Summary

लुकिंग ग्लास के माध्यम से: समय चूक माइक्रोस्कोपी और एकल कक्षों के अनुदैर्ध्य अध्ययन करने के लिए ट्रैकिंग विरोधी कैंसर चिकित्सा

Published: May 14, 2016
doi:

Summary

Here, we describe a method of long-term time-lapse microscopy to longitudinally track single cells in response to anti-cancer therapeutics.

Abstract

कैंसर रोधी दवाओं के लिए एकल कक्षों की प्रतिक्रिया आबादी प्रतिक्रिया का निर्धारण करने में महत्वपूर्ण योगदान देता है, और इसलिए कुल परिणाम में एक प्रमुख योगदान कारक है। Immunoblotting, प्रवाह cytometry और तय सेल प्रयोगों अक्सर अध्ययन करने के लिए कैसे कोशिकाओं को कैंसर रोधी दवाओं का जवाब उपयोग किया जाता है। इन तरीकों में महत्वपूर्ण हैं, लेकिन वे कई कमियों है। दवा प्रतिक्रियाओं में परिवर्तनशीलता कैंसर और सामान्य कोशिकाओं के बीच, और विभिन्न कैंसर कोशिकाओं की उत्पत्ति, और क्षणिक और दुर्लभ प्रतिक्रियाओं के बीच आबादी औसतन assays का उपयोग और सीधे ट्रैक और उन्हें longitudinally विश्लेषण करने के लिए सक्षम होने के बिना समझना मुश्किल है। माइक्रोस्कोप विशेष रूप से अच्छी छवि की जीवित कोशिकाओं के लिए अनुकूल है। प्रौद्योगिकी के क्षेत्र में प्रगति के एक संकल्प है कि न केवल सेल ट्रैकिंग, लेकिन यह भी सेलुलर प्रतिक्रियाओं की एक किस्म के अवलोकन के लिए सक्षम बनाता है पर नियमित रूप से छवि कोशिकाओं कर सकें। हम विस्तार में एक दृष्टिकोण है कि के निरंतर समय चूक इमेजिंग के लिए अनुमति देता है का वर्णनअनिवार्य रूप में लंबे समय, वांछित आम तौर पर 96 घंटा के लिए ऊपर के रूप में दवा के लिए प्रतिक्रिया के दौरान कोशिकाओं। दृष्टिकोण के रूपांतरों का प्रयोग, कोशिकाओं सप्ताह के लिए नजर रखी जा सकती है। आनुवंशिक रूप से इनकोडिंग फ्लोरोसेंट biosensors कई प्रक्रियाओं, रास्ते और प्रतिक्रियाओं के रोजगार के साथ पीछा किया जा सकता। हम उस पर नज़र रखने और सेल के विकास और कोशिका चक्र प्रगति, गुणसूत्र गतिशीलता, डीएनए की क्षति की मात्रा का ठहराव, और कोशिका मृत्यु में शामिल उदाहरण दिखाते हैं। हम यह भी तकनीक और इसके लचीलेपन के रूपांतरों पर चर्चा, और कुछ आम नुकसान पर प्रकाश डाला।

Introduction

लाइव सेल माइक्रोस्कोपी और एकल कक्षों के अनुदैर्ध्य ट्रैकिंग एक नई तकनीक नहीं है। जल्द से जल्द माइक्रोस्कोप से, उत्साही और वैज्ञानिकों मनाया और एकल कक्षों और जीवों, उनके व्यवहार, और विकास 1-3 अध्ययन किया है। 1950 के दशक में वेंडरबिल्ट विश्वविद्यालय में देर डेविड रोजर्स से एक प्रसिद्ध उदाहरण एक स्ताफ्य्लोकोच्चुस जीवाणु और अंततः phagocytosis 4 की प्रक्रिया का पीछा करते हुए एक रक्त धब्बा में एक मानव न्युट्रोफिल पता चलता है। इस लाइव सेल फिल्म कैसे कई प्रक्रियाओं मनाया जा सकता है और सहसंबद्ध एक ही प्रयोग में का एक उत्कृष्ट उदाहरण है: एक रासायनिक ढाल, यांत्रिकी और सेल गतिशीलता की गति की संवेदन, सेल गतिशीलता, आसंजन, और एक रोगज़नक़ के phagocytosis आकार।

