Die heterogene Natur von Stammzellpopulationen ist noch nicht vollständig verstanden und bleibt ein großes Hindernis für die Entwicklung klinisch wirksamer stammzellbasierter therapeutischer Anwendungen. Eine der gebräuchlichsten Methoden zur Charakterisierung einer heterogenen Stammzellpopulation ist die Verwendung einer Zellsortiermethode, wie z. B. der fluoreszenzaktivierten Zellsortierung (FACS), um Zellen basierend auf ihren Oberflächenmarker-Expressionsprofilen zu trennen. Mit zunehmender Komplexität der Sortiermethoden wird es möglich, spezifischere funktionelle Subpopulationen von Zellen zu identifizieren. Mikrofluidik-basierte Technologien werden immer häufiger bei der Analyse der Genexpression auf Einzelzellebene eingesetzt. Die geplexte quantitative Polymerase-Kettenreaktion (qPCR) in einem mikrofluidischen Chip ermöglicht eine effektive und zuverlässige hochauflösende Einzelzell-Transkriptionsanalyse. 1-5
In einer früheren Studie, in der Einzelzell-Transkriptionsprofile von 48 Genen verwendet wurden, wurde eine beträchtliche transkriptionelle Heterogenität zwischen ASCs beobachtet. 6 Die Verteilung der Gene MSX2, BMP-5, BMP-7, ALP, OCN, RUNX2 zeigte jedoch eine starke Assoziation mit einem Cluster von Zellen mit hochgradig osteogenen Transkriptionsprofilen. Um Zellen entsprechend diesem osteogenen Genexpressionsprofil zu isolieren, wurden Oberflächenantigen-Expressionsmuster mit Transkriptionsmustern korreliert, und anschließend wurde entdeckt, dass die Oberflächenmarkerexpression von Endoglin (CD105) eng mit einem erhöhten osteogenen Differenzierungspotenzial von ASCs korreliert. Unabhängig von der CD105-Expression war die Expression des Oberflächenrezeptors Thy-1 (CD90), eines Glykosyl-Phosphatidylinositol-gebundenen Membranproteins, von dem Chen et al. zuvor gezeigt hatten, dass es mit Osteoprogenitorzellen assoziiert ist, auch mit der osteogenen Genexpression korreliert. 6,7 Diese Ergebnisse bieten die Möglichkeit, Subpopulationen innerhalb des größeren heterogenen Pools von ASCs mit erhöhter osteogener Kapazität für zellbasierte Bone Tissue Engineering-Anwendungen prospektiv zu isolieren.