阶段或延伸阶段抑制整体翻译水平。此外，单个mRNA的翻译也可通过mRNA的亚细胞定位或特异性microRNA的存在进行调控。对蛋白质合成的研究常采用多聚核糖体分析，以揭示翻译调控机制或蛋白质合成缺陷。在该实验中，从真核细胞中分离mRNA/核糖体复合物。利用蔗糖密度梯度离心，可将结合多个核糖体的mRNA（即多聚核糖体）与结合单个核糖体（单体核糖体）的mRNA分离开来。通过梯度分级收集，可分离并定量不同类型的核糖体群体及其结合的mRNA或蛋白质。在特定条件下，多聚核糖体与单体核糖体比例的变化可能提示翻译起始或延伸/终止过程存在缺陷。对多聚核糖体组分中mRNA的分析，可揭示在不同实验条件下被翻译的特定mRNA群体是否发生变化。此外，通过分析梯度中分离出的小核糖体亚基和大核糖体亚基的峰形，还可监测核糖体的组装情况。本视频介绍了一种从酵母细胞制备粗核糖体提取物、通过蔗糖梯度离心分离提取物并解读结果的方法。该方法可便捷地适用于哺乳动物细胞。

多聚核糖体分析, 蔗糖密度梯度离心, 蛋白质合成, 翻译调控, 核糖体, mRNA, 酵母, 哺乳动物细胞

本文介绍了一种从真核细胞中提取正在翻译的核糖体的实验方案。提取后，通过蔗糖梯度分级分离将核糖体分为单体核糖体和多聚核糖体，从而实现对不同核糖体群体的分析。因此，该方法是研究翻译调控的金标准。