पूरी तरह से स्वचालित माइक्रोस्कोप और अति संवेदनशील डिजिटल कैमरों के आगमन माइक्रोस्कोपी का उपयोग जांचकर्ताओं की एक बढ़ती हुई संख्या में हुई है कोशिका जीव विज्ञान से लेकर एफ में मौलिक सवाल पूछने के लिएROM कैसे कोशिकाओं 5,6 के लिए कदम और 7.8 विभाजित गतिशीलता और झिल्ली की तस्करी 9-11 organelle करने के लिए। गैर फ्लोरोसेंट, चरण विपरीत (पीसी) है, जो 1953 में Frits Zernike के लिए नोबेल पुरस्कार हुई हैं, और अंतर हस्तक्षेप विपरीत सहित brightfield माइक्रोस्कोपी, (डीआईसी) कोशिकाओं और नाभिक लेकिन यह भी microtubule बंडलों सहित उप सेलुलर संरचनाओं के अवलोकन के लिए अनुमति गुणसूत्रों, nucleoli, organelle गतिशीलता, और मोटी actin फाइबर 12। आनुवंशिक रूप से फ्लोरोसेंट प्रोटीन इनकोडिंग और अंगों के खिलाफ फ्लोरोसेंट रंगों के विकास नाटकीय रूप से समय चूक माइक्रोस्कोपी 13-15 असर पड़ा है। हालांकि इस लेख का ध्यान केंद्रित नहीं, सेल spheroids में और सीटू (intravital माइक्रोस्कोपी) confocal और multiphoton माइक्रोस्कोपी का उपयोग करने में इमेजिंग दृष्टिकोण का एक और विस्तार का प्रतिनिधित्व करते हैं, और वहाँ बकाया लेख है कि का उपयोग करें और इन तरीकों 16-19 पर चर्चा कर रहे हैं।

विरोधी CANC के लिए कोशिकाओं की प्रतिक्रियाएंएर दवाओं या प्राकृतिक उत्पादों आणविक और सेलुलर पैमाने पर निर्धारित होते हैं। समझना सेल प्रतिक्रिया और भाग्य इलाज के बाद अक्सर आबादी औसतन assays (जैसे।, Immunoblotting, पूरे अच्छी तरह के उपाय), या immunofluorescent का पता लगाने के साथ तय समय अंक और प्रवाह cytometry, जो एकल कक्षों को मापने शामिल है। आबादी के भीतर दवाओं के लिए एक सेल प्रतिक्रिया में विविधता, ट्यूमर में विशेष रूप से, सेल लाइनों और ट्यूमर है कि संतृप्ति में एक ही दवा के साथ व्यवहार कर रहे हैं भर में देखा प्रतिक्रिया में परिवर्तनशीलता के कुछ समझा जा सकता है। लंबे समय तक अनुदैर्ध्य दृष्टिकोण एक दिया एकल कक्ष या कक्षों की आबादी का पालन करने के लिए एक कम आम है लेकिन बहुत शक्तिशाली दृष्टिकोण है कि आणविक प्रतिक्रिया रास्ते में से प्रत्यक्ष अध्ययन के लिए अनुमति देता है, अलग अलग phenotypes (जैसे।, कोशिका मृत्यु या कोशिका विभाजन), के अवलोकन आबादी के भीतर सेल करने वाली सेल परिवर्तनशीलता, और कैसे इन कारकों जनसंख्या प्रतिक्रिया गतिशीलता 20-22 के लिए योगदान करते हैं। आशावादी, सक्षम होने के नातेनिरीक्षण और एकल कोशिका प्रतिक्रियाओं का अंदाजा कैसे दवाओं काम करते हैं, यही कारण है कि वे कभी कभी असफल हो, और करने के लिए सबसे अच्छा कैसे उन का उपयोग करने के बारे में हमारी समझ को बेहतर बनाने में मदद करने के लिए होगा।

