1. Lösungsvorbereitung (im Voraus durchzuführen)
- Fibrinogen-Markierung
HINWEIS: Der Markierungsschritt ist nur erforderlich, wenn die Analyse der Verformung des Fibringels gewünscht wird. Für zelluläre Experimente ist es möglich, ein unmarkiertes Gel zu verwenden.
- 38 μL 10 mg/ml Succinimidylester-Fluoreszenzfarbstoff (gelöst in DMSO) zu 1,5 ml 15 mg/ml Fibrinogenlösung (Molverhältnis 5:1) in ein 50-ml-Zentrifugenröhrchen geben und für 1 Stunde bei Raumtemperatur auf einen Shaker legen. Anschließend legen Sie das Röhrchen für 3 Minuten bei 800 x g (Raumtemperatur) in die Zentrifuge.
- Filtern Sie den Überstand aus dem vorherigen Schritt durch eine Entsalzungssäule, die mit Dextrangelharz (Table of Materials) verpackt ist, um den nicht umgesetzten Farbstoff zu trennen,42, indem Sie diese Schritte ausführen.
- Waschen Sie die Säule mit 25 ml Fibrinogenpuffer vor.
- Injizieren Sie das markierte Fibrinogen aus Schritt 1.1.1 langsam in die Säule und stellen Sie sicher, dass keine Blasen in den Filter gelangen. Verwerfen Sie die ersten ~ 0,3 ml eluierte Lösung (4-6 Tropfen schwach gefärbte Flüssigkeit). Sammeln Sie dann die folgenden 1,0-1,5 ml gereinigte Lösung (folgen Sie dem Protokoll des Herstellers für genauere Details).
- Beenden Sie den Filtrationsprozess, indem Sie die resultierende gereinigte Lösung mit einem spritzengetriebenen Filter (0,22-0,45 μm) sterilisieren.
- Um die Säule zu reinigen und zu recyceln, waschen Sie mit 20 ml Fibrinogenpuffer und lagern Sie sie dann in 25 ml 20% Ethanol.
- Nach der Elution teilen Sie das resultierende gereinigte markierte Fibrinogen in kleine Aliquoten von ~ 7-50 μL, abhängig von der gewünschten Anzahl von gedehnten Gelen. Bereiten Sie für jedes gedehnte Kreisgel mit einem Durchmesser von 2 mm etwa 3,5 μL Fibrinogen vor (2,5 μL werden pro Gel + 1 μL für Pipettierfehler verwendet).
- Lagern Sie die Aliquoten in einem -20 °C Gefrierschrank. Sie können bis zu etwa einem Jahr verwendet werden (es wird nicht empfohlen, aufzutauen und wieder einzufrieren).
- Für den Rest dieses Protokolls halten Sie etwa 7 μL des gereinigten markierten Fibrinogens bis Schritt 4 im Kühlschrank (4 °C). Dieses Volumen ist für die Herstellung von zwei gedehnten Gelen vorgesehen (2,5 μL werden pro Gel benötigt, und ein zusätzliches Volumen von 1 μL wird verwendet, um Fehler bei der Probenvorbereitung zu berücksichtigen).
HINWEIS: Dieses Filterverfahren verdünnt typischerweise die anfängliche 15 mg / ml Fibrinogenlösung auf eine Endkonzentration von etwa 10 mg / ml. Der Verdünnungsfaktor hängt vom Anfangsvolumen und der Konzentration von Fibrinogen ab, wie im Protokoll des Herstellers angegeben.
- 7 μL Thrombinlösung vorbereiten (mit Thrombinpuffer auf 2 Einheiten/ml verdünnen, Materialtabelle)und bis Schritt 4 im Kühlschrank (4 °C) aufbewahren. Dieses Volumen soll die Ausschnitte von zwei gestreckten Gelen füllen.
HINWEIS: Zur Durchführung einer internen Dehnungsanalyse sollten fluoreszierende kugelförmige Perlen mit einem Durchmesser von 1 μm (gekauft als Suspension [2% Feststoffe] in Wasser plus 2 mM NaN3)zur Thrombinlösung hinzugefügt werden (ein Verhältnis von 1:25 v/v % Perle:Thrombin wird für ein 40-faches Ziel empfohlen). Perlen sollten nur eingeschlossen werden, wenn interne Dehnungsmessungen gewünscht werden, entweder in Gegenwart oder Abwesenheit von Zellen.
