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DOI: 10.3791/63872-v
Masue Marbiah*1,2, Pavlos Kotidis*1,3, Roberto Donini1,4, Itzcóatl A. Gómez5, Ioscani Jimenez del Val5, Stuart M. Haslam4, Karen M. Polizzi1,2, Cleo Kontoravdi1
1Department of Chemical Engineering,Imperial College London, 2Imperial College Centre for Synthetic Biology,Imperial College London, 3BioPharm Process Research,GlaxoSmithKline Research and Development, 4Department of Life Science,Imperial College London, 5School of Chemical & Bioprocess Engineering,University College Dublin
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
抗体的糖基化模式决定了其临床表现,因此控制糖基化的工业和学术努力持续存在。由于典型的糖工程活动是时间和劳动密集型的,因此使用瞬时沉默来表征糖基化基因影响的快速方案的生成将被证明是有用的。
该方案可用于筛选多种糖基化酶对目标蛋白糖谱的影响,并有助于更好地了解酶的功能。该方案的性质允许以瞬时但高通量的方式筛选糖基化酶。糖基化谱的改变可以改善抗体活性,从而提高最终产品的功效。
生物制药公司密切监测糖基化作为关键质量属性。异常糖基化是癌症等疾病的标志。因此,这种方法与药理学和生物医学研究有关。
该协议假设用户具有几种实验技术的经验,包括哺乳动物细胞转染和蛋白质印迹。最好从较少的样本开始,并在第一个实例中使用停止点。首先评估中国仓鼠卵巢细胞的密度和活力。
然后,用70%乙醇和RNase抑制剂溶液仔细清洁生物安全柜和所有设备,以避免污染。接下来,将细胞以100倍G沉淀五分钟,并以每毫升细胞密度5倍10的细胞密度将其重悬于预热的培养基中。将八微升DsiRNA预混液或对照转移到无菌电穿孔比色皿中。
将800微升细胞悬浮液加入同一比色皿中,混合并传递电穿孔脉冲。然后,将细胞悬浮液从比色皿转移到六孔板的一个孔中,避免使用泡沫状材料。将细胞孵育10分钟而不摇动。
孵育后,加入800微升预热培养基,使最终体积达到每孔1.6毫升。在培养箱中培养转染的细胞,同时以150 RPM振荡。48小时后,收获上清液和细胞。
IgG纯化后,将洗脱液A加入到三千道尔顿分子量截止离心浓缩器中,并在4摄氏度下以13,300倍G离心40~50分钟。一旦残余体积等于或小于50微升,离心就完成了。弃去流通液,加入500微升预冷的1X PBS以稀释残留的上清液。
使用相同的条件再次离心样品,直到残留50微升残留上清液。为了获得100X稀释的上清液,加入500微升预冷的1X PBS并重复离心过程。将上清液浓缩到40微升中约每升约2.5克的最终浓度,以确保与聚糖分析方法的相容性。
对于聚糖分析,将200微升磁珠溶液转移到2毫升PCR管中。将其放在磁性支架上,将磁珠与上清液分离,并小心地除去上清液。然后,从磁性支架中取出试管,加入纯化的蛋白质样品和涡旋。
接下来,将供应变性缓冲液加入样品管中,并在60摄氏度下孵育8分钟。保持样品管打开,以获得最佳反应性能。孵育后,加入PNGase F并在60摄氏度下再孵育20分钟,以从纯化的抗体中切割聚糖。
释放N-聚糖后,关闭样品管并涡旋。然后,将乙腈加入样品管中,涡旋,并在室温下孵育一分钟。将样品管放在磁性支架中,以将磁珠与溶液分离。
然后,使用移液器,小心地除去上清液而不接触珠子。将含荧光团的聚糖标记溶液加入通风橱中的样品中,并通过涡旋混合。在60摄氏度下用打开的盖子孵育20分钟后,通过在乙腈中洗涤样品三次以除去多余的染料。
然后,在双蒸馏水中洗脱标记的聚糖。将样品管置于磁性支架中,并收集富含纯化和标记的聚糖的上清液。接下来,准备所有必需的标准品和样品并将其装载到指定的托盘位置。
运行聚糖分析方案,并使用适当的软件分析和鉴定样品中存在的聚糖。蛋白质印迹分析显示,用三种Fut8 DsiRNA构建体的混合物转染的细胞中Fut8蛋白表达降低。来自敲低细胞的聚糖结构也显示出岩藻糖基化减少。
这种趋势在无乳糖基化结构中最为明显,在半乳糖基化结构中观察到的程度较小。与单个方波脉冲相比,使用两个方波脉冲的电穿孔观察到核心岩藻糖基化减少两倍,而细胞活力没有显着差异。总体而言,增加短干扰RNA浓度对核心岩藻糖基化有很大的干扰,而不是增加收获时间。
水和乙腈之间的比例决定了聚糖是在溶液中还是在微球中。在洗涤步骤中记住这一点至关重要,以避免从溶液中意外去除标记的聚糖。后续实验可能涉及使用基于细胞的测定来表征纯化的单克隆抗体,以量化抗体依赖性细胞介导的细胞毒性和补体依赖性细胞毒性。
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