लंबी अवधि के समय चूक माइक्रोस्कोपी, अनुदैर्ध्य ट्रैकिंग, और दवा प्रतिक्रियाओं का विश्लेषण करने की तकनीक कई जांचकर्ताओं के लिए उपलब्ध है और phenotype प्रतिक्रियाओं 20,21 निरीक्षण करने के लिए केवल प्रेषित प्रकाश का उपयोग कर, आसान हो सकता है। दृष्टिकोण के मुख्य घटक शामिल हैं: ब्याज की कोशिकाओं की उचित तैयारी, पर्यावरण कक्ष के साथ एक स्वचालित माइक्रोस्कोप, एक कैमरा एक कंप्यूटर के साथ प्राप्त करने के लिए और समय चूक की समीक्षा करने के लिए छवियों को स्टोर, और सॉफ्टवेयर और मापने के लिए और कोशिकाओं का विश्लेषण एकीकृत और किसी भी फ्लोरोसेंट biosensors। हम brightfield और / या widefield epifluorescent माइक्रोस्कोपी का उपयोग कर के रूप में लंबे समय के रूप में कई दिनों के लिए संवर्धित कोशिकाओं के समय चूक माइक्रोस्कोपी के संचालन के लिए कई सुझावों के साथ एक विस्तृत प्रोटोकॉल प्रदान करते हैं। इस प्रोटोकॉल किसी भी कोशिका लाइन के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है कि संस्कृति में उगाया जा सकता हैविरोधी कैंसर उपचार के लिए उनकी प्रतिक्रियाओं का अध्ययन करने के लिए। हम अधिग्रहीत डेटा का उदाहरण देते हैं और कई अलग अलग आनुवंशिक रूप से इनकोडिंग फ्लोरोसेंट biosensors और चरण विपरीत माइक्रोस्कोपी का एक उदाहरण का उपयोग करते हुए विश्लेषण किया है, संक्षेप में जांच के विभिन्न प्रकार के फायदे और लंबी अवधि के समय चूक और अनुदैर्ध्य ट्रैकिंग के नुकसान पर चर्चा, क्या हो सकता है इस दृष्टिकोण है कि गैर प्रत्यक्ष दृष्टिकोण, और कुछ बदलाव है कि हमें आशा है कि ब्याज और अनुभवहीन शोधकर्ताओं जो दृष्टिकोण का उपयोग करने के लिए विचार नहीं किया है मूल्य का हो जाएगा से समझने के लिए मुश्किल है, और अनुभवी शोधकर्ताओं के लिए है के लिए सीखा है।

Protocol

निम्नलिखित प्रोटोकॉल आंकड़े 4 और 6 के बारे में अधिग्रहण सेटिंग्स और प्रयोगात्मक शर्तों में प्रयोगों द्वारा निर्धारित मापदंडों का उपयोग करता है। इन मानकों में से कई अन्य प्रयोगों फिट करन?…

Representative Results

लंबी अवधि के समय चूक माइक्रोस्कोपी और प्रत्यक्ष अनुदैर्ध्य ट्रैकिंग दवा प्रतिक्रिया के दौरान कई विरोधी कैंसर प्रभाव के अध्ययन के लिए अनुमति देता है। चित्रा 1 में सामान्य रूपरेखा क…

Discussion

समय चूक माइक्रोस्कोपी और अनुदैर्ध्य ट्रैकिंग के लाभ

माइक्रोस्कोप दवा प्रतिक्रिया के अनुदैर्ध्य अध्ययन के लिए एक आदर्श साधन के रूप में यह जांचकर्ताओं व्यक्ति की कोशिकाओं और उनके भा…

Offenlegungen

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank Joshua Marcus for technical support and Jolien Tyler, Ph.D., Director of the Richard J. McIntosh Light Microscopy Core Facility, for technical advice. This work was supported by funds from the University of Colorado Boulder and the University of Colorado Boulder Graduate School to J.D.O. R.T.B. is partially supported by pre-doctoral training grant from the NIH (T32 GM008759). We thank Karyopharm Therapeutics, Inc. for selinexor and Merck Serono for Kinesin-5 inhibitor. FUCCI plasmids are from Atsushi Miyawaki (RIKEN, Japan) via MTA. mCherry-BP1-2 was from Addgene. HeLa expressing H2b-mCherry and β-tubulin-EGFP are from Daniel Gerlich (IMBA, Austrian Academy of Sciences, Austria).