蛋白质合成是一个在多个层次上受到调控的复杂细胞过程。例如，全局翻译可在起始阶段被抑制……

本实验的总体目标是从细胞裂解液中分离并比较单核糖体和多核糖体组分。首先培养目标细胞以完成第一步，实验的第二步是制备细胞裂解液。该实验步骤的第三步是将裂解液通过蔗糖梯度离心。最后一步是分段收集梯度组分，并通过紫外吸收曲线来观察不同的核糖体群体。最终，可通过多核糖体图谱分析获得结果，以显示在不同实验条件下翻译水平的变化。大家好，我是 Anthony Esposito，来自马里兰大学（UMD）及罗伯特·伍德·约翰逊医学院（R-W-J-M-S）分子遗传学、微生物学与免疫学系 Terry Goss Kinsey 博士实验室。我是 Marcus Lewis，同样来自 R-W-J-M-S 的 McKinsey 实验室。今天我们将向您展示一种多聚核糖体分析的实验方法。在我们的实验室中，利用该方法研究由基因突变或环境因素引起的蛋白质合成变化。那么，让我们开始吧。蔗糖。梯度液应在使用前一天配制，以使梯度充分连续。取适量体积的7%和47%蔗糖储备液，配制下列每种蔗糖浓度的溶液各48毫升：7%、17%、27%、37%和47%。向每种蔗糖溶液中加入1 mol/L的DTT，使其终浓度为1 mmol/L。为便于倾注梯度液，将一根意大利面移液管通过Parafilm封口膜固定并密封连接至20 mL注射器上。在一根直径1英寸、长3.5英寸的聚丙烯超速离心管底部加入7 mL的7%蔗糖溶液。接着，将巴斯德移液管的管尖置于管底附近，缓慢加入7 mL的17%蔗糖溶液，使其位于7%蔗糖溶液下方。每层溶液的加入时间应不少于20秒。当梯度制备完成后，分别用 7 毫升的 27%、37% 和 47% 蔗糖溶液重复操作。应观察到各层之间有清晰的分界线，表明混合程度最小。将所有梯度连同转子、收集样品所用的瓶子和试管一起在 4°C 下过夜保存。为了制备酵母细胞的提取物，首先将100个25毫升的酵母培养液培养至OD 600为0.8至1.0。向培养液中加入环己酰亚胺，使其终浓度为100 µg/mL，并在30 °C下继续振荡15分钟。15分钟后，将培养液倒入250 mL离心管中，并用冰填充。从这一步开始，所有操作均需在冰上进行。在4°C条件下，以8,000 × g离心五分钟。重悬沉淀物于10毫升预冷的冰浴裂解缓冲液中，并转移至15毫升聚丙烯管中。在4°C条件下，以5,900 × g离心三分钟，重悬沉淀。将沉淀重悬于0.5毫升裂解缓冲液中。将悬液转移至1.5毫升微量离心管中，然后加入0.5毫升预冷的经焙烧酸洗的玻璃珠。涡旋振荡细胞4次，每次30秒，每次振荡后将离心管置于冰上冷却30秒。然后向1.5毫升离心管中再加入0.5毫升裂解缓冲液，在4°C下以5,000 × g离心5分钟。将上清液转移至新的1.5毫升微量离心管中，在4°C下以最大速度离心10分钟。最后，将上清液转移至新的1.5毫升微量离心管中。提取物可保存于-80°C，用于将裂解液转移至蔗糖梯度。将移液器枪头紧贴离心管管壁靠近梯度表面处，轻柔地将裂解液铺加在梯度上方。对于35毫升的梯度溶液，通常上样500微升裂解液。使用镊子小心将梯度溶液放入摆动桶转子的吊桶中。在4摄氏度条件下，以100,000 × g离心4小时。在四小时离心结束前约 30 分钟，将针头连接到管路穿刺器上，并将笔连接到在线吸光度荧光监测仪。打开吸光度监测仪的电源，以便在分析样品前达到稳定的基线。通过连接 DI 1 48 U 数据采集单元，可实时轻松获取 PolyZone 谱图的电子数据。将注射泵用 50 毫升氟化坚果以反向流动快速设置填充后，连接至图表记录仪。确保其中无气泡存在。将注射器的管路连接到穿管器上。然后短暂开启 Flo 惰性气体以每分钟 6 毫升的流速正向流动，以排出管路中的任何气泡。为清除气泡，在流动池末端的管路下方依次放置一系列试管，用于收集流出的样品。准备一个冰桶，并在其中预先制备好用于放置含蔗糖梯度的离心管的孔洞。当四小时的离心完成后，小心地将离心管从离心转子中取出，并立即置于冰上，注意避免扰动梯度。为分析细胞提取物，将梯度管置于穿刺架上，将管子顶端连接至出口并固定。抬起底部载物台，使针头刺入离心管底部。以每分钟六毫升的流速开始向前流动荧光素标记物。当液体开始流入试管后，观察在线紫外吸收监测仪上指针的移动情况。当指针开始移动时，将记录仪的走纸速度调至60。当多核糖体图谱末端到达时，关闭流向离心管的Flo惰性气体流动，并停止吸收荧光监测仪上的记录仪走纸。通过以快速的反向流速将Flo inert从离心管回吸至注射器中，注意不要将蔗糖吸入注射器内。将离心管从穿刺针上拧下，降低针头并取下离心管。此处展示的是在环己酰亚胺存在下从酵母中制备的核糖体提取物的代表性图谱。图中标示了包含多核糖体以及A位点60S和40S核糖体的紫外吸收峰。我们刚刚向您展示了如何进行多核糖体分析。在执行该实验步骤时，务必注意操作迅速，保持样品低温，并防止RNA降解。以上就是全部内容。感谢观看，祝您的实验顺利成功。

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Biology

生物学

真核Polyribosome剖面分析

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本方案介绍了多核糖体分级分离的关键改进方法，用于研究体内中枢神经系统（CNS）样本的翻译组。通过分离并比较总RNA与核糖体结合的RNA组分，可实现对翻译和转录调控的全局评估。...

in vivo 中通过多聚核糖体分级分离研究中枢神经系统翻译组

核糖体在蛋白质合成中起着核心作用。通过蔗糖密度梯度离心法对多核糖体（多聚体）进行分级分离，可直接在全基因组范围内测定各个mRNA的翻译效率。此外，该方法还可用于对与核糖体和多核糖体相关的分子（如分子伴侣和信号分子）进行生物化学分析。...

多聚核糖体分级分离及哺乳动物转译组的全基因组规模分析

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利什曼原虫、人细胞和小鼠睾丸中的多聚核糖体分析

本实验方案描述了如何在不使用自动梯度生成仪或梯度分段收集系统的情况下，制备多聚核糖体图谱。...

无需梯度混合器或组分分离系统的多聚核糖体分析

共翻译相互作用在新生肽链的修饰、定位、折叠和组装过程中起着关键作用。本文介绍了选择性核糖体谱分析法，这是一种用于在模式真核生物Saccharomyces...

通过选择性核糖体谱分析全局鉴定共翻译相互作用网络

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从头合成 利用核糖体谱分析数据鉴定活跃翻译的开放阅读框

学习真核细胞多聚核糖体分析技术，通过蔗糖密度梯度离心分离单核糖体和多聚核糖体组分，利用紫外吸收监测可视化不同核糖体群体，从而研究蛋白质翻译调控机制。该方法为分子生物学研究提供了重要工具。

真核生物多聚核糖体图谱分析

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