2. Silikonstreifenvorbereitung
- Holen Sie den 0,5 mm dicken Silikonkautschuk und schneiden Sie ihn in 15 x 80 mm2 Streifen mit einem Loch mit 2 mm Durchmesser in der Mitte des Streifens (Abbildung 1). Wenn möglich, verwenden Sie einen programmierbaren Laserschneider für hohe Präzision. Wenn keine programmierbaren Maschinen zur Verfügung stehen, reicht eine Schere zum Schneiden des Bandumrisses aus und ein kleiner Locher ist für den Mittelausschnitt ausreichend.
HINWEIS: Kommerzieller Silikonkautschuk wird normalerweise mit Beidseitig mit Plastikfolie gekauft. Bewahren Sie nach Möglichkeit eine originale Kunststoffabdeckung auf beiden Seiten des Silikons auf. Wenn Sie Silikonstreifen aus einem früheren Experiment wiederverwenden, behandeln Sie sie 0,5 Stunden lang mit Trypsin, tränken Sie 0,5 Stunden lang 0,2 M NaOH ein und weichen Sie sie dann 1 Stunde lang in 70% Ethanol ein. Lassen Sie sie vor Gebrauch trocknen.
- Bereiten Sie Dichtfilmschichten (hydrophobe) Schichten mit Abmessungen von mindestens 20 × 30 mm2vor, damit sie breiter als der Silikonstreifen sind und sich so eine Dichtung über den gesamten geometrischen Ausschnitt bilden kann.
- Waschen Sie eine 10-cm-Schüssel mit 70% Ethanol und wischen und trocknen Sie sie dann mit nicht linting empfindlichen Aufgabentüchern ab (sowohl für sterile als auch für nicht sterile Experimente). Dieser Schritt ist wichtig, da er es den Siegelfilmschichten ermöglicht, besser an der Platte zu haften und die Bewegung der Probe während des Vorbereitungsprozesses einzuschränken.
- Legen Sie die Siegelfolienschichten in die gewaschene 10-cm-Schüssel, damit genügend Platz vorhanden ist, um zwei Streifen nebeneinander in jede Schüssel zu legen (Abbildung 2A).
- Entfernen Sie die Plastikfolie von einer Seite des Silikonstreifens und legen Sie die freiliegende Seite auf die Siegelfolienschicht, so dass der Ausschnitt vollständig von der Siegelfolienschicht umgeben ist (Abbildung 2B). Drücken Sie dann vorsichtig auf das Silikon gegen die Dichtfilmschicht, um den Bereich um den Ausschnitt mit sauberen behandschuhten Fingern zu versiegeln.
HINWEIS: Stellen Sie sicher, dass sich keine Lufteinschlüsse zwischen dem Silikon und der Dichtfolie befinden, insbesondere um den Ausschnitt herum. Untersuchen Sie dazu die Unterseite der Schüssel (Abbildung 2C).

Abbildung 1: Hydrogel-Belastungsansatz. (A) 15 × 80 mm2 Silikonstreifen mit einem Ausschnitt von 2 mm Durchmesser in der Mitte des Streifens (B) Ein Silikonstreifen mit einem kreisförmigen Ausschnitt mit eingebettetem Fibringel. Zur Veranschaulichung ist der Ausschnitt im Silikon größer als in den eigentlichen Experimenten (C) Schematische Darstellung des Dehnansatzes mit dem Silikonstreifen (orange), kreisförmigem Gel (Ausschnitt in der Mitte) und Stoffverlängerern (grün), die das Silikon mit der Dehnvorrichtung verbinden. Vergrößerte Fläche des Gels zeigt die Verformung des Gels als Reaktion auf einachsige Dehnung des Silikons an. Der Einfachheit halber ist die Kompressionentlang der Dicke des Gels (Z-Achse) in der Abbildung nicht dargestellt. Die Abbildungen 1B & 1C wurden von Roitblat Riba et al.41adaptiertBitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Beispiel für die korrekte Platzierung eines Silikonstreifens auf einer Dichtfilmschicht vor der Gelpolymerisation. (A) Platzierung von zwei Dichtfilmschichten in einer 10 cm großen Schüssel (B) Platzierung von Silikonstreifen auf den Dichtfilmschichten (C) Unteransicht der Schüssel, die die Luftdichtung zwischen dem Silikon und der Siegelfolienschicht zeigt. Links: Ordnungsgemäße Abdichtung der Dichtfilmschicht mit dem Silikonstreifen um den Ausschnitt ohne Lufteinschlüsse. Rechts: Unsachgemäße Abdichtung der Dichtfilmschicht zum Silikonstreifenausschnitt mit Lufteinschlüssen am Rand des Ausschnitts. Dies führt zu einem Auslaufen der Hydrogelkomponenten unter dem Silikon. Der rote Pfeil zeigt auf einen Bereich, in dem sich eine Lufttasche gebildet hat. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
3. Thrombin mit Zellen zubereiten
HINWEIS: Führen Sie diesen Schritt nur durch, wenn das Einbetten von Zellen in das Hydrogel gewünscht ist, und unter sterilen Bedingungen in einer biologischen Haube (Materialtabelle).