Materials

Taxol (paclitaxel) Sigma T7191 microtubule stabilizing drug
etoposide Selleckchem S1225 topoisomerase II inhibitor
selinexor Karyopharm Therapeutics na XPO1/CRM1 inhibitor, gift
Kinesin-5 inhibitor Merck Serono na gift, also available from American Custom Chemicals Corporation. CAS 858668-07-2
cell growth medium HyClone (Fisher) or Mediatech many companies available
5% CO2/balance air, certified Airgas Z03NI7222004379
35mm dish, 20mm glass bottom Cellvis D35-20-1.5-N many companies available
35mm 4 well dish, 20mm glass bottom Cellvis D35C4-20-1.5-N many companies available
35mm dish, gridded glass bottom MatTek P35G-2-14-CGRD many companies available
multi-well, glass bottom Cellvis P12-1.5H-N many companies available
Olympus IX81 inverted epifluorescence microscope Olympus
Olympus IX2-UCB controller Olympus
PRIOR LumenPro200 Prior Scientific Lumen200PRO
PRIOR Proscan III motorized stage Prio Scientific H117
STEV chamber InVivo Scientific STEV.ECU.HC5 STAGE TOP
Environmental Controller Unit InVivo Scientific STEV.ECU.HC5 STAGE TOP
Hamamatsu ORCA R2 CCD with controller Hamamatsu C10600
Nikon Eclipse Ti Nikon
Nikon laser launch Nikon
SOLA light engine lumencor
iXon Ultra 897 EM-CCD ANDOR 
TOKAI HIT inclubation chamber TOKAI HIT TIZSH

