El modelo tradicional por vía subcutánea tumor es menos que ideal para estudiar el cáncer colorrectal. Ortotópico modelos de ratón de cáncer colorrectal, que cuentan con las células cancerosas que crecen en su ubicación natural, reproducir enfermedades humanas con alta fidelidad. Dos técnicas se pueden utilizar para establecer este modelo. Ambas técnicas son similares y requieren de anestesia del ratón y la laparotomía para la exposición del ciego. Una técnica consiste en la inyección de una suspensión de células cancerosas de colon en la pared del ciego. Las células cancerosas son los primeros en cultivo, cosecha cuando subconfluentes y preparada como una suspensión de células individuales. Un pequeño volumen de las células se inyectaron lentamente para evitar fugas. La otra técnica consiste en el trasplante de un trozo de tumor subcutáneo en el ciego. Un ratón con un tumor establecido con anterioridad por vía subcutánea colorrectal es la eutanasia y el tumor se extirpa mediante una técnica estéril. La pieza del tumor se divide en trozos pequeños para el trasplante a otro ratón. Antes del trasplante, la pared del ciego está ligeramente dañado para facilitar la infiltración de células tumorales. El tiempo necesario para el desarrollo de los tumores primarios y metástasis hepáticas pueden variar dependiendo de la técnica, la línea celular, y las especies de ratón utilizada. Este modelo de ratón ortotópico es útil para estudiar la evolución natural del cáncer colorrectal y ensayo de nuevos agentes terapéuticos contra el cáncer colorrectal.