- Sterilisation: Am Tag vor dem Zellexperiment die Silikonstreifen und Siegelfilmschichten über Nacht in 70% Ethanol legen und dann 30 Minuten lang auf jeder Seite UV-Sterilisation durchführen (wenn das 10 cm Geschirr nicht bereits steril ist, sollte es auch nach einer 70% igen Ethanolwäsche 30 Minuten lang unter UV-Licht sterilisiert werden). Das im Protokoll verwendete UV-System ist dasjenige, das in die biologische Haube eingebaut ist.
HINWEIS: Alternativ kann ein Autoklaven-Sterilisationszyklus (140 °C) an den Silikonstreifen durchgeführt werden, da sie bis zu 260 °C beständig sind.
- Führen Sie eine Zellzählung durch, um die Zellkonzentration zu bestimmen, und zentrifugieren und suspendieren Sie dann das Zellpellet mit 7 μL Thrombin (2 Einheiten / ml) in einem 1,5 ml Zentrifugenröhrchen. Wir empfehlen eine Zellkonzentration von 800 Zellen/μL Thrombin. Halten Sie die Zellen bis zum Gebrauch gekühlt (überschreiten Sie nicht mehr als eine halbe Stunde, um eine Schädigung der Zellen zu vermeiden).
4. Polymerisation von Fibringelen
- Holen Sie die 2 Unit/ ml Thrombin & 10 mg / ml markierte Fibrinogenlösungen aus dem Kühlschrank (vorbereitet in Schritt 1) und legen Sie sie auf Eis, wo sie zugänglich sind.
HINWEIS: Lösungen werden vor dem Mischprozess kalt gehalten, um die Kinetik der Polymerisationsreaktion zu verlangsamen. Dies ermöglicht eine homogenere Mischung der Proteine.
- Extrahieren Sie bei der Einrichtung der Schüssel(n) (Schritt 2) 2,5 μL markiertes Fibrinogen und pipetieren Sie es gleichmäßig in den Silikonausschnitt (wobei die Siegelfilmschicht an der Unterseite befestigt ist), so dass der gesamte Umfang des Ausschnitts mit Fibrinogen in Kontakt kommt. Achten Sie darauf, dass sich nirgendwo in der Lösung Lufteinschlüsse oder Blasen bilden, wobei Sie besonders auf die unteren Kanten des Ausschnitts (die Schnittstelle zwischen der Dichtungsfolienschicht und silikon) achten.
- Nehmen Sie sofort 2,5 μL Thrombin (mit oder ohne Zellen/Perlen) und pipetieren Sie es direkt in die Fibrinogenlösung im Ausschnitt (erreichen Sie das Endvolumen von 5 μL Fibrin). Mischen Sie dann schnell die beiden Lösungen, indem Sie sorgfältig ~ 10 Mal auf und ab pipettieren. Bewegen Sie während des Mischvorgangs die Spitze um das gesamte Volumen, um eine möglichst homogene Lösung zu erhalten.
- Fügen Sie eine sehr kleine Menge Phosphatpuffersalzlösung (PBS) [alternativ Zellmedium für Zellexperimente, Materialtabelle]entlang des Randes jeder Schüssel hinzu, damit das Hydrogel während des Polymerisationsprozesses nicht austrocknet. Stellen Sie sicher, dass kein Kontakt zwischen dem PBS/Zellmedium und den Proben besteht, da dies die Probe beschädigt.
- Decken Sie die Schüssel(n) ab und stellen Sie sie für 30 Minuten bei 37 °C in den Inkubator.