Referenzen

  1. Abercrombie, M., Heaysman, J. E., Pegrum, S. M. The locomotion of fibroblasts in culture I. Movements of the leading edge. Exp Cell Res. 59, 393-398 (1970).
  2. Abercrombie, M., Heaysman, J. E. Observations on the social behaviour of cells in tissue culture. I. Speed of movement of chick heart fibroblasts in relation to their mutual contacts. Exp Cell Res. 5, 111-131 (1953).
  3. Landecker, H. Seeing things: from microcinematography to live cell imaging. Nat Methods. 6, 707-709 (2009).
  4. van Roosmalen, W., Le Devedec, S. E., Zovko, S., de Bont, H., Bvan de Water, . Functional screening with a live cell imaging-based random cell migration assay. Methods Mol Biol. 769, 435-448 (2011).
  5. Krueger, E. W., Orth, J. D., Cao, H., McNiven, M. A. A dynamin-cortactin-Arp2/3 complex mediates actin reorganization in growth factor-stimulated cells. Mol Biol Cell. 14, 1085-1096 (2003).
  6. Cluet, D., Stebe, P. N., Riche, S., Spichty, M., Delattre, M. Automated high-throughput quantification of mitotic spindle positioning from DIC movies of Caenorhabditis embryos. PLoS One. 9 (e93718), (2014).
  7. Held, M., et al. Cell Cognition: time-resolved phenotype annotation in high-throughput live cell imaging. Nat Methods. 7, 747-754 (2010).
  8. Orth, J. D., Krueger, E. W., Weller, S. G., McNiven, M. A. A novel endocytic mechanism of epidermal growth factor receptor sequestration and internalization. Cancer Res. 66, 3603-3610 (2006).
  9. Rowland, A. A., Chitwood, P. J., Phillips, M. J., Voeltz, G. K. ER contact sites define the position and timing of endosome fission. Cell. 159, 1027-1041 (2014).
  10. Merrifield, C. J., Feldman, M. E., Wan, L., Almers, W. Imaging actin and dynamin recruitment during invagination of single clathrin-coated pits. Nat Cell Biol. 4, 691-698 (2002).
  11. Centonze Frohlich, V. Phase contrast and differential interference contrast (DIC) microscopy. J Vis Exp. , (2008).
  12. Drummen, G. P. Fluorescent probes and fluorescence (microscopy) techniques–illuminating biological and biomedical research. Molecules. 17, 14067-14090 (2012).
  13. Guan, Y., et al. Live-cell multiphoton fluorescence correlation spectroscopy with an improved large Stokes shift fluorescent protein. Mol Biol Cell. 26, 2054-2066 (2015).
  14. Snapp, E. L. Fluorescent proteins: a cell biologist’s user guide. Trends Cell Biol. 19, 649-655 (2009).
  15. Orth, J. D., et al. Analysis of mitosis and antimitotic drug responses in tumors by in vivo microscopy and single-cell pharmacodynamics. Cancer Res. 71, 4608-4616 (2011).
  16. Brown, E., Munn, L. L., Fukumura, D., Jain, R. K. In vivo imaging of tumors. Cold Spring Harb Protoc. (5452), (2010).
  17. Chittajallu, D. R., et al. In vivo cell-cycle profiling in xenograft tumors by quantitative intravital microscopy. Nat Methods. 12, 577-585 (2015).
  18. Nakasone, E. S., Askautrud, H. A., Egeblad, M. Live imaging of drug responses in the tumor microenvironment in mouse models of breast cancer. J Vis Exp. (50088), (2013).
  19. Orth, J. D., et al. Quantitative live imaging of cancer and normal cells treated with Kinesin-5 inhibitors indicates significant differences in phenotypic responses and cell fate. Mol Cancer Ther. 7, 3480-3489 (2008).
  20. Gascoigne, K. E., Taylor, S. S. Cancer cells display profound intra- and interline variation following prolonged exposure to antimitotic drugs. Cancer Cell. 14, 111-122 (2008).
  21. Yang, R., Niepel, M., Mitchison, T. K., Sorger, P. K. Dissecting variability in responses to cancer chemotherapy through systems pharmacology. Clin Pharmacol Ther. 88, 34-38 (2010).
  22. Orth, J. D., McNiven, M. A. Get off my back! Rapid receptor internalization through circular dorsal ruffles. Cancer Res. 66, 11094-11096 (2006).
  23. Li, J., et al. Co-inhibition of polo-like kinase 1 and Aurora kinases promotes mitotic catastrophe. Oncotarget. 6, 9327-9340 (2015).
  24. Orth, J. D., Loewer, A., Lahav, G., Mitchison, T. J. Prolonged mitotic arrest triggers partial activation of apoptosis, resulting in DNA damage and p53 induction. Mol Biol Cell. 23, 567-576 (2012).
  25. Batchelor, E., Loewer, A., Mock, C., Lahav, G. Stimulus-dependent dynamics of p53 in single cells. Mol Syst Biol. 7 (488), (2011).
  26. Purvis, J. E., et al. p53 dynamics control cell fate. Science. 336, 1440-1444 (2012).
  27. Zhang, C. Z., Leibowitz, M. L., Pellman, D. Chromothripsis and beyond: rapid genome evolution from complex chromosomal rearrangements. Genes Dev. 27, 2513-2530 (2013).
  28. Zhang, C. Z., et al. Chromothripsis from DNA damage in micronuclei. Nature. 522, 179-184 (2015).
  29. Sakaue-Sawano, A., et al. Visualizing spatiotemporal dynamics of multicellular cell-cycle progression. Cell. 132, 487-498 (2008).