HINWEIS: Die erforderliche Inkubationszeit ist abhängig vom Volumen des Gels. Werden größere Volumina verwendet, sollte sich die Inkubationszeit erhöhen.
- Entfernen Sie die Schüssel(n) aus dem Inkubator und fügen Sie PBS / Zellmedium in die Schüssel hinzu, wobei das gesamte Gel-Silikon-Konstrukt untergetaucht wird.
- Heben Sie die Probenkonstrukte vorsichtig einzeln aus der Schüssel und stellen Sie sicher, dass die Siegelfilmschicht auf dem Streifen haftet. Lösen Sie die Dichtfilmschicht langsam vom Silikon, indem Sie vorsichtig von einem Ende des Silikons zum anderen rühren (Abbildung 3). Vermeiden Sie das Ziehen aus Bereichen in der Nähe des Ausschnitts, in denen Spannungskonzentrationen vorhanden sein können (dies ist hauptsächlich für nicht kreisförmige Geometrien wichtig). Vermeiden Sie jeglichen Kontakt mit dem Ausschnitt, da er die Probe beschädigt.
- Legen Sie den Streifen mit PBS / Zellmedium wieder in die Schüssel, so dass der Streifen in der Schüssel schwimmt. Dann nehmen Sie die Schüssel(n) zu einem Standard-Zellkulturmikroskop, um den Zustand jeder Probe qualitativ zu beurteilen. Gele müssen gleichmäßig und durchgehend im gesamten Ausschnitt sein und keine Blasen sollten vorhanden sein. Wählen Sie anhand von Abbildung 4 die besten Proben für die weitere Analyse aus.

Abbildung 3: Ordnungsgemäßes Entfernen der Dichtfilmschicht vom Boden des Silikonstreifens. Der Entfernungsprozess sollte langsam durchgeführt werden, damit das Hydrogel seine Haftung an den Innenwänden des Ausschnitts nicht reißt oder bricht. Der weiße Pfeil zeigt die Entfernungsrichtung an. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 4: Mikroskopische Beobachtung von Fibringelen im Silikonausschnitt. (A) Zwei Beispiele für ein richtig polymerisiertes Fibringel. Beachten Sie die relative Homogenität des Gels und die vollständige Haftung an den Rändern des Ausschnitts (B) Zwei Beispiele für Probenpolymerisationsfehler. Oben: Beachten Sie die vielen Blasen und die Aggregate, die sich unten links bilden. Unten: Beachten Sie das Reißen des Gels von den Ausschnittkanten und den Aggregaten im unteren linken Bereich des Ausschnitts. Maßstabsleiste = 300 μm Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
5. Probenladen auf das SCyUS-Gerät
- Füllen Sie das Bad mit PBS/Zellmedium (Abbildung 5) und legen Sie den Silikonstreifen, der das Probengel trägt, über die Oberseite, so dass die Enden auf jeder Seite des Bades sitzen. Das Bad soll ein Austrocknen des Gels vermeiden. Legen und festziehen Sie die Klemmen (lila) zusammen mit den Stoffstreifen (grün), so dass alle Teile zu einem geraden Streifen mit dem Ausschnitt in der Mitte verbunden sind (Abbildung 5).
- Rufen Sie das SCyUS-Gerät ab, und befestigen Sie die Aluminiumflüssigkeitsbohrung und den rechteckigen Glasdeckel von 22 mm x 40 mm (Nr. 1 oder 1,5)(Abbildung 6Aiii). Befestigen Sie den Deckelschlupf mit Dichtungsmaterial (z. B. Vakuumfett) an der Unterseite des Brunnens, damit der Brunnen ohne Leckage mit Flüssigkeit gefüllt werden kann.
- Füllen Sie den Brunnen mit ~ 1-2 ml PBS / Zellmedium und legen Sie den Streifen + Stoff + Gelkonstrukt (Abbildung 6B) in das Gerät. Klemmen Sie den Stoffstreifen (2) in die Halterung (1), so dass sich der Ausschnitt + Gel (5) wie gezeigt in der Mitte befindet, legen Sie dann vorsichtig den Pin-Down-Einsatz (4) in das Gerät und verriegeln Sie ihn.
- Als nächstes setzen Sie die andere Gewebeseite in die Spindel ein (ohne den Servomotor zu befestigen) und verriegeln Sie sie in der Spindel (Abbildung 6C).
- Setzen Sie das SCyUS-Gerät mit der angeschlossenen Probe in die Stufe des Mikroskops ein (Abbildung 6C). Verbinden Sie den Mikrocontroller (Table of Materials) über ein USB-Kabel mit dem Computer und verbinden Sie den Servomotor mit dem Mikrocontroller. Öffnen Sie das SCyUS-Steuermodul auf dem Computer. Die Probe ist nun bereit für die Bildgebung, um die Angemessenheit der Dicke des Gels und der Faserhomogenität unter dem konfokalen Mikroskop zu überprüfen.

Abbildung 5: (A) Vorrichtung, die ein PBS-Bad enthält (3D-gedruckt) (B) Streifenplatzierung auf der Vorrichtung, um eine ordnungsgemäße Inline-Befestigung der Halterungen (in lila) zu gewährleisten und das Trocknen des Gels zu verhindern. Diese Zahl wurde mit Genehmigung von Roitblat Riba et al.41geändertBitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 6: SCyUS-Stretching-Gerät. (A) Mehrere Ansichten eines CAD-Modells der Hauptteile des SCyUS: Spindel, die mit dem Servo verbunden ist (blau), statischer Anker (rot), Einsatz, der den Silikonstreifen festnagelt (lila) und Fixierer, die verhindern, dass der Einsatz aufsteigt (gelb-grün). Eine Oberansicht des Systems (Ai), eine Schnittansicht des Systems (Aii), die den Weg des Streifens (orange Linie) zeigt, und eine Unteransicht (Aiii) des Aluminiumflüssigkeitsbrunnens mit einem Glasdeckel. Der Flüssigkeitsbrunnen kann mit der Drehung einer Schraube, die in das Hauptgewinde einpasst, auf und ab bewegt werden. Die Aufwärtsbewegung der Aluminiumbohrung wird durch die Seitenflügel des violetten Einsatzes begrenzt, wie die weißen Pfeile zeigen (B) Das eigentliche System: (1) statischer Anker (2) grünes nicht dehnbares Gewebe ( 3 )Schraubezur Höhenkontrolle des Aluminiumflüssigkeitsbrunnens (4) roter Pin-Down-Einsatz (5) ein Silikonstreifen mit einem kreisförmigen Ausschnitt (6) blaue Verbindungsklemmen (C) Das Auf einem konfokalen Mikroskop platzierte Stretchsystem. Der Servomotor und die Spindel sind mit Pfeilen dargestellt. Diese Zahl wurde mit Genehmigung von Roitblat Riba et al.41geändertBitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
6. Stellen Sie sicher, dass ein ausreichendes Gel für die Probenahme geeignet ist
- Mit dem konfokalen Mikroskop (Table of Materials) wird ein konfokaler Z-Stack (≤10× Z-Scheiben mit einer Schrittgröße von ca. 10 μm ausreichend) mit niedriger Vergrößerung (~ 1,4 μm Pixelgröße) des gesamten Gels mit Lasern von 488/543/561 (≤10 Z-Scheiben mit einer Schrittgröße von ca. 10 μm ist ausreichend) Fliesenbild des gesamten Gels untersucht, um homogene Und Haftung am Umfang des geometrischen Ausschnitts während der gesamten Dicke des Silikons zu untersuchen ( Abbildung7A-B). Verwenden Sie dieses Z-Stack-Bild als Karte für die folgenden Schritte.
- Scannen Sie mit Hilfe der hochauflösenden Live-Bildgebung das Gel und bestimmen Sie die niedrigste Z-Position,bei der die volle Haftung an den Innenwänden des Ausschnitts ohne Risse oder Blasen sichtbar ist, und notieren Sie die Z-Positiondes Mikroskops ( Zl). Um die vollständige Haftung des Gels am Silikon während seines gesamten Umfangs zu bestimmen, scannen Sie die Grenzfläche der fluoreszierenden Markierung des Gels und des Silikonstreifens (dunkler Hintergrund) unter dem Mikroskop (Abbildung 7C).