  30. Neggers, J. E., et al. Identifying drug-target selectivity of small-molecule CRM1/XPO1 inhibitors by CRISPR/Cas9 genome editing. Chem Biol. 22, 107-116 (2015).
  31. Gravina, G. L., et al. XPO1/CRM1-Selective Inhibitors of Nuclear Export (SINE) reduce tumor spreading and improve overall survival in preclinical models of prostate cancer (PCa). Journal of hematology and oncology. 7 (46), (2014).
  32. Mendonca, J., et al. Selective inhibitors of nuclear export (SINE) as novel therapeutics for prostate cancer. Oncotarget. 5, 6102-6112 (2014).
  33. Marcus, J. M., Burke, R. T., DeSisto, J. A., Landesman, Y., Orth, J. D. Longitudinal tracking of single live cancer cells to understand cell cycle effects of the nuclear export inhibitor, selinexor. Scientific reports. 5, 14391 (2015).
  34. Senapedis, W. T., Baloglu, E., Landesman, Y. Clinical translation of nuclear export inhibitors in cancer. Semin Cancer Biol. 27, 74-86 (2014).
  35. Dimitrova, N., Chen, Y. C., Spector, D. L., de Lange, T. 53BP1 promotes non-homologous end joining of telomeres by increasing chromatin mobility. Nature. 456, 524-528 (2008).
  36. D’Arpa, P., Beardmore, C., Liu, L. F. Involvement of nucleic acid synthesis in cell killing mechanisms of topoisomerase poisons. Cancer Res. 50, 6919-6924 (1990).
  37. Palmitelli, M., de Campos-Nebel, M., Gonzalez-Cid, M. Progression of chromosomal damage induced by etoposide in G2 phase in a DNA-PKcs-deficient context. Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology. , (2015).
  38. Albeck, J. G., Burke, J. M., Spencer, S. L., Lauffenburger, D. A., Sorger, P. K. Modeling a snap-action, variable-delay switch controlling extrinsic cell death. PLoS biology. 6, 2831-2852 (2008).
  39. N’Diaye, E. N., et al. PLIC proteins or ubiquilins regulate autophagy-dependent cell survival during nutrient starvation. EMBO reports. 10, 173-179 (2009).
  40. Xu, J., Liu, Z. F., Wang, J., Deng, P., Jiang, Y. Study of localization and translocation of human high mobility group protein B1 in eukaryotic cells. Zhongguo wei zhong bing ji jiu yi xue = Chinese critical care medicine = Zhongguo weizhongbing jijiuyixue. 18, 338-341 (2006).
  41. Hoppe, G., Talcott, K. E., Bhattacharya, S. K., Crabb, J. W., Sears, J. E. Molecular basis for the redox control of nuclear transport of the structural chromatin protein Hmgb1. Exp Cell Res. 312, 3526-3538 (2006).
  42. Moshfegh, Y., Bravo-Cordero, J. J., Miskolci, V., Condeelis, J., Hodgson, L. A Trio-Rac1-Pak1 signalling axis drives invadopodia disassembly. Nat Cell Biol. 16, 574-586 (2014).
  43. Yu, X., Machesky, L. M. Cells assemble invadopodia-like structures and invade into matrigel in a matrix metalloprotease dependent manner in the circular invasion assay. PLoS One. 7 (e30605), (2012).
  44. Neumann, B., et al. Phenotypic profiling of the human genome by time-lapse microscopy reveals cell division genes. Nature. 464, 721-727 (2010).
  45. Burnette, D. T., et al. A role for actin arcs in the leading-edge advance of migrating cells. Nat Cell Biol. 13, 371-381 (2011).
  46. Matov, A., et al. Analysis of microtubule dynamic instability using a plus-end growth marker. Nat Methods. 7, 761-768 (2010).
  47. Wollman, R., Meyer, T. Coordinated oscillations in cortical actin and Ca2+ correlate with cycles of vesicle secretion. Nat Cell Biol. 14, 1261-1269 (2012).
  48. Day, R. N., Davidson, M. W. The fluorescent protein palette: tools for cellular imaging. Chemical Society reviews. 38, 2887-2921 (2009).
  49. Kilgore, J. A., Dolman, N. J., Davidson, M. W., Robinson, J. .. . P. a. u. l., et al. A review of reagents for fluorescence microscopy of cellular compartments and structures, Part II: reagents for non-vesicular organelles. Current protocols in cytometry. 66, (2013).
  50. Pittet, M. J., Weissleder, R. Intravital imaging. Cell. 147, 983-991 (2011).
  51. Shi, J., Zhou, Y., Huang, H. C., Mitchison, T. J. Navitoclax (ABT-263) accelerates apoptosis during drug-induced mitotic arrest by antagonizing Bcl-xL. Cancer Res. 71, 4518-4526 (2011).
  52. Tan, N., et al. Navitoclax enhances the efficacy of taxanes in non-small cell lung cancer models. Clin Cancer Res. 17, 1394-1404 (2011).
  53. Ramapathiran, L., et al. Single-cell imaging of the heat-shock response in colon cancer cells suggests that magnitude and length rather than time of onset determines resistance to apoptosis. J Cell Sci. 127, 609-619 (2014).

Play Video

Diesen Artikel zitieren
Burke, R. T., Orth, J. D. Through the Looking Glass: Time-lapse Microscopy and Longitudinal Tracking of Single Cells to Study Anti-cancer Therapeutics. J. Vis. Exp. (111), e53994, doi:10.3791/53994 (2016).

View Video