- Bewegen Sie sich in Z-Richtungnach oben, bis das Gel keine Kontinuität mehr besteht, und beachten Sie die Z-Position(Zu):
- Subtrahieren Sie die obere Grenze (Zu) der Z-Richtungvon der unteren Grenze (Zl). Dies ist die Referenzdicke der Probe (Zo):

Wenn Zo ≥ 100 μm, gilt das Gel als zufriedenstellend für die Analyse. Beachten Sie, dass die Dicke des Silikonausschnitts etwa 500 μm beträgt, aber die Gelpolymerisation im Ausschnitt führt typischerweise zu einer geringeren Geldicke. 100 μm ist die empfohlene Mindestdicke, um einen stabilen Dehnungsprozess zu gewährleisten, ohne Reiße oder Ablösung des Gels vom Silikonausschnitt.
HINWEIS: An verschiedenen XY-Stellen kann die Dicke des Gels variieren. Dieser Abschnitt des Protokolls misst die minimale Dicke des Gels, so dass wir die Gelqualität bestimmen und angeben können, ob es zum Dehnen ausreicht. Darüber hinaus bietet das Finden der Mitte des Gels einen Bezugspunkt, um zum Post-Stretching zurückzukehren, egal ob statisch oder dynamisch.

Abbildung 7: Gelhomogenität. Kachelbilder wurden mit der konfokalen Mikroskopsoftware (Table of Materials) (A) aufgenommen und genäht Ein einzelnes genähtes Kachel-Z-Slice-Bild einer Fibringelprobe mit relativ inhomogener Faserdichte aufgrund unsachgemäßer Thrombin- und Fibrinogenmischung vor polymerisation. Dieses Gel liefert keine zuverlässige Analyse (B) Ein einzelnes genähtes Kachel-Z-Scheibenbild einer Fibringelprobe mit relativ homogener Faserdichte. Dies ist ein akzeptables Gel für Dehnungsexperimente. Maßstabsleiste für Bilder A & B ist 200 μm (C) Zoomen Sie die Grenzfläche zwischen dem fluoreszierend markierten Gel (rot) und dem Silikon (schwarzer Hintergrund) an. Maßstabsleiste = 100 μm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
7. SCyUS-Betrieb, Stretching & Imaging
- Nachdem nun festgestellt wurde, dass die Probe von zufriedenstellender Qualität ist und ordnungsgemäß auf das SCyUS-Gerät eingestellt ist, bestimmen Sie die vordehnte Position der Probe. Dies wird durch live-Bildgebung unter dem konfokalen Mikroskop erreicht (ähnlich wie Bei schritt 6.2).
- Stellen Sie sicher, dass sich der Servomotor in seiner Nullposition befindet, indem Sie auf die Schaltfläche Go To Zero Servo Pos klicken (Klicken Sie auf Abbildung 8A und stellen Sie sicher, dass in Abbildung 8B Null angezeigt wird), und befestigen Sie ihn an der Dehnungsvorrichtung , wie in Abbildung 6Cdargestellt.
HINWEIS: Führen Sie diesen Schritt langsam und vorsichtig aus, um die Probe nicht übermäßig zu belasten.
- Bewegen Sie den Motor bei der Abbildung der Probe um ein Grad(Abbildung 8C)im Uhrzeigersinn, indem Sie auf die +1-Taste klicken, bis sich die rechte Seite des Ausschnitts bewegt. Kehren Sie dann die Bewegung (Abbildung 8D) zurück in die vorletzte Schrittposition, indem Sie auf die Schaltfläche -1 klicken. Dadurch wird überprüft, ob die Probe unter minimaler Spannung steht. Klicken Sie auf die Schaltfläche Min. Servoposition einstellen (Abbildung 8E), um die Referenzposition festzulegen. Es ist jederzeit möglich, zur Referenzposition zurückzukehren, indem Sie auf die Schaltfläche Go To Min Servo Position klicken ( Abbildung8F).
HINWEIS: Es wird empfohlen, für diesen Schritt ein Objektiv mit hoher Vergrößerung (≥40×) zu verwenden, um Fehler zu minimieren.
- Erfassen Sie ein bild mit hoher Vergrößerung (40×), hoher Auflösung (~ 0,2 μm × 0,2 μm Pixelgröße), einem einzelnen Z-Slice-Kachelbild des gesamten Gelbereichs. Dieses wird als Referenzbild für die Nachbearbeitungsanalyse verwendet. Es wird empfohlen, ein einzelnes Z-Slice-Bild in der Mitte der Geldicke aufzunehmen (mit Zo von Eq. 1),dies ermöglicht die Rückkehr in ungefähr die gleiche Z-Positionnach dem Dehnen. Berücksichtigen Sie auch, dass hochauflösende Kachelbilder des gesamten Gelbereichs viel Zeit in Anspruch nehmen (~ 20-30 min).
- Nun ist die Probe bereit für die statische Dehnung. Stellen Sie den Servomotor auf die gewünschte Dehnungsgröße ein, indem Sie einen Grad(Abbildung 8C)gleichzeitig in der GUI vorrücken (führen Sie dies langsam durch, etwa 1 Grad / Sekunde).
- Erfassen Sie bei jeder Dehnungsgröße, bei der die Analyse gewünscht wird, ein einzelnes hochauflösendes Z-Slice-Kachelbild des gesamten Gelbereichs für die Nachbearbeitungsanalyse. Überprüfen Sie ähnlich wie bei Schritt 6.2, ob sich das Gel während seines gesamten Umfangs nicht vom Silikon gelöst hat, indem Sie die Grenzfläche zwischen dem Gel (rot) und dem Silikon (dunkler Hintergrund) scannen und nach Änderungen der Haftung gegenüber der vorherigen Dehnungsgröße suchen.
HINWEIS: Verwenden Sie während der Aktivierung des Motors Live-Bildgebung, um die Gelposition in X-Y zu verfolgen (mit Einstellungen mit niedriger Auflösung und geringer Vergrößerung). Das Gel erfährt einen Z-Poisson-Effekt, bei dem der Boden des Gels ansteigt, daher sollte die Z-Positiondes Mikroskops auch für jede Dehnungsgröße auf den ungefähren Mittelpunkt der Geldicke eingestellt werden. Dies kann durch Neuberechnung von Zo (Eq. 1) für jede Dehnungsgröße erreicht werden. Da die Dehnung in Z-Richtungrelativ homogen ist, ist es nicht kritisch, die genaue Mittentiefe des Gels zu finden.

Abbildung 8: GUI für das SCyUS-Steuermodul. (A) Position des Motors in Grad. Der Wert reicht von -90° bis 90° (B) 'Minimale Servoposition einstellen'. Diese Taste ermöglicht eine voreingestellte Mindestposition, um eine neue Referenzposition einzustellen, die sich von der Taste Zero Servo Position (C) "Plus 1 °" unterscheidet, bewegt den Servomotor um einen Grad im Uhrzeigersinn (D) "Minus 1 °" Taste bewegt den Servomotor um ein Grad gegen den Uhrzeigersinn (E) "Zur Nullposition gehen" Taste setzt die Servomotorposition auf 0 ° ([A] wird auf Null gesetzt) (F) "Zur minimalen Servoposition gehen" Taste bewegt den Servomotor in die benutzerdefinierte "Min" Position. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
8. Nachbearbeitung externer Dehnungsmessungen
- Um die effektiven Dehnungen der Ausschnittgrenzen zu messen, messen Sie dieKantenlängen in der Dehnungsrichtung ( X-Achse) in der Mitte der Y-Achse(Abbildung 9A).
- Laden Sie das Pre-Stretch-Bild in die Bildverarbeitungssoftware (ImageJ FIJI43) hoch und messen Sie den größten Kanten-zu-Kanten-Abstand, der als axiale Länge der Bohrung ( ) in der Mitte definiert
ist.
- Definieren Sie den größten Abstand von oben nach unten als senkrechten Abstand (
).
- Wiederholen Sie diesen Vorgang für alle Dehnungsintervallbilder, berechnen Sie die axialen (
) und senkrechten (
) Abstände der ausgeschnittenen Peripherie (Abbildung 9A, unten) und führen Sie dann die folgenden Berechnungen durch, um die Dehnungen der Ausschneidkanten zu ermitteln:



Abbildung 9: Gelbelastungen durch äußere Dehnung des Silikonstreifens. (A) X-Y-Querschnitt eines undehnten Fibringels (oben) und nach Dem Auftragen εLoch = 64% Dehnung entlang der x-Richtung (unten). Das Gel ist mit fluoreszierenden Perlen eingebettet. Die relevanten Längen von d und l, die für die Berechnung εLochs verwendet werden, sind in den Bildern angegeben (B) Zoom-in-Bilder der gestrichelten quadratischen Fläche, die in A (C) markiert ist Illustration der in dieser Studie berücksichtigten Dehnungstypen: εLoch ist die axiale Dehnung des Ausschnitts bei seinem maximalen Durchmesser, und εGel ist die axiale Dehnung in der Mitte des Gels (gemessen an den Perlenaggregatpositionen) (D) Es wurde eine lineare Beziehung zwischen εLoch und εGel in xx-Richtung (rote Linie) und yy-Richtung (grüne Linie) gefunden. Diese Abbildung wurde mit Genehmigung von Roitblat Riba et al.41angepasstBitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
9. Analyse der Faserorientierung
- Verwenden Sie die Quantifizierung der Faserausrichtung, um die strukturelle Reaktion des faserigen Gels auf zunehmende Dehnungsgrößen zu charakterisieren. Laden Sie hochauflösende Bilder in die ImageJ FIJI-Software (NIH)43 hoch und analysieren Sie sie dann mit dem Modul OrientationJ (EPFL)44 (Einstellungen: Gaußscher Farbverlauf und 3-Pixel-Fenster, Abbildung 10).
- Berechnen Sie den 2D Nematic Order Parameter (NOP) des Orientierungs histogramms wie:45

HINWEIS: Ein Wert von NOP = 1 zeigt die perfekte Ausrichtung entlang der axialen Richtung (Winkel Null) und NOP = 0 die Isotropie an. Der Orientierungswinkel θist der Faserwinkel in Bezug auf die Dehnungsachse (x-Achse), der durch Bildanalyse erhalten und in der OrientationJ-Dokumentation genau definiert ist. 44

Abbildung 10: Analyse der Faserorientierung mit der SOFTWARE FIJI ImageJ. (A) Hauptmenü von ImageJ mit einem Pfeil, der die Position des Pulldown-Menüs "Plugins" angibt, in dem sich "OrientationJ" befindet. Klicken Sie im erweiterten Menü von 'OrientationJ' auf die Option 'OrientationJ Distribution' (B) OrientationJ's Distribution Modul. Setzen Sie 'Lokales Fenster σ' auf 3 Pixel und 'Gradient' auf 'Gaussian'. Drücken Sie dann die Schaltfläche "Ausführen" (roter Pfeil). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
10. Manuelle interne Gelstammanalyse
- Während Sie live hochvergrößerungsreiche Bildgebung eines Hydrogels mit eingebetteten Perlen durchführen, lokalisieren Sie manuell eine Region von Interesse (ROI) mit leicht erkennbaren Merkmalen (z. B. Aggregate von Perlen), um nach jeder Dehnungsgröße an die gleiche Stelle zurückzukehren.
HINWEIS: Die Kompression in Z-Richtung (Poisson-Effekt) kann zu einer Erhöhung der Perlendichte führen, wenn die Dehnung zunimmt, daher empfehlen wir, Perlenaggregate zu wählen, die groß genug sind, damit sie klar identifizierbar sind. Dieses Protokoll erfordert die Analyse der zentralen Region des Fibringels, obwohl jede Region ausgewählt werden kann.
- Erfassen Sie in der Pre-Stretch-Position (Schritt 6) ein hochauflösendes Z-Stack-Bild des ausgewählten ROI. Kehren Sie nach jedem gewünschten Dehnungsintervall zum gleichen ROI zurück und wiederholen Sie den Bilderfassungsvorgang.
- Nehmen Sie die Bilder und importieren Sie sie in ImageJ. Notieren Sie im ROI die X-Y-Pixelposition jedes sichtbaren Perlenaggregats. Übertragen Sie die aufgezeichneten Daten in eine Tabelle.
- Messen Sie die Abstände zwischen jedem Aggregatepaar und vergleichen Sie sie mit den Abständen der gleichen Paare im Referenzbild, um die Berechnung von Dehnungen in X- und Y-Richtung zu ermöglichen.
HINWEIS: Wenn ein kontinuierlicher Echtzeitfilm aufgezeichnet wird, während das Gel gestreckt wird (anstelle einer statischen Bildaufnahme), kann eine automatische Analyse von Dehnungen mit digitalen Bild- oder Volumenkorrelationsmethoden (DIC / DVC) durchgeführt werden, wie zuvor gezeigt46,47. Es ist jedoch zu beachten, dass die automatische DIC/DVC-Analyse in dieser Einstellung eine Herausforderung darstellt, da sich der Z-Stackaufgrund des Poisson-Effekts (Kompression) nicht nur in der X-Y-Ebene, sondern auch in Z-Richtungbewegt, was zu erheblichen Drifts während des aufgenommenen Films führt.